Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001363989.1
Sequence Length
5023 nt
GC Content
0.5485
CCCCACUUAAUCCCAUCCCGUCUGCUACAAGGGCCCCACAGUUGGAGGUGGGGGAGGUGGGAAGAGAAAAGAUCACUUGUGGACAAAGUUUGCUCUAUUCCACCUCCUCCAGGCCCUCCUUGGGUCCAUCACCCCAGGGGUGCUGGGUCCAUCCCACCCCCAGGCCCACACAGGCUUGCAGUAUUGUGUGCGGUAUGGUCAGGGCGUCCGAGAGCAGGUUUCGCAGUGGAAGGCAGCACGGGCAGGCAAGUGGUCCCUAGGUUCGGGAGCAGAGCAGCAGCGCCUCAGUCCUGGUCCCCCAGUCCCAAGCCUCACCUGCCUGCCCAGCGCCAGGAUGGCCACCAUCACCUGCACCCGCUUCACGGAAGAGUACCAGCUCUUCGAGGAAUUGGGCAAGGGAGCCUUCUCGGUGGUGCGAAGGUGUGUGAAGGUGCUGGCUGGCCAGGAGUAUGCUGCCAAGAUCAUCAACACAAAGAAGCUGUCAGCCAGAGACCAUCAGAAGCUGGAGCGUGAAGCCCGCAUCUGCCGCCUGCUGAAGCACCCCAACAUCGUCCGACUACAUGACAGCAUCUCAGAGGAGGGACACCACUACCUGAUCUUCGACCUGGUCACUGGUGGGGAACUGUUUGAAGAUAUCGUGGCCCGGGAGUAUUACAGUGAGGCGGAUGCCAGUCACUGUAUCCAGCAGAUCCUGGAGGCUGUGCUGCACUGCCACCAGAUGGGGGUGGUGCACCGGGACCUGAAGCCUGAGAAUCUGUUGCUGGCCUCCAAGCUCAAGGGUGCCGCAGUGAAGCUGGCAGACUUUGGCCUGGCCAUAGAGGUGGAGGGGGAGCAGCAGGCAUGGUUUGGGUUUGCAGGGACUCCUGGAUAUCUCUCCCCAGAAGUGCUGCGGAAGGACCCGUACGGGAAGCCUGUGGACCUGUGGGCUUGUGGGGUCAUCCUGUACAUCCUGCUGGUUGGGUACCCCCCGUUCUGGGAUGAGGACCAGCACCGCCUGUACCAGCAGAUCAAAGCCGGCGCCUAUGAUUUCCCAUCGCCGGAAUGGGACACUGUCACCCCGGAAGCCAAGGAUCUGAUCAAUAAGAUGCUGACCAUUAACCCAUCCAAACGCAUCACAGCUGCCGAAGCCCUUAAGCACCCCUGGAUCUCGCACCGCUCCACCGUGGCAUCCUGCAUGCACAGACAGGAGACCGUGGACUGCCUGAAGAAGUUCAAUGCCAGGAGGAAACUGAAGGGAGCCAUUCUCACCACGAUGCUGGCCACCAGGAACUUCUCCGGAGGGAAGAGUGGGGGAAACAAGAAGAGCGAUGGUGUGAAGAAAAGAAAGUCCAGUUCCAGCGUUCAGUUAAUGGAAUCCUCAGAGAGCACCAACACCACCAUCGAGGAUGAAGACACCAAAGUGCGGAAACAGGAAAUUAUAAAAGUGACAGAGCAGCUGAUUGAAGCCAUAAGCAAUGGAGAUUUUGAGUCCUACACGAAGAUGUGCGACCCUGGCAUGACAGCCUUCGAACCUGAGGCCCUGGGGAACCUGGUUGAGGGCCUGGACUUCCAUCGAUUCUAUUUUGAAAACCUGUGGUCCCGGAACAGCAAGCCCGUGCACACCACCAUCCUGAAUCCCCACAUCCACCUGAUGGGCGACGAGUCAGCCUGCAUCGCCUACAUCCGCAUCACGCAGUACCUGGACGCUGGCGGCAUCCCACGCACCGCCCAGUCGGAGGAGACCCGUGUCUGGCACCGCCGGGAUGGCAAAUGGCAGAUCGUCCACUUCCACAGAUCUGGGGCGCCCUCCGUCCUGCCCCACUGAGGGACCAGGCUGGGGUCGCUGCGUUGCUGUGCCGCAGAGAUCCACUCUGUCCGUGGAGUGGAGCUGCUGGUUCUCCCAGGUGGAUUUUGCUGGAAUUCUCCCAUGUCAUCACCCCACCACCGUCACUUCUGUACCUGCAUCAAGAAAACCUGCUUGUUCACAAAAGUCAUCGCAACUUCAGAGCGAACGGCCACAUCUCCCCACCUCUCACCCCCACCCUCUCCCCUGCCAGGCUGGGGCUUCCUCAGGCAUGGGUGUCCACAGCACUGGCCCCCUCUCCCCAGCCUCAGCUGCUGUCCGCCUGAUCUGUCUUGGGCUGUAGGCUAGAAUGCCCGGGCUGGUGCCCACCAGGGGCUGGGGAGAAGGAGGGGUGGCAUGAUGAGGAAGGCAGCAUCCGUCCGUCCCUCUCCCAGACCUCUCCUCUUCCAGUGUCCCCGGGGAAGGGCAGAUGACACUCCCUUCCCCCUAAGCCAACCGCACUGAAGGAGUGGGGAGAAGAGCAUACGCCAGGAGCCUCCUGCCUCAAAGUGCUCCCCUAAGUCUUCUUCCUCCUGUGCUGACCUCAGGGUGGUCUGACCCUUCCCUCGGUGUGGGGGAUGUGGCCCUCUCAGGUGCCCCUACUUGCUUUCUGCUUCCUUCUGGUGAAGUCCACCUCCAACAUUAACCUGCCCACCCCACCCCCGUCAUCCCUGGAGAAUUCCAGCUUUGUCGUAUCUCAGAGAGGGAAUCUAAUUGUUUUUGGGGGGCAAAAGAAAGCAACGUUUAGGUAUCACUUCUACUUGGACCGCAUGCCUUUUUAUAGCCAAAUUUCUGUGUAUUUCGUAAAUGGAUUUCGCGUUAAUGGAUAUUUAUGUAAUAACUAGACUUCUCAGAUUAUUGUGAGAAGGGUCAGGUUGGAAGGGGUGUAGGAAGAGGGGUGAGGGGUAGUUUUUUUCUGUUCUAGUUUUUUUUUUUUUUUUUGUCAUCUCUGAGGUGGACCUUGUCACCUGUGGUUAUUGGGGCCAAGGUGGACUCAGCUCCGGGGAGAAGGGCCUCUCUGCCAUUUCGGUCCCAAGGUGAGCUGACACAGGCGUUCCUUUUGGGACUGUGGAAGCAUCAGAUGCCAGCACUGACUCAGGAACAGCAAGUCAGGGCAGAGAGGAGGAGGGAGGCUGUCAGGAUGGAAAUACCUGGACUUUUCUUUGCUUCCCUCGCAAACUGGGGUCUUCUCUACCGAACUUCCCAGGAUUUCAUCUCACCAUAUCUGUGUGCCGCCCCCAGCACCCCCCACCCACCUCUGGGGGGCCCGUGAGCGUGUGUCUUCAUUGCCUCUCUCCCCUUGGCGUCUGAUGACCACAGCAAAGCACUGGGAAUUUCUACUCUUCAUGCCUCAUCCUGCAGCCUCGGGUUCGCAUUCUCUCUUUCUUUUCCUCUUUCCCUCUUUCCCUGGGAUUGACUCUGAGUGGAAUACCUUGGCACAUCCACUAGGAUCUACUGUCUGCACUGUUUUCUUUGCAUGACUUUAUACGCAGUAAGUAUGUUGAAAACAAACAAAAAGAAGAAAACACUCAACAAAACCAAUCUACAUGUUUUGGACUAAAAAAAAAAAUAGAGGUUGUAUUCUCAGUGUCCGACUCGGAAUUAUGUUGCUGCCUCUCUGUGCUUUUGGCCUCUGUGUGGCCGUGUUUUGCCAGCAUGAGAUACUGUCCCCUCUGGAGGAUUUUAGGGGAGGAAGAGCCACGUCCCCAGGGAUUGGAGGAGGCUCCGGUACCCUCGACCCUCCUGGGUGUUGGUUGGAGCAGAACUGGUGAGGAUGUUUGAUCCGAGAUUUUCUGAGCUCUCCCCAAUCACCAGCUGUCUGCUGGGUUCUUUUCUCAAGUCCUGCUGCCCAGGCCCAGGUGAGACAGGCAACGCCAGGUCUGCAGGCCAGGAGAGAUGCUGCCCAGGCCUCCUGGUUUCCAAGCUGGUCCAUCACUGGCCUCUGUCCUUGGCAGAGACCUUGCUGCCCAGGCCCAGGGGCAGGCUCUUGGCCUGCCCCAGGCCCAGAGGGCUUCCCAGUAAGGCCCAGUGAUCCCAUUAUCCCAGGGGCAAAACCACCUGUCCCCUUUUGAGCUGCCAGUUCCCUACAGCCAUCCCCAGUCAAGGGUGAGGGUGUGGCCUUCACCAGGGGCUGCUGUAAUUACCGAGCAAGGUCUGAGCUCUUCUUCAGCCUCAGUUCCCUCAUUGGUUAAAAGGGUUCUUUGUUCCCAUCCAGCCGAUGAAGGAGCAAACGUCUGGCUAUGUGAAGCCUAAUUUACCUGCAGGAACUGGCAGGGAUAGUCACUGGCUGGACUCCUGUUUACUUCUAGACCUGGUCAGGCUCCAUCCCCUCCCCCACCUGCCCCUGAUUCCCCUCGUCGGUGCCUGUCAACUGCUUUUCAGCAGUGGACUGCAGGGGAAAGAGCAGUGAUUUGGGGUGAGUAGGCUUCAAUUCCCAGCUCUGACCAGACUUGCUGUGUGACCUUGGGCAAGUUCCUUUCCCUCUUUGGAGCUUGGUUUCCCUGCCAGAGGAAACUGAGCUGGAGGAGCCUGAGGUCCUGCCUUUCAUUGGCUGACACACCUCCUGUCCACUGUGUCACUCUCCAAGUGCCAGAGAAGUGGAGGCAGAUCGCUACCCCAGGCUGAGAUGGCCCCCACUGUGAAGGCCACGCCUGUGGGUGGGCAGCCACCUGGUGCCACCACAGGGCACCAGGGAUGAUCCUGAUGUGGCAGGCAGGGGAGACUCACAGAAAAAUCUGCCCAGAGCCUACCCUCACCAGACAAACUCUGUGCUCCUCCAAAACAUCCUUUAGAUGCAAAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAAUAAAUAAAUAAAAAUCCAAACCCAAGUCAAAACCUUGGCUCCAGCAUGAAAACACGUUUACAGGAAAGUGUUCUCCUGGGUUUGUGCCCACCAUGGUGCGAAUCCUGACCCAAGGCCUCCUGUCUCCCUUCAAAGGGAGACCCUUUUGGGGGAUGAGUUUGCCAGACUCCCCGUGCUGGUUUCUUUGUUACUAUUUGUUUGGGGUUUUGUUUUAGUUCUUUUUUUUUUUCUUUUCUUUUUUAAAAAUAUGUGGCUGUGAACUUGAAUGAACACUGCUCAAACUUUCUGCUAUUGGGGGGGGCGGGUGGGAUGGGAAGAAGGGGCGUUUGUUUUAUUCUUGGUGUUUUCAGUGCAAUAAAUAGCUACAAACUUCUGUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1922.42 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2013.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 1273.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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