Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001364159.2
Sequence Length
5360 nt
GC Content
0.4282
GUGUUCUUCUAUGUGUGUGUGUGUGCCUGUGCGCGCUUGUGUUGGGCAGGUCCGGCUGUCAGUGGCCGCCUGGCGCCCCAGGCGCUCCAGCCUCCCAUCGCCGGCCGGCGCACUGAGCCAGCAGCCCUGGCCUUUAGGAUUUCUGGAAUGAGUGUGAGGAUUUCUGCGGAACAGCGAAACUUUGUUAGGACAGGUCUUUAAGAAAACACCCCUCUUCCCUUUUUCACAGCGACCACCCGCGACAGUUCUGAGCCCCGCCCUCGGACCCUUCUCCACAUGCUUUUUGGUGGUGGGGGGAUGUGGCUUCCCAAGGCCGGGCACUCGCAGUUGGCCAGAGCUUGAGGGGUUCCUGGAGGGUGGCUGCUGCGGCGAGACGCCGAGCAUGUUUUCCAUCCAUUCCCACCUGCCCUGCUAGCUGAGACGUGAGAUUCGAGGGGUGCCGGAAUAUAACUGUGGGUUCUACUCCGCGAAGGUGGGUUCACUUCAUCCACCGCCACUUUUCUUCCUCCCCACGCAGUGCGUGUCAGCGGGGUGGGUCUGGCCCGGGCUCACUUUGAGAAGCAGCCGCCUUCCAAUCUGCGGAAAUCCAACUUCUUCCACUUCGUCCUGGCCCUCUACGACAGACAGGGCCAGCCCGUGGAGAUCGAGAGGACAGCGUUUGUGGGGUUCGUGGAGAAGGAAAAAGAAGCCAACAGCGAAAAGACCAAUAACGGAAUUCACUACCGGCUUCAGCUUCUCUACAGCAAUGGGAUAAGGACGGAGCAGGAUUUCUACGUGCGCCUCAUUGACUCCAUGACAAAACAAGCCAUAGUGUAUGAAGGCCAAGACAAGAACCCAGAAAUGUGCCGAGUCUUGCUCACACAUGAGAUCAUGUGCAGCCGCUGUUGUGACAAGAAAAGCUGUGGCAACCGAAAUGAGACUCCCUCAGAUCCAGUGAUAAUUGACAGGUUCUUCUUGAAAUUUUUCCUCAAAUGUAACCAAAAUUGCCUAAAGAAUGCGGGAAACCCACGUGACAUGCGGAGAUUCCAGGUCGUGGUGUCUACGACAGUCAAUGUGGAUGGCCAUGUCCUGGCAGUCUCUGAUAACAUGUUUGUCCAUAAUAAUUCCAAGCAUGGGCGGAGGGCUCGGAGGCUUGACCCCUCGGAAGGUACGCCCUCUUAUCUGGAACAUGCUACUCCCUGUAUCAAAGCCAUCAGCCCGAGUGAAGGAUGGACGACGGGAGGUGCGACUGUGAUCAUCAUAGGGGACAAUUUCUUUGAUGGGUUACAGGUCAUAUUCGGUACCAUGCUGGUCUGGAGUGAGUUGAUCACUCCUCAUGCCAUCCGUGUGCAGACCCCUCCUCGGCACAUCCCUGGUGUUGUGGAAGUCACACUGUCCUACAAAUCUAAGCAGUUCUGCAAAGGAACACCAGGCAGAUUCAUUUAUACAGCGCUCAACGAACCCACCAUCGAUUAUGGUUUCCAGAGGUUACAGAAGGUCAUUCCUCGGCACCCUGGUGACCCUGAGCGUUUGCCAAAGGAAGUAAUACUCAAAAGGGCUGCGGAUCUGGUAGAAGCACUGUAUGGGAUGCCACACAACAACCAGGAAAUCAUUCUGAAGAGAGCGGCCGACAUUGCCGAGGCCCUGUACAGUGUUCCCCGCAACCACAACCAACUCCCGGCCCUUGCUAACACCUCGGUCCACGCAGGGAUGAUGGGCGUGAAUUCGUUCAGUGGACAACUGGCCGUGAAUGUCUCCGAGGCAUCACAAGCCACCAAUCAGGGUUUCACCCGCAACUCAAGCAGCGUAUCACCACACGGGUACGUGCCGAGCACCACUCCCCAGCAGACCAACUAUAACUCCGUCACCACGAGCAUGAACGGAUACGGCUCUGCCGCAAUGUCCAAUUUGGGCGGCUCCCCCACCUUCCUCAACGGCUCAGCUGCCAACUCCCCCUAUGCCAUAGUGCCAUCCAGCCCCACCAUGGCCUCCUCCACAAGCCUCCCCUCCAACUGCAGCAGCUCCUCGGGCAUCUUCUCCUUCUCACCAGCCAACAUGGUCUCAGCCGUGAAACAGAAGAGUGCUUUCGCACCAGUCGUCAGACCCCAGACCUCCCCACCUCCCACCUGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCUGCAAGCGAUAUCUGGCAUGAUUGUUCCUCCUAUGUGAAAGAAUUGCCUUGAAGAAUUGUAUUAAUGAAGAGGUUGGAUUCUGCUACAGAGAGUAAUCUGAUACAAGUCCCAGAGUGGAACUUUUAACUCAGGCCUUUUUAAGAGGAAUCACAAUAACUGCAGAUUUUUAAACAAACAAAAUCACCGACCUUGCAAAUACUGAAAUUGGAAGAGGGAUCUGCAAGUGCAGGGUGUUGGUUAAAGUUGUACCUCCCAAGUAUUUGGGGGAUAUAUUUAUUCUGUAUUGACAAAAGCAAAUCCACUUUUUCUUUUUCUUUUUUUUUUUUAAGCUUAAUUCUGCAAUCAUUUGUCUUUUAUAAACCGUAAAGCUCUAUACAAGGGACACUAUAAAUAAGACUCCAUGUUUUAAUUUAUGAUGUUUUUAAAGCUGUGUAAAGGAAGAAUGAAGUGGUGAUAUUUACAAAAAAGUAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGCUUGUAUGGGACAGAAUAGGAAUGCCAGUUAGAUUUUUUAGAAAAACUAAGGGUCGGCUUUUGCGCCUUAAAGCAUAUCAAAUGGUAGUUAGCUCAGACAGUGCAUUUUCAAUAUCUAACUUAACAUGCCACCCCUUAGCAGUGCAAGCUUAUUUAUCUCUUUUGUAUUGUUGUCUUAAGCAACUGUGUAAAUAAAUGCAGCCUGGAAAGUUAAAACGCGAUGUAAGUGAUCACAUUUUUCCCUCUACUCGAAAAUCCAGUGCCUCUAGACAGAUUGUUAAAACUGCAUAUUUAAAUCUGAUCUCAUUCUCUCCUUUUACUUAAGUCAGUUUCUUCUGAAGCCGAUGGCCUCUCGAGAGCUUGGUGGCACACAUACUGUGUGAGAAUCUCCUUUGAGACUUCAUGGAACAGGGUCCAGGCACAGAAUUCCACACUCUGCCCUCCAGUUAACAAGCCAAAACCUCACGUACGCUCCCCCAUUUGCAAGUUUAAAGUUUACUCGUCCUAAAUGCAGACUUCAUACCUAUCUUCCAAAAGUUGAUAAAAGCAACGUGGCAGGUAUUUUCGAUUUUCCCAUUCCAGAUACUGCCUCUAUCAGUCGACCCUUACCAUUUGUAACAUAAUAGAUUGAAACAACAGGUUAAGUGCUUUGGAAUUAAGAGUUAAAGGGAACCGGGGGUGGAGAAAGGAAAAGAAGGUUGAGACCUCCAAAACAUAGUUUUCUGUUCUAUGGGAAUUUUUGCUCUCAUUAUCUGGGAAGUGUUCUUAAAAAUAAGAAUUAAUAGCAAAGAUGCAGCAAAGCUCUGAGGAUGCAUUUGCCUGAUAUUUUUUUCUUUGCUCUUGUGUUUUUGUAUGUAGUUAUAAAUACUGUAGAUUUUUUUUUUGUGAUUUUUUGCCAAAGUUGUUGUUCUAUUUAUACAUUUUAAUGUCUUAAGACAUUUUUUCAAUAUCACAAAAAGAUUUUACUGCGUAUUUUGCAAAGAAAAAAAGCUCACUACCUUUAGCUUGCACAUACUUGCAAAGUUAAUUAAAAGGCUUUUUGUUUUAAAGGGGAUUUUGUAAAAUAUCCAUAUAAAUAAUGUAUUUAUCUUUCGAAUUUGUACAUUGCUUUUCCCUUCUUCCUCUUCCUUCCACCCCCAAUUUAUUUUAUUGUGUAUGUUUGCUACGUGAAAAGUGCGUAUUUGUUUGGUCACCUACACUUGUAUUAGCUGUUUCAAUGUGAUUUUUAAACAUUUCAUUUAUAGUUAUUUUUAGUAUUGUUAUAAACCAUGCUUCAGUUUUUUUAAUUUCCACCCAAAAGUCAUUGUCUAUUUUUGUAUUAUUUGUAAGUUAAGAAGUUUUUUCCAAUAUAUGGCAAAAAAAAAAAAAUAGUAGCAUAUUAUUCUUGUAGUAUUUAGUUCAGUAGAUUUAAAAAAAAAUGUAUCCUUUGCUUUGGAAGCUUACAAAACAACCCUAAUGCUGUUUUACUCUAUUAAUAUGCAUGGAAUCUCUCCCUUUGGAGUGACGCAUUUUGUGCAUUAAAUUCUAGGGAGAAACUUCAUAGAAAUCAAUGAACAUACUUUCUUUCUUAAGUCUGCUUGUAUAUUUCCUCUGUCUUUCACAUAAAUAUAAACCAGCAGAUUGGAUGCCUUAACAAUGCAAAUCAUAUUCAUUUCACUUGUACAUUGUAACUGUGCACCAGAACUGUCAGUCAUCACUAACAUUCUAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAACAAAGAAAUCGAAAAGCACAAAAGAACUGUUUUGUUACCUUAAGACAAUGUAACUUUUUCUAGUAGAGCAAGAAAUCAUUUACAACAAUGCUGCAACUGUGCAUGCCCCCAUAUGGAUUUUGCAAUGGUUUUCACUAGGCUGUCAAGAGUGCGAUUUUUAUGGGUUGGGGUGGGUGGGGGAGGGGAGUUGUGGGAGGGUAGGGGAGGGAGGAAAGCUGUUUUUCAUGGUGAGAAAUAAUAAUGAUGACUAAUAAUAAUAAAAAAAACUGGAAAAUGUAAGCAAGGUGGACGCAUUGCUUCUCGGUACUCAGAAAGGUUAUCUGAAUUUGCGUGGUAAGCGCUGGCCUGAAGAUGUACACAAGUUAAAGCCAUAUUUUAUCUGGUGAGCCCCUUAACUGUUUCUGAAGGAAUGAACGGUCAGCCGGGAAGGUGUCCGGCUUAGACCUUGACAACAGACACUACCCAUCUGUCAGCCAUGUGCAGUGGUUAGAACUCUUCUUGAAAGUCCAAAGAGCCUUUAAAAUGUGUAUAAUUUGUGUUUUGUUGCUUCUAUUUCUAUUGAUUAGAUGAAAAGACAUUCUGGCCCUCUGAUCCUCUUUCUUCUCCACAAAAGUUUUA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1480.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1587.39
Frequency: 0.0000
Diversity: 1441.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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