Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001364781.1

Sequence Length

2069 nt

GC Content

0.5070

ACUUCCUCCUCGGGGGCCUCAGAAAACCACAGGGCGCGGGGCCAGGGCGGCGGCCCCCAGGGAGUUGGCAGGAUGGCAGAGGGCAAGGCAGGCGGCGCGGCCGGCCUCUUCGCCAAGCAGGUGCAGAAGAAGUUUAGCAGGGCCCAGGAGAAGGUGCUGCAGAAAUUGGGGAAAGCUGUAGAAACCAAAGAUGAACGAUUUGAACAAAGCGCUAGCAACUUCUACCAACAACAGGCAGAAGGCCACAAGCUGUACAAGGACCUGAAGAACUUCCUUAGUGCAGUCAAAGUGAUGCAUGAAAGUUCAAAAAGAGUGUCAGAAACCCUGCAGGAGAUCUACAGCAGCGAGUGGGACGGUCAUGAGGAGCUGAAGGCCAUCGUAUGGAAUAAUGAUCUCCUUUGGGAAGACUACGAGGAGAAACUGGCUGACCAGGCUGUAAGGACCAUGGAAAUCUAUGUUGCCCAGUUCAGUGAAAUUAAGGAGAGAAUUGCCAAGCGGGGUCGGAAACUCGUGGACUAUGACAGUGCCCGACACCACCUGGAGGCAGUGCAGAAUGCCAAGAAGAAAGAUGAGGCCAAGACUGCCAAGGCAGAGGAAGAGUUCAACAAAGCCCAGACUGUGUUUGAAGAUCUGAACCAAGAACUACUAGAGGAGCUGCCUAUUCUUUAUAAUAGCAGCAGGCGCUCUUUAGUCAUUUCUCCCCCAGUUCGAACAGCUACAGUCUCCAGUCCUCUUACCUCACCUACUAGUCCCUCUACACUUUCCUUGAAGAGUGAGAGUGAAUCUGUCUCAGCAACUGAAGAUCUGGCACCUGAUGCAGCCCAAGGGGAAGACAAUUCUGAGAUCAAGGAGCUCUUAGAAGAGGAGGAAAUAGAGAAGGAAGGAUCUGAAGCAAGCUCCUCUGAGGAAGAUGAGCCUCUACCAGCCUGCAAUGGCCCCGCCCAGGCCCAGCCCUCUCCUACCACUGAAAGGGCCAAGUCCCAGGAGGAAGUUCUCCCCAGCUCCACAACUCCAUCACCAGGCGGAGCCCUGAGCCCUUCAGGGCAGCCUUCAUCAUCUGCCACAGAAGUAGUCCUCCGAACCCGCACCGCAAGUGAAGGAUCUGAACAACCAAAGAAGAGAGCCUCUAUCCAGAGGACCUCAGCACCCCCUAGUAGGCCUCCUCCACCCAGAGCCACUGCAAGCCCCAGGCCCUCCUCAGGGAACAUACCUUCCAGCCCUACAGCCUCUGGAGGGGGUUCACCCACCAGCCCUAGGGCCUCCUUGGGGACUGGGACUGCAAGUCCUAGGACCUCCCUAGAGGUCUCUCCUAAUCCAGAACCACCAGAGAAGCCAGUAAGAACUCCUGAGGCCAAAGAAAAUGAAAACAUCCACAAUCAGAACCCUGAAGAACUUUGUACUUCCCCCACCUUAAUGACAUCUCAGGUUGCUUCAGAGCCUGGAGAGGCAAAGAAGAUGGAAGACAAGGAAAAGGAUAAUAAGCUUAUCUCAGCUAACUCCUCGGAGGGCCAAGACCAGCUUCAAGUCUCCAUGGUACCAGAAAACAACAACCUCACAGCACCUGAACCUCAAGAAGAGGUAUCCACAAGUGAAAAUCCACAACUCUGAAGAGAAACUACCAAGACUCCUCCUGCCCCAAACCUCGCCAGAGAAGCUCUUCAACCAGAGGGUAUAGGUCAGAGGGAUAUAAGAGCCAGCAUCCAUCCCUGGGUUCUCAGUAGGAAUGCUGGUGCUGUCUAAAGACCUGGCAUUAAUGGAGGCGGAGGAGCAGCCUUACGGGAGGGAUGGAGGGAGGCAGGCUGGGGAGAAGAGAACAUUAGACUCAGGGAAUAUUUAAUUCUGGUUUUAGCAUUAUUAGAAUAAGACUUUAUACAUUAACUAAAGUGGAGCUUUAAUCACUAUAAAAAGCAAAAGUAUCUAUAGACACAGACACUUGCCUAUACAGAGACAUAACCACACACACUCAGAGGAUAGUGAACAAAUCUGUCUUUGACUUACGACCCAUUUUGCAAGACUUAAAGCCGGAAGAACACAUUUUCAGAUUGUUAAAUAAAGUCUGAUUCUGACUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-654.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -695.14

Frequency: 0.0000

Diversity: 451.74

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((.(((((((((((........(((((...(((((.((((((.((((.....((.(((((.....((((.((((...((((.(((......))).))))))))))))..(((((((......(((((.((((.(((........))).))))..)))))........((((((........((((..(..(((((((...((....))..(((((.((.......)).)))))(((((..((((((((((((...........))))).)))))))....)))..))......)))))))..)..)))).......)))))).((((((.(((..((...((((((((....((((.((((.(((((((...))))........((((((((((.....))).)))))))..((((....))))...........(((((....))))).((((((((((..(..........)..))))))(((.(.((.(((((..(((.((........)))))..))))).)).).))).((((((.......(((..............)))....))))))..))))(((((((((..(..........((((((((.(((..((.(((.....((((..(((((((.(((.((((.((((.......)).)).))))))))))))))...))))....))).))...))).))))))))...)..))))).)))).)))..)))).))))..((((((((((...))).)))))))...))))))))))..))).)))))).))))))).(((..(((...)))..).))..(((((((.(.....).)))))))(((((((.......(((........)))........)))))))((((........))))..))))))).....)))))))))).))))).))))).........))))...))))....)))))))))))))(((((((((((((....(((((((.((((((...(((((((.....))))))).))))......((((...))))........((.((.((..(((.....)))..)).)).))............(((..(((((....)))))..)))......(((....(((((((((((...(((.....))).((((....((((((((..((((..............))))...(((((.(((((((.....))).((((((((((((...)))))))).))))((((...))))(((((.....))))).(((.((((.................)))).)))........)))).)))))........................((((....))))....((((((.(((((..(..(((..((.(.(((((((((.......))))).)))).))))))..)..)))))))))))...((((.....((((......))))...)))).)))))))).......))))...(((((((((((.((((..........((((...(.(((((..((((..((((((.(........(((......)))..(((((..(((.........((.......)).........)))..))))).).)))))).....))))...)))))).))))......((.((((((((((....((((....))))..)).)))))))).))(((....))))))).))).)))))))))))))))..))))...))).)))))))))...))..)))))))))))........(((((.(((((...(((((((((((((((((((...............((((((.........))))))...(((((...........)))))..((((.(((........))).)))).......((((((((........(((..((....))..)))........)))))))).(((.(((......))).)))..)))))))))))..................))))))))...))))).)))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

,(((((((((.(((((((((((........(((((...(((((.((((((.((((,.,..,,.{{{|(((((.(((.(((((,{.{(((.(((......))).)))}|||{|||...(((((((((,...{((((.((((.(((........))).))))..))))}((((,..((((((((..{{.....,...,..(((((((...((....))..(((((.((.......)).))))){{(((..((((((((((((..,.....,..))))).)))))))....)))..))......)))))))..,..|{,{{(.....)))}}))...)))))))).,{.((((((..(((.,.(((((.(((..((((.((((........,,,.((((((((((.....))).)))))))..((((....))))((((,..(({,(((((....))))).|,}}||||{|,,|........,,,,,||}}||(({,(.,({(((((..(((.((........)))))..))))).)).,}))).(((({{......}|||..........,},,)))}...,||||,..,)))).{{....,||,......}},,((((({{{|{{{.|{,,(({.....{(({.,(((((((((((.((((.{{((.......)).)}.))))))))))))))...))))....)))}))..}))),,})})))).))))))))..)))...)))))).})))))...((((((((((...))).))))))).....,{(((((...)))}}))))),})))))).,||..{{{..,)))..,.....(((((((.(.....).)))))))(((((((.......(((........)))........)))))))|,,|,,,....,))))).))).))))),,})))))))))).))))).))))).........)))}..,))))....))))))))))))|(((((((((((((.,..(((((((.{{{(((,,,(((((((,...,))))))).}}}}......||||,,.}}}}.,,.{{,,({,{,.({.,({{.,...))).,)),)),},.........,..(((..(((((....)))))..)))....,{(((..{{(((((((((((...,,,.,,..,|}.{{{{....((((((((..{(((........,|,,..,.|,...(((((.(((((((,....))).{{{{((((((((...)))))))).||||((((...))))||||({{{{{,,,,)}|||}((((.................)))).}}}........)))).)))))....,....{{.....,,......{(((....))))....((((((.(((((..{..(((..((.(.(((((((((.......)))))}}))).,))}))..)..)))))))))))...((((.....((((......))))...)))).))))))))..,....))))...(((((((({((.((((..........{{{{...(.{{{{{.{((((..,,,|||}}........(((......)))..(((({..{||.........,{..,,{{,||{,,.....,|||..,}|||...}}))}}.....))))...,}))}),)))),.....((.(((((((({{.,..((({....})))..))}}))))))).))(((....))))))).))}.}))))))))))))))..)))),}}))).))))))))).,.))..))))))))))),.......{{(((,(((((,..{,,,,,,|||||||||{{,.....{{{(({{.{{{((((({...,,,,,,{{{{({{.{((({...........,}}||,.,{((.(((.,,,....}}}.}}})},,},,.((((((({........{{(..({...,}}..)))........)))))))).,,,.,{,....,,))).,,}..})))))})))),{,....,}}))).,..,))}}})))}}}))),)})))))...