Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001366007.2
Sequence Length
7661 nt
GC Content
0.3984
UCCGGUCCAGCCGGCUUCUCCUUUUCUCGUGGAGCCAUUGUAACGCUCUCCAGGCAUCAGUCUAGUUGCCGGGGGCGCUGGCAAGGGGGUUAGGAUGAGGCUCCCGUAGCCAUGCAUUUUUUAAUUUCAUAAAAGCUUGGGGUCGCAAGGUUCCGCCCGUCCUUUCACUGGGGGCCUGGGGAGGAGGAGUGUGAAGCGCGUCCUCGGCGGAGCUUAUUUGCUCCGGGCGCUGGGGCCCGGGGCCACCCCAGCGUCCCGCCCGCUUUGCCCUCCGGUCCCGCACUAUAUGAAGAUCAAUGAUGCAGACUGAUGGUUUUGAUGAAGCUGGGCAUUUAUAACUAGAUUCAUUAAGGAAUACAAAGAAAAUACUUAAAGGGAUCAAUAAUGGUGUCUUCUGGUUGCAGAAUGCGAAGUCUGUGGUUUAUCAUUGUAAUCAGCUUCUUACCAAAUACAGAAGGUUUCAGCAGAGCAGCUUUACCAUUUGGGCUGGUGAGGCGAGAAUUAUCCUGUGAAGGUUAUUCUAUAGAUCUGCGAUGCCCGGGCAGUGAUGUCAUCAUGAUUGAGAGCGCUAACUAUGGUCGGACGGAUGACAAGAUUUGUGAUGCUGACCCAUUUCAGAUGGAGAAUACAGACUGCUACCUCCCCGAUGCCUUCAAAAUUAUGACUCAAAGGUGCAACAAUCGAACACAGUGUAUAGUAGUUACUGGGUCAGAUGUGUUUCCUGAUCCAUGUCCUGGAACAUACAAAUACCUUGAAGUCCAAUAUGAAUGUGUCCCUUACAUGGAGCAAAAAGUUUUUGUGUGUCCUGGGACCUUGAAAGCAAUUGUGGACUCACCAUGUAUAUAUGAAGCUGAACAAAAGGCGGGUGCUUGGUGCAAGGACCCUCUUCAGGCUGCAGAUAAAAUUUAUUUCAUGCCCUGGACUCCCUAUCGUACCGAUACUUUAAUAGAAUAUGCUUCUUUAGAAGAUUUCCAAAAUAGUCGCCAAACAACAACAUAUAAACUUCCAAAUCGAGUAGAUGGUACUGGAUUUGUGGUGUAUGAUGGUGCUGUCUUCUUUAACAAAGAAAGAACGAGGAAUAUUGUGAAAUUUGACUUGAGGACUAGAAUUAAGAGUGGCGAGGCCAUAAUUAACUAUGCCAACUACCAUGAUACCUCACCAUACAGAUGGGGAGGAAAGACUGAUAUCGACCUAGCAGUUGAUGAAAAUGGUUUAUGGGUCAUUUACGCCACUGAACAGAACAAUGGAAUGAUAGUUAUUAGCCAGCUGAAUCCAUACACUCUUCGAUUUGAAGCAACGUGGGAGACUGUAUACGACAAACGUGCCGCAUCAAAUGCUUUUAUGAUAUGCGGAGUCCUCUAUGUGGUUAGGUCAGUUUAUCAAGACAAUGAAAGUGAAACAGGCAAGAACUCAAUUGAUUACAUUUAUAAUACCCGAUUAAACCGAGGAGAAUAUGUAGAUGUUCCCUUCCCCAACCAGUAUCAGUAUAUUGCUGCAGUGGAUUACAAUCCAAGAGAUAACCAACUUUACGUGUGGAACAAUAACUUCAUUUUACGAUAUUCUCUGGAGUUUGGUCCACCUGAUCCUGCCCAAGUGCCUACCACAGCUGUGACAAUAACUUCUUCAGCUGAGCUGUUCAAAACCAUAAUAUCAACCACAAGCACUACUUCACAGAAAGGCCCCAUGAGCACAACUGUAGCUGGAUCACAGGAAGGAAGCAAAGGGACAAAACCACCUCCAGCAGUUUCUACAACCAAAAUUCCACCUAUAACAAAUAUUUUUCCCCUGCCAGAGAGAUUCUGUGAAGCAUUAGACUCCAAGGGGAUAAAGUGGCCUCAGACACAAAGGGGAAUGAUGGUUGAACGACCAUGCCCUAAGGGAACAAGAGGAACUGCCUCAUAUCUCUGCAUGAUUUCCACUGGAACAUGGAACCCUAAGGGCCCCGAUCUUAGCAACUGUACCUCACACUGGGUGAAUCAGCUGGCUCAGAAGAUCAGAAGCGGAGAAAAUGCUGCUAGUCUUGCCAAUGAACUGGCUAAACAUACCAAAGGGCCAGUGUUUGCUGGGGAUGUAAGUUCUUCAGUGAGAUUGAUGGAGCAGUUGGUGGACAUCCUUGAUGCACAGCUGCAGGAACUGAAACCUAGUGAAAAAGAUUCAGCUGGACGGAGUUAUAACAAGCUCCAAAAACGAGAGAAGACAUGCAGGGCUUACCUUAAGGCAAUUGUUGACACAGUGGACAACCUUCUGAGACCCGAAGCUUUGGAAUCAUGGAAACAUAUGAAUUCUUCUGAACAAGCACAUACUGCAACAAUGUUACUCGAUACAUUGGAAGAAGGAGCUUUUGUCCUAGCUGACAAUCUUUUAGAACCAACAAGGGUCUCAAUGCCCACAGAAAAUAUUGUCCUGGAAGUUGCCGUACUCAGUACAGAAGGACAGAUCCAAGACUUUAAAUUUCCUCUGGGCAUCAAAGGAGCAGGCAGCUCAAUCCAACUGUCCGCAAAUACCGUCAAACAGAACAGCAGGAAUGGGCUUGCAAAGUUGGUGUUCAUCAUUUACCGGAGCCUGGGACAGUUCCUUAGUACAGAAAAUGCAACCAUUAAACUGGGUGCUGAUUUUAUUGGUCGUAAUAGCACCAUUGCAGUGAACUCUCACGUCAUUUCAGUUUCAAUCAAUAAAGAGUCCAGCCGAGUAUACCUGACUGAUCCUGUGCUUUUUACCCUGCCACACAUUGAUCCUGACAAUUAUUUCAAUGCAAACUGCUCCUUCUGGAACUACUCAGAGAGAACUAUGAUGGGAUAUUGGUCUACCCAGGGCUGCAAGCUGGUUGACACUAAUAAAACUCGAACAACGUGUGCAUGCAGCCACCUAACCAAUUUUGCAAUUCUCAUGGCCCACAGGGAAAUUGCAUAUAAAGAUGGCGUUCAUGAAUUACUUCUUACAGUCAUCACCUGGGUGGGAAUUGUCAUUUCCCUUGUUUGCCUGGCUAUCUGCAUCUUCACCUUCUGCUUUUUCCGUGGCCUACAGAGUGACCGAAAUACUAUUCACAAGAACCUUUGUAUCAACCUUUUCAUUGCUGAAUUUAUUUUCCUAAUAGGCAUUGAUAAGACAAAAUAUGCGAUUGCAUGCCCAAUAUUUGCAGGACUUCUACACUUUUUCUUUUUGGCAGCUUUUGCUUGGAUGUGCCUAGAAGGUGUGCAGCUCUACCUAAUGUUAGUUGAAGUUUUUGAAAGUGAAUAUUCAAGGAAAAAAUAUUACUAUGUUGCUGGUUACUUGUUUCCUGCCACAGUGGUUGGAGUUUCAGCUGCUAUUGACUAUAAGAGCUAUGGAACAGAAAAAGCUUGCUGGCUUCAUGUUGAUAACUACUUUAUAUGGAGCUUCAUUGGACCUGUUACCUUCAUUAUUCUGCUAAAUAUUAUCUUCUUGGUGAUCACAUUGUGCAAAAUGGUGAAGCAUUCAAACACUUUGAAACCAGAUUCUAGCAGGUUGGAAAACAUUAAUAAUUACCGUGUUUGUGAUGGCUACUAUAAUACGGACUUACCUGGGUCUUGGGUGCUUGGCGCUUUCGCUCUUCUGUGUCUUCUUGGCCUCACCUGGUCCUUUGGGUUGCUUUUUAUUAAUGAGGAGACUAUUGUGAUGGCAUAUCUCUUCACUAUAUUUAAUGCUUUCCAGGGAGUGUUCAUUUUCAUCUUUCACUGUGCUCUCCAAAAGAAAGUACGAAAAGAAUAUGGCAAGUGCUUCAGACACUCAUACUGCUGUGGAGGCCUCCCAACUGAGAGUCCCCACAGUUCAGUGAAGGCAUCAACCACCAGAACCAGUGCUCGCUAUUCCUCUGGCACACAGAGUCGUAUAAGAAGAAUGUGGAAUGAUACUGUGAGAAAACAAUCAGAAUCUUCUUUUAUCUCAGGUGACAUCAAUAGCACUUCAACACUUAAUCAAGGAAUGACUGGCAAUUACCUACUAACAAACCCUCUUCUUCGACCCCACGGCACUAACAACCCCUAUAACACAUUGCUCGCUGAAACAGUUGUAUGUAAUGCCCCUUCAGCUCCUGUAUUUAACUCACCAGCUACUCUUAGGCCAGAUAGCCUGAGCAGACAGACAUGAUGUGAGUUGUCCAAAGACAUUCACUGAACAAUGCCAGGGAUACAAGUGCCAUGGAUACUCUACCGCUAAAUGGUAAUUUUAACAACAGCUACUCGCUGCACAAGGGUGACUAUAAUGACAGCGUGCAAGUUGUGGACUGUGGACUAAGUCUGAAUGAUACUGCUUUUGAGAAAAUGAUCAUUUCAGAAUUAGUGCACAACAACUUACGGGGCAGCAGCAAGACUCACAACCUCGAGCUCACGCUACCAGUCAAACCUGUGAUUGGAGGUAGCAGCAGUGAAGAUGAUGCUAUUGUGGCAGAUGCUUCAUCUUUAAUGCACAGCGACAACCCAGGGCUGGAGCUCCAUCACAAAGAACUCGAGGCACCACUUAUUCCUCAGCGGACUCACUCCCUUCUGUACCAACCCCAGAAGAAAGUGAAGUCCGAGGGAACUGACAGCUAUGUCUCCCAACUGACAGCAGAGGCUGAAGAUCACCUACAGUCCCCCAACAGAGACUCUCUUUAUACAAGCAUGCCCAAUCUUAGAGACUCUCCCUAUCCGGAGAGCAGCCCUGACAUGGAAGAAGACCUCUCUCCCUCCAGGAGGAGUGAGAAUGAGGACAUUUACUAUAAAAGCAUGCCAAAUCUUGGAGCUGGCCAUCAGCUUCAGAUGUGCUACCAGAUCAGCAGGGGCAAUAGUGAUGGUUAUAUAAUCCCCAUUAACAAAGAAGGGUGUAUUCCAGAAGGAGAUGUUAGAGAAGGACAAAUGCAGCUGGUUACAAGUCUUUAAUCAUACAGCUAAGGAAUUCCAAGGGCCACAUGCGAGUAUUAAUAAAUAAAGACACCAUUGGCCUGACGCAGCUCCCUCAAACUCUGCUUGAAGAGAUGACUCUUGACCUGUGGUUCUCUGGUGUAA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2040.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2186.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 2531.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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