Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001366524.1
Sequence Length
7054 nt
GC Content
0.3775
GUCACGUGACCGCGCUCAGCCAAGGCGGCAGCGGCGGCGGCGCGAGCUUCGGCGGCGGUGGCGGCUGUGGCAGCGGGAGCAGCUGCGCCGCCAGCGUGGAGCGGGAGGCGUGUGGGUGUGGAGAAAAGGGAGCGCCAGACCGGAACGGAUGUGUAUAUCUCAUGAUUGAUAUGGAGAAACUAGUCAUGGGCCAAAGGUCAAGAUACUUCUCUGGGAAAUGUUGCUGCUGAUGCUGCUUUACAAAGUCAUACAAUGAGUGUUUGGUUUAAGAAAGAUUUUCAUACUUAAAAGAUUUUCAUCUUGGAAAUACAUCAAGUGAAAAUUAAAUUCUUUUGGGAAACAUUUUCCUUCUGAUAUAUUAUACUUGUAAUGGGCGACAUGGCAAACAACUCAGUUGCUUACAGUGGUGUGAAAAACUCUUUGAAGGAAGCUAAUCAUGAUGGAGACUUUGGAAUUACGCUCGCAGAGCUGCGGGCUCUCAUGGAGCUCAGGUCCACAGAUGCAUUACGAAAAAUACAGGAAAGCUAUGGAGAUGUCUAUGGAAUUUGCACCAAAUUGAAAACAUCUCCCAAUGAAGGUUUAAGUGGAAACCCUGCAGAUUUAGAAAGAAGAGAAGCAGUGUUUGGAAAGAAUUUUAUACCUCCUAAAAAGCCAAAAACCUUUCUUCAAUUAGUAUGGGAAGCAUUACAAGAUGUCACUUUAAUUAUAUUAGAAAUUGCAGCCAUAGUAUCAUUGGGCCUUUCUUUUUAUCAGCCUCCAGAAGGGGAUAAUGCACUUUGUGGAGAAGUUUCUGUUGGGGAGGAAGAAGGUGAAGGUGAAACUGGUUGGAUUGAAGGAGCUGCAAUCCUCUUGUCUGUAGUGUGUGUGGUGUUAGUAACAGCUUUCAAUGACUGGAGUAAGGAAAAACAGUUUAGAGGUUUGCAGAGCCGAAUUGAACAAGAACAGAAGUUCACUGUCAUCAGGGGUGGUCAGGUCAUUCAGAUACCUGUAGCUGACAUUACUGUUGGAGAUAUUGCUCAAGUGAAAUAUGGUGAUCUUCUUCCAGCUGACGGCAUACUUAUUCAAGGCAACGAUCUUAAAAUUGAUGAAAGCUCAUUGACUGGUGAAUCAGAUCAUGUUAAAAAGUCUUUAGAUAAGGAUCCCUUACUUCUAUCAGGUACUCAUGUAAUGGAAGGCUCUGGAAGAAUGGUAGUUACAGCUGUAGGUGUAAAUUCUCAAACUGGAAUUAUCUUUACCUUACUUGGAGCUGGAGGUGAAGAGGAAGAGAAGAAAGAUGAGAAGAAAAAGGAAAAGAAAAAUAAGAAACAAGAUGGAGCUAUUGAGAAUCGCAACAAAGCAAAAGCCCAGGAUGGUGCAGCCAUGGAAAUGCAGCCAUUGAAGAGUGAAGAAGGUGGAGAUGGUGAUGAAAAAGAUAAAAAGAAAGCAAAUUUGCCAAAAAAGGAAAAAUCUGUUUUACAAGGGAAACUUACAAAACUGGCUGUUCAGAUUGGCAAAGCAGGUCUGUUGAUGUCUGCCAUCACAGUUAUCAUUCUAGUAUUAUAUUUUGUCAUUGACACCUUCUGGGUUCAGAAAAGACCAUGGCUUGCUGAGUGCACACCAAUUUAUAUACAAUACUUUGUGAAGUUCUUCAUUAUUGGAGUUACAGUUUUAGUGGUCGCAGUGCCAGAAGGUCUUCCACUUGCAGUCACGAUCUCACUGGCUUAUUCAGUCAAAAAAAUGAUGAAAGAUAAUAACUUAGUAAGGCAUCUGGAUGCUUGUGAAACCAUGGGAAAUGCUACAGCUAUUUGUUCAGAUAAAACAGGAACUUUGACAAUGAACAGAAUGACAGUCGUUCAAGCUUACAUAAAUGAAAAACAUUAUAAAAAGGUUCCUGAACCAGAAGCUAUUCCACCAAAUAUUUUGUCCUAUCUUGUAACAGGAAUUUCUGUGAAUUGUGCUUAUACAUCAAAAAUAUUGCCACCAGAGAAAGAGGGUGGAUUACCUCGUCACGUUGGUAAUAAAACUGAAUGUGCCUUGUUGGGACUUCUUUUGGAUUUAAAACGGGAUUAUCAGGAUGUUAGAAAUGAAAUACCAGAAGAAGCACUGUACAAAGUCUACACCUUCAAUUCUGUUAGGAAGUCCAUGAGUACUGUCCUGAAAAAUUCAGAUGGAAGUUAUCGAAUAUUCAGCAAGGGUGCAUCUGAGAUAAUUCUGAAAAAGUGUUUCAAAAUCUUGAGUGCUAAUGGUGAGGCAAAAGUAUUCAGACCAAGGGACCGUGAUGAUAUUGUAAAAACUGUGAUUGAACCGAUGGCAUCAGAAGGCUUGAGAACCAUAUGUCUUGCAUUCAGAGAUUUUCCAGCAGGAGAACCAGAACCAGAGUGGGAUAAUGAAAAUGAUAUUGUCACCGGCCUUACAUGCAUUGCUGUUGUGGGGAUUGAAGAUCCUGUGAGACCUGAGGUGCCAGAUGCAAUUAAAAAGUGUCAGAGGGCUGGAAUUACUGUGCGGAUGGUCACUGGUGAUAAUAUUAAUACUGCUCGGGCCAUUGCUACCAAAUGUGGUAUUUUACAUCCUGGGGAAGAUUUUCUGUGCCUAGAAGGUAAAGAUUUUAACAGAAGAAUACGAAAUGAAAAAGGAGAGAUUGAGCAAGAGAGGAUAGACAAGAUUUGGCCAAAACUUCGAGUACUUGCAAGAUCAUCUCCUACUGAUAAGCAUACACUGGUUAAAGGUAUAAUUGACAGCACUGUCUCAGACCAACGCCAGGUUGUAGCUGUAACUGGUGAUGGUACAAAUGAUGGCCCAGCACUAAAGAAAGCAGAUGUUGGAUUUGCAAUGGGUAUUGCUGGAACUGAUGUAGCUAAAGAAGCAUCCGAUAUUAUUCUCACAGAUGACAACUUUACAAGCAUUGUUAAAGCAGUUAUGUGGGGACGAAAUGUCUAUGACAGCAUCUCAAAAUUCCUUCAGUUCCAACUUACUGUUAAUGUAGUAGCAGUGAUUGUUGCUUUUACGGGCGCCUGCAUUACUCAAGACUCACCGCUUAAGGCUGUGCAGAUGCUGUGGGUAAACCUCAUAAUGGAUACACUCGCUUCCCUGGCUCUGGCAACGGAACCACCCACUGAGUCUCUCUUGCUUCGGAAACCUUAUGGUAGAAAUAAGCCUCUCAUCUCACGUACAAUGAUGAAGAAUAUUUUGGGUCAUGCAUUCUAUCAACUUGUAGUAGUCUUUACACUCUUAUUUGCUGGAGAAAAGUUUUUUGACAUUGAUAGUGGAAGAAAUGCUCCUUUGCAUGCUCCUCCUUCAGAACAUUAUACUAUUGUUUUUAAUACCUUUGUGCUGAUGCAACUUUUCAACGAAAUAAAUGCCCGGAAAAUUCAUGGUGAAAGAAAUGUAUUCGAAGGAAUCUUUAACAAUGCCAUCUUCUGCACAAUUGUUUUAGGCACUUUUGUGGUACAGAUAAUAAUUGUGCAGUUUGGUGGAAAACCUUUCAGUUGUUCAGAACUUUCAAUAGAACAGUGGCUAUGGUCAAUAUUCCUAGGAAUGGGAACAUUACUCUGGGGCCAGCUUAUUUCAACAAUUCCAACUAGCCGUUUAAAAUUCCUCAAAGAAGCUGGUCAUGGAACACAAAAGGAAGAAAUACCUGAGGAGGAAUUAGCAGAGGAUGUUGAAGAGAUUGAUCACGCUGAAAGGGAGUUGCGGCGUGGCCAAAUCUUGUGGUUUAGAGGUCUGAACAGAAUCCAAACACAGAUGGAUGUAGUGAAUGCUUUCCAGAGUGGAAGUUCCAUUCAGGGGGCUCUAAGGCGGCAACCCUCCAUCGCCAGCCAGCAUCAUGAUAUUCGAGUGGUGAAUGCAUUUCGUAGUUCUUUAUAUGAAGGGUUAGAAAAACCGGAAUCAAGAAGUUCGAUUCACAACUUUAUGACACAUCCUGAGUUUAGGAUAGAAGAUUCAGAGCCUCAUAUCCCCCUUAUUGAUGACACUGAUGCCGAAGAUGAUGCUCCUACAAAACGUAACUCCAGUCCUCCACCCUCUCCCAACAAAAAUAACAAUGCUGUUGACAGUGGAAUUCACCUUACAAUAGAAAUGAACAAGUCUGCUACCUCUUCAUCCCCAGGAAGCCCACUACAUAGUUUGGAAACAUCACUCUGAUUGUAAGCUGAAUGUUAACACACUAGCUGCAUUGUAAAGAAACAAAUUGAAACUGGGUCUUUUCACAUAUUGUGAUGGACAAGCUAGUAUUCUUGUCUUUGGACUUCAACAGAAGACACACUUGUACGAAUGUAGAUUUAUUUUUUUAAAAAAAAAAAAGCAAAGCUUUCUGCCAGACUGAGGGUGCUUUUUGGGGGGUGGGAGAAAUGAACUGACAGAUAAACAGUAACUCAGCGUAAGUGACCUGUGGAUCAUCAGUAGUACCCAAGCAUGGUCCUGAACAGUGUAUUAGCAGAGCUUUAGUUUAUCUCAGUCCUGGAUGGGAGAGAGAGGGAGGAGUAAAACUGGGCAAGACAAAGAGCCCUGGAUCGUUGAAUUGAUAGUUUAAUUUCUGCUGUUGGCUGUUAAUAAUUUGGAUUAUUUAUGUUUAUAAAUGAUACAGAUCUGUUUACAAGGUUUGUAGAUACUUUUUUUGUUCCUGUUCAUAGAUGGGAAGCUUCCUUAUAACUGAUGCAGAGAAAAAUUAGUCCUUCAAAUACUGCUGUAUUUUCAGGAAAAAAAAAAAAAGGGGUGUUUCUAUUGAAACUGUACUAAAUUUUUGCCUACAAUUUACCUUGUUAAAUAUUGUAGAUAAAUUGCUAAUACUAAUAGCCAAAUAGAUAACACUAAUGCUUUGUUUAAAAAAACGAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACAUGAGCAGUGGUGUUCUAAUGAAGUUAUGACAUCUGUCCUAAUUAGUUUCUUAAAUACAUUUACUACUUAAUGGUUUUGAAGCAACUGUUUAAUUUUUAAAAUUUUUGAAAACUUGCUAAUAACCUUUUGUUCAGAAUUUAGUAGAUUGUUUAAUGCAGGACAUCAA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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1839.27 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1985.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 1868.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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