Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001370430.1
Sequence Length
4246 nt
GC Content
0.5782
ACAAAGAGUUGGCAGAUCACGGAUGGAGGGCAGCAUCUCCCAACAGCCUGGGCGGCCGCUGAGACCCAGAGAACCCAAGGACUCCCCUGGGCUCAUCCAGCAGCCUCUGCUUCCCAGGAGAGAGGUGCUGAAGUCCACGAAGAGGUGGUGACUUCCAAGAGUGACUCCGUCGGAGGAAAAUGACUCCCCAGUCGCUGCUGCAGACGACACUGUUCCUGCUGAGUCUGCUCUUCCUGGUCCAAGGUGCCCACGGCAGGGGCCACAGGGAAGACUUUCGCUUCUGCAGCCAGCGGAACCAGACACACAGGAGCAGCCUCCACUACAAACCCACACCAGACCUGCGCAUCUCCAUCGAGAACUCCGAAGAGGCCCUCACAGUCCAUGCCCCUUUCCCUGCAGCCCACCCUGCUUCCCGAUCCUUCCCUGACCCCAGGGGCCUCUACCACUUCUGCCUCUACUGGAACCGACAUGCUGGGAGAUUACAUCUUCUCUAUGGCAAGCGUGACUUCUUGCUGAGUGACAAAGCCUCUAGCCUCCUCUGCUUCCAGCACCAGGAGGAGAGCCUGGCUCAGGGCCCCCCGCUGUUAGCCACUUCUGUCACCUCCUGGUGGAGCCCUCAGAACAUCAGCCUGCCCAGUGCCGCCAGCUUCACCUUCUCCUUCCACAGUCCUCCCCACACGGCCGCUCACAAUGCCUCGGUGGACAUGUGCGAGCUCAAAAGGGACCUCCAGCUGCUCAGCCAGUUCCUGAAGCAUCCCCAGAAGGCCUCAAGGAGGCCCUCGGCUGCCCCCGCCAGCCAGCAGUUGCAGAGCCUGGAGUCGAAACUGACCUCUGUGAGAUUCAUGGGGGACAUGGUGUCCUUCGAGGAGGACCGGAUCAACGCCACGGUGUGGAAGCUCCAGCCCACAGCCGGCCUCCAGGACCUGCACAUCCACUCCCGGCAGGAGGAGGAGCAGAGCGAGAUCAUGGAGUACUCGGUGCUGCUGCCUCGAACACUCUUCCAGAGGACGAAAGGCCGGAGCGGGGAGGCUGAGAAGAGACUCCUCCUGGUGGACUUCAGCAGCCAAGCCCUGUUCCAGGACAAGAAUUCCAGCCAAGUCCUGGGUGAGAAGGUCUUGGGGAUUGUGGUACAGAACACCAAAGUAGCCAACCUCACGGAGCCCGUGGUGCUCACUUUCCAGCACCAGCUACAGCCGAAGAAUGUGACUCUGCAAUGUGUGUUCUGGGUUGAAGACCCCACAUUGAGCAGCCCGGGGCAUUGGAGCAGUGCUGGGUGUGAGACCGUCAGGAGAGAAACCCAAACAUCCUGCUUCUGCAACCACUUGACCUACUUUGCAGUGCUGAUGGUCUCCUCGGUGGAGGUGGACGCCGUGCACAAGCACUACCUGAGCCUCCUCUCCUACGUGGGCUGUGUCGUCUCUGCCCUGGCCUGCCUUGUCACCAUUGCCGCCUACCUCUGCUCCAGGGUGCCCCUGCCGUGCAGGAGGAAACCUCGGGACUACACCAUCAAGGUGCACAUGAACCUGCUGCUGGCCGUCUUCCUGCUGGACACGAGCUUCCUGCUCAGCGAGCCGGUGGCCCUGACAGGCUCUGAGGCUGGCUGCCGAGCCAGUGCCAUCUUCCUGCACUUCUCCCUGCUCACCUGCCUUUCCUGGAUGGGCCUCGAGGGGUACAACCUCUACCGACUCGUGGUGGAGGUCUUUGGCACCUAUGUCCCUGGCUACCUACUCAAGCUGAGCGCCAUGGGCUGGGGCUUCCCCAUCUUUCUGGUGACGCUGGUGGCCCUGGUGGAUGUGGACAACUAUGGCCCCAUCAUCUUGGCUGUGCAUAGGACUCCAGAGGGCGUCAUCUACCCUUCCAUGUGCUGGAUCCGGGACUCCCUGGUCAGCUACAUCACCAACCUGGGCCUCUUCAGCCUGGUGUUUCUGUUCAACAUGGCCAUGCUAGCCACCAUGGUGGUGCAGAUCCUGCGGCUGCGCCCCCACACCCAAAAGUGGUCACAUGUGCUGACACUGCUGGGCCUCAGCCUGGUCCUUGGCCUGCCCUGGGCCUUGAUCUUCUUCUCCUUUGCUUCUGGCACCUUCCAGCUUGUCGUCCUCUACCUUUUCAGCAUCAUCACCUCCUUCCAAGGCUUCCUCAUCUUCAUCUGGUACUGGUCCAUGCGGCUGCAGGCCCGGGGUGGCCCCUCCCCUCUGAAGAGCAACUCAGACAGCGCCAGGCUCCCCAUCAGCUCGGGCAGCACCUCGUCCAGCCGCAUCUAGGCCUCCAGCCCACCUGCCCAUGUGAUGAAGCAGAGAUUCGGCCUCGUCGCACACUGCCUGUGGCCCCCGAGCCCGGCCCAGCCCCAGGCCAGUCAGCCGCAGACUUUGGAAAGCCCAACGACCAUGGAGAGAUGGGCCGUUGCCAUGGUGGACGGACUCCCGGGCUGGGCUUUUGAAUUGGCCUUGGGGACUACUCGGCUCUCACUCAGCUCCCACGGGACUCAGAAGUGCGCCGCCAUGCUGCCUAGGGUACUGUCCCCACAUCUGUCCCAACCCAGCUGGAGGCCUGGUCUCUCCUUACAACCCCUGGGCCCAGCCCUCAUUGCUGGGGGCCAGGCCUUGGAUCUUGAGGGUCUGGCACAUCCUUAAUCCUGUGCCCCUGCCUGGGACAGAAAUGUGGCUCCAGUUGCUCUGUCUCUCGUGGUCACCCUGAGGGCACUCUGCAUCCUCUGUCAUUUUAACCUCAGGUGGCACCCAGGGCGAAUGGGGCCCAGGGCAGACCUUCAGGGCCAGAGCCCUGGCGGAGGAGAGGCCCUUUGCCAGGAGCACAGCAGCAGCUCGCCUACCUCUGAGCCCAGGCCCCCUCCCUCCCUCAGCCCCCCAGUCCUCCCUCCAUCUUCCCUGGGGUUCUCCUCCUCUCCCAGGGCCUCCUUGCUCCUUCGUUCACAGCUGGGGGUCCCCGAUUCCAAUGCUGUUUUUUGGGGAGUGGUUUCCAGGAGCUGCCUGGUGUCUGCUGUAAAUGUUUGUCUACUGCACAAGCCUCGGCCUGCCCCUGAGCCAGGCUCGGUACCGAUGCGUGGGCUGGGCUAGGUCCCUCUGUCCAUCUGGGCCUUUGUAUGAGCUGCAUUGCCCUUGCUCACCCUGACCAAGCACACGCCUCAGAGGGGCCCUCAGCCUCUCCUGAAGCCCUCUUGUGGCAAGAACUGUGGACCAUGCCAGUCCCGUCUGGUUUCCAUCCCACCACUCCAAGGACUGAGACUGACCUCCUCUGGUGACACUGGCCUAGGGCCUGACACUCUCCUAAGAGGUUCUCUCCAAGCCCCCAAAUAGCUCCAGGCGCCCUCGGCCGCCCAUCAUGGUUAAUUCUGUCCAACAAACACACACGGGUAGAUUGCUGGCCUGUUGUAGGUGGUAGGGACACAGAUGACCGACCUGGUCACUCCUCCUGCCAACAUUCAGUCUGGUAUGUGAGGCGUGCGUGAAGCAAGAACUCCUGGAGCUACAGGGACAGGGAGCCAUCAUUCCUGCCUGGGAAUCCUGGAAGACUUCCUGCAGGAGUCAGCGUUCAAUCUUGACCUUGAAGAUGGGAAGGAUGUUCUUUUUACGUACCAAUUCUUUUGUCUUUUGAUAUUAAAAAGAAGUACAUGUUCAUUGUAGAGAAUUUGGAAACUGUAGAAGAGAAUCAAGAAGAAAAAUAAAAAUCAGCUGUUGUAAUCACCUAGCAAACUGGCGUAAGCAUUUUGGGUCAUUUCCUUCUGAGCUUUUUCCUGUGCUUCUAUUGAAAGAGUCACUGAUACUAAUACAAAUACCUUGGGGCCAAUCAGGAAACAUGAAAGAGAGAAGAGGGCUGUGUGUGAAGAAAAAAAAAAAAUCGACUGCUGGAAACCUCAUCAACCAGGGCACAGGGGAAGAUAAAUGGCAACUUGGUGUCUGUGCUGGGGAGGCAAUGGGGAGUGGUGGGGCCUGUGGCGAACUGGAGACUCCCAACCCCAUGCUGAGAGCGUGGCUGCUCAUCAGCUCCAGCUGGUCACUACCUUGCAGGGAUGAGGGCCCAUGUAGCCAGACCACCUGCCUUUUAUGAGAAAUGGGAAAUCCAGACUGUGGUUUGACAUCCCCUGAUUUUAAAAUUUUGGCGAAUCCAAAACAUUUUCUGGCCAAAGAGAUUACAGUCAAAAGCUGCCUGGUCCUGGGAUUUAUGCAACCAGUUUACUGAUCACUCUGCAGCAGGUGGGCUGCAAGAAUUAAAUCACUGGACUUCUCUCCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1625.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1701.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 970.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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