Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001370556.1
Sequence Length
6214 nt
GC Content
0.3679
AGAGGCGCUUUCGGCUUCCAAGGGGGAAGUGCUGGGCUAUAAUUAAUGUUUUUAUUAAAUUUGGAGGGAAGUUUUUGCAGCCUUUCGCCUAGCGUGGCCUUCAGGUUGAUAGAAGUCCAGAUCCUGAGGAAAUCUCCAGCUAAAUGCUCAAAAUAUAAAAUACUGAGCUGAGAUUUGCGAAGAGCAGCAGCAUGGAUGGAUUUUAUGACCAGCAAGUGCCUUACAUGGUCACCAAUAGUCAGCGUGGGAGAAAUUGUAACGAGAAACCAACAAAUGUCAGGAAAAGAAAAUUCAUUAACAGAGAUCUGGCUCAUGAUUCAGAAGCUCAGGUACCUGACAAUGAUGAGCAGUUUGUACCAGACUAUCAGGCUGAAAGUUUGGCUUUUCAUGGCCUGCCACUGAAAAUCAAGAAAGAACCCCACAGUCCAUGUUCAGAAAUCAGCUCUGCCUGCAGUCAAGAACAGCCCUUUAAAUUCAGCUAUGGAGAAAAGUGCCUGUACAAUGUCAGUGCCUAUGAUCAGAAGCCACAAGUGGGAAUGAGGCCCUCCAACCCCCCCACACCAUCCAGCACGCCAGUGUCCCCACUGCAUCAUGCAUCUCCAAACUCAACUCAUACACCGAAACCUGACCGGGCCUUCCCAGCUCACCUCCCUCCAUCGCAGUCCAUACCAGAUAGCAGCUACCCCAUGGACCACAGAUUUCGCCGCCAGCUUUCUGAACCCUGUAACUCCUUUCCUCCUUUGCCGACGAUGCCAAGGGAAGGACGUCCUAUGUACCAACGCCAGAUGUCUGAGCCAAACAUCCCCUUCCCACCACAAGGCUUUAAGCAGGAGUACCACGACCCAGUGUAUGAACACAACACCAUGGUUGGCAGUGCGGCCAGCCAAAGCUUUCCCCCUCCUCUGAUGAUUAAACAGGAACCCAGAGAUUUUGCAUAUGACUCAGAAGUGCCUAGCUGCCACUCCAUUUAUAUGAGGCAAGAAGGCUUCCUGGCUCAUCCCAGCAGAACAGAAGGCUGUAUGUUUGAAAAGGGCCCCAGGCAGUUUUAUGAUGACACCUGUGUUGUCCCAGAAAAAUUCGAUGGAGACAUCAAACAAGAGCCAGGAAUGUAUCGGGAAGGACCCACAUACCAACGGCGAGGAUCACUUCAGCUCUGGCAGUUUUUGGUAGCUCUUCUGGAUGACCCUUCAAAUUCUCAUUUUAUUGCCUGGACUGGUCGAGGCAUGGAAUUUAAACUGAUUGAGCCUGAAGAGGUGGCCCGACGUUGGGGCAUUCAGAAAAACAGGCCAGCUAUGAACUAUGAUAAACUUAGCCGUUCACUCCGCUAUUACUAUGAGAAAGGAAUUAUGCAAAAGGUGGCUGGAGAGAGAUAUGUCUACAAGUUUGUGUGUGAUCCAGAAGCCCUUUUCUCCAUGGCCUUUCCAGAUAAUCAGCGUCCACUGCUGAAGACAGACAUGGAACGUCACAUCAACGAGGAGGACACAGUGCCUCUUUCUCACUUUGAUGAGAGCAUGGCCUACAUGCCGGAAGGGGGCUGCUGCAACCCCCACCCCUACAACGAAGGCUACGUGUAUUAACACAAGUGACAGUCAAGCAGGGCGUUUUUGCGCUUUUCCUUUUUUCUGCAAGAUACAGAGAAUUGCUGAAUCUUUGUUUUAUUUCUGUUGUUUGUAUUUUAUUUUUAAAUAAUAAUACACAAAAAGGGGCUUUUCCUGUUGCAUUAUUCUAUGGUCUGCCAUGGACUGUGCACUUUAUUUGAGGGUGGGUGGGAGUAAUCUAAACAUUUAUUCUGUGUAACAGGAAGCUAAUGGGUGAAUGGGCAGAGGGAUUUGGGGAUUACUUUUUACUUAGGCUUGGGAUGGGGUCCUACAAGUUUUGAGUAUGAUGAAACUAUAUCAUGUCUGUUUGAUUUCAUAACAACAUAAGAUAAUGUUUAUUUUAUCGGGGUAUCUAUGGUACAGUUAAUUUCACGUUGUGUAAAUAUCCACUUGGAGACUAUUUGCCUUGGGCAUUUUCCCCUGUCAUUUAUGAGUCUCUGCAGGUGUACAAAAAAACCCCAAUCUACUGUAAAUGGCAGUUUAAUUGUUAGAAAUGACUGUUUUUGCACCACUUGUAAAAAGGUAUUUAGCGAUUGCAUUUGCUGUUUGUUGUUUUAUUUUGCUUUAUAUAUGACUUGCAGAGGAUAACCAUAAAAUGGGUAAUUCUCUCUGAAGUUGAAUAAUCACCAUGACUGUAAAUGAGGGGCACAAUUUUGGACUCUGGCGCCAAACUGAGUCAUAGGCCAGUAGCAUUACGUGUAUCUGGUGCCACCUUGCUGUUUAGAUACAAAUCAUACCGUCUUUUAAAUAUUUUGAAGCCCAUUUCAGUUAAAUAAUGACAUGUCAUGGUCCUUUGGAAUCUUCAUUUAAAUGUUAAAUCUGGAAUCAAAAUGAAGCAAAAAAUAUCUGUCUCCUUUUCACUUUCUUCAGUACAUAAAUACAUUAUUUAAUCAAUAAGAAUUAACUGUACUAAAUCAUGUAUUAUGCUGUUCUAGUUACAGCAAACACUCUUUAAGAAAAAUAUCCAAUACACUAAAUAGGUACUAUAGUAAUUUUUAGACAUGGUACCCAUUGAUAUGCAUUUAAACCUUUUACUGCUGUGUUAUGUUGAUAACAUAUAUAAAUAUUAGAUAAUGCUAAUGCUUCUGCUGCUGUCUUUUCUGUAAUAUUCUCUUUCAUGCUGAAUUUACUAUGACCAUUUAUAAGCAGUGCAGUUAACUACAGAUAGCAUUUCAGGACAAAAUAGAUGACUCAAACCAUUUAUUGCUUAAAAAAUAGCUUACGCCAUGCUAUGCUAUAAGCAGCUUUUAUGCACAUUGACAAAUGAAGAGUAAGCUUCAGCUUGCUAAAGGAAACUGUGGAACCUUUUGUAACUUUUGGUGAUAUGGAAAAUUAUUUACAAACCGUCAAAGAAUAUGAGGAAGUUGCUGUAUGACAUAGUGCUGGCACUGAUAUUAUCCAUCAUCUCUUUUUGGACACUUCUGUAAAUGUGAUUGGAUUGUUUGAAAGAAGAUUUAAAGUUUCAAAGUUUUUUGUUCUGUUUUUGCUUUGCAUUUGGAGAAAAUAUUGAAAGCAGGGUAUGUUGUUUCAUUCACCUUGAAAAAACCAUGAGUAAAUGGGGAUAUAGAAUCUCUGAAUAGCUCGCUAAAAGAUUCAAGCAAGGGACAUGAAUUUUGUUCCAUCUAUCAAUAAUAUCCAGAAGAACAACUUUUUUAAAGAGUCUAUAGCAAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAUUCUAAACACAAAGUCAAAAUAAACCUAUUGUAAAAGCAUUUCGUGAUGAGCAUGAAAAAGAUUGUUUAAAGAUGAUCCCCCCAGCUACCCAUUUUCCAAAACUACACAGAUCACAGCUCAUUUCUCUAAGUGGAGCAGUUAUCAAGAAACCCAAACACCAAAAUUGCUACUCUUCACAUUUAAUCCUACAAAAAGUACUCCAAUUUCAAAAUAUGUAUGUAACCUGCGAUUUCAAUGAUUGUUGUUCAUAUACAUCAUGUAUUAUUUUGGCCCAUUUUGGGCCUAAAAAAGAAAACUAUGCCUUAAAAAUCAGAACCUUUUCUCCCCACUAUGCUUAUGUGGCCAUCUACAGCACUUAGAAUAAAAACAGAUGUUAAAAUAUUCAGUGAAAGUUUUAUUGGAAAAAGGAAUUGAGAUAUAUAAUUGAGAUUUGGUGAAAUUGAAGGAGAAAAUUUAAGUGAGUCUUUAAAAUAUAUUCUGAAUGAAAACUGUAUUGAGGAUUCAUUUUUGUUCCUUUUUUUUCUUUUUCUCUUUUCUCCUUUUUCUUCUUUUUAAUAGUCUAGUUUUAGUCAGUCAGUGAGGAAGAAUUGGGCCAUGCUAACGUUAUCACAAGAGAACAAUGGCAGAAAUGGUAUUAGUUAUAUAAUAUUUAAGGACAAACUAUAUGUUUUGCUGUUUUAACGUAGUGACUCACUGAACUAAAUACAUAAUUGACCAACAUUAAGUGUAUUUCCAAUACAGAAGGGUUGAAAAUAUUACAUUAUAAACUCUUUUGAAAAAUGUAUCUAAAAUUUUUUAAGUUCUGUUUUGAUUCCACUUUUUGGUUGAGUUUUUAUGUUUUUGUUUUCAGGUAGAUUAAUAAAUCUGGCAGCUGAUUUCUGCAAGAUUCUUGUGUUUUGAAUUUCUCAUUGAAUUGGCUACUCAAACAUAGAAAUCAUUUGUUAAUGAUGUAAUGUCUUCUCUCAGCUUUUAUCUUCACUGCUGUUUGCUGUCUCUUGAUGAUGACAUGUUAAUACCCAAUAGAUUAAUUGCAACAAACACUUAUACUCAAAUAACUAAGUAAAAAUAAUUUUUCUUGUUAUGUCCAUGAAAAGUGCUUCAGAAUAAAAAUCCACAAGACUGACAGUGCAGAACAUUUUUCUCAAAUCAUGGGCGGAUCUUGGAGGUCUAGUUUCCCGUAGAUGCUGUAACCAAUUACCACAACUUCAGUAAUUUACACAAAUUUAUCUUAUAGUUCUGGAGGCAGAAGUUCAAAAGAAGCCUUAAGAGACUAAAACCAAGAUGUCCUUAGGUCUGGUUCCUUCUGGAGGCUCCAGGGGAGAUUCUUCCAGCUUUCACUUCUAGAGUCUGCUGACAUUCCUUGGCUCCUGGCUACAUCACUUCAAUCUCUGCUUCCAUGGUCACAUACUCUUCUACUAUAGUCAAAUUUCCUUCCUGCCUCUUAUAAGGAUGCUUGUGAUUACAUUUAGGGGAUGCUCAGAUAAUCCAGGACAAUCUCUCCAUCUCAAGAUCCUUAACUUAAUGACGUGUGCCAAGUCCCUUUGGCUAGAUAAUUAUUCAUAGGUCCCAGGGAUUAGGACAUGGAUGUAAGGGGUGAGGGCAGGGCUGUUAUUCAGAACACCGCACGGAGGAGGAAGACUGUGUAGCAAAGACUCUAAUUGAUUUACUCAGGAACAGUGGAGUUCUGCUGAGGGAUCUAGGAUUUGAAAGU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1508.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1636.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 1608.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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