Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001374509.1

Sequence Length

2286 nt

GC Content

0.5647

AUGUUGAGCUCUGGCAUAGAAGAGGCUGGUGGCUAUUUUGUCCUUGGGCUGCCUGUUUUCAGGUGAGGAAGGGGAUGGUAGGAGACAGGAGACCUCUAAAGACCCCAGGUCACCAGACUUCUCUGAGCCCCAGUUUCCCCAGCAGUGUAUACGGGCUAUGUGGGGAGUAUUCAGGAGACAGACAACUCACUCGUCAAAUCCUCCCCUUCCUGGCCAACAAAGCUGCUGCAACCACAGGGAUUUCUUCUGUUCAGGCGCCAUGUCAGAACCGGCUGGGGAUGUCCGUCAGAACCCAUGCGGCAGCAAGGCCUGCCGCCGCCUCUUCGGCCCAGUGGACAGCGAGCAGCUGAGCCGCGACUGUGAUGCGCUAAUGGCGGGCUGCAUCCAGGAGGCCCGUGAGCGAUGGAACUUCGACUUUGUCACCGAGACACCACUGGAGGGUGACUUCGCCUGGGAGCGUGUGCGGGGCCUUGGCCUGCCCAAGCUCUACCUUCCCACGGGGCCCCGGCGAGGCCGGGAUGAGUUGGGAGGAGGCAGGCGGCCUGGCACCUCACCUGCUCUGCUGCAGGGGACAGCAGAGGAAGACCAUGUGGACCUGUCACUGUCUUGUACCCUUGUGCCUCGCUCAGGGGAGCAGGCUGAAGGGUCCCCAGGUGGACCUGGAGACUCUCAGGGUCGAAAACGGCGGCAGACCAGCAUGACAGAUUUCUACCACUCCAAACGCCGGCUGAUCUUCUCCAAGAGGAAGCCCUAAUCCGCCCACAGGAAGCCUGCAGUCCUGGAAGCGCGAGGGCCUCAAAGGCCCGCUCUACAUCUUCUGCCUUAGUCUCAGUUUGUGUGUCUUAAUUAUUAUUUGUGUUUUAAUUUAAACACCUCCUCAUGUACAUACCCUGGCCGCCCCCUGCCCCCCAGCCUCUGGCAUUAGAAUUAUUUAAACAAAAACUAGGCGGUUGAAUGAGAGGUUCCUAAGAGUGCUGGGCAUUUUUAUUUUAUGAAAUACUAUUUAAAGCCUCCUCAUCCCGUGUUCUCCUUUUCCUCUCUCCCGGAGGUUGGGUGGGCCGGCUUCAUGCCAGCUACUUCCUCCUCCCCACUUGUCCGCUGGGUGGUACCCUCUGGAGGGGUGUGGCUCCUUCCCAUCGCUGUCACAGGCGGUUAUGAAAUUCACCCCCUUUCCUGGACACUCAGACCUGAAUUCUUUUUCAUUUGAGAAGUAAACAGAUGGCACUUUGAAGGGGCCUCACCGAGUGGGGGCAUCAUCAAAAACUUUGGAGUCCCCUCACCUCCUCUAAGGUUGGGCAGGGUGACCCUGAAGUGAGCACAGCCUAGGGCUGAGCUGGGGACCUGGUACCCUCCUGGCUCUUGAUACCCCCCUCUGUCUUGUGAAGGCAGGGGGAAGGUGGGGUCCUGGAGCAGACCACCCCGCCUGCCCUCAUGGCCCCUCUGACCUGCACUGGGGAGCCCGUCUCAGUGUUGAGCCUUUUCCCUCUUUGGCUCCCCUGUACCUUUUGAGGAGCCCCAGCUACCCUUUUUCUCCAGCUGGGCUCUGCAAUUCCCCUCUGCUGCUGUCCCUCCCCCUUGUCCUUUCCCUUCAGUACCCUCUCAGCUCCAGGUGGCUCUGAGGUGCCUGUCCCACCCCCACCCCCAGCUCAAUGGACUGGAAGGGGAAGGGACACACAAGAAGAAGGGCACCCUAGUUCUACCUCAGGCAGCUCAAGCAGCGACCGCCCCCUCCUCUAGCUGUGGGGGUGAGGGUCCCAUGUGGUGGCACAGGCCCCCUUGAGUGGGGUUAUCUCUGUGUUAGGGGUAUAUGAUGGGGGAGUAGAUCUUUCUAGGAGGGAGACACUGGCCCCUCAAAUCGUCCAGCGACCUUCCUCAUCCACCCCAUCCCUCCCCAGUUCAUUGCACUUUGAUUAGCAGCGGAACAAGGAGUCAGACAUUUUAAGAUGGUGGCAGUAGAGGCUAUGGACAGGGCAUGCCACGUGGGCUCAUAUGGGGCUGGGAGUAGUUGUCUUUCCUGGCACUAACGUUGAGCCCCUGGAGGCACUGAAGUGCUUAGUGUACUUGGAGUAUUGGGGUCUGACCCCAAACACCUUCCAGCUCCUGUAACAUACUGGCCUGGACUGUUUUCUCUCGGCUCCCCAUGUGUCCUGGUUCCCGUUUCUCCACCUAGACUGUAAACCUCUCGAGGGCAGGGACCACACCCUGUACUGUUCUGUGUCUUUCACAGCUCCUCCCACAAUGCUGAAUAUACAGCAGGUGCUCAAUAAAUGAUUCUUAGUGACUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-902.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -940.24

Frequency: 0.0000

Diversity: 537.29

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((.(((((((((((.((((.((((....(((((((((((((.(((..((((..((((((((((.((((.(.(((((.((((((((..(((...((((...))))...)))..)))))...(((((((((((((((((((.......(((((.(.((((((.(((.(.(((..((....))..))).)..))).))))))..).)))))......)))))))........))))........((((.(((.....))).)))).)))))))).(((..((((((..(((((((((((......)))))))..(((((.(.(((((((((((.(((.((......)))))..(((.((((((((.......))).))))))))..(.((((((.(.((.((..(((((....((((.....))))....)))))((((....))))..(((((.((.(((((.(...).))))).)).))))).)).))))))))).)((((((...))))))..((((.(((((((((.(((.(((.(((((.....(((((......)))))((((.(((((((((((.(..(((((.((((((.((((((((.((((((.((...)).)))))).)))))((((.(((((.(((((....))))).)))))))))((((.............)))).)))))))))...))))).............((((..((((((...))))))))))....(((((...(((((.........)))))...))).))((((((...))))))).)))...))))))))....))))(((...((((((....((........((((((......))))))........)))))))).)))((((......((((((((((((((((....(((..................(.((((..((.(((((((((..(((((((((...))))))))).....((((......)))).))))).)))))))))).)...........)))...)))))))))))).))))))))....)))))))).)))))))))))).))))))))))))))).)........)))))((((.((((((((((((((..((((.((((.((...(((...)))...))...))))))))((((((..((((......)))))))))).........)))))......))))))))).))))(((.(((((.((((......(((((((.(((((((..((.(((...)))..))..)))).))).))))))).(((.(((((...))))).)))((((.((.((......)).)))))))))).))))))))((((((...))))))(((((.(((((((((.(((...)))...))))))))).)))))))))....))))))..))).(((((((((.....((((((((((((............)))))((((((.((..(((.(((((((.((((.............))))))))))).)))....((((((((((((.((.((.....((((....(((((....((((((.(((((...(((.((((((((.((((((((((..((((....((((.((....))))))..))))..))))).....((((..(((....)))..)))).....))))).))).)).))).)))............))))).)))))))))))..((....))(((((((((.((((......)))).....)))))))))(((((....((((((((((((((....)))).(((((..........)))))...((((...)))).)))))))))).)))))....((((...((((.((((..........))))..))))..))))...))))......)).))))))))))))))....))))))))....(((.(.(((((((..(((.((((((((.((....)))))))))).)))....))))))))))).)))))))((((((.....))))))((.((.(((((((...))))))))).)).(((((..((.(((...))).)).)))))............)))))))))))).))))).))))).))))).))))))))).))).....)))))))))))))....))))..)).)).)))))))))....................(((((......))))))).))))))))....................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((((((.{{(((((((((.((((.((((....{((((((((((((.{({..(({,..((((((((((.((((.(.(((((.((((((({,,{{,...((({..,))))..,|||..,})))}..(((((((,(((((((((((.......(((((.{.((((((.(((.{.(((..{(....})..))).}..))).))))))..,.)))))......)))))))........))))......,.((((.(((,...,))).)))).)))))))).,{{..(((((({{((..(((((((......))))))).(((.....)))(((((((.{{((,.,,.|||}.((({{,.(,{.{,{||||{...,}|.)))})),))},|{,|}}{{{{.,,,,}}}}..,,)),.,..((((.....))))))))))).|||}......(((((((.(((.(.((((((...(((.(((((((.(((((((((((((..((((((((..((((((({((((((((.(((((((((.(((.(({{(((({.....(((((......)))))((((.((((((((,{,.{{(((((,.(((((,{((({(({,,(((({{.(({{.||,|,},})})))))|{(,{(((((.(((((....))))).)))))))))}||{,,..,))),}}}}).)),})))),,}|....,,...............((((..((((((...))))))))))....{((((...(((((.........)))))...))).)}((((((...))))))..}}}...))))))))....)))){{{...((((((....,,........((((((......))))))........},)))))).)})||||,,....((((((((((((((((....(((.....,,,,.....,,..,.((((..(,{(((((((({..(((((((((...))))))))).....,{{,......,,},.))))),,))))))))),)...........},}...)))))))))))).))))}))}....}))))))).))}))))))))).)))))))).(((((((...{(,...(((((((.((((....{({..((((((......))))))...)},..))))))))))}...)),)))))))..(((....((({{{{....)))))}....))).}))).)}}})..)))))))),,.(((.(((((.((((......(((((((.(((((((..((.(((...)))..))..)))).))).))))))).(((.(((((...))))).)))((((.((.((......)).)))))))))).)))))))),||((({{..,,)))))))))))))))))}..))).)))).))))))))))))).)))).)))...))))))..|||,(((((((((...,|{{||||,(((((............)))))((((((.((..(((.((((((((((((.............))))))))))).)))....((((((((((({.((.((.....((((,,,,(((({{,,,((((((.,{(((...(((,({{((({(,((((((((((..((((..,.((({,{,...})}))))..))))..))))),....((((..(((....)))..)))),,,,.})))),)))},).))).))){{{,{{.,....}}}}}.)))))))})))},{{.,..}}{(((((((({((((....,.)))),....,)))))))}(((({....((((((({{{((((....)))).((((({(.{.{{{{,|,,,,.....|,}}}).),.))))))),,}.,)))),}}.{{||,,.((((.((((..........))))..))))..))))...))))......)).))})))))))))))....)))))))),.,{((,,(.(((((((..{(({((((((((.((....)))))))))).))..,.,))))))),)),.))))}}}{(((((.....)))))}((,({.(((((((...)))))))}}.}}.|{{{|,.||.{{{...})}.)),))))}..}},,......))))))}}}))).))))).})))).))))),}))))}))).}}}..,,.))))))))))))}....))))..)).)).)))))))))......,,........,,..(((((......)))))}).))))))))....................