Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001374510.1

Sequence Length

2140 nt

GC Content

0.5673

AUGUUGAGCUCUGGCAUAGAAGAGGCUGGUGGCUAUUUUGUCCUUGGGCUGCCUGUUUUCAGGUGAGGAAGGGGAUGGUAGGAGACAGGAGACCUCUAAAGACCCCAGGCGCCAUGUCAGAACCGGCUGGGGAUGUCCGUCAGAACCCAUGCGGCAGCAAGGCCUGCCGCCGCCUCUUCGGCCCAGUGGACAGCGAGCAGCUGAGCCGCGACUGUGAUGCGCUAAUGGCGGGCUGCAUCCAGGAGGCCCGUGAGCGAUGGAACUUCGACUUUGUCACCGAGACACCACUGGAGGGUGACUUCGCCUGGGAGCGUGUGCGGGGCCUUGGCCUGCCCAAGCUCUACCUUCCCACGGGGCCCCGGCGAGGCCGGGAUGAGUUGGGAGGAGGCAGGCGGCCUGGCACCUCACCUGCUCUGCUGCAGGGGACAGCAGAGGAAGACCAUGUGGACCUGUCACUGUCUUGUACCCUUGUGCCUCGCUCAGGGGAGCAGGCUGAAGGGUCCCCAGGUGGACCUGGAGACUCUCAGGGUCGAAAACGGCGGCAGACCAGCAUGACAGAUUUCUACCACUCCAAACGCCGGCUGAUCUUCUCCAAGAGGAAGCCCUAAUCCGCCCACAGGAAGCCUGCAGUCCUGGAAGCGCGAGGGCCUCAAAGGCCCGCUCUACAUCUUCUGCCUUAGUCUCAGUUUGUGUGUCUUAAUUAUUAUUUGUGUUUUAAUUUAAACACCUCCUCAUGUACAUACCCUGGCCGCCCCCUGCCCCCCAGCCUCUGGCAUUAGAAUUAUUUAAACAAAAACUAGGCGGUUGAAUGAGAGGUUCCUAAGAGUGCUGGGCAUUUUUAUUUUAUGAAAUACUAUUUAAAGCCUCCUCAUCCCGUGUUCUCCUUUUCCUCUCUCCCGGAGGUUGGGUGGGCCGGCUUCAUGCCAGCUACUUCCUCCUCCCCACUUGUCCGCUGGGUGGUACCCUCUGGAGGGGUGUGGCUCCUUCCCAUCGCUGUCACAGGCGGUUAUGAAAUUCACCCCCUUUCCUGGACACUCAGACCUGAAUUCUUUUUCAUUUGAGAAGUAAACAGAUGGCACUUUGAAGGGGCCUCACCGAGUGGGGGCAUCAUCAAAAACUUUGGAGUCCCCUCACCUCCUCUAAGGUUGGGCAGGGUGACCCUGAAGUGAGCACAGCCUAGGGCUGAGCUGGGGACCUGGUACCCUCCUGGCUCUUGAUACCCCCCUCUGUCUUGUGAAGGCAGGGGGAAGGUGGGGUCCUGGAGCAGACCACCCCGCCUGCCCUCAUGGCCCCUCUGACCUGCACUGGGGAGCCCGUCUCAGUGUUGAGCCUUUUCCCUCUUUGGCUCCCCUGUACCUUUUGAGGAGCCCCAGCUACCCUUUUUCUCCAGCUGGGCUCUGCAAUUCCCCUCUGCUGCUGUCCCUCCCCCUUGUCCUUUCCCUUCAGUACCCUCUCAGCUCCAGGUGGCUCUGAGGUGCCUGUCCCACCCCCACCCCCAGCUCAAUGGACUGGAAGGGGAAGGGACACACAAGAAGAAGGGCACCCUAGUUCUACCUCAGGCAGCUCAAGCAGCGACCGCCCCCUCCUCUAGCUGUGGGGGUGAGGGUCCCAUGUGGUGGCACAGGCCCCCUUGAGUGGGGUUAUCUCUGUGUUAGGGGUAUAUGAUGGGGGAGUAGAUCUUUCUAGGAGGGAGACACUGGCCCCUCAAAUCGUCCAGCGACCUUCCUCAUCCACCCCAUCCCUCCCCAGUUCAUUGCACUUUGAUUAGCAGCGGAACAAGGAGUCAGACAUUUUAAGAUGGUGGCAGUAGAGGCUAUGGACAGGGCAUGCCACGUGGGCUCAUAUGGGGCUGGGAGUAGUUGUCUUUCCUGGCACUAACGUUGAGCCCCUGGAGGCACUGAAGUGCUUAGUGUACUUGGAGUAUUGGGGUCUGACCCCAAACACCUUCCAGCUCCUGUAACAUACUGGCCUGGACUGUUUUCUCUCGGCUCCCCAUGUGUCCUGGUUCCCGUUUCUCCACCUAGACUGUAAACCUCUCGAGGGCAGGGACCACACCCUGUACUGUUCUGUGUCUUUCACAGCUCCUCCCACAAUGCUGAAUAUACAGCAGGUGCUCAAUAAAUGAUUCUUAGUGACUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-854.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -888.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 537.12

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((.(((((((((((.((((.((((....(((((((((((((.(((..((((..((((((((((.((((.(.(((((.(((((((.((....(((((.((((((...(((((((....((((((((....))((((((..(((((((((((......)))))))..(((((.(.(((((((((((.(((.((......)))))..(((.((((((((.......))).))))))))..(.((((((.(.((.((..(((((....((((.....))))....)))))((((....))))..(((((.((.(((((.(...).))))).)).))))).)).))))))))).)((((((...))))))..((((.(((((((((.(((.(((.(((((.....(((((......)))))((((.(((((((((((.(..(((((.((((((.((((((((.((((((.((...)).)))))).)))))((((.(((((.(((((....))))).)))))))))((((.............)))).)))))))))...))))).............((((..((((((...))))))))))....(((((...(((((.........)))))...))).))((((((...))))))).)))...))))))))....))))(((...((((((....((........((((((......))))))........)))))))).)))((((......((((((((((((((((....(((..................(.((((..((.(((((((((..(((((((((...))))))))).....((((......)))).))))).)))))))))).)...........)))...)))))))))))).))))))))....)))))))).)))))))))))).))))))))))))))).)........)))))((((.((((((((((((((..((((.((((.((...(((...)))...))...))))))))((((((..((((......)))))))))).........)))))......))))))))).))))(((.(((((.((((......(((((((.(((((((..((.(((...)))..))..)))).))).))))))).(((.(((((...))))).)))((((.((.((......)).)))))))))).))))))))((((((...))))))(((((.(((((((((.(((...)))...))))))))).)))))))))....))))))..(((((((((......))))))))).(((((............)))))((((((.((..(((.(((((((.((((.............))))))))))).)))....((((((((((((.((.((.....((((....(((((....((((((.(((((...(((.((((((((.((((((((((..((((....((((.((....))))))..))))..))))).....((((..(((....)))..)))).....))))).))).)).))).)))............))))).)))))))))))..((....))(((((((((.((((......)))).....)))))))))(((((....((((((((((((((....)))).(((((..........)))))...((((...)))).)))))))))).)))))....((((...((((.((((..........))))..))))..))))...))))......)).))))))))))))))....))))))))((((((.((.(((((((..(((.((((((((.((....)))))))))).)))....))))))).))..)))).))((((((.....))))))((.((.(((((((...))))))))).))..)))))).)))..))))....))))))...))))).....))))))...))).))))).))))).))))).))))))))).))).....)))))))))))))....))))..)).)).)))))))))....................(((((......))))))).))))))))....................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((((((.({(((((((((.((((.((((,...{((((((((((((.{((..({{,..((((((((((.((((.(.(((((.(((((((.((....{((((.((((((...{(({{{{....{(((((({..,,,,(((((({(((..(((((((......))))))).(((.....)))(((((((.{{((,.,,,|||}.((({{,.(,,.,,{||||{...,}|.)))})),)}},|{,|}}((((...,,|}}}..},)),....((((.....))))))))))).|||}......(((((((.(((.(.((((((...(((.(((((((.(((((((((((((..((((((((..((((((({((((((((.(((((((((.(((.(({{(((({.....(((((......)))))((((.((((((((,{,.{{(((((,.(((((,{((({(({,,(((({{.(({{.||,|,},})})))))|{(,{(((((.(((((....))))).)))))))))}||{,,..,))),}}}}).)),})))),,}|....,,...............((((..((((((...))))))))))....{((((...(((((.........)))))...))).)}((((((...))))))..}}}...))))))))....)))){{{...((((((....,,........((((((......))))))........},)))))).)})||||,,....((((((((((((((((....(((.....,,,,.....,,..,.((((..(,{(((((((({..(((((((((...))))))))).....,{{,......,,},.))))),,))))))))),)...........},}...)))))))))))).))))}))}....}))))))).))}))))))))).)))))))).(((((((...{(,...(((((((.((((....{({..((((((......))))))...}},..))))))))))}...)),)))))))..(((....{(({{{{....)))))}....))).}))).)}}})..)))))))),{.(((.(((((.((((......(((((((.(((((((..((.(((...)))..))..)))).))).))))))).(((.(((((...))))).)))((((.((.((......)).)))))))))).)))))))),||((({{..,,)))))))))))))))))}..))).)))).))))))))))))),)))).)))...))))))..(((((((((......,)))))))}.(((((............)))))((((((.((..{((.((((((((((((.............))))))))))).))}....((((((((((({.((.((.....((((,,,{(((({{,,,((((({.,{(((...(((,({{{(({(,((((((((((..((((..,.((({,{,...})}))))..))))..))))),....((((..(((....)))..)))),,,,.})))),)))},).})).)))||{,||.,....}}}}}.)))))))}}))},{{.,,.}}{(((((((({((((....,.)))),....,)))))))}(((({....((((((({{{((((....)))).((((({(.{.{{{{,|,,,,.....|,}}}).),.))))))),,}.,)))),}}.{{||,,.((((.((((..........))))..))))..))})...))))......)).))})))))))))))....)))))))){,{(((.((.(((((((..{(({((((((((.((....)))))))))).))..,.,))))))).))..)))).|,((((((.....)))))){{.{{.(((((((...))))))))).}).,)))))}.})},.})))...,))))))...))))}.....))))))...))).))))).})))).))))),}))))}))}.}}}..,,.))))))))))))}....))))..)).)).)))))))))......,,,......,,,..(((((......))))))).))))))))....................