Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001374523.1
Sequence Length
1485 nt
GC Content
0.5663
GACACUGUCCCAGCUGCCACCUAGACUCGGAGCUCCAUCCAAACCUCCAGCGAAGACAUCCCAGGUCGGGUGAAUCUUCCAGCCCUGGGGGUGGAGCCAUGGCCAUGCAGAAAAUCUUUGCCCGGGAAAUCUUGGACUCCAGGGGCAACCCCACGGUGGAGGUGGACCUGCACACGGCCAAGGGCCGAUUCCGAGCAGCUGUGCCCAGUGGGGCUUCCACGGGUAUCUAUGAGGCUCUGGAACUAAGAGACGGAGACAAAGGCCGCUACCUGGGGAAAGGAGUCCUGAAGGCUGUGGAGAACAUCAACAAUACUCUGGGCCCUGCUCUGCUGCAAAAGAAACUAAGCGUUGUGGAUCAAGAAAAAGUUGACAAAUUUAUGAUUGAGCUAGAUGGGACCGAGAAUAAGUCCAAGUUUGGGGCCAAUGCCAUCCUGGGCGUGUCCUUGGCCGUGUGUAAGGCGGGAGCAGCUGAGAAGGGGGUCCCCCUGUACCGCCACAUCGCAGAUCUCGCUGGGAACCCUGACCUCAUACUCCCAGUGCCAGCCUUCAAUGUGAUCAACGGGGGCUCCCAUGCUGGAAACAAGCUGGCCAUGCAGGAGUUCAUGAUUCUGCCUGUGGGAGCCAGCUCCUUCAAGGAAGCCAUGCGCAUUGGCGCCGAGGUCUACCACCACCUCAAGGGGGUCAUCAAGGCCAAGUAUGGGAAGGAUGCCACCAAUGUGGGUGAUGAAGGUGGCUUCGCACCCAACAUCCUGGAGAACAAUGAGGCCCUGGAGCUGCUGAAGACGGCCAUCCAGGCGGCUGGUUACCCAGACAAGGUGGUGAUCGGCAUGGAUGUGGCAGCAUCUGAGUUCUAUCGCAAUGGGAAGUACGAUCUUGACUUCAAGUCGCCUGAUGAUCCCGCACGGCACAUCACUGGGGAGAAGCUCGGAGAGCUGUAUAAGAGCUUUAUCAAGAACUAUCCUGUGGUCUCCAUCGAAGACCCCUUUGACCAGGAUGACUGGGCCACUUGGACCUCCUUCCUCUCGGGGGUGAACAUCCAGAUUGUGGGGGAUGACUUGACAGUCACCAACCCCAAGAGGAUUGCCCAGGCCGUUGAGAAGAAGGCCUGCAACUGUCUGCUGCUGAAGGUCAACCAGAUCGGCUCGGUGACCGAAUCGAUCCAGGCGUGCAAACUGGCUCAGUCUAAUGGCUGGGGGGUGAUGGUGAGCCACCGCUCUGGGGAGACUGAGGACACAUUCAUUGCUGACCUUGUGGUGGGGCUCUGCACAGGACAGAUCAAGACUGGCGCCCCCUGCCGCUCGGAGCGUCUGGCCAAAUACAACCAACUCAUGAGGAUCGAGGAGGCUCUUGGGGACAAGGCAAUCUUUGCUGGACGCAAGUUCCGUAACCCGAAGGCCAAGUGAGAAGCUGGAGGCUCCAGGACUCCACUGGACAGACCCAGGUCUUCCAGACCUGCUUCCUGAAAUAAACACUGGUGCCAACCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-567.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -596.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 260.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((((((..((.......(((......)))..(((((((.((...((.(((((((.(.((........)).).)))))))))(((((((.((((..(((((.....)))))...))...)).))).)))).((((...)))).)).))))))).(.(((((((((((((((((((...((((((((..(.((((((.((((.....))))))))))....)..)))).))))...((((..(..((......((((..(((.((((......))))..)))..))))......))..)....)))).((((((((..((((.............))))..)))).((((..(.(((((....))))).)..)))).((((((.((((.........))))..)))))))))).(((((......))))))))))))))))))))).))))))..)))))))...(((((((((.(((((...((((((((.((.....((((((((....((....))...))))))))...((((.((.(((..((..((((((((.((.((..(((.....(((((((..(((((((.........)).)))))..).)))))))))..)).)).))))..((((....)))).(((((........)))))..((.((.((((....(((....)))....)))))).)).(((((((((.(((((....)))))))))).))))))))))..))).))))))((((((...((((....))))..))))))..(((((((((((.......).)))))))))).)))))))))).(((...((((((((((((((.((..(((((((.((((....)))))))(((.(...((((.((.(((......(((((......)))))((((((.......))))))...............((((((.(((((....(((((((.(.(((....((((((((((.(((.((..(((((((((..(((((.........((((((.(((.....))).))))))....))))).))))))..((.(((((.((((((........)).)))).)))))..))....((....)).((((((.((((...)))).)))))).))).)).)))..))))))))))...)))).)))))))))))).)).)))).))).))))))...).)))..........))))..)))))))))))))))))))))))).........((.(((((.....))))).))(((((.((((((.............(((((..((.(((.((.((..((((.(..((..((((...))))))..).))))..))....)))))...))..)))))..)))))).))))).))))))).))))))))...(((((((...))))))).................((((....)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((((((((((..((.......(({...,,.|||..(((((((.((...,,.(((((((.,,((.......,)).).)))))))}|(((((((.{{((..(((((.....)))))..,)}...}}.))).)))),((((...)))).)).))))))),|,(((((((((((((((((((.,.((((((((..(.((((((.((((,...,)))))))))}....}..)))).))))...,{{{.,({,(,......((((..(((.((((......))))..}))..))))......}}..,....)))),((((((((,,,,,,,,...........,,||{{.{((.((((..,.(((((....))))).}..)))).)}}|}|,((((.........)))).,}},,)))))).(((((......))))))))))))))))))))),,)).))..)))))))....(((((,(((({,((.....(((((.(.((....((((((((....{{....}}...))))))))..,,.)).).)))))....)))))))))))).{(((((........},.))).))}(((((((.(((,{(((((((((((((((..{.((..(((((..(((.,((((....)))).,.))}....((((((((...{(,((.((((....(((....)))....)))))).)).(((((((((.(((((....))))))))))},))).((((.(...(((.((.(((((((...((((....))))..)))))).).)).))).)))))...)))))))).(((((((((((((((((((.((((((((((.((.(,,{,,(((({.({....||}}}}).,)}|}|{{({((..{({....))..)}))}.})}))))}})))))))..)))))...{(..{{{....,}}..}}.((((.,(((((((.{({...(((((((.(.(((....((((((((((.(((.((..{{,((((((.,((({(......,{,{{{{{|,|{(,.,,,||}.}})))),,}.,)))).)))))),{({.,(((((.{{.....,,.))))))}},..{{{{{,....,..||,,..||.((((((.((((...)))).)))))),))),)).))}..))))))))))...)))).)))))))..|{{{(,,,}}}})})),},))))))),)))))))))))),})))))))))).)).}.)))))).)))))).))))))).((.(((({.....})))).))(((((.((((((.............(((((..((.(((.({.((..((((.(..(,.{((({...})))))..).))))..))....)))))...))..)))))..)))))).))))).)))))))...))))))...(((((((...))))))).................((((....)))).
Back