Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001374524.1

Sequence Length

1468 nt

GC Content

0.5674

AACUCAUCCCGGCGCUGGCUGGCCUGGAGAGGGUAGGAUGGGGCGGCGCCGAGAAUGGCCGUUAUGAGGACCCUAAGAGCCAUGGCCAUGCAGAAAAUCUUUGCCCGGGAAAUCUUGGACUCCAGGGGCAACCCCACGGUGGAGGUGGACCUGCACACGGCCAAGGGCCGAUUCCGAGCAGCUGUGCCCAGUGGGGCUUCCACGGGUAUCUAUGAGGCUCUGGAACUAAGAGACGGAGACAAAGGCCGCUACCUGGGGAAAGGAGUCCUGAAGGCUGUGGAGAACAUCAACAAUACUCUGGGCCCUGCUCUGCUGCAAAAGAAACUAAGCGUUGUGGAUCAAGAAAAAGUUGACAAAUUUAUGAUUGAGCUAGAUGGGACCGAGAAUAAGUCCAAGUUUGGGGCCAAUGCCAUCCUGGGCGUGUCCUUGGCCGUGUGUAAGGCGGGAGCAGCUGAGAAGGGGGUCCCCCUGUACCGCCACAUCGCAGAUCUCGCUGGGAACCCUGACCUCAUACUCCCAGUGCCAGCCUUCAAUGUGAUCAACGGGGGCUCCCAUGCUGGAAACAAGCUGGCCAUGCAGGAGUUCAUGAUUCUGCCUGUGGGAGCCAGCUCCUUCAAGGAAGCCAUGCGCAUUGGCGCCGAGGUCUACCACCACCUCAAGGGGGUCAUCAAGGCCAAGUAUGGGAAGGAUGCCACCAAUGUGGGUGAUGAAGGUGGCUUCGCACCCAACAUCCUGGAGAACAAUGAGGCCCUGGAGCUGCUGAAGACGGCCAUCCAGGCGGCUGGUUACCCAGACAAGGUGGUGAUCGGCAUGGAUGUGGCAGCAUCUGAGUUCUAUCGCAAUGGGAAGUACGAUCUUGACUUCAAGUCGCCUGAUGAUCCCGCACGGCACAUCACUGGGGAGAAGCUCGGAGAGCUGUAUAAGAGCUUUAUCAAGAACUAUCCUGUGGUCUCCAUCGAAGACCCCUUUGACCAGGAUGACUGGGCCACUUGGACCUCCUUCCUCUCGGGGGUGAACAUCCAGAUUGUGGGGGAUGACUUGACAGUCACCAACCCCAAGAGGAUUGCCCAGGCCGUUGAGAAGAAGGCCUGCAACUGUCUGCUGCUGAAGGUCAACCAGAUCGGCUCGGUGACCGAAUCGAUCCAGGCGUGCAAACUGGCUCAGUCUAAUGGCUGGGGGGUGAUGGUGAGCCACCGCUCUGGGGAGACUGAGGACACAUUCAUUGCUGACCUUGUGGUGGGGCUCUGCACAGGACAGAUCAAGACUGGCGCCCCCUGCCGCUCGGAGCGUCUGGCCAAAUACAACCAACUCAUGAGGAUCGAGGAGGCUCUUGGGGACAAGGCAAUCUUUGCUGGACGCAAGUUCCGUAACCCGAAGGCCAAGUGAGAAGCUGGAGGCUCCAGGACUCCACUGGACAGACCCAGGUCUUCCAGACCUGCUUCCUGAAAUAAACACUGGUGCCAACCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-564.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -593.20

Frequency: 0.0000

Diversity: 396.66

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........(((((.((.((((((((.....((((...(((((((.(((((((((...(((........(.(((((((((((..(((((((((((.....)))))(((((....))))).(((((((((...))))....))))))))).))(((((((((((((((((...((((((((..(.((((((.((((.....))))))))))....)..)))).))))...((((..(..((......((((..(((.((((......))))..)))..))))......))..)....)))).((((((((..((((.............))))..)))).((((..(.(((((....))))).)..)))).((((((.((((.........))))..)))))))))).(((((......)))))))))))))))))))))).(((.(((((..(((((.(((((((.(((((((...((((((((.((.....((((((((....((....))...))))))))...((((.((.(((..((..((((((((.((.((..(((.....(((((((..(((((((.........)).)))))..).)))))))))..)).)).))))..((((....)))).(((((........)))))..((.((.((((....(((....)))....)))))).)).(((((((((.(((((....)))))))))).))))))))))..))).))))))((((((...((((....))))..))))))..(((((((((((.......).)))))))))).)))))))))).(((...((((((((((((((.((..(((((((.((((....)))))))(((.(...((((.((.(((......(((((......)))))((((((.......))))))...............((((((.(((((....(((((((.(.(((....((((((((((.(((.((..(((((((((..(((((.........((((((.(((.....))).))))))....))))).))))))..((.(((((.((((((........)).)))).)))))..))....((....)).((((((.((((...)))).)))))).))).)).)))..))))))))))...)))).)))))))))))).)).)))).))).))))))...).)))..........))))..)))))))))))))))))))))))).............)).)))))))....))))).)).))).)))............(((((....)).)))..))))))))))).)..)))..))))....)).)))..))))))).))))..))))).))).))..))))).(((.((((.........(((.((...(((((((...))))))))))))...........)))).)))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

........(((((.((.((((((((.....((((...(((((((.(((((({({.,.(((.......,{.(((((((((((.((((({,(({({.....}}|||(((((....}}}}}.(((({(|({||.|||(..({(((,((((({(((((((((((((((((((.,.((((((((..(.((((((.((((,...,)))))))))}....}..)))).))))...,{{{.,({,(,......((((..(((.((((......))))..}))..))))......}}..,....)))),((((((((,,,,,,,,...........,,||{{.{((.((((..,.(((((....))))).}..)))).)}}|}|,((((.........)))).,}},,)))))).(((((......))))))))))))))))))))),,(({(({{,(,,{{....,|({|,||||||}{|.|||,|,,{{,{{{{..,.((((((((....{{....}}...))))))))..}},}}}}..)))),....,}}|||{||{{.{({{({.....,{|||||{,.{{{{{((....,,,,,|||||||||,|{|||,}||{(,.|||||.,|||..((((....))))..,)))))}}|,|||||,...,|}||,{{{{..,,{{{....})),..,)))|||{||.(((((((((.(((((....))))))))))},))).((((.{...(((.((.(((((((...((((....))))..)))))).).)).))).}))))...,))))))}.(((((((((((((((((((.((((((((((.((.(,,{,,({(((.({...,||}}}}).,)}|}|{{({((..{({....))..)}))}.})}))))}})))))))..)))))...,(..{{{....,}}..}}.((((.,(((((((.{({...(((((((.(.(((....((((((((((.(((.((..{{,((((((.,((({(......,{,{{{{{|,|{(,.,,,||}.}})))),,}.,)))).)))))),{({.,(((((.{{.....,,.))))))}},..{{{{{,....,..||,,..||.((((((.((((...)))).)))))),))),)).))}..))))))))))...)))).)))))))..|{{{(,,,}}}})})),},))))))),)))))))))))),})))))||}}|{||{|{|||,}|{|,|||,.,,,,,,,.,,))))})))))}})))})}.))})},},)})))}...........(((,{....,}.)))..))))))))))).}..))),.}})},..})).)))..))))))).))))..))))),,)).))..))))).(((.((((.......,,|||,((,..(((((((...))))))),,))),}.........}})),)))..,,..