Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001376378.1
Sequence Length
8240 nt
GC Content
0.4775
GUGUUCUGCUCUGGCGGCAGCGGCAGCGGCGGCGGGACGCGGAGGCUCCCCCGGGAUUCGGCCUCAGCAGCGAGGCGGCGGCGGCGGCUGCGGAGGCGCAGGCAGCAACUGAGGCAGCGGCAGGCUCAGGUGCAGCCGCUGGCUGGAGUGCAGUGGUGUGUUCUCAGCUCUGCAGCCCCCGCUUCCCAGGUUCAAGUAACUGCCUCAGCCUUCUGAGUAGCUGGGAUUACAGGUGUGCACCACCACGCCCAGGCUGAACAUAACUUCUUUUUUUCAAAGUUCCCUGUGUUGUGAACUGAGCUUGGGUGAAGUGAAAUCUUUGAGGAAGCUAAAGCUGUGUGUAUUUGUGGAUCAGACAAGUGCAGCAAGUUAAUAUCAUUGGCUUCUGAAGGGGAGAGUGAGGUGAUGGCUGCGUUUAAGUUGGAUUUCCUUCCAGAAAUGAUGGUGGAUCAUUGCUCUUUGAAUUCCAGUCCCGUCUCAAAGAAAAUGAACGGCACCCUGGACCACCCAGACCAACCAGAUCUUGAUGCUAUCAAGAUGUUUGUGGGCCAGGUUCCAAGGACCUGGUCUGAAAAGGACUUGCGGGAACUCUUCGAACAGUAUGGUGCUGUGUAUGAAAUCAACGUCCUAAGGGAUAGGAGCCAAAACCCGCCUCAGAGCAAAGGGUGCUGUUUUGUUACAUUUUACACCCGUAAAGCUGCAUUAGAAGCUCAGAAUGCUCUUCACAACAUGAAAGUCCUCCCAGGGAUGCAUCACCCUAUACAGAUGAAACCUGCUGACAGUGAGAAGAACAAUGCAGUGGAAGACAGGAAGCUGUUUAUUGGUAUGAUUUCCAAGAAGUGCACUGAAAAUGACAUCCGAGUCAUGUUCUCUUCGUUUGGACAGAUUGAAGAAUGCCGGAUAUUGCGGGGACCUGAUGGCCUGAGCCGAGGUUGUGCAUUUGUGACUUUUACAACAAGAGCCAUGGCACAGACGGCUAUCAAGGCAAUGCACCAAGCACAGACCAUGGAGGGUUGCUCAUCACCCAUGGUGGUAAAAUUUGCUGAUACACAGAAGGACAAAGAACAGAAGAGAAUGGCCCAGCAGCUCCAGCAGCAGAUGCAGCAAAUCAGCGCAGCAUCUGUGUGGGGAAACCUUGCUGGUCUAAAUACUCUUGGACCCCAGUAUUUAGCACUUUAUUUGCAGCUCCUUCAGCAGACUGCCUCCUCUGGGAACCUCAACACCCUGAGCAGCCUCCACCCAAUGGGAGGGUUGAAUGCAAUGCAGUUACAGAAUUUGGCUGCACUAGCUGCUGCAGCUAGUGCAGCUCAGAACACACCAAGUGGUACCAAUGCUCUCACUACAUCCAGCAGUCCCCUCAGCGUGCUCACUAGUUCAGGGUCCUCACCUAGCUCUAGCAGCAGUAAUUCUGUCAACCCCAUAGCCUCACUUGGAGCCCUGCAGACAUUAGCUGGAGCAACGGCUGGCCUCAAUGUUGGCUCUUUGGCAGGAAUGGCUGCUUUAAAUGGUGGCCUGGGCAGCAGUGGCCUUUCCAAUGGCACCGGGAGCACCAUGGAGGCCCUCACUCAGGCCUACUCGGGUAUCCAGCAAUAUGCUGCUGCUGCGCUCCCCACUCUGUACAACCAGAAUCUUCUGACACAGCAGAGUAUUGGUGCUGCUGGAAGCCAGAAGGAAGGUCCAGAGGGAGCCAACCUGUUCAUCUACCACCUGCCCCAGGAGUUUGGUGAUCAGGACCUGCUGCAGAUGUUUAUGCCCUUUGGGAAUGUCGUGUCUGCCAAGGUUUUCAUAGACAAGCAGACAAACCUGAGCAAGUGUUUUGGUUUUGUAAGUUACGACAAUCCUGUUUCGGCCCAAGCUGCCAUCCAGUCCAUGAACGGCUUUCAGAUUGGCAUGAAGCGGCUUAAAGUGCAGCUCAAACGUUCGAAGAAUGACAGCAAGCCCUACUGAGCGUGCUCCCCUCUGAGACUGGAGUGAGAGGGUCUUCUGGUAAGUGGGGGAGGAGCACCCUUAAUGAUUCGAAGCCCUGAGGCUGUGUGUUGACAGCCCUGGACCCUGAUCCCUGCCACUCUCGCAGGCACAGCUUGCCCUGAAGACUCGGCUACUGCCUUCUGUGGGAGUUUCGCUUCGUACAGAGGACAAGUUUGUGCUUUGGUUUCCAGUGUUUUACUUUGGAGUUUAGGUGCCAUAUCCUGAGGUUUUUUUUGUUUUUGUUUUUGUUUCUCCUUUAUUUAAAGUUUGCUGUGUUUGUAACCAGUGUGUGUUGAGAAGGACCAACACCAAACCACCCUGGGGAAGGGGGACAGGGAAACAUUUAACACAGACGAUGAUCAGGAUUUGCCCCAAACCACCCCAAGAGAGAGGACUGAGUGGAACAAAAAAGUGACCCCCAGAACCUCUCUUAGUGUGAGGGUGGGUAGAAUGAGAACUGACACCUGGGAGCUGUGGGGAGCAGAGCGGCUUUGGGGAAGAGUGGAGUGACUAGACACCUAAUGCCCUGGCAGCUGGAGACUCAAACUCCUGUACAGCUACCUUCUGGGAAAUAGUUUUUGACACCUAUUUUUCAGAUUCUUGUCCGGAAUUUCUGCUGCUCUUUUCAAAAAAGGGCAUUAACAAUUCUCUGGAAAUAAAGCACCUGUUAGCCUGACAUAUGCAAAAAGCAGGGCGGCAUCACCCAUUACGAGCUCCCCCAGCCAGCAGUCAGUAUUGGAUUGGCCUUGCCUGGCUGGUGGCAGUUUGGGAGAAACAGCCAAAGAGGUUAGUUUAUUUCAACACCAAAUUAGACCAUGGCCCAUUUCCAACGGGUCUCUUUAAAGGCCUCUAUGGAAUACAUUGCCUGGUUUCCUUCUUUGCAGUUCACCACAGCAAGGAAUGUCACCUCCAUCCCAAGCCACCAUUUUCUCAUGAAGGCAAAUCCAAGAAGGGCUUGCAGUUCUUGCUGAAGGGGGUACCAUUUGUGGGCAGAGUGAUCAAUACCAUCUAGUUGGGGGAGGAGGAGCUUAUUUCUUGGUGUACUUGAAUCAGAAGGUCCCUGCAAGCCAGUAUGCUUCAUUUGCCAGUGGCCAGAAAUUCUCCCUUGCCUCCUUGAUUGAGGUGUCCCAGAUGUAGUAUUCCCACAGGGGUCUGGCAGGCCCCUCCUGUAACCACUCCAGUCACAUUUUCUGCUCUUGAGGCAGAGGUGACAUCAGGACGUUUACAGCCUCCACAUGAAUUGAGUGUUCAUUUACCUCAGUAUUACCGUGUUCAUUUUUGUCCUCGUGCUACAGUUAGCUCCCUGCCGCCUCUUGCAGGUCUUACUUCAGCUCUUGCCUGUGACCCACACAGCUUCUGGGCUCUGCCUCUGCUCUAAGAAGUGCUGUGGGGGUAGAGAACCAGGAAGGACAUGCUGUUGGGAAUGUACACCUGGGCAGAGGUGGCCCUGUUAAGAUGUGACUGUAGCCACAGCCAGGGAUGGGAUCCCUGGGUCUCUGGAAUCUGAAACCUCAACAAAUACCAGUCUUGACCCCUAGCAGCAGAGAUAAGAAUAAAGGGGUUGGUUUGCUAUUAAGUCAGAUGGGGGCUCUCUCCUUGUCAUGCUGUCCCUGUGGGUAACAGACAGGGAUUGACCAUCUUACUGUUGUACAGGUAGCUGGUGGUGUUGGAUUAUCCCAUUGAAGCUGGGACAGCUGUUCCUUUCUCAUAGUGAUAACUUGGGUCUGUUGUCCUCUAAGGAACGUGAAACAUACACUUCUUAAGCUGAACCACGUAAACUUGAAAUUCUGCGCACUGGGAGAAAUGUGUCCUGUGUUUCAAAGGAUAAAACUGUUCUAAAGGCUUCCAGGGUCAUGAUGGGAUUUUUUAAAUAAAUGCAAAAAAUAAAAAUAAAAAAGAAAAAAGAAAACAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAUGCUAGGUUGGGGAGGCGCUGUUCUGAAUCCCAACCGGCUGGAACCAAGAAUGUCGUUUCUAUUUUUAUAGAAGUUUUAUACAGCUCCGGGGUGGAGAAUAUUUAUUACCUAAAUUAUAUCUCUGGAAAAGGCCAGGAUUUUGUAGAAUCCAGAAUGUGAUUGUUAUACACACAGGGUGCUGUGUAUGAUUGAAACUACUGACUUUCUGUGGCCCGUUUGCAGCCCAGCUAACCUGCCCAAGGGGAAGGUGUUAAUGCUGUGAAUUGGCAGAGGAGAGAGCUGUGCUCCAUAGGGUGCUGCCGGUGCUGUGCUCCCUAGCCUUCUGUUCUGUCUUCCUCCUUAGCCAGAACGCCACUCCCUUCCCACAUCCCCUUCUUCUCUCCGCCUUCCCCCAUCUCACCAUUAUUUGUCCAUGGAUUUGUCCUGGGCUCUGGGACCUUAUGAAACCCCUUUCCUAAUGACAUAAGAGGCCAAGGUGCAAUCCACCCACCUUUGAUACCAGACCCUGAGGGCUUCAUACCUGCUGAUGGGUUUUCUUUUCUAAAAGGAAUGCUCGCCCCAGCAGGGUCCUGGGCUGCUUGAGCAGCCAGCUGGUGAGACCAUGCACUUCUCUGUUCUCUCCUCCCCCUGCCCAGUGAGUUAGCACAGCAGUAGCACUGCCCUUGAGCACAGUUCUUUCCCCAGGCCAAAGAUGGUUUUGUGAAGAAGCUGCUCCCCUACAAGUCUCACGUGUGAAAGGGCUCAGCUCAGAGUGGAGACUCGCUGUCAAGUCUUAAGCAAUCCUUUUCUGUUGUGUGAAGGUUUCACUUACAAUGUGUUUUCUGCUGUAGUUUUGUUUCUUACUUGGGUUACAUCAUGAAAUUGAUUUGCCUUGAAUGCAGCCAGACCACUGUCUCCUGGGUUCCCCUUGAGUGGCCAGGGCCUGGAUGGAAGCUAAGAGCUUGGAUUUCUGGGAACAAAGGGCCAUCCCCAUAAGAUUGAGCAGAAAUUCUGGUCCUCUUCCCUGAAAAAUUUUCCCCACCCCAGCCAGCAUCUUCUGCUUCCCCUUGGGUUGUGACCAGGGAGUGGGGAGAGAGGCUGAGGCUCUGCUCCCCUGGAGAC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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2752.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2909.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 2135.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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