Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001376412.1
Sequence Length
6345 nt
GC Content
0.4725
GUGUUCUGCUCUGGCGGCAGCGGCAGCGGCGGCGGGACGCGGAGGCUCCCCCGGGAUUCGGCCUCAGCAGCGAGGCGGCGGCGGCGGCUGCGGAGGCGCAGGCAGCAACUGAGGCAGCGGCAGGCUCAGGUGCAGCCGCUGGCUGAACAUAACUUCUUUUUUUCAAAGUUCCCUGUGUUGUGAACUGAGCUUGGGUGAAGUGAAAUCUUUGAGCUCAAAGAAAAUGAACGGCACCCUGGACCACCCAGACCAACCAGAUCUUGAUGCUAUCAAGAUGUUUGUGGGCCAGGUUCCAAGGACCUGGUCUGAAAAGGACUUGCGGGAACUCUUCGAACAGUAUGGUGCUGUGUAUGAAAUCAACGUCCUAAGGGAUAGGAGCCAAAACCCGCCUCAGAGCAAAGGGUGCUGUUUUGUUACAUUUUACACCCGUAAAGCUGCAUUAGAAGCUCAGAAUGCUCUUCACAACAUGAAAGUCCUCCCAGGGAUGCAUCACCCUAUACAGAUGAAACCUGCUGACAGUGAGAAGAACAAUGCAGUGGAAGACAGGAAGCUGUUUAUUGGUAUGAUUUCCAAGAAGUGCACUGAAAAUGACAUCCGAGUCAUGUUCUCUUCGUUUGGACAGAUUGAAGAAUGCCGGAUAUUGCGGGGACCUGAUGGCCUGAGCCGAGGUUGUGCAUUUGUGACUUUUACAACAAGAGCCAUGGCACAGACGGCUAUCAAGGCAAUGCACCAAGCACAGACCAUGGAGGGUUGCUCAUCACCCAUGGUGGUAAAAUUUGCUGAUACACAGAAGGACAAAGAACAGAAGAGAAUGGCCCAGCAGCUCCAGCAGCAGAUGCAGCAAAUCAGCGCAGCAUCUGUGUGGGGAAACCUUGCUGGUCUAAAUACUCUUGGACCCCAGUAUUUAGCACUUUAUUUGCAGCUCCUUCAGCAGACUGCCUCCUCUGGGAACCUCAACACCCUGAGCAGCCUCCACCCAAUGGGAGGGUUGAAUGCAAUGCAGUUACAGAAUUUGGCUGCACUAGCUGCUGCAGCUAGUGCAGCUCAGAACACACCAAGUGGUACCAAUGCUCUCACUACAUCCAGCAGUCCCCUCAGCGUGCUCACUAGUUCAGCAGGGUCCUCACCUAGCUCUAGCAGCAGUAAUUCUGUCAACCCCAUAGCCUCACUUGGAGCCCUGCAGACAUUAGCUGGAGCAACGGCUGGCCUCAAUGUUGGCUCUUUGGCAGGAAUGGCUGCUUUAAAUGGUGGCCUGGGCAGCAGUGGCCUUUCCAAUGGCACCGGGAGCACCAUGGAGGCCCUCACUCAGGCCUACUCGGGUAUCCAGCAAUAUGCUGCUGCUGCGCUCCCCACUCUGUACAACCAGAAUCUUCUGACACAGCAGAGUAUUGGUGCUGCUGGAAGCCAGAAGGAAGGUCCAGAGGGAGCCAACCUGUUCAUCUACCACCUGCCCCAGGAGUUUGGUGAUCAGGACCUGCUGCAGAUGUUUAUGCCCUUUGGGAAUGUCGUGUCUGCCAAGGUUUUCAUAGACAAGCAGACAAACCUGAGCAAGUGUUUUGGUUUUGUAAGUUACGACAAUCCUGUUUCGGCCCAAGCUGCCAUCCAGUCCAUGAACGGCUUUCAGAUUGGCAUGAAGCGGCUUAAAGUGCAGCUCAAACGUUCGAAGAAUGACAGCAAGCCCUACUGAGCGUGCUCCCCUCUGAGACUGGAGUGAGAGGGUCUUCUGGUAGCUGGUGGUGUUGGAUUAUCCCAUUGAAGCUGGGACAGCUGUUCCUUUCUCAUAGUGAUAACUUGGGUCUGUUGUCCUCUAAGGAACGUGAAACAUACACUUCUUAAGCUGAACCACGUAAACUUGAAAUUCUGCGCACUGGGAGAAAUGUGUCCUGUGUUUCAAAGGAUAAAACUGUUCUAAAGGCUUCCAGGGUCAUGAUGGGAUUUUUUAAAUAAAUGCAAAAAAUAAAAAUAAAAAAGAAAAAAGAAAACAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAUGCUAGGUUGGGGAGGCGCUGUUCUGAAUCCCAACCGGCUGGAACCAAGAAUGUCGUUUCUAUUUUUAUAGAAGUUUUAUACAGCUCCGGGGUGGAGAAUAUUUAUUACCUAAAUUAUAUCUCUGGAAAAGGCCAGGAUUUUGUAGAAUCCAGAAUGUGAUUGUUAUACACACAGGGUGCUGUGUAUGAUUGAAACUACUGACUUUCUGUGGCCCGUUUGCAGCCCAGCUAACCUGCCCAAGGGGAAGGUGUUAAUGCUGUGAAUUGGCAGAGGAGAGAGCUGUGCUCCAUAGGGUGCUGCCGGUGCUGUGCUCCCUAGCCUUCUGUUCUGUCUUCCUCCUUAGCCAGAACGCCACUCCCUUCCCACAUCCCCUUCUUCUCUCCGCCUUCCCCCAUCUCACCAUUAUUUGUCCAUGGAUUUGUCCUGGGCUCUGGGACCUUAUGAAACCCCUUUCCUAAUGACAUAAGAGGCCAAGGUGCAAUCCACCCACCUUUGAUACCAGACCCUGAGGGCUUCAUACCUGCUGAUGGGUUUUCUUUUCUAAAAGGAAUGCUCGCCCCAGCAGGGUCCUGGGCUGCUUGAGCAGCCAGCUGGUGAGACCAUGCACUUCUCUGUUCUCUCCUCCCCCUGCCCAGUGAGUUAGCACAGCAGUAGCACUGCCCUUGAGCACAGUUCUUUCCCCAGGCCAAAGAUGGUUUUGUGAAGAAGCUGCUCCCCUACAAGUCUCACGUGUGAAAGGGCUCAGCUCAGAGUGGAGACUCGCUGUCAAGUCUUAAGCAAUCCUUUUCUGUUGUGUGAAGGUUUCACUUACAAUGUGUUUUCUGCUGUAGUUUUGUUUCUUACUUGGGUUACAUCAUGAAAUUGAUUUGCCUUGAAUGCAGCCAGACCACUGUCUCCUGGGUUCCCCUUGAGUGGCCAGGGCCUGGAUGGAAGCUAAGAGCUUGGAUUUCUGGGAACAAAGGGCCAUCCCCAUAAGAUUGAGCAGAAAUUCUGGUCCUCUUCCCUGAAAAAUUUUCCCCACCCCAGCCAGCAUCUUCUGCUUCCCCUUGGGUUGUGACCAGGGAGUGGGGAGAGAGGCUGAGGCUCUGCUCCCCUGGAGACCUUCUCUUAGGAGUUGGGUGCUUCAUGGAAAAUCCAAGCCUUAGGUUCCCUUCUGUCUCUGGCAAUUAGAUGUGUUCUUGGUGUCCUCCAUGUCCUUUUUGACUUUUCCCUGUGUCCAUUGUUAGCAUGUGCAAAAGUUCCCUGUCAUUACCCAACCCCUGCCCGCCCACCUCAUUUCAGGGCUGUACACACAGUGAGUGUUCCUGUUCUCUCUCUCUUUGUUUGGAUGUAUUGCUCUGUGUAACUCAGUGGGUCUCCCUCUUUCUGGUUUGUUUUUUUUUCUAGAUUCCUGCCGUUUGUUCAUCGUUGUGCCUAAAGCAUGUCGAUGUGGCGUCAAGUACAUCGUCCAAAUCCCUGUCUCUUCAGCUUCUCUGAUGCUUGAACUCUCACCUUUGACCUUGUGUUGACCUUUGAUGCUGAUGUGUAUUUUUAUUAUGUUUGUUUCUUUCUUCGUUUUUUUUUCUUUUUUUCUUUCCUUUUUUUUUCCUUUUGUGCUGCCAAAUUGGUUUUGCUAGAACGACUGCUGAAGGGGAAAUAUUUAAACUUGCAUUUGAAUAUAAAAAAAAUCUAUUUUUCUAGAACUUCAUAAGAUAACCACUUGAUUUUGUGAUUCCAAUUCUUUGUAAUUGUCUUCAGAGCAGCCCUACUAGCACAUACCGCGUGGUGUUUGUAUUUCUGUGAACACACAGCCAGUCCGUUUCUAGGCUUUGUUUCUCUGUGUGCUUAGUUUUAAAGACAACUUUGAAGUAAACAAUGAAAUAAAAGAUGUCACUAAAACCUCUGAGGCUCCUGAGCACAUUUUGCUGAUACAGUCUGUGGGGCUUGAGGAGACCGCAUGUAUUGUUCUUUCUUUUGUUUUUCUUCUGAGUUCUCAACUGCGGAGAGCACCUGAACCCCCUUUCCUUUUUGACCGCAGGCUGCACUUUGGGCCCCAGCCAGCCCUUUUUCUUUUUCUUUUUCUUUUGUGGUUCUUCCCUGGAGCGACUCUGGGGAGUCCUGGAUAUCCCGCCUGCCCCUUCCCCUCAGCCCCAUGCUUGUUCCAACAGUCUCCACAGCAAAAUGUGAUGCUUUGAUUUUUUUGUUGUUGUUUUUGUUUUUGUAUUGUUUUUGUGUUUUUGUUUUGAAUUUUUUCCUUUCCUACUAAGAUUAUGCCCAGAAAAAAGUUUUGCAUGUUUCCUGCUGUUUCUUCACACCUUCGUAUAUAUCACCUUCACCUCUCUGUUUUCUAUAGUUUGUGCAAAAACUGAUCGAUUUAAAAGGGUUUCAAAGAAGCUGUUUUAAAUUGUUGUAGGGUUGAUUAUUUUUUUCAAGAUUGUAUUGUUUAAUUUUGAAGUGGCAACUUUCUCCUCUAUUGCCCUUAGAGCGUUUGCCUGUGCACUUAGACUGUCACUUCGUGUGGCCUCCAGGUCUUACCGGGGCUUCCGGGAGGCUGGCUGCUUUGCUCAGAGAGGGUGGGAAGGGGGCCUGGAGAGACACGAGAAGCAGAGGUAGAGCCUAGAAGGUGGCAGCAGGUGGGUAAGAGGCUUAUUUAGCACAUUAGGGGCAGUGAGCACCUGGAGGAAGGAGGGCGCUCCCAAUCACCCGUAGGAGGCCAUCUGCACACCAAGCGGCAAUUCACCUGCUGGCGCUUUUCCUAGGUGACAAGCACAAUACUACAGUCUUCACACUGUUUACAGCCCUGGGCACCAGCCACCCGGCACUGGCUCUUCAUCACAGCUCUGCUCUUGCUUAGCUAGUGGGGUGGGGGAAAGGGCAGGGAUUUGUUUUUUUAAUUGGGUGGAGAGCCAAACAGCUACUGUCCCUGGGUGCCAAGCAAGCCAGUUUUUUGGUUCCCUGAGGGAAACUGACCCUCCUCUCUUGUGGCACCAUCCAGCCUCAGGGUCUUGGAGACUUGA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2073.73 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2190.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 2033.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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