Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001377130.1
Sequence Length
4466 nt
GC Content
0.6037
GAGCGCGCGUGGCCCCGGAGCCGCCGGCGCCGCGCGGGGAAUAGCUGUGCAGCACGCCGAGCCCGGACUCGGCUGGCUCGGCUCGGCGCGGGCGGGCGAGAGGAUGCUGGCGGGCUUCCCCGGGCUCGGCCCGCGCUCCCGCCGGGGAGGGCCCCGCGCGCGCCCCUAGCAGCCGCCGCCGCCGCGGGUGCAGGGGAGGGGUCCGGAGAGCCGCGCUCGCCGCCGCCCGCGCCUGCCGGCCCCCGCACGGCCCCUGCCCCUGAGCCUCAGCCCCAGGGCGGGCGCGCUGGGCCGGCGCCCACGGAUCUCCCAGCCCUCGUCGCCGCCUCCUCCUUCCCCCUGCGGCCGGGCGCCCGCGGAUGCUGAGGGGCAGCCCUGCGCCUCUCCCGGUCGGAUCCCGGGCCUGACGGCGGGAGAUCGCGCUCCGGCCGGGCCCCGAGGCGCUGCCGGGGCGGCGCGGCUCUGCGGGGAGCAGCCCUCGGGCGCGCCGAGCUCUCCCGCCCCAGCCCGCGCGGGGACCGUCCCGGAGCACGCGGUGGCCGAGUUCCCGCACAGUUCUAGCUGAUCAGUGCUACCUGUGCUCUGGAAACCCGCUCUGCGUUCCUGCUGGAGGUGGCCUCCCCUCCGCCCCAGACAAGAAGAGGCCCUCAGCCCUCCCCCGGUCUCAGAGAGCCCUGAGAGGAGGCCCAGUCCAGAGCUCUUCCUCCGUUCCCAGUCCACUUCUCUAGGGCCAGUAGCAGACACCAGCCAGUAUGCCGAGGAACCAGGGCUUCUCCGAGCCCGAAUACUCGGCCGAGUACUCAGCCGAGUACUCCGUCAGCCUGCCCUCCGACCCUGACCGCGGGGUGGGCCGGACCCAUGAAAUCUCGGUCCGGAACUCGGGCUCCUGCCUGUGCCUGCCUCGCUUCAUGCGGCUGACUUUCGUGCCGGAGUCCUUGGAGAACCUCUACCAGACCUACUUCAAAAGGCAGCGCCACGAGACCCUGCUGGUGCUGGUGGUCUUUGCAGCCCUCUUUGACUGCUACGUGGUGGUCAUGUGUGCUGUGGUCUUCUCCAGCGACAAGCUGGCUUCCCUCGCCGUGGCUGGAAUUGGACUGGUGUUGGACAUCAUCCUCUUCGUGCUCUGCAAAAAGGGGCUGCUCCCGGACCGGGUCACCCGCAGAGUGCUGCCCUACGUGCUGUGGCUGCUCAUAACCGCCCAGAUCUUCUCCUACCUGGGCCUGAACUUCGCGCGUGCCCACGCGGCUAGUGACACGGUGGGCUGGCAGGUCUUCUUUGUCUUCUCCUUCUUCAUCACGCUGCCCCUCAGCCUCAGCCCCAUCGUGAUCAUCUCCGUGGUCUCCUGUGUGGUGCACACGUUGGUCCUGGGGGUCACCGUGGCCCAGCAGCAGCAGGAGGAGCUCAAGGGGAUGCAGCUGCUGCGGGAGAUCCUGGCCAACGUCUUCCUCUACCUGUGCGCCAUCGCUGUGGGCAUCAUGUCCUACUACAUGGCUGACCGCAAGCACCGCAAGGCCUUCCUGGAGGCCCGCCAGUCGCUGGAGGUGAAGAUGAACCUGGAAGAGCAGAGCCAGCAGCAGGAGAACCUCAUGCUUUCCAUCCUGCCCAAGCACGUGGCUGACGAGAUGCUGAAAGACAUGAAGAAAGACGAGAGCCAGAAGGACCAGCAGCAGUUCAACACCAUGUACAUGUACCGUCACGAGAACGUCAGCAUCCUCUUUGCCGACAUCGUGGGCUUUACCCAGCUGUCUUCUGCCUGCAGUGCCCAGGAGCUUGUGAAGCUGCUCAACGAGCUCUUUGCCCGCUUUGACAAGCUGGCAGCUAAAUACCACCAGCUGCGGAUUAAGAUCCUGGGCGACUGCUACUACUGCAUCUGCGGCUUGCCCGACUACCGGGAGGACCACGCCGUCUGCUCCAUCCUCAUGGGGCUGGCCAUGGUGGAGGCCAUCUCGUAUGUGCGGGAGAAGACCAAGACUGGGGUGGACAUGCGUGUGGGGGUGCACACGGGCACCGUGCUGGGGGGCGUCCUGGGCCAGAAGCGCUGGCAGUACGACGUGUGGUCGACUGAUGUCACUGUAGCCAACAAGAUGGAGGCCGGCGGCAUCCCUGGGCGCGUGCACAUCUCCCAGAGCACCAUGGACUGCCUGAAAGGGGAGUUUGAUGUGGAGCCAGGCGAUGGGGGCAGCCGCUGUGAUUACCUAGAAGAGAAGGGUAUUGAAACCUACCUCAUCAUUGCCUCCAAGCCAGAGGUGAAGAAAACAGCCACCCAGAAUGGCCUCAAUGGCUCGGCCCUGCCCAAUGGAGCACCAGCUUCCUCAAAGUCCAGCUCCCCUGCCCUCAUUGAGACCAAGGAGCCCAACGGGAGUGCCCACAGCAGUGGGUCCACGUCGGAGAAGCCCGAGGAGCAGGAUGCCCAGGCCGACAACCCCUCAUUCCCCAACCCACGCCGGAGGCUGCGCCUGCAGGACCUGGCUGACCGAGUGGUGGAUGCCUCUGAAGAUGAGCACGAGCUCAACCAGCUGCUCAACGAGGCCCUGCUUGAGCGAGAGUCCGCCCAAGUAGUAAAGAAGAGAAACACCUUCCUCUUGUCCAUGCGGUUCAUGGACCCCGAGAUGGAAACCCGCUACUCGGUGGAGAAGGAGAAGCAGAGUGGGGCUGCCUUCAGCUGCUCCUGCGUCGUCCUGCUCUGCACGGCCCUGGUCGAGAUACUCAUCGACCCCUGGCUAAUGACAAACUAUGUGACCUUCAUGGUGGGGGAGAUUCUGCUCCUCAUCCUGACCAUCUGCUCCCUGGCUGCCAUCUUUCCCCGGGCCUUUCCUAAGAAGCUUGUGGCCUUCUCAACUUGGAUUGACCGGACCCGCUGGGCCAGGAACACCUGGGCCAUGCUCGCCAUCUUCAUCCUGGUGAUGGCAAAUGUCGUGGACAUGGUAGAAAAACUGGCACGGACACUUUUCUUGUGGAAGAUUGAGGUCCACGACCAGAAGGAACGUGUCUAUGAGAUGCGACGCUGGAACGAGGCCUUGGUCACCAACAUGUUGCCUGAGCACGUGGCACGCCAUUUCCUGGGGUCCAAGAAGAGAGAUGAGCUCCUGGACAAUCCCAAGUUCCGGGUGAUCACCAAGAUCAAAACCAUUGGCAGCACGUAUAUGGCGGCUUCAGGAGUCACCCCCGAUGUCAACACCAAUGGCUUUGCCAGCUCCAACAAGGAAGACAAGUCCGAGAGAGAGCGCUGGCAGCACCUGGCUGACCUGGCCGACUUCGCGCUGGCCAUGAAGGAUACGCUCACCAACAUCAACAACCAGUCCUUCAAUAACUUCAUGCUGCGCAUAGGCAUGAACAAAGGCGGGGUUCUGGCUGGGGUCAUCGGAGCCCGGAAACCACACUACGACAUCUGGGGCAAUACAGUCAAUGUAGCCAGCAGGAUGGAGUCCACGGGGGUCAUGGGCAACAUUCAGUGGCGUCUGGCAGAAAAGCUCCACGAAAGGGGCAAAGGGACAGAAGAGCAGGCAGUGGCAGUUUCCAGGUGGUAGAAGAAACCCAAGUCAUCCUCCGAGAGUACGGCUUCCGCUUUGUGAGGCGAGGCCCCAUCUUUGUGAAGGGGAAGGGGGAGCUGCUGACCUUCUUCUUGAAGGGGCGGGAUAAGCUAGCCACCUUCCCCAAUGGCCCCUCUGUCACACUGCCCCACCAGGUGGUGGACAACUCCUGAAUGGCCUCGAGCCUGCAACAGUCCAAACCGGAAGGGAGAAUUUAUUUUUUGAAACUGAAGGAAGUCCCGACCUUCCUGGAUUGAAGUGCACACUCAUGGACUUUAGGUUUAGAAACCUCCUCAGCCUUCAUUUGUUCGUGGAUGUGUGAGCUCUGAGGGUGGCCCUGCUAUUCCUGUGUGUGCCUGUAGUGUCCCCAGCAUAGGGGUCUUAGGCAUAGGGCUGAACAGUCCUUCCAGAGCCCUCGUUCCAAUCCCUGCCGUCCUUGCCCCUGAGGGGCCCUGACCACUGUGAGCAGGAGGGUGGCAGAGCUGGGACAAAGCUGCCUUUGCCGCUGGGCUUUCCGGGACUGUGGAGGGAGCACAGGCGGGGAAGCUCCACUUCAGACAGGGCUUGGUGGGGCAGGACAUGGCUCCCAUUUUGAAGGGAGGUCUCCAUGUGGUCCGAGUGAGGUGAGACGGCCCUCGUCCUGGUGUUCCUGAUCAUCUUGAAAGGUUCUUCUGGAACUCCUGUCCCCUUAGUCAUGAGAACAGAAAGUGCAAUAUUUCCUUUCACCUGGCAGGGGAGGGGGGAUUUAUUUCUGAAAGAAAAAUAUAUAAACAGAUCUUCUACAUUUAUAUUUUUAAUCUUCUGUUAAAUACACUUUCCGAUAUUGCCUUGCCUUUUGAGCUCUUGCUACAGUCGCCUUUGCUACUGCUUUAAGAGAAUUUACAGGUAUUGAUAAAGAACAAGACUGUUUUAUUAAAAGCUUUAUUCAACUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1898.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1974.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 1025.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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