Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001378092.1
Sequence Length
4878 nt
GC Content
0.5291
GUGAGCGAGGGCAGCCAAGUUUGGCUACAGCACGCGCGGCUUCGCUCCUGCCUCUGGGGAGGAGAGAGGGGACAGUCCCCUCCCGAGCUAGGCUCGGACCUUGGCCCCCAGAGCCGCCGCAGACCUCCAGGGGUGACUUCGUCGCUCCCUAGUCUGGACUCGCUAGGUCCCGGGUGCACCGGAGUCGCGCAGCGAACGCGCCAUGCAGGAGGGCGACAUCGGCCUGGAGGGGCUGCCCCCCAGGGAAGUCCCCACAGUCGAGGCCGCCGGGGCCGUGGAUGGGGAGGGCGCGCCGCCCGGCGGUCCCAGCGCACAGGCGGCCACGAUGAGGGUCAACGAGAAGUACUCGACGCUCCCGGCCGAGGACCGCAGCGUCCACAUCAUCAACAUCUGCGCCAUCGAGGACAUCGGCUACCUGCCGUCCGAGGGCACGCUGCUGAACUCCUUAUCUGUGGACCCUGAUGCCGAGUGCAAGUAUGGCCUGUACUUCAGGGACGGCCGGCGCAAGGUGGACUACAUCCUGGUGUACCAUCACAAGAGGCCCUCGGGCAACCGGACCCUGGUCAGGAGGGUGCAGCACAGCGACACCCCCUCUGGGGCUCGCAGCGUCAAGCAGGACCACCCCCUGCCGGGCAAGGGGGCGUCGCUGGAUGCAGGCUCGGGGGAGCCCCCGAUGGACUACCACGAGGAUGACAAGCGCUUCCGCAGGGAGGAGUACGAGGGCAACCUCCUGGAGGCGGGCCUGGAGCUGGAGCGGGACGAGGACACUAAAAUCCACGGAGUCGGGUUUGUGAAAAUCCAUGCCCCCUGGAACGUGCUGUGCAGAGAGGCCGAGUUUCUGAAACUGAAGAUGCCGACGAAGAAGAUGUACCACAUUAAUGAGACCCGUGGCCUCCUGAAAAAAAUCAACUCUGUGCUCCAGAAAAUCACAGAUCCCAUCCAGCCCAAAGUGGCUGAGCACAGGCCCCAGACCAUGAAGAGACUCUCCUAUCCCUUCUCCCGGGAGAAGCAGCAUCUAUUUGACUUGUCUGAUAAGGAUUCCUUUUUCGACAGCAAAACCCGGAGCACGAUUGUCUAUGAGAUCUUGAAGAGAACGACGUGUACAAAGGCCAAGUACAGCAUGGGGCAAGGCGAGGGAAGAAAGAAGGACUCCGCCCUUCUAAGUAAAAGGCGGAAAUGUGGGAAGUAUGGCAUCACGAGCCUGCUGGCCAAUGGUGUGUACGCGGCUGCAUACCCACUGCACGAUGGAGACUACAACGGUGAAAACGUCGAGUUCAACGACAGAAAACUCCUGUACGAAGAGUGGGCACGCUAUGGAGUUUUCUAUAAGUACCAGCCCAUCGACCUGGUCAGGAAGUAUUUUGGGGAGAAGAUCGGCCUGUACUUCGCCUGGCUGGGCGUGUACACCCAGAUGCUCAUCCCUGCCUCCAUCGUGGGAAUCAUUGUCUUCCUGUACGGAUGCGCCACCAUGGAUGAAAACAUCCCCAGCAUGGAGAUGUGUGACCAGAGACACAAUAUCACCAUGUGCCCGCUUUGCGACAAGACCUGCAGCUACUGGAAGAUGAGCUCAGCCUGCGCCACGGCCCGCGCCAGCCACCUCUUCGACAACCCCGCCACGGUCUUCUUCUCUGUCUUCAUGGCCCUCUGGGCUGCCACCUUCAUGGAGCACUGGAAGCGGAAACAGAUGCGACUCAACUACCGCUGGGACCUCACGGGCUUUGAAGAGGAAGAGGAGGCUGUCAAGGAUCAUCCUAGAGCUGAAUACGAAGCCAGAGUCUUGGAGAAGUCUCUGAAGAAAGAGUCCAGAAACAAAGAGAAGCGCCGGCAUAUUCCAGAGGAGUCAACAAACAAAUGGAAGCAGAGGGUUAAGACAGCCAUGGCGGGGGUGAAAUUGACUGACAAAGUGAAGCUGACAUGGAGAGAUCGGUUCCCAGCCUACCUCACUAACUUGGUCUCCAUCAUCUUCAUGAUUGCAGUGACGUUUGCCAUCGUCCUCGGCGUCAUCAUCUACAGAAUCUCCAUGGCCGCCGCCUUGGCCAUGAACUCCUCCCCCUCCGUGCGGUCCAACAUCCGGGUCACAGUCACAGCCACCGCAGUCAUCAUCAACCUAGUGGUCAUCAUCCUCCUGGACGAGGUGUAUGGCUGCAUAGCCCGAUGGCUCACCAAGAUCGAGGUCCCAAAGACGGAGAAAAGCUUUGAGGAGAGGCUGAUCUUCAAGGCUUUCCUGCUGAAGUUUGUGAAUUCCUACACCCCCAUCUUUUACGUGGCGUUCUUCAAAGGCCGGUUUGUUGGACGCCCGGGCGACUACGUGUACAUUUUCCGUUCCUUCCGAAUGGAAGAGUGUGCGCCAGGGGGCUGCCUGAUGGAGCUAUGCAUCCAGCUCAGCAUCAUCAUGCUGGGGAAACAGCUGAUCCAGAACAACCUGUUCGAGAUCGGCAUCCCGAAGAUGAAGAAGCUCAUCCGCUACCUGAAGCUGAAGCAGCAGAGCCCCCCUGACCACGAGGAGUGUGUGAAGAGGAAACAGCGGUACGAGGUGGAUUACAACCUGGAGCCCUUCGCGGGCCUCACCCCAGAGUACAUGGAAAUGAUCAUCCAGUUUGGCUUCGUCACCCUGUUUGUCGCCUCCUUCCCCCUGGCCCCACUGUUUGCGCUGCUGAACAACAUCAUCGAGAUCCGCCUGGACGCCAAAAAGUUUGUCACUGAGCUCCGAAGGCCGGUAGCUGUCAGAGCCAAAGACAUCGGAAUCUGGUACAAUAUCCUCAGAGGCAUUGGGAAGCUUGCUGUCAUCAUCAAUGCCUUCGUGAUCUCCUUCACGUCUGACUUCAUCCCGCGCCUGGUGUACCUCUACAUGUACAGUAAGAACGGGACCAUGCACGGCUUCGUCAACCACACCCUCUCCUCCUUCAACGUCAGUGACUUCCAGAACGGCACGGCCCCCAAUGACCCCCUGGACCUGGGCUACGAGGUGCAGAUCUGCAGGUAUAAAGACUACCGAGAGCCGCCGUGGUCGGAAAACAAGUACGACAUCUCCAAGGACUUCUGGGCCGUCCUGGCAGCCCGGCUGGCGUUUGUCAUCGUCUUCCAGAACCUGGUCAUGUUCAUGAGCGACUUUGUGGACUGGGUCAUCCCGGACAUCCCCAAGGACAUCAGCCAGCAGAUCCACAAGGAGAAGGUGCUCAUGGUGGAGCUGUUCAUGCGGGAGGAGCAAGACAAGCAGCAGCUGCUGGAAACCUGGAUGGAGAAGGAGCGGCAGAAGGACGAGCCGCCGUGCAACCACCACAACACCAAAGCCUGCCCAGACAGCCUCGGCAGCCCAGCCCCCAGCCAUGCCUACCACGGGGGCGUCCUGUAGCUAUGCCAGCGGGGCUGGGCAGGCCAGCCGGGCAUCCUGACCGAUGGGCACCCUCUCCCAGGGCAGGCGGCUUCCCGCUCCCACCAGGGCCCGGUGGGUCCUGGGUUUUCUGCAAACAUGGAGGACCACUUUCUGAUAGGACAUUUUCCUUUCUUCUUUCUGUUUUCUUUCCCUUGUUUUUGCACAAAGCCAUUAUGCAGGGAAUAUUUUUUAAUCUGUAGUAUUCAAGAUGAAUCAAAAUGAUGGCUGGUAAUACGGCAAUAAGGUAGCAAAGGCAGGUGCUUUGCAGAAAGAAUGCUUGGAAACUUGAGUCUCCCUAGAGGUGAAAAGUGAGCAGAGGCCCGUAGAAACCCUCCUCUGAAUCCUCCUAAUUCCUUAAGAUAGAUGCAAAAUGGUAAGCCGAGGCAUCGCGCAAAAGCUGGUGCGAUGCUUCAGGGAAAAUGGAAAACCCACGCAAGAAUAAUGAUUGAUUCCGGUUCCAAAAGGUGUCACCUACCUGUUUCAGAAAAGUUAGACUUUCCAUCGCCUUUUCCUUCCAUCAGUUGAGUGGCUGAGAGAGAAGUGCCUCAUCCCUGAGCCACACAGGGGGCGUGGGAGCAUCCCAGUUAUCCCUGGAAAGCUAGAAGGGGACAGAGGUGUCCCUGAUUAAGCAGGAAACAGCACCCUUGGCGUCCCCAGCAGGCUCCCCACUGUCAGCCACACACCUGCCCCCAUCACACCAAGCCGACCUCAGAGUUGUUCAUCUUCCUUAUGGGACAAAACCGGUUGACCAGAAAAUGGGCAGAGAGAGAUGACCUCGGAAGCAUUUCCACAGAUGGUGUCAGGGUUUCAAGAAGUCUUAGGGCUUCCAGGGGUCCCCUGGAAGCUUUAGAAUAUUUAUGGGUUUUUUUUCAAAUAUCAAUUAUAUGGUAGAUUGAGGAUUUUUUUUCUGUAGCUCAAAGGUGGAGGGAGUUUAUUAGUUAACCAAAUAUCGUUGAGAGGAAUUUAAAAUACUGUUACUACCAAAGAUUUUUAUUAAUAAAGGCUUAUAUUUUGGUAACACUUCUCUAUAUUUUUACUCACAGGAAUGUCACUGUUGGACAAUUAUUUUAAAAGUGUAUAAAACCAAGUCUCAUAAAUGAUAUGAGUGAUCUAAAUUUGCAGCAAUGAUACUAAACAACUCUCUGAAAUUUCUCAAGCACCAAGAGAAACAUCAUUUUAGCAAAGGCCAGGAGGAAAAAUAGAAAUAAAUUUGUCUUGAAGAUCUCAUUGAUGUGAUGUUACAUUCCCUUUAAUCUGCCAACUGUGGUCAAAGUUCAUAGGUGUCGUACAUUUCCAUUAUUUGCUAAAAUCAUGCAAUCUGAUGCUUCUCUUUUCUCUUGUACAGUAAGUAGUUUGAAGUGGGUUUUGUAUAUAAAUACUGUAUUAAAAAUUAGGCAAUUACCAAAAAUCCUUUUAUGGAAACCAUUUUUUUAAAAAGUGAAUGUACACAAAUCCACAGAGGACUGUGGCUGGACAUUCAUCUAAAUAAAUUUGAAUAUACGACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1723.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1818.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 993.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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