Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001378516.1

Sequence Length

1690 nt

GC Content

0.5467

AACCGUCCCGGCCACCGCUGCCUCAGCCUCUGCCUCCCAGCCUCUUUCUGAGGGAAAGGACAAGAUGAAGUGGAAGGCGCUUUUCACCGCGGCCAUCCUGCAGGCACAGUUGCCGAUUACAGCCUCCAGCCUCCCCCACCCAACUCAGCAGAGCCCUGAGAAGAAAGUCCUGGGUCCCGGAGGCUGCACCUGCAGACACAACAGAUUCUGCAAUGAGGCACAGAGCUUUGGCCUGCUGGAUCCCAAACUCUGCUACCUGCUGGAUGGAAUCCUCUUCAUCUAUGGUGUCAUUCUCACUGCCUUGUUCCUGAGAGUGAAGUUCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGUACCAGCAGGGCCAGAACCAGCUCUAUAACGAGCUCAAUCUAGGACGAAGAGAGGAGUACGAUGUUUUGGACAAGAGACGUGGCCGGGACCCUGAGAUGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCUCAGGAAGGCCUGUACAAUGAACUGCAGAAAGAUAAGAUGGCGGAGGCCUACAGUGAGAUUGGGAUGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGAUGGCCUUUACCAGGGUCUCAGUACAGCCACCAAGGACACCUACGACGCCCUUCACAUGCAGGCCCUGCCCCCUCGCUAACAGCCAGGGGAUUUCACCACUCAAAGGCCAGACCUGCAGACGCCCAGAUUAUGAGACACAGGAUGAAGCAUUUACAACCCGGUUCACUCUUCUCAGCCACUGAAGUAUUCCCCUUUAUGUACAGGAUGCUUUGGUUAUAUUUAGCUCCAAACCUUCACACACAGACUGUUGUCCCUGCACUCUUUAAGGGAGUGUACUCCCAGGGCUUACGGCCCUGGCCUUGGGCCCUCUGGUUUGCCGGUGGUGCAGGUAGACCUGUCUCCUGGCGGUUCCUCGUUCUCCCUGGGAGGCGGGCGCACUGCCUCUCACAGCUGAGUUGUUGAGUCUGUUUUGUAAAGUCCCCAGAGAAAGCGCAGAUGCUAGCACAUGCCCUAAUGUCUGUAUCACUCUGUGUCUGAGUGGCUUCACUCCUGCUGUAAAUUUGGCUUCUGUUGUCACCUUCACCUCCUUUCAAGGUAACUGUACUGGGCCAUGUUGUGCCUCCCUGGUGAGAGGGCCGGGCAGAGGGGCAGAUGGAAAGGAGCCUAGGCCAGGUGCAACCAGGGAGCUGCAGGGGCAUGGGAAGGUGGGCGGGCAGGGGAGGGUCAGCCAGGGCCUGCGAGGGCAGCGGGAGCCUCCCUGCCUCAGGCCUCUGUGCCGCACCAUUGAACUGUACCAUGUGCUACAGGGGCCAGAAGAUGAACAGACUGACCUUGAUGAGCUGUGCACAAAGUGGCAUAAAAAACAUGUGGUUACACAGUGUGAAUAAAGUGCUGCGGAGCAAGAGGAGGCCGUUGAUUCACUUCACGCUUUCAGCGAAUGACAAAAUCAUCUUUGUGAAGGCCUCGCAGGAAGACCCAACACAUGGGACCUAUAACUGCCCAGCGGACAGUGGCAGGACAGGAAAAACCCGUCAAUGUACUAGGAUACUGCUGCGUCAUUACAGGGCACAGGCCAUGGAUGGAAAACGCUCUCUACUCUGCUUUUUUUCUACUGUUUUAAUUUAUACUGGCAUGCUAAAGCCUUCCUAUUUUGCAUAAUAAAUGCUUCAGUGAAAAUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-623.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -650.81

Frequency: 0.0000

Diversity: 266.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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