Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001379.4
Sequence Length
5226 nt
GC Content
0.5494
GCGAAAAGCCGGGGCGCCUGCGCUGCCGCCGCCGCGUCUGCUGAAGCCUCCGAGAUGCCGGCGCGUACCGCCCCAGCCCGGGUGCCCACACUGGCCGUCCCGGCCAUCUCGCUGCCCGACGAUGUCCGCAGGCGGCUCAAAGAUUUGGAAAGAGACAGCUUAACAGAAAAGGAAUGUGUGAAGGAGAAAUUGAAUCUCUUGCACGAAUUUCUGCAAACAGAAAUAAAGAAUCAGUUAUGUGACUUGGAAACCAAAUUACGUAAAGAAGAAUUAUCCGAGGAGGGCUACCUGGCUAAAGUCAAAUCCCUUUUAAAUAAAGAUUUGUCCUUGGAGAACGGUGCUCAUGCUUACAACCGGGAAGUGAAUGGACGUCUAGAAAACGGGAACCAAGCAAGAAGUGAAGCCCGUAGAGUGGGAAUGGCAGAUGCCAACAGCCCCCCCAAACCCCUUUCCAAACCUCGCACGCCCAGGAGGAGCAAGUCCGAUGGAGAGGCUAAGCCUGAACCUUCACCUAGCCCCAGGAUUACAAGGAAAAGCACCAGGCAAACCACCAUCACAUCUCAUUUUGCAAAGGGCCCUGCCAAACGGAAACCUCAGGAAGAGUCUGAAAGAGCCAAAUCGGAUGAGUCCAUCAAGGAAGAAGACAAAGACCAGGAUGAGAAGAGACGUAGAGUUACAUCCAGAGAACGAGUUGCUAGACCGCUUCCUGCAGAAGAACCUGAAAGAGCAAAAUCAGGAACGCGCACUGAAAAGGAAGAAGAAAGAGAUGAAAAAGAAGAAAAGAGACUCCGAAGUCAAACCAAAGAACCAACACCCAAACAGAAACUGAAGGAGGAGCCGGACAGAGAAGCCAGGGCAGGCGUGCAGGCUGACGAGGACGAAGAUGGAGACGAGAAAGAUGAGAAGAAGCACAGAAGUCAACCCAAAGAUCUAGCUGCCAAACGGAGGCCCGAAGAAAAAGAACCUGAAAAAGUAAAUCCACAGAUUUCUGAUGAAAAAGACGAGGAUGAAAAGGAGGAGAAGAGACGCAAAACGACCCCCAAAGAACCAACGGAGAAAAAAAUGGCUCGCGCCAAAACAGUCAUGAACUCCAAGACCCACCCUCCCAAGUGCAUUCAGUGCGGGCAGUACCUGGACGACCCUGACCUCAAAUAUGGGCAGCACCCACCAGACGCGGUGGAUGAGCCACAGAUGCUGACAAAUGAGAAGCUGUCCAUCUUUGAUGCCAACGAGUCUGGCUUUGAGAGUUAUGAGGCGCUUCCCCAGCACAAACUGACCUGCUUCAGUGUGUACUGUAAGCACGGUCACCUGUGUCCCAUCGACACCGGCCUCAUCGAGAAGAAUAUCGAACUCUUCUUUUCUGGUUCAGCAAAACCAAUCUAUGAUGAUGACCCAUCUCUUGAAGGUGGUGUUAAUGGCAAAAAUCUUGGCCCCAUAAAUGAAUGGUGGAUCACUGGCUUUGAUGGAGGUGAAAAGGCCCUCAUCGGCUUCAGCACCUCAUUUGCCGAAUACAUUCUGAUGGAUCCCAGUCCCGAGUAUGCGCCCAUAUUUGGGCUGAUGCAGGAGAAGAUCUACAUCAGCAAGAUUGUGGUGGAGUUCCUGCAGAGCAAUUCCGACUCGACCUAUGAGGACCUGAUCAACAAGAUCGAGACCACGGUUCCUCCUUCUGGCCUCAACUUGAACCGCUUCACAGAGGACUCCCUCCUGCGACACGCGCAGUUUGUGGUGGAGCAGGUGGAGAGUUAUGACGAGGCCGGGGACAGUGAUGAGCAGCCCAUCUUCCUGACACCCUGCAUGCGGGACCUGAUCAAGCUGGCUGGGGUCACGCUGGGACAGAGGCGAGCCCAGGCGAGGCGGCAGACCAUCAGGCAUUCUACCAGGGAGAAGGACAGGGGACCCACGAAAGCCACCACCACCAAGCUGGUCUACCAGAUCUUCGAUACUUUCUUCGCAGAGCAAAUUGAAAAGGAUGACAGAGAAGACAAGGAGAACGCCUUUAAGCGCCGGCGAUGUGGCGUCUGUGAGGUGUGUCAGCAGCCUGAGUGUGGGAAAUGUAAAGCCUGCAAGGACAUGGUUAAAUUUGGUGGCAGUGGACGGAGCAAGCAGGCUUGCCAAGAGCGGAGGUGUCCCAAUAUGGCCAUGAAGGAGGCAGAUGACGAUGAGGAAGUCGAUGAUAACAUCCCAGAGAUGCCGUCACCCAAAAAAAUGCACCAGGGGAAGAAGAAGAAACAGAACAAGAAUCGCAUCUCUUGGGUCGGAGAAGCCGUCAAGACUGAUGGGAAGAAGAGUUACUAUAAGAAGGUGUGCAUUGAUGCGGAAACCCUGGAAGUGGGGGACUGUGUCUCUGUUAUUCCAGAUGAUUCCUCAAAACCGCUGUAUCUAGCAAGGGUCACGGCGCUGUGGGAGGACAGCAGCAACGGGCAGAUGUUUCACGCCCACUGGUUCUGCGCUGGGACAGACACAGUCCUCGGGGCCACGUCGGACCCUCUGGAGCUGUUCUUGGUGGAUGAAUGUGAGGACAUGCAGCUUUCAUAUAUCCACAGCAAAGUGAAAGUCAUCUACAAAGCCCCCUCCGAAAACUGGGCCAUGGAGGGAGGCAUGGAUCCCGAGUCCCUGCUGGAGGGGGACGACGGGAAGACCUACUUCUACCAGCUGUGGUAUGAUCAAGACUACGCGAGAUUCGAGUCCCCUCCAAAAACCCAGCCAACAGAGGACAACAAGUUCAAAUUCUGUGUGAGCUGUGCCCGUCUGGCUGAGAUGAGGCAAAAAGAAAUCCCCAGGGUCCUGGAGCAGCUCGAGGACCUGGAUAGCCGGGUCCUCUACUACUCAGCCACCAAGAACGGCAUCCUGUACCGAGUUGGUGAUGGUGUGUACCUGCCCCCUGAGGCCUUCACGUUCAACAUCAAGCUGUCCAGUCCCGUGAAACGCCCACGGAAGGAGCCCGUGGAUGAGGACCUGUACCCAGAGCACUACCGGAAAUACUCCGACUACAUCAAAGGCAGCAACCUGGAUGCCCCUGAGCCCUACCGAAUUGGCCGGAUCAAAGAGAUCUUCUGUCCCAAGAAGAGCAACGGCAGGCCCAAUGAGACUGACAUCAAAAUCCGGGUCAACAAGUUCUACAGGCCUGAGAACACCCACAAGUCCACUCCAGCGAGCUACCACGCAGACAUCAACCUGCUCUACUGGAGCGACGAGGAGGCCGUGGUGGACUUCAAGGCUGUGCAGGGCCGCUGCACCGUGGAGUAUGGGGAGGACCUGCCCGAGUGCGUCCAGGUGUACUCCAUGGGCGGCCCCAACCGCUUCUACUUCCUCGAGGCCUAUAAUGCAAAGAGCAAAAGCUUUGAAGAUCCUCCCAACCAUGCCCGUAGCCCUGGAAACAAAGGGAAGGGCAAGGGAAAAGGGAAGGGCAAGCCCAAGUCCCAAGCCUGUGAGCCGAGCGAGCCAGAGAUAGAGAUCAAGCUGCCCAAGCUGCGGACCCUGGAUGUGUUUUCUGGCUGCGGGGGGUUGUCGGAGGGAUUCCACCAAGCAGGCAUCUCUGACACGCUGUGGGCCAUCGAGAUGUGGGACCCUGCGGCCCAGGCGUUCCGGCUGAACAACCCCGGCUCCACAGUGUUCACAGAGGACUGCAACAUCCUGCUGAAGCUGGUCAUGGCUGGGGAGACCACCAACUCCCGCGGCCAGCGGCUGCCCCAGAAGGGAGACGUGGAGAUGCUGUGCGGCGGGCCGCCCUGCCAGGGCUUCAGCGGCAUGAACCGCUUCAAUUCGCGCACCUACUCCAAGUUCAAAAACUCUCUGGUGGUUUCCUUCCUCAGCUACUGCGACUACUACCGGCCCCGGUUCUUCCUCCUGGAGAAUGUCAGGAACUUUGUCUCCUUCAAGCGCUCCAUGGUCCUGAAGCUCACCCUCCGCUGCCUGGUCCGCAUGGGCUAUCAGUGCACCUUCGGCGUGCUGCAGGCCGGUCAGUACGGCGUGGCCCAGACUAGGAGGCGGGCCAUCAUCCUGGCCGCGGCCCCUGGAGAGAAGCUCCCUCUGUUCCCGGAGCCACUGCACGUGUUUGCUCCCCGGGCCUGCCAGCUGAGCGUGGUGGUGGAUGACAAGAAGUUUGUGAGCAACAUAACCAGGUUGAGCUCGGGUCCUUUCCGGACCAUCACGGUGCGAGACACGAUGUCCGACCUGCCGGAGGUGCGGAAUGGAGCCUCGGCACUGGAGAUCUCCUACAACGGGGAGCCUCAGUCCUGGUUCCAGAGGCAGCUCCGGGGCGCACAGUACCAGCCCAUCCUCAGGGACCACAUCUGUAAGGACAUGAGUGCAUUGGUGGCUGCCCGCAUGCGGCACAUCCCCUUGGCCCCAGGGUCAGACUGGCGCGAUCUGCCCAACAUCGAGGUGCGGCUCUCAGACGGCACCAUGGCCAGGAAGCUGCGGUAUACCCACCAUGACAGGAAGAACGGCCGCAGCAGCUCUGGGGCCCUCCGUGGGGUCUGCUCCUGCGUGGAAGCCGGCAAAGCCUGCGACCCCGCAGCCAGGCAGUUCAACACCCUCAUCCCCUGGUGCCUGCCCCACACCGGGAACCGGCACAACCACUGGGCUGGCCUCUAUGGAAGGCUCGAGUGGGACGGCUUCUUCAGCACAACCGUCACCAACCCCGAGCCCAUGGGCAAGCAGGGCCGCGUGCUCCACCCAGAGCAGCACCGUGUGGUGAGCGUGCGGGAGUGUGCCCGCUCCCAGGGCUUCCCUGACACCUACCGGCUCUUCGGCAACAUCCUGGACAAGCACCGGCAGGUGGGCAAUGCCGUGCCACCGCCCCUGGCCAAAGCCAUUGGCUUGGAGAUCAAGCUUUGUAUGUUGGCCAAAGCCCGAGAGAGUGCCUCAGCUAAAAUAAAGGAGGAGGAAGCUGCUAAGGACUAGUUCUGCCCUCCCGUCACCCCUGUUUCUGGCACCAGGAAUCCCCAACAUGCACUGAUGUUGUGUUUUUAACAUGUCAAUCUGUCCGUUCACAUGUG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1874.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1965.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 903.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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