Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001382757.1

Sequence Length

1762 nt

GC Content

0.4904

AGAACCGCGACCUCCGCAACCUUGAGCGGCAUCCGUGGAGUGCGCCUGCGCAGCUACGACCGCAGCAGGAAAGCGCCGCCGGCCAGGCCCAGCUGUGGCCGGACAGGGACUGGAAGAGAGGACGCGGUCGAGUAGGUGUGCACCAGCCCUGGCAACGAGAGCGUCUACCCCGAACUCUGCUGGCCUUGAGGUGGGGAAGCCGGGGAGGGCAGUUGAGGACCCCGCGGAGGCGCGUGACUGGUUGAGCGGGCAGGCCAGCCUCCGAGCCGGGUGGACACAGCUCCUACAGCUCUGGACAGGCUGCUUUUCAUUUUGGUGAGUCCAUCCAGUACCUCCACGUGCCCUGUUUUUCUCCAGGCACAUCCUUGGCCUCUUCCACAGUCCUUGGGUUUUAAAACAUGAAUCCUACACUCAUCCUUGCUGCCUUUUGCCUGGGAAUUGCCUCAGCUACUCUAACAUUUGAUCACAGUUUAGAGGCACAGUGGACCAAGUGGAAGGCGAUGCACAACAGAUUAUACGGCAUGAAUGAAGAAGGAUGGAGGAGAGCAGUGUGGGAGAAGAACAUGAAGAUGAUUGAACUGCACAAUCAGGAAUACAGGGAAGGGAAACACAGCUUCACAAUGGCCAUGAACGCCUUUGGAGACAUGACCAGUGAAGAAUUCAGGCAGGUGAUGAAUGGCUUUCAAAACCGUAAGCCCAGGAAGGGGAAAGUGUUCCAGGAACCUCUGUUUUAUGAGGCCCCCAGAUCUGUGGAUUGGAGAGAGAAAGGCUACGUGACUCCUGUGAAGAAUCAGGGUCAGUGUGGUUCUUGUUGGGCUUUUAGUGCUACUGGUGCUCUUGAAGGACAGAUGUUCCGGAAAACUGGGAGGCUUAUCUCACUGAGUGAGCAGAAUCUGGUAGACUGCUCUGGGCCUCAAGGCAAUGAAGGCUGCAAUGGUGGCCUAAUGGAUUAUGCUUUCCAGUAUGUUCAGGAUAAUGGAGGCCUGGACUCUGAGGAAUCCUAUCCAUAUGAGGCAACAGAAGAAUCCUGUAAGUACAAUCCCAAGUAUUCUGUUGCUAAUGACACCGGCUUUGUGGACAUCCCUAAGCAGGAGAAGGCCCUGAUGAAGGCAGUUGCAACUGUGGGGCCCAUUUCUGUUGCUAUUGAUGCAGGUCAUGAGUCCUUCCUGUUCUAUAAAGAAGGCAUUUAUUUUGAGCCAGACUGUAGCAGUGAAGACAUGGAUCAUGGUGUGCUGGUGGUUGGCUACGGAUUUGAAAGCACAGAAUCAGAUAACAAUAAAUAUUGGCUGGUGAAGAACAGCUGGGGUGAAGAAUGGGGCAUGGGUGGCUACGUAAAGAUGGCCAAAGACCGGAGAAACCAUUGUGGAAUUGCCUCAGCAGCCAGCUACCCCACUGUGUGAGCUGGUGGACGGUGAUGAGGAAGGACUUGACUGGGGAUGGCGCAUGCAUGGGAGGAAUUCAUCUUCAGUCUACCAGCCCCCGCUGUGUCGGAUACACACUCGAAUCAUUGAAGAUCCGAGUGUGAUUUGAAUUCUGUGAUAUUUUCACACUGGUAAAUGUUACCUCUAUUUUAAUUACUGCUAUAAAUAGGUUUAUAUUAUUGAUUCACUUACUGACUUUGCAUUUUCGUUUUUAAAAGGAUGUAUAAAUUUUUACCUGUUUAAAUAAAAUUUAAUUUCAAAUGUAGUGGUGGGGCUUCUUUCUAUUUUUGAUGCACUGAAUUUUUGUGUAAUAAAGAACAUAAUUGGGCUCUAAGCCAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-587.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -620.63

Frequency: 0.0000

Diversity: 537.21

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((((....((((........))))....)))))(((((.(((((((.(......).)).)))))......((.(((((....((((.((..((((((.(((((..(((..(.(.((((((..(((..((((.((......))))))....)))..)))))).)))))..)))))))))))...)).))))...)))))))((((((((.((((......(((((((((.((.(((......))).)).))..))))))).((.((((((((.(((((((.........)))...))))....((((....)))))))))))).)).)))).)).))))))((((((((((..((((.....((..((((((((...(((((((((((........))))))..((.((((((.(((((((((((((.(((..((((((((((((..((........))....))))..))))))..))...))).))))))))))..))).............)).)))).))...)))))))))))))..)))))).))))))))))......................((((((((((.(((((((..........((((((..(((.((((....((...))...)))).)))))))))...(((.((((.((((...(((((((((((.(((((.(((((((((((((...((((.(((.(((((..((((...((((((((((((((((((..(((..((.((((.((((((((((((.((((........)))))))).))).((((((...((((..(((((...))))).))))...)))))).....((((((....))))))))))).)))).)).)))..)))).))))))...........)))))))).........(((((((....)))))))..(((((.(((((....))))))))))(((((..(((..(((........)))..))))))))......(((((((((............((((........)))))))))))))...))))..)).))).))))))).))..((((((((..((((((.......(((((....)))))))))))..))))))))(((..((((....))))..)))))))))))((((....))))(((.((......))))).((((.(((((.......((((...))))...)))))..)))))))))))).))))))))).))..))))...............((((((((........(((((((((((.(((((..(.(.(((((((((.....).)))))....))).).)...))))).)....)))))))))).)))))))).....)))).)))((((((((((((.((((((......((((..((.(.....).))..)).))......)))))).)).))))))))))(((((((...((((((.((((((((.(((......))).))))))))))))))....(((((.....)))))..(((((...)))))............(((((..(((((((((.....((((..((((..(((..(((...........)))..)))..))))..))))......)))))))))....................))))))))))))))))))).)))))))))))))))......((((((........))))))...((((...))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,.(((((....((((........))))....))))),((((.(((((((.{......}.)).)))))...}}}|(.(((((....((((.((..((((((.(((((..(((..,.,.((((((..(((.,((((.((......)))))).,..)))..)))))).},)))..)))))))))))...)).))))...))))),)((((((((.((((,{,,,.(((((((((.((.(({,,...,)}),)).))..))))))).|,.|||{((({.{((({|{...,,,.,{|||..|}}}}....{{{,...,))}))))}}))).)}.)))).)).))))))((((((((((..,((({,...{{,,((((((({..,(((((((((((........))))))..,,.((((,(.(((((((((((((.(((..(((((((({(((..((........))....)))}..))))))..))...))).)))))))))}..}},.............))})}),,)),..))))))))))))).,))))))})))))))))).......{{{,{{...,,,,,,||||({{{((,(({({{(,,...{{{,,((((((..{((,({((....{{...)).,.}}}}.))})}}}}}..,||{,{{,{{{,|{|,,,{({{{|||,,.|||{,,|(((,,,,,{({{..{((,{(((,{((((,{{((((({.{((((((((((({{({{{.,|{{||,{,({,{{{(((((((((((.((((........)))))))).)))))}}})}..,||||||||{{{,|,.}|)).))}}},,.)))))))).))}))))},.}))|||}|||||,}|||.|,}}))}}))}}..,||||{{{{{{{.,,|||||||||.,|||....{{{{{||....)})))))..{((({{{{{((,{{{|||||||||,(((((..(((..(((.,....,.)))..))))))))......((((((((((......,,...,,,,........},,)))))))))).....,.{{||,,,|,}}}.{{{{|{{,((((({((,,((((((.......(((((....)))))))))))..,))))}))|||..,{{{,,..||||.,{{{{{{{{||,{(((....)))},{(,{{.,,...,.|||{(.((..,{(((((.,,{(((,...,,},}}}),))|{{|||{||||,,,|,||||},,,,.}},,|})|,.,..{,{{....,}}|{{{{{{......,.(((((((((((.(((((..{.(.(((((((({.....}.))))),...,)).).}...))))).)....))))))))))}))))))))}}.}}))))..,}||||||,{{,|},||||||}}}}}}|}||,}||}|}}}}.}})),}).}))}|}|,.)))))).,)}))))))))))})})})}))){(((((.((((((((.(((......))).)))))))))))))}....{((((.....)))))..(((({...})))).,,,,,,...,,{{{{{,,{|||||||{..,..{{,,,,||{{..,,,.,||,..||||,|,,.}}}..,},.,)))},,},,,,,.,..)))))))}|,,....,,,,....,.....}}}}}}}}||||||}}}}}.},||||||,|||||,......,{||||,.,,,,,,}}},}}..,||||,..}))),,..