Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001382758.1
Sequence Length
1366 nt
GC Content
0.4700
AGAACCGCGACCUCCGCAACCUUGAGCGGCAUCCGUGGAGUGCGCCUGCGCAGCUACGACCGCAGCAGGAAAGCGCCGCCGGCCAGGCCCAGCUGUGGCCGGACAGGGACUGGAAGAGAGGACGCGGUCGAGUAGAAGGAUGGAGGAGAGCAGUGUGGGAGAAGAACAUGAAGAUGAUUGAACUGCACAAUCAGGAAUACAGGGAAGGGAAACACAGCUUCACAAUGGCCAUGAACGCCUUUGGAGACAUGACCAGUGAAGAAUUCAGGCAGGUGAUGAAUGGCUUUCAAAACCGUAAGCCCAGGAAGGGGAAAGUGUUCCAGGAACCUCUGUUUUAUGAGGCCCCCAGAUCUGUGGAUUGGAGAGAGAAAGGCUACGUGACUCCUGUGAAGAAUCAGGGUCAGUGUGGUUCUUGUUGGGCUUUUAGUGCUACUGGUGCUCUUGAAGGACAGAUGUUCCGGAAAACUGGGAGGCUUAUCUCACUGAGUGAGCAGAAUCUGGUAGACUGCUCUGGGCCUCAAGGCAAUGAAGGCUGCAAUGGUGGCCUAAUGGAUUAUGCUUUCCAGUAUGUUCAGGAUAAUGGAGGCCUGGACUCUGAGGAAUCCUAUCCAUAUGAGGCAACAGAAGAAUCCUGUAAGUACAAUCCCAAGUAUUCUGUUGCUAAUGACACCGGCUUUGUGGACAUCCCUAAGCAGGAGAAGGCCCUGAUGAAGGCAGUUGCAACUGUGGGGCCCAUUUCUGUUGCUAUUGAUGCAGGUCAUGAGUCCUUCCUGUUCUAUAAAGAAGGCAUUUAUUUUGAGCCAGACUGUAGCAGUGAAGACAUGGAUCAUGGUGUGCUGGUGGUUGGCUACGGAUUUGAAAGCACAGAAUCAGAUAACAAUAAAUAUUGGCUGGUGAAGAACAGCUGGGGUGAAGAAUGGGGCAUGGGUGGCUACGUAAAGAUGGCCAAAGACCGGAGAAACCAUUGUGGAAUUGCCUCAGCAGCCAGCUACCCCACUGUGUGAGCUGGUGGACGGUGAUGAGGAAGGACUUGACUGGGGAUGGCGCAUGCAUGGGAGGAAUUCAUCUUCAGUCUACCAGCCCCCGCUGUGUCGGAUACACACUCGAAUCAUUGAAGAUCCGAGUGUGAUUUGAAUUCUGUGAUAUUUUCACACUGGUAAAUGUUACCUCUAUUUUAAUUACUGCUAUAAAUAGGUUUAUAUUAUUGAUUCACUUACUGACUUUGCAUUUUCGUUUUUAAAAGGAUGUAUAAAUUUUUACCUGUUUAAAUAAAAUUUAAUUUCAAAUGUAGUGGUGGGGCUUCUUUCUAUUUUUGAUGCACUGAAUUUUUGUGUAAUAAAGAACAUAAUUGGGCUCUAAGCCAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-439.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -465.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 364.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((.(((((.((.(((((..((((...(((((..((((....)))).)))))..((((((.((.....(((........))))).))))))))))..)))))..))...).)))).))))))..(((((.((((((((((..(.(((((((((((.(..(((.(((..((((((.......))))))...((((((.(..(((........((((((..(((.((((....((...))...)))).)))))))))...(((.((((.((((...(((((((((((.(((((.(((((((((((((...((((.(((.(((((..((((...((((((((((((((((((..(((..((.((((.((((((((((((.((((........)))))))).))).((((((...((((..(((((...))))).))))...)))))).....((((((....))))))))))).)))).)).)))..)))).))))))...........)))))))).........(((((((....)))))))..(((((.(((((....))))))))))(((((..(((..(((........)))..))))))))......(((((((((............((((........)))))))))))))...))))..)).))).))))))).))..((((((((..((((((.......(((((....)))))))))))..))))))))(((..((((....))))..)))))))))))((((....))))(((.((......))))).((((.(((((.......((((...))))...)))))..)))))))))))).))))))))).))..))))...............((((((((........(((((((((((.(((((..(.(.(((((((((.....).)))))....))).).)...))))).)....)))))))))).)))))))).....)))).)))((((((((((((.((((((......((((..((.(.....).))..)).))......)))))).)).)))))))))))))).))))))(((((.((((((((.(((......))).)))))))))))))..))))))..).))))))))))).)........))))))))))..)))))....(((((((((.....((((..((((..(((..(((...........)))..)))..))))..))))......))))))))).......................((((((((((((..((...((((((.(((((.........))))).))))))....))..)))))))..)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{.((((((.(((((,(,.(((((.{(((,..,(((((.{((({...|))),.))))).}|||.||}||...}}||{.(({{{{{{{{...))),))))))}.)))))..},...,.)))).))))))}.(((((.((((((((((,,(.(((((((((((.{..(((.(({..((((((.......))))))...,(((((.(..(((........((((((..(((.((((..,.((...)).,.)))).)))))))))...(((.(({(,((((,..{((((((((({.((((,,(((({{{{{((({,.,{({{((({,(((({{{(((({,.{(((((((((((((({((..{{{{{,(,((,{{{(((((((((((.((((........)))))))).)))))}|}}}...{{{(||{{(((.,,.||||.|||||,,.}}}})))}.))|)))),..}))}))}}}))},)))).}),)}},,))}}..}||||.{{{,,,.,,,}}|||}}}.,|||....(((((((....)))))))..{(((,,{{{{{,|||}|}||||}||(((((..(((..(((.,....,.)))..))))))))......((((((((((......,,...,,,,........},,))))))))))...,.,.,,|}.}}}.)))}||||||,.((((({((,,((((((.......(((({....}))))))))))..,))))}))|||..{{{{,...|||}..||||||||||}{(((....)))}{{(.{{......,,|||,(,((.,{{(((({.,.,((({...}})},,,))))},|||||)))))))).})))))))).))..)))}.....,,,.....,,||(((({{........(((((((((((.(((((..{.(.(((((((({.....}.))))),...,)).}.}...))))).)....)))))))))).)))))))),,.,,)))).)}){(((((((((||.{{{((|,,.,,,|||{.,{|,{,,,,.).)).,),.)),,,...)))))).,),)))))))))))))).)))))|(((((.((((((((.(((......))).))))))))))))),.))))))..}.))))))))))).).....,,.)))))))))}..}),))}}}.(((((((((..,.,(({{..{{((..{{,..{({...........))}..,}}..)))).,)}}),,....))))))))).......................((((((((((((..{,...((((((.(((((.........))))).))))))....,,..)))))))..)))))..
Back