Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001384918.1

Sequence Length

2765 nt

GC Content

0.5678

AGACACGGACUUGGGAAUGUUUUGAAACAACAGGAACGACAUCACCCUAGGUUUGUGUUUUCAAGCCAGAUAUUCCGGCGUGGAUGCUAAGAAUUCUUACAUGGGCAAGUAUUAAUAUUUGAAUGCAGCCGUGAUUGAGGUGGAGGUGGAGACAAAAGGCGUGCGUCCCUAGAACAUGUUUUGUCCCCACUGCCGGAGGGAAUAUUCUGUGUCAGCUAUCGCACGCACCCUUUCCCUCCAUGUGAGUGGACUCCACACUCUAAGCAAGGCGCUCUGGACUGCAAACUCAGCUUGUGCCUCUCUCCAGCCCUGUGGCCUCGCUGGACAAUUUUUCUAAUCUCUUUGGAGCUGAUCUUCAUGUUGAAAAAGGACAAGUCCCAUCUUCAGAUCAACACCUGUCCCAGCGCUGCCAUUUUGCCAAGGCUCCUCCUUGGAGUGUUUGUAAGGCACUUUUGCCACGAAGUAACCCAGCCACCAGCCUCAGUGGAACCUCCAAGCCUAAUUCUGGAGGAGACUUUAACUCGGUGACCAAAAGCCAGCCCCACUGUGAGUUGAACUCUUUCGUGUUGACCGGCCACUCUCCGUGCUCUGGAUGAUGUCGGAACACGACCUGGCCGAUGUGGUUCAGAUUGCAGUGGAAGACCUGAGCCCUGACCACCCAGUUGUUUUGGAGAAUCAUGUAGUGACAGAUGAAGACGAACCUGCUUUGAAACGCCAGCGACUAGAAAUCAAUUGCCAGGAUCCAUCUAUAAAGUCAUUCCUGUAUUCCAUCAACCAGACAAUCUGCUUGCGGUUGGAUAGCAUUGAAGCCAAAUUGCAAGCCCUGGAGGCUACUUGUAAAUCCUUAGAAGAAAAGCUGGAUCUGGUCACGAACAAGCAGCACAGCCCCAUCCAGGUCCCCAUGGUGGCCGGCUCCCCUCUCGGGGCAACCCAGACGUGCAACAAAGUGCGAUGCGUCGUCCCCCAGACUACAGUAAUACUCAACAAUGAUCGGCAGAACGCCAUUGUAGCCAAGAUGGAAGACCCCUUGAGCAACAGGGCACCGGAUUCCCUGGAAAAUGUCAUUAGCAACGCUGUGCCUGGGCGUCGGCAGAACACCAUUGUGGUGAAGGUGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCUCGGAGGCCAGCGACUCUGUGUCCAGCUGUGGGCAGGCGGGCAGUCAGAGCAUCGGGAGCAACGUCACGCUCAUCACCCUGAACUCGGAAGAGGACUACCCCAAUGGCACCUGGCUGGGCGACGAGAACAACCCCGAGAUGCGGGUACGCUGCGCCAUCAUCCCCUCCGACAUGCUGCACAUCAGCACCAACUGCCGCACGGCCGAGAAGAUGGCGCUCACGCUGCUGGACUACCUCUUCCACCGCGAGGUGCAGGCUGUGUCCAACCUCUCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCUGGACCCGCUCACCAUCUACGGCAUCCGGUGUCACCUUUUCUAUAAAUUUGGCAUCACAGAAUCCGACUGGUACCGAAUCAAGCAGAGCAUCGACUCCAAGUGCCGCACGGCGUGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCUGGCGGUCAAGAGCUUCUCGCGGAGAACGCCCAACUCGUCCUCCUACUGCCCUUCAGAGCCGAUGAUGAGCACCCCACCUCCUGCCAGCGAGCUCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCUGCACUACGCGCUGGCCAACGCACAGCAGGUGCAGAUCCACCAGAUCGGAGAAGACGGACAGGUGCAAGUAGGACACCUCCACAUCGCCCAGGUGCCGCAGGGGGAGCAAGUCCAGAUCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCUCCAGAUCCAUCACGUGGGGCAGGACGGUCAGGUGCUGCAGGGUGCACAGCUGAUCGCCGUGGCCUCCUCGGACCCCGCGGCGGCGGGCGUGGAUGGGUCGCCACUCCAGGGCAGCGACAUCCAGGUUCAGUACGUGCAGCUGGCGCCAGUGAGUGACCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCUGCAGCCCACGCUACAGCCGGAGAUGCAGCUCGAGCACGGGGCCAUCCAGAUUCAGUGAGCGGUGCCCAUGGCACCAGGAGCCCCUCGCCGGCUCCGCCUACGGCCCGGCCCCCACGCGCCCUGCUCUCACGGCCUCGGCACAGGCAGCGGCUGCACGUGUUCUGCUGAAGUGCGUCUGAAGGCCGCUGCCUCCGCGGGGAACAGCAUCCUAUCAACUGAAAGAGCAGCCGCCGCCGCCCCCAGCCGGAGACCCCUUUCGUUUGAGUCCUGCUGUUGGUGUCGGAGCACGAGGGGAGGCACGGUGCGGAGAGCGUCGCAUAUGCGCGGGAAAUCAAGAACUAUGAUAUUUUUCUGUUUAAACAGCUUUUUUUAAUUUGCUAUGGUGUUUAUAACAAAAAAGAAAAUUUGAAAAAAAAAAUCCCAGGGGAGUAGCAGGAGCCCUUUGCUGUGUGCUCUGUCCAGUGUCAUGAGACGGGAGCCCUUUGCUGUGUGCUCUGUCCAGUGUCAUGAGACGGGAGCCCUUUGCUGUGUGCUCUGUCCAGUGUCAUGAGACGGGAGCCCUUUGCUGUGUGCUCUGUCCAGUGUCAUGAGGCAGGUGUUUGCAAAGCCAGCUCUCGGUUCCGAUGGGGUAUUGCUGACCUACUUUUCUAGGGGAAAUGCUCUUAAACACUGUAAUUAUGCAUUUCUAAUGAAAUAAAAUGUAUUUAUGACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-999.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1051.85

Frequency: 0.0000

Diversity: 968.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((((((((.((((((((......)))....)))))...))))))))))))))(((((((..(((((((((((((((.(((((((....))))...((((..(((((........))))).(((........)))((.(((((.(((((((.(.((.(.......).)).).))))))).))))).))((((((((.....(((((..((....)))))))....))))))))....(((((.......))))).......((((((..((.(((((...((((((.((((..((((.((((((((((.((((((((..(......(((((.....)))))((((((((.............((((...((((.(((.(.......(((((((((((((((.(((...((((.((.(((((.....))))).)).)))))))(((((......))))).......((((........))))..((((((..........))))))(((.((((((((((((...............))))..)))))))).)))...)))))).((((((.((((((((.((((((.((..((((.....))))(((.(((((...(((.(((((((.((((.......(((((..(.(((((..((((((((((((...((.(.(((((((((((.....((.(((((.((((..................))))..).)))).))))))).....))))))).))..)))))......)))))))..((((((((((((............)).))))))))))((((((((((.(((.(((....))).)))....((((....((........))..))))..))))...)))))).......)))))).)))))...(((.(((((.((.((..(((((......))))).)).)).).)))).))))))).))))).)).)))....))))))))...(((.((((.((((((..((....)).)))).)).))))))).((((.....))))....(((.....)))..(((((..((.(((.((((((...(((((...)))))....))))))))).))...)))))))))).))).))))))))...))).))).((((.(((...(((((....(((((((....(((((.(((....((..((((((.........((((((((....(..(((....)))..).........(((..((((..((((((((((.....((((((((.(((....))).((((((((.((.(..(((...(((.(((.............))).))))))..).)).)))))))).........(((((.((..(((.((((....)))).)))..)))))))...))))))))..((((...(.((.((.(((((..((.((((.((((((((....(((..((.(((((((..(((.....)))..)))))))...))..)))..)))).............))))...........(((((((........))))))).....((.((((....)))).)))))).)).))))))).))..)...))))..))))))........)))).)))).)))..)))))))).......))))))...))..))))))))..)))))))))))).))).))))(((((((....((((((....)).)))).))))))).(((........)))......)))))))))......((.(((((...........)))))))).)))))))....)))))))))).)).)..)))))))).))((((((...(((((...)))))...))).))))))).)))).)))).)))))))))).((((((((..((....))..))))))))((((((.((((((.((.(((.......))).))..)))))).)))).))...))))))))))))).(((......))).((((((.........))))))..)))).)))..)))))))...((((((((.((((..((.....((((((.................((((((...)))))).((((((.......))))))(((...)))..))))))....))..)))))))).))))(((.((..(((((((((((..((((.(((....)))..)))).....)))))))))))..)).)))(((((((.....((((.((((((.(...(((..((........)))))....).)))))).))))....)))))))...((((((((.((((((..(((....((((((.(.((.(((....))))((((.............(((.(((((.((((((((((.(.................).)))))).))))...))))).)))............)))).(((.((.((((.((((.....))).).)))))).))).((.((((((.((((((((.(...((...(.((((((((..(((.(((..(((((.(((.(........).))))))))..))).)))..))).))))).)...))...).))))...)).)).)))))).)).).).))))))..)))..)))))))))))))))))))))))))..((((......))))((((((((...................))))))))..))))....................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((((((((((((.((((({({......}}}....)))))...))))))))))))))|{({.,,,,(({.{(((,((((,.((((,,,,...,{{{{((((({(..(((((........))))).}))}))..,}}||,((.(((((.((((({,.(((((..,,....},.))))))))))).))))).))((((((((.....(((((..((....)))))))....)))))))).,,,(((((.......)))))...},,.((((((((...((((....{(((({,((((,,(({{.((((((((((,({{(((((,,(......(((((.....)))))({((((((,,....,||....((({..,|||,.|{|,|,}}},,.,,{{|||{{{||||{,|||.,.((((.((.(((((.....))))).)).)))}((({,,,,||||,,,,.|,....,,{(({{..{{{.,.||||..((((((..........)))))),{,.{{{{((({((((..,....,{{,{..,||||{{||}}||||{||}.,{|||||,.{(((((,,{{(((((,,(((({,,,,.{|||},.}}))},,|||||||||,||||}||,||||}||||.....}}|{{{,,||,{|||{,|(((({{,((({(,,,((.(.(((((((((((.....((.(((((.((((....,.,,...,,.,...))))..)}}))).))))))).....)))))),,)).,)))}}.,,,},||},,,,,,((((((((((((....,.......))}}})))))))){|||||||||.(((.(({....))).)))....||||},,|||}}..........||||,.||||,,,|||}||{{,,...))|))|||||||{{{{{{.((({,..|,|||,((((({.....|})}|.|||}||||||}|,||,}|||.||....,|.,,,..||},||||.,...|||.{(((.((((((..((....}),)))).)).)))})|},((({....,))))....{({,....}},..(((((..{|.(((.{(((((...(((({...)))))....))))))))).}}...})))),.,|,,|||,||||||||.{{|||,||,.||||.||{.|}||{||}}}.|||||||||}}|{|||.|{{|,|.|{.,||{(((|...,....||||,,,.,}}}},.}|}}},,}}||,|,.{{||..{(((,,{{||,||||,(({{{{.....((((((((.((({|,.,,,.((((((((.((.{..(((...(((,(({...,.,,......}}}.}}}}))..}.)).))))))))....,||||(((((.{(..(((.((((....)))).}))..)}))))}...})))))))..{|||..,|.|{,||||{{{{..{(,((({{(({{,{{.{{{.(((({({.(({(((,..{{(,,,....|{{{{|.|||,..|...,|,,,||||.}}}}}}...,.,|||....},},),..||||||{.,{{,,||||}|||,..||.{||{{({|,,.||}||}}||}}.,|.|||}}}}.}},,}...))}}..||||||.{{{{.{{||},.,)}),},,},}))))))}.......}}}}})|,.}},.))})}})}.}},,,,))}))})}))).))),(((((((....((((((....)).)))).))))))).{||,,,,,.}})))......}}},}}}|}|..,,.{|,|||||}}...,,},,,}))))))).,)))))},,..))))})}}}}.}}.)..))))||||.}}{{((((.,.{(({{...))))},|.))).))))))).)))).)))).)))))))))}.,((((((,(((((((,,.{,||((((|(((((((,((({((,((,(((,{,...,}}|.||..}}}}}}.}}}|.,{{||||||||||,}{|{,|||.|||,,}.),|(((((,,,,.....}|||}}..}}}}}},,)))).,}}}...((((((((.((((..((.{...((((((...,.........}...((((((...)))))).((((((.......))))))(((...)))..))))))...,))..)))))))).)))){,{,||..{|||{{|||||}|||||,{{(....))},|}}}|,....))))))))))}}}))}))),.,,{{,.,,,.{{,,.{||,||.|}.}||}}}|}||||,,{{||,||||....}}}}}}.},},,}}}}))))}}))}},,),.),,)})))))}),)))))))))))))))))))))).})))),)}}}|||..,,,...,||,...,,||{|||,..,{({({((((({(({(,.{(....((({...))))..,.)).,))}}}))))))}...{{((((,,(((|,.,{.(((((.((((((.,..,((,(((((..(((.(((..(((((((((.(...((...{.((((((((..(((.(((..((({{{(((,(......,.).))))))))..))).)))..)))}}}))).}...))...).))))))))..))).)))..))))))}},..))))))...))))}.}}))))..))))))..,)))).((((......))))((((((((...................))))))))..,}}},,,.....,.,},,},....