Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001384931.1

Sequence Length

2783 nt

GC Content

0.5677

AGACACGGACUUGGGAAUGUUUUGAAACAACAGGAACGACAUCACCCUAGGUUUGUGUUUUCAAGCCAGAUAUUCCGGCGUGGAUGCUAAGAAUUCUUACAUGGGCAAGUAUUAAUAUUUGAAUGCAGCCGUGAUUGAGGUGGAGGUGGAGACAAAAGGCGUGCGUCCCUAGAACAUGUUUUGUCCCCACUGCCGGAGGGAAUAUUCUGUGUCAGCUAUCGCACGCACCCUUUCCCUCCAUGUGAGUGGACUCCACACUCUAAGCAAGGCGCUCUGGACUGCAAACUCAGCUUGUGCCUCUCUCCAGCCCUGUGGCCUCGCUGGACAAUUUUUCUAAUCUCUUUGGAGCUGAUCUUCAUGUUGAAAAAGGACAAGUCCCAUCUUCAGAUCAACACCUGUCCCAGCGCUGCCAUUUUGCCAAGGCUCCUCCUUGGAGUGUUUGUAAGGCACUUUUGCCACGAAGUAACCCAGCCACCAGCCUCAGUGGAACCUCCAAGCCUAAUUCUGGAGGAGACUUUAACUCGGUGACCAAAAGCCAGCCCCACUGUGAGUUGAACUCUUUCGUGUUGACCGGCCACUCUCCGUGCUCUGGAUGAUGUCGGAACACGACCUGGCCGAUGUGGUUCAGAUUGCAGUGGAAGACCUGAGCCCUGACCACCCAGGUACAGAGCUGUGGGACAUUGUUUUGGAGAAUCAUGUAGUGACAGAUGAAGACGAACCUGCUUUGAAACGCCAGCGACUAGAAAUCAAUUGCCAGGAUCCAUCUAUAAAGUCAUUCCUGUAUUCCAUCAACCAGACAAUCUGCUUGCGGUUGGAUAGCAUUGAAGCCAAAUUGCAAGCCCUGGAGGCUACUUGUAAAUCCUUAGAAGAAAAGCUGGAUCUGGUCACGAACAAGCAGCACAGCCCCAUCCAGGUCCCCAUGGUGGCCGGCUCCCCUCUCGGGGCAACCCAGACGUGCAACAAAGUGCGAUGCGUCGUCCCCCAGACUACAGUAAUACUCAACAAUGAUCGGCAGAACGCCAUUGUAGCCAAGAUGGAAGACCCCUUGAGCAACAGGGCACCGGAUUCCCUGGAAAAUGUCAUUAGCAACGCUGUGCCUGGGCGUCGGCAGAACACCAUUGUGGUGAAGGUGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCUCGGAGGCCAGCGACUCUGUGUCCAGCUGUGGGCAGGCGGGCAGUCAGAGCAUCGGGAGCAACGUCACGCUCAUCACCCUGAACUCGGAAGAGGACUACCCCAAUGGCACCUGGCUGGGCGACGAGAACAACCCCGAGAUGCGGGUACGCUGCGCCAUCAUCCCCUCCGACAUGCUGCACAUCAGCACCAACUGCCGCACGGCCGAGAAGAUGGCGCUCACGCUGCUGGACUACCUCUUCCACCGCGAGGUGCAGGCUGUGUCCAACCUCUCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCUGGACCCGCUCACCAUCUACGGCAUCCGGUGUCACCUUUUCUAUAAAUUUGGCAUCACAGAAUCCGACUGGUACCGAAUCAAGCAGAGCAUCGACUCCAAGUGCCGCACGGCGUGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCUGGCGGUCAAGAGCUUCUCGCGGAGAACGCCCAACUCGUCCUCCUACUGCCCUUCAGAGCCGAUGAUGAGCACCCCACCUCCUGCCAGCGAGCUCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCUGCACUACGCGCUGGCCAACGCACAGCAGGUGCAGAUCCACCAGAUCGGAGAAGACGGACAGGUGCAAGUAGGACACCUCCACAUCGCCCAGGUGCCGCAGGGGGAGCAAGUCCAGAUCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCUCCAGAUCCAUCACGUGGGGCAGGACGGUCAGGUGCUGCAGGGUGCACAGCUGAUCGCCGUGGCCUCCUCGGACCCCGCGGCGGCGGGCGUGGAUGGGUCGCCACUCCAGGGCAGCGACAUCCAGGUUCAGUACGUGCAGCUGGCGCCAGUGAGUGACCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCUGCAGCCCACGCUACAGCCGGAGAUGCAGCUCGAGCACGGGGCCAUCCAGAUUCAGUGAGCGGUGCCCAUGGCACCAGGAGCCCCUCGCCGGCUCCGCCUACGGCCCGGCCCCCACGCGCCCUGCUCUCACGGCCUCGGCACAGGCAGCGGCUGCACGUGUUCUGCUGAAGUGCGUCUGAAGGCCGCUGCCUCCGCGGGGAACAGCAUCCUAUCAACUGAAAGAGCAGCCGCCGCCGCCCCCAGCCGGAGACCCCUUUCGUUUGAGUCCUGCUGUUGGUGUCGGAGCACGAGGGGAGGCACGGUGCGGAGAGCGUCGCAUAUGCGCGGGAAAUCAAGAACUAUGAUAUUUUUCUGUUUAAACAGCUUUUUUUAAUUUGCUAUGGUGUUUAUAACAAAAAAGAAAAUUUGAAAAAAAAAAUCCCAGGGGAGUAGCAGGAGCCCUUUGCUGUGUGCUCUGUCCAGUGUCAUGAGACGGGAGCCCUUUGCUGUGUGCUCUGUCCAGUGUCAUGAGACGGGAGCCCUUUGCUGUGUGCUCUGUCCAGUGUCAUGAGACGGGAGCCCUUUGCUGUGUGCUCUGUCCAGUGUCAUGAGGCAGGUGUUUGCAAAGCCAGCUCUCGGUUCCGAUGGGGUAUUGCUGACCUACUUUUCUAGGGGAAAUGCUCUUAAACACUGUAAUUAUGCAUUUCUAAUGAAAUAAAAUGUAUUUAUGACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1010.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1064.33

Frequency: 0.0000

Diversity: 689.14

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((((((((.((((((((......)))....)))))...))))))))))))))((((.((((((...((((((.......(((((.(((..((((.((((..............((((((((..(((((..((((((((((((.(((((((.(.((.(.......).)).).))))))).)))))...((((((((.....(((((..((....)))))))....))))))))....(((((.......)))))..((..((((((...((.(((......))))).))))))..))...(((....))).((.((((.(((((((((((.((.(((((((((((.(((((((.(((.....(((....)))..((((((((.(((....(((((((..((((((...((((.((.(((((.....))))).)).)))))))(((((......))))).......((((........))))..((((((..........))))))(((.((((((((((((...............))))..)))))))).)))..((((((..(((((...((((((.....)))).)).)))))))))))((((((.....(((((.(((....(((.(.....))))....))))))))))))))....)))..)))))))))).)))))))).((((...)))))))))))))))).....)))))))......)).)).))))))..)))))))))))))))))).....)))))..))))))))......((((.......((((((((((((............)).)))))))))).))))..))).).))))))).))))).......))))))))))))..........(((((..((((((((..((((((...)).)))).((((((((((.(((....)))))..(((((.....(((((((((((((.(.(((((..((((((....((....((((((.........(((.((((.((((((..((....)).)))).)).))))))).((((.....)))).....))))))))....)))))).))))).).))))....(((((...)))))..((.((((((((.........(((.(((((.(((((.((((.((((((....)))).))..)))).)))))...)))))...)))((((.....(((..((((((((........)))......))))).)))((((((((..........(((((((.((.((..(.....)..)).))(((((((((((((.....((((((((.((.(..(((...(((.(((.............))).))))))..).)).))))))))(((.((((((((....))((((((.(......((((..(((.(((((.........))))).)))..)))))))))))))))))))))))))).....)))).))).....))))))))))))))).........((.((((.(((((.(..((((.(((..((.(((...(((((...(((..(((((((........)))))))..(((((((((((((.((.((((.(((..(((...)))..((((.(((.......))).))))...((((((...(.((((....((((((((..((((((((((.....((((((.(.((....(((((....)).))).(((((((....((((((....)).)))).)))))))...((((...(((.......)))...))))......((.(((((...........))))))))).).))))))..((((..........))))...((((....)))).....((((...))))))))))).)))..)))))).)).(((((.((((((..((((((((..((....))..))))))))((((((.((((((.((.(((.......))).))..)))))).)))).)).....))))))))))).(((......))).)))))))))))..))).))))..)).)))..)))).))))...)).)))))))).))).))...))).))))..).))))).))))))((((((...)))))).((((((.......))))))))))..))))))))))(..((((((.(((((((.((((...(((...(((.((((((((((((.(((....)))..)))).((((((..((((..(((....))).))))..))).))).........)))))))).))))))....))))))).((((((...(((((..((.......))..)))))....)))))).)))).))))))..).))))))))).)))))((((.............(((.(((((.((((((((((.(.................).)))))).))))...))))).)))............))))))))))))....((((((....((((...((((((((..(((.(((..(((((.(((.(........).))))))))..))).)))..))).))))).((((((....(((.(((((..(((.(((..(((((.(((.(........).))))))))..))).)))..))))))))...)))))).))))....))))))))))))))..))))).((((......))))((((((((...................))))))))..))))....................

Thermodynamic Ensemble Prediction

,((((((((((((((.((((({({......}}}....)))))...))))))))))))))|{({.....(((.((((.((((,.((((.......,{|||(((((,{..(((((........))))).})))))..,}}},.((.(((((.((((({,.(((((..,,....},.))))))))))).))))).))((((((((.....(((((..((....)))))))....)))))))).,{,(((((.......)))))...,,,.((((((((...((((....((((({{((((..((((.((((((((((.((((((((..(......(((((.....)))))(((((((({{,...}}}....((((.(((((..(((((.,.......(((((((((((((((,{.{{(((({((.(((((.....))))).)).,,..((((((((((((((((.,........((((........))))..((((((..........))))))(((.((((((((((((...............))))..)))))))).))).(((((((..(((((...((((((.....}))).)}.)))))})))))).{{|{(((((({(({{(((...,({{.{,....}))).,,.))))))}(((((((((((.(.(((..((((((.(({,((.(((((..(.(((((((((((.....((.(((((.((((.......,....,.,...))))..),}))).))))))).....))))))...{{.{((((((..((((.......((((((((((((............))})))))))))).)))).(((({({(.(({....})).)}}....((((..(((((..{(({.,..{{{{{{{{((((((,({{{{...}}.})))))..)))),{{,,,,.||||...|,}}},,|{|{......)))),.})}}))))...)))))...)))).....,,,....||}..(((.....))),,,))))))..))))))}.,){((({{.....})))).,,..))))))),))).))))))....))).).))))))))))))))))))}).......)))))))))))))))).))|,}}}}.}.)))),.......(((((.((((.((((((....)))).))..)))).))))).)))).))))))){|{{..,{{{(.(...,{,((((........)))).....})))).})),)))))))))).((((..((((((((({,{((({(({({(.....((((((((.((({{,.,,..((((((((.((.,..(((...(((,(({.....,,......})}.))})))..}.)).)))))))).,,.,||||((({{.{{.,(((.((((....)))).})},,}|)))}}...})))))))..((((...|.{{,{||(((((.,|{.{{{{{({.{,,,,|||.{((({(,.(({(((...{{(,{,....{(((({.|||,..{....|,.,)))}.}))}}}...,.,}}|....}}).)}..||||||,.,||,,|}||}||||..}}.{|||{{||,,.||}}|}}}}}}.,|.))))))).)},.}...))))..}|}}||.{({{,((({{{,,|},.,,,|||}}}}}|,,,,....||}|.||{.|{{.|||,,.||.||....)).)))))))).))).{((((({....((((((....)).)))).))))))),||,..,,,,)}))},..,..}),.}))}))..}},|||...,}))...,,)}))))))))))..)))),.....)))))))))).)).)..)))))))).))((((((.,.(((((...))))).,.))).))))))).)))).)))).))))))))))..((((((.((((((({..({(((((({(((((((,((({((,((,(((,{,...,|}|,||..|}}}}}.}}||,,{{{{||{{||||.,{{{,|||.|||,,}.)}|((((({{{{.,,,.,|||,,..}|}}}}..}})).,))}...((((((((.((((..((.{...((((((...,.........}...((((((...)))))).((((((.......))))))(((...)))..))))))...,))..)))))))).)))),,|}|},,,|||,,|||||}}||||,,{{.,,,))|,||}||,....))))))))))}}})))))),,{,{{,.,,,.{{,,.{||,||.|}.}||}|||}|||,..{{|{,||,,.,..|}},,,.,,)},}}}})))),,}|||,.}}.),,)}})))),),)))))))))))))))))))))).,)))).)))))))..{{{,...{{....,,}},||}}...((((((((((((((({.((.,..((({...))))..,.)).,))})}))))))}...((((((..(((,..,(.(((((.((((((....,((,(((((..(((.(((..(((((((((.{...((...(.((((((((..(((.(((..(((((((((,(......,.).))))))))..))).)))..)))}}}))).}...))...).))))))))..))).)))..))))))}},..))))))...))))).,,))))..))))))...)))).((((......))))((((((((...................))))))))..,}}},,,.....,.,,,,,,....