Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001386007.1

Sequence Length

1182 nt

GC Content

0.5431

AGCACUUCCCAGAAGAGAAAACUCCUCCAAAAGCAGCUCUCACUAUCAGAAAACCCAACUACAGUUGUGAACGCCUUCAUUUUCUGCCUGAGUCACUGUGCAUGGCAUCAUCCUGGCCCCCUCUAGAGCUCCAAUCCUCCAACCAGAGCCAGCUCUUCCCUCAAAAUGCUACGGCCUGUGACAAUGCUCCAGAAGCCUGGGACCUGCUGCACAGAGUGCUGCCAACAUUUAUCAUCUCCAUCUGUUUCUUCGGCCUCCUAGGGAACCUUUUUGUCCUGUUGGUCUUCCUCCUGCCCCGGCGGCAACUGAACGUGGCAGAAAUCUACCUGGCCAACCUGGCAGCCUCUGAUCUGGUGUUUGUCUUGGGCUUGCCCUUCUGGGCAGAGAAUAUCUGGAACCAGUUUAACUGGCCUUUCGGAGCCCUCCUCUGCCGUGUCAUCAACGGGGUCAUCAAGGCCAAUUUGUUCAUCAGCAUCUUCCUGGUGGUGGCCAUCAGCCAGGACCGCUACCGCGUGCUGGUGCACCCUAUGGCCAGCCGGAGGCAGCAGCGGCGGAGGCAGGCCCGGGUCACCUGCGUGCUCAUCUGGGUUGUGGGGGGCCUCUUGAGCAUCCCCACAUUCCUGCUGCGAUCCAUCCAAGCCGUCCCAGAUCUGAACAUCACCGCCUGCAUCCUGCUCCUCCCCCAUGAGGCCUGGCACUUUGCAAGGAUUGUGGAGUUAAAUAUUCUGGGUUUCCUCCUACCACUGGCUGCGAUCGUCUUCUUCAACUACCACAUCCUGGCCUCCCUGCGAACGCGGGAGGAGGUCAGCAGGACAAGGUGCGGGGGCCGCAAGGAUAGCAAGACCACAGCGCUGAUCCUCACGCUCGUGGUUGCCUUCCUGGUCUGCUGGGCCCCUUACCACUUCUUUGCCUUCCUGGAAUUCUUAUUCCAGGUGCAAGCAGUCCGAGGCUGCUUUUGGGAGGACUUCAUUGACCUGGGCCUGCAAUUGGCCAACUUCUUUGCCUUCACUAACAGCUCCCUGAAUCCAGUAAUUUAUGUCUUUGUGGGCCGGCUCUUCAGGACCAAGGUCUGGGAACUUUAUAAACAAUGCACCCCUAAAAGUCUUGCUCCAAUAUCUUCAUCCCAUAGGAAAGAAAUCUUCCAACUUUUCUGGCGGAAUUAAAACAGCAUUGAACCAAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-416.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -435.09

Frequency: 0.0000

Diversity: 156.46

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((((((((((((.....(((((((((((((((.((((((..(((((((..((((....))))((((....)))))))))))....)))..(((((((..(((...(((((((....(((.((((..............(((.((((((..............)))..)))))).......)))).))).))).))))..)))))))))).(.(((((.....................(((((((.((...)).)))))))....((((((((((((.(((((((((((..((((.......((.((((((((...........((((...)))).(((((((..(((.((((.(((((.(((((((((....)))))(((....((((((((((((...)))))..)))))))...)))....(((.(((.....))).)))......(((((....((.(((((((((.....(((((((((((........)).))))))))).))))))))).))....))))))))).))))))))).))))))))))..(((((((((((....)))...))))))))(((((((((((....).)).))))))))...)))))))).)).......)))).((((((....(((.((((.(((((((...((((((((......))))...))))...))).))).).)))).)))......))))))...............(((((.(((.((..............))))).)))))...........)))))))))))))))))))))))((((.((((.(((((((((..(((..(((((((((.(((...))))))).))))))))..))))....))).)).)))).))))......((((...((((((((....)))))))).))))))))).))))))))))))).)))))).......(((((.((((((.((..((((.........((((.((...(((.....(((....))).......)))...)).)))).)))).)))))).)).)))))(((((..............(((...((...))...))).............)))))..((((.......))))..))))))))).)))........................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....((((((((((((.....(((((((((((((((.((({{{..(((((({..((((....)))){(({....}))})))))))....}}}..((((((,.,(((...((({(((....(((.((((..............(((.((((((..,...........)))..)))))),),....)))).))).))).)))}..)))))))))).{.(((((.....................(((((((.((...)).)))))))....((((((((((((.(((((((((((..,((((({....((.((((((((..........,((({...}))).(((((((..(((.(({{{(((((.(((({((((....))))}(((....((((((((((((...)))))..)))))))...})},,,|{((,({,.....)))}}),......(((((....((.(((((((((.....(((((((((((........)).))))))))).))))))))).))....))))))))).))))))))).))))))))))..(((((((((((....)))...)))))))){((((((((((....).)).))))))))...)))))))).||.,.....|}}},((((((....(((.((((.{((((((...((((((((......))))...))))...)))}})).}.)))).)))......))))))...............||{||.|||,||............,,}}})).})))).....}.,...)))))))))))))))))))))))((((.((((,(((((((((..(({..(((((((((.(((...))))))).))))))))..))))....))).}),)))),))))......((((...((((((((....)))))))).))))))))).,))))))))))))})))))).......(((((,({((((.{,..((((.........((((.((...(((.....(((....))).......)))...)).)))).)))).,,)))).)).)))))(((((..............(((...,,...,}...))).............)))))..((((,{....}))))..))))))))).)))........................