Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001386613.1
Sequence Length
4796 nt
GC Content
0.4944
CCCUCCGUCCCUCUCCCUUGCGCACUUGCCGGGUACCAGCUGAGUGCAUCCUUUUCCCAAACCUGCUCUGCUUCCAAGGGGCCCUUUUCUGUCUCCUCCACCUGUCCCCAUGUUUUGGGGACUGCCUGGAAAUCCGGGACACCCUCCUGAGGAGGGAGCUGGUGCCCAACGGCACCUCUUAGGAUGAACCCAGCCAGCUGCGUUCCUGGCCUCUGCAGAAUGGCAUACAGAAGGCAUUUUAAGCAAGCGAGCUGAGCUCGCCGCAGGACUCCGACUACCAGGCACCGAUCCAGACACAUUAGUCAAGCUGCAGCCAAAGUCGACGUUGAAUUUGAUUAUGAUGGGCCUCUGAUGAAGACGGAAGUCCCAGGGCCUAGAUCUCAGGAGUUAAUGAAACAGCUGAAUAUAAUUCAGAAUGCAGAGGCUGUGCAUUUUUUCUGCAAUUACGAAGAGAGCCGAGGCAAUUACCUGGUUGAUGUGGACGGCAACCGAAUGCUGGAUCUUUAUUCCCAGAUCUCCUCUGUCCCCAUAGGUUACAGCCACCCCGCCCUGCUGAAACUCAUCCAACAGCCUCAAAAUGCGAGCAUGUUUGUCAACAGACCCGCCCUCGGAAUCCUGCCUCCGGAGAACUUUGUGGAGAAGCUCCGGCAGUCCUUGCUCUCGGUGGCUCCCAAAGGGAUGUCCCAGCUCAUCACCAUGGCCUGCGGCUCCUGCUCCAAUGAAAACGCCUUAAAGACCAUCUUCAUGUGGUACCGGGCCCCUGGCUGCCCCGACUACAGCAUCCUCUCCUUCAUGGGCGCGUUCCAUGGGAGGACCAUGGGUUGCUUAGCGACCACGCACUCUAAAGCCAUUCACAAGAUCGACAUCCCUUCCUUUGACUGGCCCAUCGCACCGUUCCCACGGCUGAAAUACCCUCUGGAAGAGUUUGUGAAAGAGAACCAACAGGAGGAGGCCCGCUGUCUGGAAGAGGUGGAGGAUCUGAUUGUGAAAUAUCGGAAAAAGAAGAAGACGGUGGCCGGGAUCAUCGUGGAGCCCAUCCAGUCCGAGGGUGGAGACAACCACGCAUCCGAUGACUUCUUUCGGAAGCUGAGAGACAUCGCCAGGAAGCAUGGCUGCGCCUUCUUGGUGGACGAGGUCCAGACCGGAGGAGGCUGCACGGGCAAGUUCUGGGCCCAUGAGCACUGGGGCCUGGAUGACCCAGCAGACGUGAUGACCUUCAGCAAGAAGAUGAUGACUGGGGGCUUCUUCCACAAGGAGGAGUUCAGGCCUAAUGCUCCCUACCGGAUCUUCAACACCUGGCUGGGGGACCCGUCCAAGAACCUGUUGCUGGCUGAGGUCAUCAACAUCAUCAAGCGGGAGGACCUGCUAAAUAAUGCAGCCCAUGCCGGGAAGGCCCUGCUCACAGGACUGCUGGACCUCCAGGCCCGGUACCCCCAGUUCAUCAGCAGGGUGAGAGGACGAGGCACCUUUUGCUCCUUCGAUACUCCCGAUGAUUCCAUACGGAAUAAGCUCAUUUUAAUUGCCAGAAACAAAGGUGUGGUGUUGGGUGGCUGUGGUGACAAAUCCAUUCGUUUCCGUCCCACGCUGGUCUUCAGGGAUCACCACGCUCACCUGUUCCUCAAUAUUUUCAGUGACAUCUUAGCAGACUUCAAGUAAAGAAGCCAUUUCCACUACAGUGAGAAAGCCCGGAUCCCAACAGUUGUCAAAUUGAUUAGUUUGCCUAAUUCAUGUUUUCACUUAAAAGUAUCAGAGGUGAAUGCACAGUGAAGGGUGAUUUGUGGGGAGGGAGCAUUUUUGGUGGUCUUGGGGGAGGGGAGGGGAGGGAAGGGCUGGUGUUGAUUUUCCUCCCUGCAGAGCCAAUGGUGCACAUUGGUUUAAGCCCAGAGAUCCUGCUUGAGCCCUGGACUCAUCUUGGGAAGGGCCAUGGGAGGUCCUGGCUAGAGUUCUGCCCAACCUUGACCAACCCCAGCAAUUUUUCCAAAAGCCAGUCAAGGGCAUUACAUUUGUUCCUGGGACUGGCAGCUGGGCCUCCUGGGUGCCAGUCCAUCUCAAGUGCCAUAUUCUGUGAUCACGGAUGUUGGCUCCCCCUCGCCCUAUGCAAGCAAACACACUCUCACCUCCUCUCCCAGCCUCCCGGAGCUCUGAGCACGCCCCACGCAUGGUGCAGGAGGGACUGGACAGAUCUGAGGAAGGCCGUAAAAUGGGGACAGGAGGAUUCAGCUCAGGAGUAAGGGAAGAGGUCCUCUGGCCCCCUGAAGAUGAGAAUCACCCCUCUCAGUGCACCUGGGGAUCCCCCUAAACUGUGAAUUCUGCCCUGGACAGGGCUUUGCCCUUGGAGGAUCCCCAGGUGGCCUUACCCGUGAUUCUUACUCGGCAUCCUCCAUUCCCCAAACUCCCUCCUCCCUGUUAAAUGUCAACCUAGACCUGGACCUGGGUGGGAGGAAACUGUAGCCUGAGUGUCCACAGGGACACACGUGAGCCACAGGGCUAGAAGCACAGGCCCGUCACCCCAGGAGGAAAAGCCCAGGGUCUGGGGCAGCAGAGCCAUCGCAUCAUGUUUCCCAGGGCAACUUGAGGUCUGACUUUUGGCUCCCUCGCCCUAAGAGGCUCUUCCUCUCUUUUGCUCAUCCACCUUCACACCACUUGUGAGCUGACCCCCAGGAACAGCUUGGCUGUUCCACCAGAGCAGAGGGAAUCAUUGCUGGACUGGAUUUCUUCUGGAGGGAAGCACCAUGAAUUAAAGGUGCCAGAGCUCCAUGCAUGGAAAAGUGGCCUGUUGGUUCAACGUGGUUUCCUUGUACUUGAUCCUCCUGAAAUGAGAGAUUUUCCUGAGAUGACUGAGUAUGGAGAUUACCAGGCAGAUGAUACCGAAAUGCUUAAAGGGGCUGUGGCUGAGGCUGUAGCAUCUCUGCUGGAGGUGAGACACUCUGGGAACUGAUUUGACCUCGAAUGCUCCUAAAAGAGAACUUGAUAGCCUGACAGCAGAGAAGUAUUAUUUGGUGGGGAGUCUGAGAAAGCCUGGCUUGUAUUAUCUGUCCAAAAGGAAGCCUCUUCAUCUCCCGGUGCCUUGGUUGACUAUUUUGGAAAUAGGCAUAUCAAGGUUCCUGAUUCAGCACUUUGCUCUUUUAAUAACAAAUCGUCCAAAGAUCUCAAAGUAAGGGUUUUUUUUUUUAGCUUCCACUCUUCCGCAGACUUGGUCAUCGACCUAUUUUUGUUGAAGAAUGAAAGGCAAUGACAAGUUUAACAUAUACAAAUUCGUGAAUUCUUGUUCAUUUUGCAUUCCUGCAGUCAGUGCUAAUCCGUCGUUCUUAAUCAGGAGUUCUGCCAGGUUUAAGGUCACCUGCACUCCCAGCCAAGUGGUGAUGUAUGCCUCCCACUCUCUGCAAGGUUUUCCUCAUUUUUAUAUUCAUUUAUUCAUCAUUCAUUCAUUCACCUAACUUUCAUUAAAUAGCUGCACCAUCCCAGGCCCUGUGCGGAGCAUCGGGAAUACAAAGAUGAGAUAAAACAUUGUCCCUGCCCCCGGGGGCUCACAUGCCACUGGAAACAACAGACUCUUAAACUAACAAUUCAAGCAGGCGCCAAGUGCUAUGACAGAGGUGUGAAUAAAAGCAUCAGGAAAUCGGAUGGAGAACCACCAUUCACCCAAGGGUCAGAGGAGGUUUCAAAGAAAAGGUGUCAUUGGAGCAGUGUUUUGCAGAAUGAGCCAGAGUUCACCAAGCAGGCAAGGCAAGGAAGGGUGUUGCAGAGAGGGAACAGCAUAUGCAAAGGCGUAUCAGUUCAUGGCAUCACAUCUUUCACUGGGGAAGCCAGUUUCCACAGGCAGCAUCCCAAGGUUCAAUAAGGCCUUAUUUAACAAGCAAGCAAAAUGCAAACCAAACCAUUAUUCAUUUAUUGGCUUAAGUAUGCUUUCUCCUGAAAACUUUAGCAUUGGGUGCAAAUAUUCAGUAUGGUUCUCGGAGUCCAAAGGGUUUUAAGCCAGGGCACAACCAGAAAAGUGGCUCUCUUUGGUAGGGAGAGGGGCUCCAAUAUUUCGUUCUCUCCCCAUGGGGCACUGACAGAGAAAUGAAAUAGUUUUAUCUGGAAAAUUCCAGAGCUAUUAUUUACUCCUUACCAAGGGAAGUUACUUCUUGUAAAAACUUUUAAGCCAUUUAUCAACAAGUUCUUGUUGACUCAGGGCAUAAUGAGUUCCUGAGACAUGCUCUUUUGGGGGCUGGGGCUUUAGCUAGAAGAAUUUCAAGGAAAAGAAUUCUCAGCAGAGCUCAAGAUUGUAGAAACUCAGCAGAAGCUGGUAAAAACAUGGGGAGCCCGGAGGACAGGCUGCUGUCCAGGGCAGAGGCCAUGAAGAAGUGCUUCCGUGGCCGACAGUCUGGAAAUGAAUCCAUCAUACAUUAGUGCCAUAGAGUUUAGUAACCGUCCAGCAAGUGUCAUCACUUUUACAGAAAACAAGGUCCAGUAAUAGCAAGUCUUAGUACAUCCUCACUUUUAUUAUAAAUGGGUGUUUUUUCAUAAUUUUUACUGACGCUCAGUAACCAUGCAAAAUUGUGUAUAGCAUUAAUGUAUCUACAUACCUACACCUAUCUAUAUAUAAGCUCAUGGUAGAAAACCAUAGCUAAGUAGCAUCGCAGACUUAAGCGUACAAAGUGAUCUUGUUCACAAGUAAUCUGUUGACAGUGCCAAUAAAUGAUAAAAAAAAAAUUAACAUGUCACAAUGUAACGGAUGACCAUAUGCACAAUUCCAUGAAUUAAAUCUGUUUCCUGUGUUAGUCAGUAUUCUUAAAUAAAAUUUAUAAUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1614.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1698.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 1254.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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