Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001386682.1

Sequence Length

1840 nt

GC Content

0.4190

AUAGCAAGAGUGGAGAAAAAGCCACACACAGGGGAGAAGACAGGGGUUGGACUGAUGCCUCUACAAAGCCAGGAAUACCAAGGAUUUCCAACAACCACCACGAUCUUGGAGAGAGGCAUGGAACAGACUCUCCGUUAGAACCCACAGAAAGAACCAAUCCUGCCAACACCUGGAUCUUGGACUCCAGCCUCCAGAACUGUGGGGGGAAUCAGAUCCUGUUUGUAUGCUUAUGGAAUUAUCCAGAAGUAAAAGGGGUGAAUGAUGUAGAGGAGAAGGAAGGGAUAACUGUGCCAUCUUUGAAAAGGCAACUGGAAAUGGGAUCCAGAGUAAAGUGGAGAGAACCAGGGAAGAUUCCAUUAAACUGGACCAGAAGCUUGAAAGAAGAGAAGUGGCUUAGUAAACAAGGAACAAACUAGAAAUAAGAUAUGUGGAACGGAGUUAUGUAUCAAAACCCACUUUGAAGGAAGUGGUCAUAGUAAGUGCUACAAGAACACCCAUUGGAUCUUUUUUAGGCAGCCUUUCCUUGCUGCCAGCCACUAAGCUUGGUUCCAUUGCAAUUCAGGGAGCCAUUGAAAAGGCAGGGAUUCCAAAAGAAGAAGUGAAAGAAGCAUACAUGGGUAAUGUUCUACAAGGAGGUGAAGGACAAGCUCCUACAAGGCAGGCAGUAUUGGGUGCAGGCUUACCUAUUUCUACUCCAUGUACCACCAUAAACAAAGUUUGUGCUUCAGGAAUGAAAGCCAUCAUGAUGGCCUCUCAAAGUCUUAUGUGUGGACAUCAGGAUGUGAUGGUGGCAGGUGGGAUGGAGAGCAUGUCCAAUGUUCCAUAUGUAAUGAACAGAGGAUCAACACCAUAUGGUGGGGUAAAGCUUGAAGAUUUGAUUGUAAAAGACGGGCUAACUGAUGUCUACAAUAAAAUUCAUAUGGGCAGCUGUGCUGAGAAUACAGCAAAGAAGCUGAAUAUUGCACGAAAUGAACAGGACGCUUAUGCUAUUAAUUCUUAUACCAGAAGUAAAGCAGCAUGGGAAGCUGGGAAAUUUGGAAAUGAAGUUAUUCCUGUCACAGUUACAGUAAAAGGUCAACCAGAUGUAGUGGUGAAAGAAGAUGAAGAAUAUAAACGUGUUGAUUUUAGCAAAGUUCCAAAGCUGAAGACAGUUUUCCAGAAAGAAAAUGGCACAGUAACAGCUGCCAAUGCCAGUACACUGAAUGAUGGAGCAGCUGCUCUGGUUCUCAUGACGGCAGAUGCAGCGAAGAGGCUCAAUGUUACACCACUGGCAAGAAUAGUAGCAUUUGCUGACGCUGCUGUAGAACCUAUUGAUUUUCCAAUUGCUCCUGUAUAUGCUGCAUCUAUGGUUCUUAAAGAUGUGGGAUUGAAAAAAGAAGAUAUUGCAAUGUGGGAAGUAAAUGAAGCCUUUAGUCUGGUUGUACUAGCAAACAUUAAAAUGUUGGAGAUUGAUCCCCAAAAAGUGAAUAUCAAUGGAGGAGCUGUUUCUCUGGGACAUCCAAUUGGGAUGUCUGGAGCCAGGAUUGUUGGUCAUUUGACUCAUGCCUUGAAGCAAGGAGAAUACGGUCUUGCCAGUAUUUGCAAUGGAGGAGGAGGUGCUUCUGCCAUGCUAAUUCAGAAGCUGUAGACAACCUCUGCUAUUUAAGGAGACAACCCUAUGUGACCAGAAGGCCUGCUGUAAUCAGUGUGACUACUGUGGGUCAGCUUAUAUUCAGAUAAGCUGUUUCAUUUUUUAUUAUUUUCUAUGUUAACUUUUAAAAAUCAAAAUGAUGAAAUCCCAAAACAUUUUGAAAUUAAAAAUAAAUUUCUUCUUCUGCUUUUUUCUUGGUAACCUUGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-518.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -555.38

Frequency: 0.0000

Diversity: 415.55

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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