Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001387175.1
Sequence Length
3988 nt
GC Content
0.6061
GGCGACGCGCACGCGCGCCAGCCCGGCUCGCGCCCUCUCGCUUUCCUCCAGCCGCGAGACCCCCUCCCCUUCCGCCUCGCGGCGCUUCCUCGCGCCGCGGUCUUCUCUCUCCACCCCCGACACCGCGGGGCUCCCCCCGCCCGCCCACGGCGGGCCCCGGCUGCCCGAUCCCCCUCGCUUCCCGCGCUCUCCAGCGGGGCCCCAGCCCCGGCCCCCUCUCUCCCUCCCUUCUCUCUAAUUCCCCUUCCGGACGCUGCCAUCAUGUUGAAGCCUCAGCCGCUACAACAGCCCUCCCAGCCCCAGCAGCCGCCCCCCACGCAACAGGCCGUGGCCCGUCGGCCCCCCGGGGGCACCAGCCCUCCCAACGGCGGCCUCCCGGGGCCGCUGGCCACCUCUGCGGCUCCUCCCGGGCCUCCAGCGGCCGCCUCCCCCUGCCUGGGGCCUGUGGCCGCUGCCGGGAGCGGGCUCCGCCGGGGAGCCGAAGGCAUCUUGGCGCCGCAGCCGCCGCCGCCGCAGCAACACCAGGAGAGGCCGGGGGCAGCCGCCAUCGGCAGCGCCAGGGGACAGAGCACAGGAAAGGGACCCCCACAGUCACCUGUGUUUGAAGGCGUCUACAACAAUUCCAGAAUGCUGCAUUUCCUUACAGCUGUUGUGGGCUCCACUUGUGAUGUAAAGGUGAAAAAUGGUACCACUUAUGAGGGUAUCUUCAAGACGCUAAGCUCAAAGUUUGAACUAGCCGUGGAUGCUGUGCACCGGAAAGCAUCUGAGCCAGCAGGUGGCCCUCGUCGGGAGGACAUUGUGGACACCAUGGUGUUUAAGCCAAGUGAUGUCAUGCUUGUUCACUUCCGAAAUGUUGACUUCAACUAUGCUACUAAAGACAAGUUCACCGAUUCAGCCAUUGCCAUGAACUCGAAAGUGAAUGGGGAACACAAAGAGAAGGUGCUUCAGCGCUGGGAGGGGGGUGACAGCAACAGCGACGACUAUGACCUCGAGUCUGACAUGUCCAAUGGAUGGGACCCCAAUGAAAUGUUCAAGUUCAAUGAGGAGAACUACGGUGUGAAGACUACCUAUGAUAGCAGUCUUUCUUCUUAUACGGUGCCCUUAGAAAAGGACAACUCAGAAGAGUUUCGUCAGCGAGAGCUGCGUGCGGCCCAGUUGGCUCGAGAGAUUGAAUCAAGCCCCCAGUACCGCCUACGGAUCGCCAUGGAGAACGACGAUGGGCGCACUGAAGAGGAGAAGCACAGUGCAGUCCAGCGGCAGGGCUCAGGGCGGGAGAGCCCCAGCUUGGCAUCCAGGGAGGGGAAGUAUAUCCCUCUGCCUCAACGAGUCCGGGAAGGUCCCCGGGGAGGAGUUCGAUGCAGCAGCUCUCGGGGCGGUCGGCCUGGCCUUAGCUCUUUGCCACCUCGUGGCCCUCACCAUCUGGACAACAGCAGCCCUGGCCCAGGUUCUGAGGCCCGUGGUAUCAAUGGAGGCCCUUCCCGCAUGUCCCCAAAGGCACAACGGCCUCUGAGAGGUGCCAAGACUCUGUCUUCGCCCAGUAAUAGGCCUUCUGGAGAAACUUCUGUUCCACCUCCUCCUGCAGUGGGCCGGAUGUAUCCCCCGCGUUCUCCCAAGUCUGCUGCCCCUGCCCCAAUCUCAGCUUCCUGUCCAGAGCCUCCCAUCGGCUCGGCAGUGCCAACCUCUUCAGCCUCCAUCCCUGUGACCUCAUCAGUCUCAGAUCCUGGAGUGGGCUCCAUUUCUCCAGCUUCUCCAAAGAUCUCCCUGGCCCCCACAGAUGUAAAAGAACUCUCUACCAAGGAACCUGGGAGAACUCUGGAGCCCCAGGAGCUGGCUCGGAUAGCUGGGAAAGUCCCUGGUCUUCAGAAUGAACAGAAACGAUUCCAACUGGAAGAACUGAGAAAGUUUGGGGCCCAGUUUAAGCUUCAGCCCAGUAGCUCCCCUGAGAACAGCCUGGAUCCUUUUCCUCCCCGGAUCUUAAAGGAGGAGCCCAAAGGAAAGGAGAAAGAGGUUGAUGGUCUGUUGACUUCAGAGCCCAUGGGGUCUCCCGUCUCCUCCAAGACAGAGUCCGUAUCGGAUAAGGAGGACAAACCACCCCUGGCACCAUCAGGAGGCACUGAGGGGCCAGAGCAGCCCCCACCACCUUGUCCAAGCCAAACUGGCAGCCCCCCGGUGGGCCUCAUCAAGGGAGAAGACAAAGAUGAGGGCCCUGUUGCUGAACAAGUAAAGAAAUCAACGUUGAACCCUAAUGCUAAGGAGUUCAAUCCUACAAAGCCUCUGCUGUCUGUGAAUAAAUCCACCAGUACCCCAACUUCUCCGGGGCCCCGGACUCAUUCAACUCCCUCCAUCCCGGUGCUGACAGCAGGCCAGAGUGGGCUAUACAGCCCCCAGUACAUCUCCUACAUACCUCAGAUCCACAUGGGACCAGCUGUGCAGGCACCUCAGAUGUAUCCAUAUCCUGUAUCCAAUUCAGUGCCUGGGCAGCAGGGCAAGUACCGGGGAGCAAAAGGCUCCCUUCCUCCGCAGCGCUCGGACCAACACCAGCCAGCCUCAGCCCCGCCGAUGAUGCAGGCCGCCGCGGCUGCUGGCCCGCCUCUGGUGGCUGCCACGCCCUAUUCUUCCUACAUCCCCUACAACCCUCAGCAGUUCCCAGGCCAGCCAGCCAUGAUGCAGCCCAUGGCCCACUACCCCUCACAGCCGGUGUUUGCCCCCAUGCUUCAGAGCAACCCACGCAUGCUGACGUCGGGCAGCCAUCCCCAGGCCAUCGUGUCAUCCUCUACCCCUCAGUACCCUUCUGCAGAGCAGCCUACCCCCCAAGCCCUUUAUGCCACUGUUCACCAGUCCUACCCACACCAUGCCACACAGCUCCAUGCCCACCAGCCGCAGCCGGCUACCACGCCUACUGGAAGCCAGCCGCAGUCCCAGCAUGCGGCCCCCAGUCCUGUCCAGCAUCAGGCGGGGCAGGCCCCACACUUGGGCAGUGGACAGCCACAGCAGAAUCUGUACCACCCAGGGGCCCUGACAGGCACGCCGCCCUCUCUGCCACCGGGACCUUCUGCCCAGUCCCCUCAGAGCAGCUUCCCCCAGCCAGCCGCUGUGUAUGCCAUCCACCACCAGCAGCUGCCCCACGGCUUCACCAACAUGGCCCAUGUUACCCAGGCCCAUGUCCAAACUGGAAUCACAGCAGCCCCGCCCCCUCACCCUGGGGCUCCCCACCCGCCCCAGGUGAUGCUGCUGCACCCACCCCAGAGUCAUGGGGGGCCCCCCCAAGGCGCGGUGCCCCAGAGUGGGGUGCCUGCACUCUCAGCUUCCACACCCUCACCCUACCCCUACAUCGGACACCCCCAAGUAUGUAGGGUGGGCAGAAGCCACAGUCGCCGCCGCCAGGGGCUUGCUCCUGGCUCUGUCCUUUGCUUCCCUCCGUCCUCGCUCAGUUGUGAUCCAGCAGCCCCCCUCCCCACUGCCUCCCCAGCUCUCAGUGACCCCGACUGUCUCCUGACUUAGCCGAGCUCCCCUUCCACCCCCCGGGGAACUGAAGAUUGUCCUGGCCGCGACCUGAGACCUCCAUGAGUGGAGGGAAGAGUGAUCUAUGUCUCUUCCCCCAGCAGCUCGGACCACUCCCAGCCCCCCAUCCCCCCGUUCCCCAGGGGAGCUGGGGAAUUCCUGCCAAGCACCUUGAAUGGGAGGGGCCUCACAGAGGGCAGGGCCAGGGUCCAGCAGGGGUGGGGGGUUCCUGCUCUGCCCCUGCCCGUCCCCACCCAGUCUUGCCCUCCCAUCCUCUCAUCUAUUCCCCCGCUGGAGACGGAAGAUCUUUUAUUUUCUAUUAUUUAUAACUUCAGACUUGGGCCCCCUGUUCUUUCUUUCCCAUUAACUUGAGUGACCUGUGUGAGAGACAGACAGAUGCCCCACGAGGAUGGCUGGACAAGGACUUUUACUUUUUAUUACAUAAAAAUAUUAAAAAAUAAAUAAAAAAAAUAAAAUUUUAAACUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1499.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1568.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 1130.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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