Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001389468.1
Sequence Length
1726 nt
GC Content
0.6205
ACUAUGGCCAGGGGAGGGGAGAGGCAGGAGGGCCUGGGCAGGACAAAGGACCCUGGUCAGUCGGGGACAUGAAAGACGCACAACCAGAACCGGUGGAAGAAACAGAAUUAAACACACCCUGAACCUUUCCCACCGCAACUCUGCCGGCUGCACCCUCUGGGUCAAGAUGUGAGGCAGAGUGGCUCCUCACAGCCUGAAGCUCAUCCUUCUGCACGGGCCAGCCAGGCCAGCACAGAGGCACCAGGGCAGCAGUGCACACAGGUCCCCGGGGACCCCACCAUGUGGAGCGGAUGGUGGCUGUGGCCCCUUGUGGCCGUCUGCACUGCAGACUUCUUUCGGGACGAGGCAGAGAGGAUCAUGAGGGACUCCCCUGUCAUUGAUGGGCACAAUGACCUCCCCUGGCAGCUGCUGGAUAUGUUCAACAACCGGCUGCAGGACGAGAGGGCCAACCUGACCACCUUGGCCGGCACACACACCAACAUCCCCAAGCUGAGGGCCGGCUUUGUGGGAGGCCAGUUCUGGUCCGUGUACACGCCCUGCGACACCCAGAACAAAGACGCCGUGCGGAGGACGCUGGAGCAGAUGGACGUGGUCCACCGCAUGUGCCGGAUGUACCCGGAGACCUUCCUGUAUGUCACCAGCAGUGCAGGCAUUCGGCAGGCCUUCCGGGAAGGGAAGGUGGCCAGCCUGAUCGGCGUGGAGGGCGGCCACUCCAUUGACAGCAGUUUGGGCGUCCUGCGGGCACUCUAUCAGCUGGGCAUGCGGUACCUGACCCUCACCCACAGCUGCAACACGCCCUGGGCUGACAACUGGCUGGUGGACACGGGAGACAGCGAGCCCCAGAGCCAAGGCUUGUCACCCUUUGGGCAGCGUGUGGUGAAGGAGCUGAACCGUCUGGGGGUCCUCAUCGACUUGGCUCACGUGUCUGUGGCCACCAUGAAGGCCACCCUGCAGCUGUCCAGAGCCCCGGUCAUCUUCAGCCACUCCUCGGCCUACAGCGUGUGCGCAAGCCGGCGCAACGUGCCUGACGACGUCCUGAGGCUGGUGAAACAGACAGACAGCCUGGUGAUGGUGAACUUCUACAACAAUUACAUUUCCUGCACCAACAAGGCCAACCUGUCCCAAGUGGCCGACCAUCUGGAUCACAUCAAGGAGGUGGCAGGAGCCAGAGCCGUGGGUUUUGGUGGGGACUUUGAUGGUGUUCCAAGGGUCCCUGAGGGGCUGGAGGACGUCUCCAAGUAUCCAGACCUGAUCGCUGAGCUGCUCAGGAGGAACUGGACGGAGGCGGAGGUCAAGGGCGCACUGGCUGACAACCUGCUGAGGGUCUUCGAGGCUGUGGAACAGGCCAGCAACCUCACACAGGCUCCCGAGGAGGAGCCCAUCCCGCUGGACCAGCUGGGUGGCUCCUGCAGGACCCAUUACGGCUACUCCUCUGGGGCUUCCAGCCUCCAUCGCCACUGGGGGCUCCUGCUGGCCUCCCUCGCUCCCCUGGUCCUCUGUCUGUCUCUCCUGUGAAACCUGGGAGACCAGAGUCCCCUUUAGGGUUCCCGGAGCUCCGGGAAGACCCGCCCAUCCCAGGACUCCAGAUGCCAGGAGCCCUGCUGCCCACAUGCAAGGACCAGCAUCUCCUGAGAGGACGCCUGGGCUUACCUGGGGGGCAGGAUGCCUGGGGACAGUUCAGGACACACACACAGUAGGCCCGCAAUAAAAGCAACACCCCUUCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-735.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -765.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 496.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((...((((((((((((..(.(((.(((((..((((((......(((((.((((((((((....................((((..(((((((((...(((.............)))...)))..))))))....))))))))))).)))....)))))....(((((((.....(((((..(((((((((((((...((((((..(((.((..(((((((((..((((.(..((......))..).))))......((((((((((((((((((((.((...)).)))))).((((.((((((((((((((((((((((((.((......))((((((..((((.((((.((...((((....))))(((((((.......)))))))(((.((((.((((((.((...........))..))))))))))..)))(((.....)))........(((((((........))....(((((((((((.....)))).))).)))))))))(((((((...((((...(((...)))))))))))))).....(((.((((((.((((..((...........))..)))).)))))))))((((......)))).)))))).)))).)))).)).)))))))))))....(((..(((((((......))))))).))).(((.....)))..(((.((((((((((.......((.(((((((((((((.(.(((((((.....((((((((..((.((........)).)).)).))))))..((((((..((((((((....(((((((..(((.((((.....(((((((..........)))))))....(((((((((((.((((((((.(((.((...((....)))).))))))))(((.((.....)).))).((((((........))))))...)))))))))))))).)))))))....)))))))....))))))))..))))))((((......))))...)))))))).)))))))..)))))).)).....(((((...((((.((..(((((..........................))))))).))))....)))))...)))))))).)).))))).)))))...))).))).))))..(((((((((...))))))))).(((((.........)))))..))))))))).)))))(((((.....)))))....(((.(((((..(((((...(((.((((......)))).))).))))))))))..))).)).)))))))....))))).)))))))))).)))))))))....)))))....))))))).(((((((.((((((.((((...(((((((...)))).)))(((.(((....))).)))....)))).)))))).)))))))..((((((((.......))))))))))))))))))).)))).)))))))((((..((((.(((...(((((......((((....)))).((((((....((((((((((....))))))..))))((((..((((((..(((((.(((((((((...(((((.((........))..))))).)))))....)).)).)))))....))))))))))(((...)))))))))....)))))...))).))))..)))).((.......))....)))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,(...((((((((((((.,(.(((.(((((..((((((,.....(((((.((((((((((,,....,.............((((..(((((({((...(((.............)))...}))},))))))....))))))))))).)))....)))))..,.(((((((..,..(((((..(((((((((((((...,,(((((,(({.{(,,({{{{{||||.{{{|,|,,|(..,,,,||.,|,||||.....{(((((((((((((({{{,,{{({,.{(|(|.((((((.,(((((((((((..,,((((((...))))))(((((((.,.......}.))))))}.....((((....))))(((((((.......)))))))....((({{((((((.(({......,,..},..))))))))))})))).)))))}.,..}.)))))}}.}))||},||,,{{{((.,,((((((((((({(((.,((((((((((,.(((({(((((((...((((...(((...))))))))))))))..{{{{({{((({(({((((.((....({{{{{{.,,.{||||{|||||||(((((((((,....||....,,,{(((({({{{.,,.}|}|})))}))}}}}|||..(((((((......))))))).,||{(||{{{{.{((.((.((((((.(((,,..,,{{....}})}.})).)))))).)).)).|...}}||||||||}}||,|||,,},,.,||{{{{||,|}|{|||..{{,{(|,,(((|(((,,{|(((((((.{({(.(({{.,...,||{|||}}...,,,..)}}))))}}|}|,,,||||||}}}}|)))},.|}|.},...}}})))))),}))))),.}|.,.,|,}.},}},)))},})))).}))},}})))).)))).))))),,||||||{|||||||..{{||,||||{{{{|||||||,{{||||||{(((,.,,,,))}}..|)|)),}}.}})))}})}})))))){{{,....(((((...((((,(({.((({(.....................,,,,,))))}.,.})))....))))){{{.{(((,,..))}).))).}}}}....))))}})))),)))},,,||||}}.}))))))))))))))..,)).)))))}.,,..))))))))).)))))|((((,...|)))),....,((.(((((..(((((...(((.{(((......)))).))).))))})))))..})),)).)))))))....))))}.))))),)))).)))))))))....))))).,..))))))),{((((((.((((((,((((,{{((.((((...)))).)))}||}|||....|}},|,.....)))}.)))))).)))))))..{(((((((.......))))))))))))))))))),)))).)))))))((,({{((((.(((...(((((.....,((((....)))).((((((....((((((((((....))))))..))))((((..((((((..(((((.({(((((((...(((((.((........))..))))).)))))}...}).}}.)))))....))))))))))({{...)))))))))..,,))))).,.))).)))).}))}),((.......))....)))))...,.
Back