Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001389469.1
Sequence Length
1588 nt
GC Content
0.6247
ACUUCCACCCACACCUCUGGUGCCUCUCCUGGCAGGCAGAGUGGCUCCUCACAGCCUGAAGCUCAUCCUUCUGCACGGGCCAGCCAGGCCAGCACAGAGGCACCAGGGCAGCAGUGCACACAGGUCCCCGGGGACCCCACCAUGUGGAGCGGAUGGUGGCUGUGGCCCCUUGUGGCCGUCUGCACUGCAGACUUCUUUCGGGACGAGGCAGAGAGGAUCAUGAGGGACUCCCCUGUCAUUGAUGGGCACAAUGACCUCCCCUGGCAGCUGCUGGAUAUGUUCAACAACCGGCUGCAGGACGAGAGGGCCAACCUGACCACCUUGGCCGGCACACACACCAACAUCCCCAAGCUGAGGGCCGGCUUUGUGGGAGGCCAGUUCUGGUCCGUGUACACGCCCUGCGACACCCAGAACAAAGACGCCGUGCGGAGGACGCUGGAGCAGAUGGACGUGGUCCACCGCAUGUGCCGGAUGUACCCGGAGACCUUCCUGUAUGUCACCAGCAGUGCAGGCAUUCGGCAGGCCUUCCGGGAAGGGAAGGUGGCCAGCCUGAUCGGCGUGGAGGGCGGCCACUCCAUUGACAGCAGUUUGGGCGUCCUGCGGGCACUCUAUCAGCUGGGCAUGCGGUACCUGACCCUCACCCACAGCUGCAACACGCCCUGGGCUGACAACUGGCUGGUGGACACGGGAGACAGCGAGCCCCAGAGCCAAGGCUUGUCACCCUUUGGGCAGCGUGUGGUGAAGGAGCUGAACCGUCUGGGGGUCCUCAUCGACUUGGCUCACGUGUCUGUGGCCACCAUGAAGGCCACCCUGCAGCUGUCCAGAGCCCCGGUCAUCUUCAGCCACUCCUCGGCCUACAGCGUGUGCGCAAGCCGGCGCAACGUGCCUGACGACGUCCUGAGGCUGGUGAAACAGACAGACAGCCUGGUGAUGGUGAACUUCUACAACAAUUACAUUUCCUGCACCAACAAGGCCAACCUGUCCCAAGUGGCCGACCAUCUGGAUCACAUCAAGGAGGUGGCAGGAGCCAGAGCCGUGGGUUUUGGUGGGGACUUUGAUGGUGUUCCAAGGGUCCCUGAGGGGCUGGAGGACGUCUCCAAGUAUCCAGACCUGAUCGCUGAGCUGCUCAGGAGGAACUGGACGGAGGCGGAGGUCAAGGGCGCACUGGCUGACAACCUGCUGAGGGUCUUCGAGGCUGUGGAACAGGCCAGCAACCUCACACAGGCUCCCGAGGAGGAGCCCAUCCCGCUGGACCAGCUGGGUGGCUCCUGCAGGACCCAUUACGGCUACUCCUCUGGGGCUUCCAGCCUCCAUCGCCACUGGGGGCUCCUGCUGGCCUCCCUCGCUCCCCUGGUCCUCUGUCUGUCUCUCCUGUGAAACCUGGGAGACCAGAGUCCCCUUUAGGGUUCCCGGAGCUCCGGGAAGACCCGCCCAUCCCAGGACUCCAGAUGCCAGGAGCCCUGCUGCCCACAUGCAAGGACCAGCAUCUCCUGAGAGGACGCCUGGGCUUACCUGGGGGGCAGGAUGCCUGGGGACAGUUCAGGACACACACACAGUAGGCCCGCAAUAAAAGCAACACCCCUUCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-682.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -709.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 401.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((........(((((((((((((.(((((.(((....((((((......((..((((......)))).))..)))))))))..)))))...)))))))))))))..((((((((.((.(((((..((((.(((((((((.((...)).)))))))....))))))..).)))))).))))))))....(((...(((((.((((((((((((((((.(.((((...(((((((((((.......)))))))(((.((((.((((((.((...........))..))))))))))..)))))))....((((.((((((((((.(((.(((...((....((((.((((((.....))))))...((((((((.(((((((...((((...(((...))))))))))))))........(((((((.((((..((...........))..)))).)))))))(((((((((..............(((((((((.....))).)))))))))))))))))))))))))))..))...)))))).)))(((((.(.((((....((((((((.......((.(((((((((((((.(.(((((((.....((((((((..((.((........)).)).)).))))))..((((((..((((((((....(((((((..(((.((((.....(((((((..........)))))))....(((((((((((.((((((((.(((.((...((....)))).))))))))(((.((.....)).))).((((((........))))))...)))))))))))))).)))))))....)))))))....))))))))..))))))((((......))))...)))))))).)))))))..)))))).)).....(((((...((((.((..(((((..........................))))))).))))....)))))...)))))))).)))).).))))).......))))))))))).(((((((((...)))))))))(((((((((..(((....))))))))))))((((((((((((((.((((((((((.(((...(((((..((......))))))).)))))).((.(((((((((((((.((((.(.(.((((((.........((((((((((.(((.(((((....(((.......)))..))))).)))....(.(((((((.((((.((((...)))).))))))))))).)))))))).))))))))).))))))..))))))).)))))).)).....))))))))))).)))))..)))))..)))))))))))))..))))))))))))).)))..((((....)))).((((((....((((((((((....))))))..))))((((..((((((..(((((.(((((((((...(((((.((........))..))))).)))))....)).)).)))))....))))))))))(((...)))))))))......))).............((...((.......))....))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,,,........({(((((((((((.(((((.(((....(((({(,.....((..((((......)))).))..)))))))))..)))))...)))))))))))))..((((((((.((.(((({..((((.(((((((((.((...)).)))))))....))))))..).)))))).))))))))....,,,,,.(((((.((((((((((((((((.(.((({...||||(((((((.......)))))))(((.(((,{((((((.{({,.....,,..},..))))))))))..)))}}||,,..((({.(({{{{{{(({(((.,.,...,|....{{{{,{{{{||.,,},))))}||},{({{((((.(((((((...((((...(((...))))))))))))))......,,(((((((.((((.,{{...,....,..)}..)))).))))))){|(((((((,....{{,..,,,,|((({{({{,.,,.||.|}}|||||}}}}|||,}|||||||}.},.,)}}}}))|))).|||||.,|,}}.|||{{({((((((({...,,,.((.({{({,(((((((.,.(((((((.....((((((((..,(.(({.....}})}.,,.)).))))))..((((((..((((((((..,.(((((((..(((.((((.,...(((((((..........)))))))....(((((((((((.(((((({,,({{.{{...{{....|||}.}}))}}}}{{{.{(||.,.}}.}}}.((((((........)))))),,.)))))))))))))).)))))))....))))))).,..))))))))..))))))((((......))))...))))))),.)))))))..}})))).)).....(((((...((((,(({.((({(......................,,..))))).}.})))....))))).,.}}|})}}}.)),},}}),},,,,,,..})))))}})})),(((((((((...)))))))))(((((((({..(((....)))}))))))))({((((((((((({,((((((,,{{.((({{.(((,,,{,({{{{..,)))))),))..))))}.|||||||{(((({.,{((,,...{{|||{...,,,,,,{(,(((((({.(((.(((((....{((.......)))..))))).)))....(.((((((({((((.((((...)))).))))))))))).)})))))).,,.))))}},|||}}},,))))))),))))))..,.,,,,})))))))))),)))))),))))),.))))})))))))),.})))))))))))).)),..((((....)))).((((((....((((((((((....))))))..))))((((..((((((..(((((.({(((((((...(((((.((........))..))))).)))))}...}).}}.)))))....)))))))))){{{..,)))))))))..,...}},,.........},.||...{{.......))..............
Back