Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001393370.1
Sequence Length
3625 nt
GC Content
0.4433
GGAGGAGUCUUACCCUAAUGUAAGAUGGUGGCCCGUCUGGCUGUGGAACCCACCGAAAGCUGAGAGUCUCUCUCUCAGCCGUAAAGGUCGGACUCGCUGAAGCAAUCAGGCCCGGUUCUGAAGAGUUUUUUCCCCGACGCUCGUUCGGUGGUUUCUUGUGAGGACGCGGCAGCCCGUGGAGUCGGCUGAGGGAAAAGCGAGGCAAGGCAGGCGGAUCCUUUCAAUAUACACUUCCAGAAAAAGGGAAGCCCCGUGGUGGCCCUUGAAAAGUAAAAGGAAGUUGGGAAGUGAAUGAAGUGAGGUCGUCAAAGUCCUACAUUUUAGCUUUCAGUGCUGAACUUCCUUCUCCCUUAAAUUAUUAUAAACUUUUGCUGCUGUUUAAUAAACGUGAAGAUGUCUCGCAGUCCUGAUGCGAAGGAAGACCCUGUGGAGUGCCCUCUUUGCAUGGAGCCCUUGGAGAUAGAUGAUAUCAACUUUUUCCCUUGCACCUGUGGCUACCAGAUUUGCCGAUUUUGUUGGCAUCGAAUUCGCACUGAUGAAAAUGGGCUUUGUCCUGCAUGUAGAAAGCCAUAUCCAGAAGACCCAGCAGUUUAUAAACCACUCUCCCAGGAAGAGCUGCAAAGGAUAAAGAAUGAGAAAAAACAGAAACAAAAUGAGAGAAAACAGAAAAUAUCAGAAAAUCGCAAACAUUUGGCUAGUGUACGUGUCGUACAAAAAAACCUCGUCUUUGUUGUAGGUUUAUCUCAGCGCCUAGCAGACCCAGAGGUUUUAAAACGACCAGAAUAUUUUGGGAAGUUUGGUAAAAUACAUAAAGUUGUCAUCAAUAAUAGCACAUCAUAUGCAGGCUCACAGGGUCCAAGUGCCAGUGCUUAUGUAACCUAUAUCCGGUCAGAAGACGCUCUCAGAGCCAUACAGUGUGUCAACAAUGUGGUAGUAGAUGGCAGAACACUUAAGGCAUCUCUAGGUACAACAAAAUACUGCAGUUACUUCUUAAAGAAUAUGCAGUGUCCAAAACCUGACUGCAUGUAUCUUCAUGAAUUGGGGGAUGAGGCGGCCAGCUUCACAAAAGAGGAAAUGCAGGCGGGUAAACACCAAGAAUAUGAACAGAAGCUACUUCAAGAAUUAUAUAAAUUAAAUCCCAAUUUUCUUCAGCUAUCUACGGGUUCAGUUGAUAAAAAUAAGAACAAAGUGACACCACUGCAGAGGUACGAUACCCCCAUUGACAAACCUUCAGAUUCUCUCAGUAUAGGGAACGGUGAUAAUUCCCAGCAGAUAUCUAACAGUGAUACGCCUUCACCACCACCUGGUUUGUCAAAAUCCAAUCCAGUCAUCCCCAUCAGUUCAUCCAAUCACAGUGCACGGUCCCCUUUUGAAGGGGCAGUAACAGAGUCACAGUCGUUAUUCUCAGACAAUUUUCGCCAUCCCAACCCUAUCCCAAGUGGGCUUCCUCCUUUCCCCAGCUCCCCACAGACAUCCAGUGACUGGCCUACAGCACCAGAACCACAGAGCCUCUUCACAUCAGAAACAAUCCCAGUAUCAUCCUCUACAGACUGGCAAGCAGCUUUUGGCUUUGGUUCUUCUAAACAACCAGAGGAUGACUUGGGUUUUGAUCCCUUCGAUGUCACUCGAAAAGCCUUAGCAGACCUGAUUGAGAAGGAACUGUCCGUUCAAGACCAACCUUCCCUUUCGCCCACAUCUCUUCAGAACUCCUCUUCACACACUACAACCGCCAAAGGUCCAGGCUCUGGAUUCCUGCAUCCUGCUGCAGCUACAAAUGCCAAUUCUCUCAAUAGUACCUUUUCAGUCUUGCCCCAGAGGUUCCCUCAAUUUCAGCAGCACCGAGCGGUUUAUAAUUCAUUCAGUUUUCCAGGCCAGGCAGCCCGCUAUCCUUGGAUGGCCUUUCCACGCAAUAGCAUCAUGCACUUGAACCACACAGCAAACCCCACCUCAAAUAGUAAUUUCUUGGACUUGAAUCUCCCGCCACAGCACAACACAGGUCUGGGAGGGAUCCCUGUAGCAGACAACAGCAGUUCUGUAGAGAGUUUAAAUAUGAAGGAAUGGCAGGACGGGCUAAGGGCACUUCUACCCAACAUUAACAUCAACUUUGGUGGACUGCCCAAUUCUUCUUCCCCCUCCAACGCCAACCACAGUGCACCAACGUCCAACACUGCCACCACCGACAGCCUGAGUUGGGACAGCCCUGGCAGCUGGACAGACCCAGCCAUCAUCACAGGUAUUCCAGCGUCUUCAGGAAACAGUUUAGACUCUCUUCAAGAUGACAAUCCUCCACACUGGCUAAAAUCCCUUCAGGCCCUCACAGAGAUGGACGGCCCCAGCGCUGCUCCAUCACAGACCCACCACAGCGCCCCCUUCAGCACACAGAUCCCGCUGCACAGAGCCAGUUGGAAUCCCUACCCUCCUCCUUCAAACCCUUCCAGCUUCCACUCCCCACCCCCAGGCUUUCAGACAGCCUUCAGACCCCCCAGCAAAACCCCCACAGAUUUACUACAGAGUUCAACACUGGACCGCCAUUAGGCAAAGAGGAGCAACCAUUAGAAAAUGCAGGAUUUGUCCCACUCUGUUUUCUCCCUCUCAGCCCACCACCCACAGCUCCCUUCUCAUCUCUUAUGUUCUGAAGAAUCCAGUACCUGAUCAAUUUUUUUUCUCCCUAACCCCAGAUGCAAUGCGAUCACAGGGUCAUUACCAUCUCUUUAUUAAUUGUAAAAAUUUUUGUUGAUCCAGCAUUUGAGUGACACUGUUGAAUGUUUCUAAAAAUGCCUUUUUAAGGAGAGAAAAAAAAAUCAAAGGGCAGUCUCAAUACUUAGAAAAUUAUUGUUUGUCUGUUGCGCAUAAUAAUGACAUAAUCUGCUUAGCAGAAAAUGACGAUUAAUCUAUAGGAAAGCUCAAGUAAAUGCAUUAUCAACUGCAGAAGUUUGAAAACCAGGUUCAUUUACGUGAGAUUGCUAAAUGCAUGGGGGAAAGCAGUGGUCCUAGCAUCCAUCUUGUAUUCAGCUUAUCAUUAUUGCAGGGAAAAUGCUUUUAAUUUAAAUUAAUUUUUAAUUCUUUUGGCAAGUUGAUGGCAAGGACUUGAUUGUGUCAUUAAGCAAAAGAAUGUAUUGGAAGUUGAUGGAAAGACAAAUUCAUCUGUAGUAGUAACUGGCCGAUUGCUAAAGAGUUCAUAAGGAGGUGAGAAGUAAUUUUUUUAAAGGAGAAAAAUUUUUUGGCUUUAGAUUUAAAGUAAAUUGAAAUGUUUUAAAGAAAAAAGUAUUCACAGAUUUAAUACCUAUUAAUAAUAUAAGAGCUGAAAUGUAAGUCAUUUCUUCAGUCCUUCUCCUCUGUCGGAAUCUUUUUUGUUUUACCAUAAAUUCACCUGACGAGGGCACUCUGAGAUAGCACUGCUCUGGGGCCAUCUGAUCACCAUCGGGAGCAAAUCUCUGACCUCCUUGCCUGCAGCUUUUACUUAACCCUGUAGUUUCUGGACGUUUGUGCAGUAUUGAAAAGACAGGAGAAAAGAAAACAGAAACCUGGUUAUAACCUGACGCUAAAACUAAAAACAAGGAAAUGUACCUCUUUCUUCAGAAUUAAAACUAAAAUCUUAAAUAAAACAGAAAACUUGAUGGUGACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-913.54 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -987.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 1078.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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