Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001406482.1
Sequence Length
1416 nt
GC Content
0.5304
GUCCUGUCCUCUGGGUGCGGAGAAGGCCAGCUGCACAGGCAGCUAAGCGUGGUCCGCCCUCCCCUCCUCAACCUGCAGAACCCCCUGAAGCUGUGCCAAGAUGUGUGACGACGAGGAGACCACCGCCCUGGUGUGCGACAACGGCUCUGGGCUGGUGAAGGCCGGCUUUGCGGGCGAUGACGCGCCCCGCGCUGUCUUCCCGUCCAUCGUGGGCCGCCCGCGGCACCAGGGAGUUAUGGUGGGUAUGGGUCAGAAGGACUCCUACGUAGGUGAUGAAGCCCAGAGCAAGAGAGGCAUCCUGACCCUGAAGUAUCCCAUCGAGCAUGGUAUCAUCACCAACUGGGACGACAUGGAGAAGAUCUGGCACCACACCUUCUACAAUGAGCUCCGUGUGGCUCCCGAGGAGCACCCCACCCUGCUCACAGAGGCCCCGCUGAACCCCAAGGCCAACCGGGAGAAGAUGACUCAGAUCAUGUUUGAGACCUUCAAUGUCCCUGCCAUGUACGUGGCCAUCCAGGCAGUGCUAUCCCUGUAUGCUUCUGGCCGUACCACAGGCAUUGUUCUGGACUCUGGGGAUGGUGUAACUCACAAUGUCCCCAUCUAUGAGGGCUACGCUUUGCCCCAUGCCAUCAUGCGUCUGGAUCUGGCUGGUCGGGACCUCACUGACUACCUCAUGAAGAUCCUCACUGAGCGUGGCUACUCCUUUGUCACCACUGCUGAACGUGAAAUUGUCCGUGACAUUAAAGAGAAGCUGUGCUAUGUCGCCCUGGAUUUUGAGAAUGAGAUGGCCACAGCUGCCUCUUCCUCCUCCCUGGAGAAGAGCUAUGAACUGCCUGAUGGCCAAGUCAUCACUAUUGGCAAUGAGCGCUUCCGCUGUCCUGAGACACUCUUCCAGCCCUCCUUCAUUGGUAUGGAAUCUGCUGGCAUCCAUGAAACAACUUACAAUAGCAUCAUGAAGUGUGACAUUGAUAUCCGCAAGGACCUGUAUGCCAACAAUGUCUUAUCUGGAGGCACCACUAUGUACCCUGGUAUUGCUGAUCGUAUGCAGAAGGAAAUCACUGCUCUGGCUCCUAGCACCAUGAAGAUUAAGAUUAUUGCUCCCCCUGAGCGUAAAUACUCUGUCUGGAUUGGGGGCUCCAUCCUGGCCUCUCUGUCCACCUUCCAGCAAAUGUGGAUUAGCAAGCAAGAGUACGAUGAGGCAGGCCCAUCCAUUGUCCACCGCAAAUGCUUCUAAGAUGCCUUCUCUCUCCAUCUACCUUCCAGUCAGGAUGACGGUAUUAUGCUUCUUGGAGUCUUCCAAACCACCUUCCCUCAUCUUUCAUCAAUCAUUGUACAGUUUGUUUACACACGUGCAAUUUGUUUGUGCUUCUAAUAUUUAUUGCUUUAUAAAUAAACCAGACCAGGACUUGCAACCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-481.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -509.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 321.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...(((((..(((((..(.((.((((((....))))))..)).)..)))))..................(((......)))(((((((((...(((..((((.((.((((.((((((((((((((((((((....(((((((((((.((.((((((.(((...(((((((......)).)))))))))))))))))))))....))))))..))).))))))))).....))))))....((((((...(((..(((.(.(..((..((.....))..))..).))))..))))))))).((((.((.(((..((((((((((((.(((((.(((((((....((((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))((((((..(((((........))))).....((((..............))))...))))))((((((.(((((..((.((..(((.(.((((.((((...(..(((.((.((((((((.((((((((((........((((((.(((.....))).))))))((((.(((((..(((((((.(((.....)))...)))))))...(((.((((........)))))))((......))....((((((((.(((((((.......)))))))))......))))))(((((.(((((((..((......))..)))).))).)..))))....))))).))))...(((((.(((((((((((.(((..((........))..))).)))).)))))))..))))).((((.....))))...))).....))))))))))))))).)))))..)....)))).)))).))))..))))..))))).)).))))(((((.....(((((....)))))....)))))..............((((....(((((..((..(((.((((.((...(((....))).......(((.....((((((((((((.....)))....((((.((.((.(((((((((...(((.(((((...(((.((((..(....).))))...)))((((..(((.((((((((.....))))...)))).)))))))((((.(((((((.......)))))))..)))).)))))..)))......))))))))))).)).)))))))))))))))).....)).)))))))..)).)))))..)))).)))).))).))))))).....)))))))..)).))).))))))))))))..))).))))))..........)))))).))..))))..)))...)))))))))..........((((((.....))))))......(((((((......)))))))..))))).))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((...((((({.(((((..(.((.((((((....))))))..)).)..))))),,................(((......)))(((((((((.{,(((..((((.((.((((.({((((((((((((((((((....(((((((((((.((.((((({,(((...(((((((......))))))))))))))))))))))))....))))))..)))}})))))))).....))))))....((((((,.,{({,,(((.{.,.,((..{{..,,,}}..)}..}.)))}..)}))))))).((((..({({(..((((((((((((.(((((.(((((((.{,.((((((({((...((((,(,,,,..,,.....,|||{...|||,||((((,,.}||||,...}}}..,)))),.{{{((((..,.,{..{{{{{,}}||...}|||||{,(,.{.(((((((...)))))))..,,))..,.}}}},(((((,.,,,||||{,,{(((((((((...({{(({{((((,{.{(({.{{,|||{|||||,.((({(((,({{(((((((,{((,....})),.,)))))),...{((.((((........))))))}{{......}},,..((((((((.(((((((.......)))))))))......))))))(((({.(((((((..((......))..)))).))).}..))))...,|||,,.))))...{((((.(((((((((((.(((..((.,....,.))..))).))))},))))))..))))}.((((.....)))).)))))}}.)}))))))))}}}||||,||,,.......})))|.,,{({({,,,||}|({{.,{{|||,..,{{((({,{,.........}}..)))),..,|||||,{{,,{{{..,,..{{{.,,...,,.,..}},}}})}|,})}|}},.{{{,,..))},.,|,,}}}},.}}.||||||,.,|||}}}},,......{{,{.,|}}},|{|||||{,}}}|||}|,,||}...|}}}|}.}}||...,.}},....,},((((..(({{({,(((((.....))))),,}}},,)},))))||,|}||||{,|.......)))))))..||||{|,||,..,,,.,.)}})))|||,||{|{,,.}|}|({((.(({||,,,,,,,,.}}))}}}.,)},..)))))))},}.)))).,,)}))))))).,.}.)))))))..)).))).))))))))))))..))))..))))..........}))))).))..))))..))).},))))))))),......,,,((((((.....))))))......(((((((......)))))))..))))).))))))..........
Back