Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001406485.1

Sequence Length

1410 nt

GC Content

0.4809

GUCACAUGCCUGGCCAGACAGGCUGCCAAGCAGGAGAGCUUAGUCCUCAGAGCUGGUGAAUGACUCCAGAACAGCUCUGGACAGGCUGAAUUUCACUGUUGGAGUGAGGAUGGCAUAUCAGCCCAUCAUUAUGUGUUCACUUGAAUGUCAAAAUCUUUUUCUUAGGAGAAAUACAAUGUGUCAUUAAUUCAGUCAUUCCAAAAUGCAGUCAUCUAUAUUCCAGUUGACAUGGGUGAUGAGCUUAAUAACUUAAUGAAGGCAUAUGAUAUUUUUAAGGGAGUUAUGGUGGGUAUGGGUCAGAAGGACUCCUACGUAGGUGAUGAAGCCCAGAGCAAGAGAGGCAUCCUGACCCUGAAGUAUCCCAUCGAGCAUGGUAUCAUCACCAACUGGGACGACAUGGAGAAGAUCUGGCACCACACCUUCUACAAUGAGCUCCGUGUGGCUCCCGAGGAGCACCCCACCCUGCUCACAGAGGCCCCGCUGAACCCCAAGGCCAACCGGGAGAAGAUGACUCAGAUCAUGUUUGAGACCUUCAAUGUCCCUGCCAUGCAUUGUUCUGGACUCUGGGGAUGGUGUAACUCACAAUGUCCCCAUCUAUGAGGGCUACGCUUUGCCCCAUGCCAUCAUGCGUCUGGAUCUGGCUGGUCGGGACCUCACUGACUACCUCAUGAAGAUCCUCACUGAGCGUGGCUACUCCUUUGUCACCACUGCUGAACGUGAAAUUGUCCGUGACAUUAAAGAGAAGCUGUGCUAUGUCGCCCUGGAUUUUGAGAAUGAGAUGGCCACAGCUGCCUCUUCCUCCUCCCUGGAGAAGAGCUAUGAACUGCCUGAUGGCCAAGUCAUCACUAUUGGCAAUGAGCGCUUCCGCUGUCCUGAGACACUCUUCCAGCCCUCCUUCAUUGGUAUGGAAUCUGCUGGCAUCCAUGAAACAACUUACAAUAGCAUCAUGAAGUGUGACAUUGAUAUCCGCAAGGACCUGUAUGCCAACAAUGUCUUAUCUGGAGGCACCACUAUGUACCCUGGUAUUGCUGAUCGUAUGCAGAAGGAAAUCACUGCUCUGGCUCCUAGCACCAUGAAGAUUAAGAUUAUUGCUCCCCCUGAGCGUAAAUACUCUGUCUGGAUUGGGGGCUCCAUCCUGGCCUCUCUGUCCACCUUCCAGCAAAUGUGGAUUAGCAAGCAAGAGUACGAUGAGGCAGGCCCAUCCAUUGUCCACCGCAAAUGCUUCUAAGAUGCCUUCUCUCUCCAUCUACCUUCCAGUCAGGAUGACGGUAUUAUGCUUCUUGGAGUCUUCCAAACCACCUUCCCUCAUCUUUCAUCAAUCAUUGUACAGUUUGUUUACACACGUGCAAUUUGUUUGUGCUUCUAAUAUUUAUUGCUUUAUAAAUAAACCAGACCAGGACUUGCAACCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-423.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -452.93

Frequency: 0.0000

Diversity: 274.43

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.((((((.((((..(..(((.((((.(((((((..((((((.(((((((((.....((....))...)))))))))...)))))).)))).))))))))))..)..)))).....(((.(((((((..(((((.(((.((((((.......((((((....))))))....................(.((((....)))))........)))))).))).))))).))))))).)))..............)))))).)))).......((((((....(((((....((((((...(((..(((.(.(..((..((.....))..))..).))))..))))))))).((((.((.(((..((((((((((((.(((((.(((((((....((((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))((((((..(((((........))))).....((((..............))))...)))))).......(((((((...)))))))...((((.((....(((((.(((..(((((((.((((((((((.(((.....)))...))))))....(((.((((........)))))))((......))....((((((((.(((((((.......)))))))))......))))))(((((.(((((((..((......))..)))).))).)..))))...((((...))))...(((((.(((((((((((.(((..((........))..))).)))).)))))))..))))).((((.....)))).))))))).))))(((((((((((...))))))).....))))...((((....))))(((....)))....(((((..((.........))..)))))..))))))))..))))))....((((....(((((..((..(((.((((.((...(((....))).......(((.....((((((((((((.....)))....((((.((.((.(((((((((...(((.(((((...(((.((((..(....).))))...)))((((..(((.((((((((.....))))...)))).)))))))((((.(((((((.......)))))))..)))).)))))..)))......))))))))))).)).)))))))))))))))).....)).)))))))..)).)))))..)))).)))).))).))))))).....)))))))..)).))).))))))))))))..))).))))))....)))))))))))...............(((((((.((.((....)).)))))))))((((..((.(((((..(((((((......)))))))....)))..)).))..))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((((......)))))(((({,((((((.(((..(((.((((..(((((((,,((((((((((((({{..((((..((((((((((((((.....))))),((((((......}},}}}}....{{{{{{{..,,||}}|.}}...,,(((({{...,))))}}.,,.,,}}},}}},,))))))))..))))...,|,{(((((((...((((.((((.(.((((.(.(.(((...,...,{{.,,,,}}.,}}.,,......,,..(((.(((...(((((((.((((..,..({.(((((..((.((((((((.({(,{..((..((..((.((.((........)).))))..))..)).}))).)))))))).)){(((((.((((((((..,,..{(,.........,||.........)))))))).).))))}))))),.},..)))))))))))...))))))))).).))))).},.)))).))))..)))))))||{{{{,,.|}}}}}{{{.......))).,|||}}.)},,)))))))),...(((((((,{((,....})),.,)))))))...(((.((((........)))))))(((((((.(({,,.((((((((.(((((((.......)))))))))......))))))(((({.(((((((..((......))..)))).))).}..))))...((((...)))).........(((((((((((.(((..((.,....,.))..))).))))},)))))){.{((((,{(((.....)))))))))}...,...,)).)))))))..,)))))))))...)))..)))).)))...))).)))}{((...}}}(((((..({.........))..)))))..})))))))..(((((..............}..)))))..)))))))..........(((((..((((............{{{,....(((((((((......((((.((.{{.(((((((((.{.(((.(((((...{((.(({{..(,...}.)))}...))}((((..((({({{(((((.....)))))..}}},,),,))))((((.(((((((.......))))))),.)))).)))))..))).,,...)))))))))}).)).))))(((((((.(((........{{{{.....||},.,}|{{{{{(((,((......,,,.{{{{{.,......},..))))),.)),,....)).)}})))),...,,.......)))..))))))).......,...(((((((.((.((....)).))))))))).,}...))))))))).(((((((......)))))))....}}}})))).)))))......