Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001406715.1
Sequence Length
1634 nt
GC Content
0.6242
AUACCACAGCCUUCAUCUGCGCCCUGGGGCCAGGACUGCUGCUGUCACUGCCAUCCAUUGGAGCCCAGCACCCCCUCCCCGCCCAUCCUUCGGACAGCAACUCCAGCCCAGCCCCGCGUCCCUGUGUCCACUUCUCCUGACCCCUCGGCCGCCACCCCAGAAGGCUGGAGCAGGGACGCCGUCGCUCCGGCCGCCUGCUCCCCUCGGGUCCCCGUGCGAGCCCACGCCGGCCCCGGUGCCCGCCCGCAGCCCUGCCACUGGACACAGGAUAAGGCCCAGCGCACAGGCCCCCACGUGGACAGCAUGGACCGCGGCACGCUCCCUCUGGCUGUUGCCCUGCUGCUGGCCAGCUGCAGCCUCAGCCCCACAAGUCUUGCAGAAACAGUCCAUUGUGACCUUCAGCCUGUGGGCCCCGAGAGGGGCGAGGUGACAUAUACCACUAGCCAGGUCUCGAAGGGCUGCGUGGCUCAGGCCCCCAAUGCCAUCCUUGAAGUCCAUGUCCUCUUCCUGGAGUUCCCAACGGGCCCGUCACAGCUGGAGCUGACUCUCCAGGCAUCCAAGCAAAAUGGCACCUGGCCCCGAGAGGUGCUUCUGGUCCUCAGUGUAAACAGCAGUGUCUUCCUGCAUCUCCAGGCCCUGGGAAUCCCACUGCACUUGGCCUACAAUUCCAGCCUGGUCACCUUCCAAGAGCCCCCGGGGGUCAACACCACAGAGCUGCCAUCCUUCCCCAAGACCCAGAUCCUUGAGUGGGCAGCUGAGAGGGGCCCCAUCACCUCUGCUGCUGAGCUGAAUGACCCCCAGAGCAUCCUCCUCCGACUGGGCCAAGCCCAGGGGUCACUGUCCUUCUGCAUGCUGGAAGCCAGCCAGGACAUGGGCCGCACGCUCGAGUGGCGGCCGCGUACUCCAGCCUUGGUCCGGGGCUGCCACUUGGAAGGCGUGGCCGGCCACAAGGAGGCGCACAUCCUGAGGGUCCUGCCGGGCCACUCGGCCGGGCCCCGGACGGUGACGGUGAAGGUGGAACUGAGCUGCGCACCCGGGGAUCUCGAUGCCGUCCUCAUCCUGCAGGGUCCCCCCUACGUGUCCUGGCUCAUCGACGCCAACCACAACAUGCAGAUCUGGACCACUGGAGAAUACUCCUUCAAGAUCUUUCCAGAGAAAAACAUUCGUGGCUUCAAGCUCCCAGACACACCUCAAGGCCUCCUGGGGGAGGCCCGGAUGCUCAAUGCCAGCAUUGUGGCAUCCUUCGUGGAGCUACCGCUGGCCAGCAUUGUCUCACUUCAUGCCUCCAGCUGCGGUGGUAGGCUGCAGACCUCACCCGCACCGAUCCAGACCACUCCUCCCAAGGACACUUGUAGCCCGGAGCUGCUCAUGUCCUUGAUCCAGACAAAGUGUGCCGACGACGCCAUGACCCUGGUACUAAAGAAAGAGCUUGUUGCGGUAAGGGAACUCCUGCCCCUCUGGCUCAGGAUGACAUGGACAUCUGGUUCCUCCCCUAGCCCAAGACUCUUGGGGUCCUAGCCCAGGCAGGGGGGCAAGUCACGUCCCUCUGCAAGCCUUAGUUUUCCCACUUGUAUAAUGGAAUUGAUAAUGGUACCUACCACGUGGUGAGAAUUAAAGGCAGUCUGACAGGCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-656.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -682.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 322.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........(((((((.((((....((((((.(((.((((.((((......(((.....))).((((((((........(((.........)))...(((((.((((...(((.((((((((.(((((((((....((((..(.((.((((....((((((..(((.((((((((...((((......))))..))))))))....((((.....((((.((...(((((....)))))...)).)))))))).))).)))).....))....)))).)).)..)))).......))))))).)).))).)))))...)))....))))..)))))..)))))..))))))).)))))))..))))))..((.((((((((..((((((.(((.(((((...((..(((((((((....)))))..(....).....))))..)).))))).))).))))))(((((((...((((((..((((..((..((.(((((((((.((((...(((((((((...(((((.((((..(((((((((.........))).))).)))....))))....))))).(((.((((..(((((...((.((((.....((((((..(((((((........))...)))))...)))))).((((((((((.(((.((((.(((...................((((((((.........(((((((...((....((((.........))))))..))))))).(((((..........)))))(((....)))....)))))))).((((((((.(((((..((((((...))))))(((((((.((((.((((((((.(((..((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((.((....(((....)))..)).))))))))))))...))))))..)))))....((..((((.(((((((.((((((.((((((...)))))).)))))))))..))))..(((..((......))..)))))))..))((((((((...(((.(........).)))))))))))....)))))))))))).......))...)))...))))))))...))))..(((((((...((......))...))))))).(((.....))))))))))......(((((.....((....))....))))))))))...))))))))...((((((...(((((.(((.....)))))))).))))))..((((.(........)))))..))))))).))).)))))))).)).........)))).)).))))).)))).))).((((((((...(((((.....)))))...))))))))..............(((((.((((((((......))))....(((......)))))))))))).))))))))).(((.....)))..)))).))))))))).)).))........((((((((((...))))))...))))....)))).)))))).)))))))....)))))))).))((((((((((((.((......((.(((......))).))...)).)))).))))))))...))))..))).))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
........(((((((.((((....((((((.(((.((((.((((......(((.....))),{,((((((........,,{.........,))...(((((.((((...(((.((((((((.(((((((((....((((..{.((.((((....{{{{{{..((|.((((((((...((((......))))..))))))))....((({...,,{(((.{{...||{{|,...)))}}...}}.}))}}}}}.))}.}}))...,,))....)))).)).)..)))).......))))))}.)).))),}))))...)))....))))..)))))..,},))})))})))).)))))))..))))))...{.((((((((..((((((.(((.(((((...((..(((((((((....)))))..,....}.....))))..)).))))).))).))))))(((((((...((((((..((((...,..((.(((((((((.{{{(,,,(((((((((...,,({((((,((((((((((......)))),(((.((({,(({..,.(({(..(((((((({({((((({({((({{.(((((.....{{(((({{....{{{|,....{||||{..{((({...,,,..{{..,{{||......,,}}}}}}})).......,,,|}||},,,.,|||{||....{{.,..(((((((...{,....((((.........)))),).,))))))).,||||}}}}},....,)}))})))}}}.))}}}..))}}.,,}))))).)))},}}...,(((((...)))))))))))).}||||,,.,|,.}|||}}}.))).((((((.(((((((((((((((((((((((((((.((.,,,{{,....,)),.)).))))))))))))...))))))..)))))....(..(((((((...{{(.((((((.((((((...)))))).)))))).((((((((.,((((,,(((.,,..(((((((,((({..((((((((...(((.(........}.))))))))))).....)))).,.)))))),,...(((.(((((....(((((..(((((...(((((((...{{......}),..))))))).|.....((((((.((((({...,((((((.....((....))....))))))))))))))))))......((((((...(((((.(((.....)))))))).))))))..((({,(........))))).))))))))))))))).)))..,..)))))))).,))))).))).,...........((((((((...(((((.....)))))...))))))))...}}}.....)))))))..)...,|)}))..))))))...........}))}})).)))))..))))))))).(((.....)))..)))).))))))))).)).||......,.({({((((((...))))))...}})).,..)))).)))))).)))))))....)))))))),||((((((((((((.{({,....{{.{{{.....,||}.}},}})).)))).))))))))}.,))))..))).))))...
Back