Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001407382.1
Sequence Length
785 nt
GC Content
0.4713
CUCUCCAUCUUCUGCCACCAUGUGAAGAUGUGCUUGCUUCCCCUUUGCCCUUCUGCCGUGAUUCUAAGUUUCCUGAGGCUUCCCAGCCAUGCUUCUUGUACAGCCUGUGGAACUAUUUGUGGUCUGCAUUAUGUCUGGAGCCAGAAGUAAGCUUGCUCUUUUCCUCUGCGGCUGUUACGUGGUUGCCCUGGGAGCCCACACCGGGGAGGAGAGCGUGGCUGACCAUCACGAGGCUGAAUAUUAUGUGGCUGCCGUGUAUGAGCAUCCAUCCAUCCUGAGUCUGAACCCUCUGGCUCUCAUCAGCCGCCAAGAGGCCUUGGAGCUCAUGAACCAGAACCUUGACAUCUAUGAACAGCAAGUGAUGACUGCAGCCCAAAAGGAUGUACAGAUUAUAGUGUUUCCAGAAGAUGGCAUUCAUGGAUUCAACUUUACAAGAACAUCCAUUUAUCCAUUUUUGGACUUCAUGCCGUCUCCCCAGGUGGUCAGGUGGAACCCAUGCCUGGAGCCUCACCGCUUCAAUGACACAGAGGUGAUUCCUGCCUUUUUCCUCAGUAGGCUGAGGGUACACAGAGGUGAUCUAAGUCAGGGACCAGAAGCUGUGACAUGUUAACUAAGAUUGAUAGGAGACCUUAACAUCCCCAAAAUCCAACCCAAACUCCCAAAGAUCCAUGUGCCACAUGUUCAUUCCAUUAAAGAAUGUCUGACGUUACAAGGCAGUUAUUCAUCUAUGGAUCUUUCCAUUUAUUAAUUACACAAUAAAUACAGGAAUGUAUACUUAAACCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-219.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -234.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 265.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((.(((........((.((.((((....(((((((((.....((((((..((.(((..((((....(((((((..((((.((((((.((((.((.(((((.((...(((((.(((.((.((.......)).))))).))))).....((((((((((((((.((((.(((.(.((...)))))).))))))....))))))))))))(.(((((..((((((...((((..(((.(((((((((..((.(((((((.((((........(((........))).((((......))))(((....)))..))))))))))).)))))..))...))))..)))..))))..))))))....))))))....(((..(((........)))..)))...(((((((((..((((((....(((...)))...))))))...((((....))))....))))))))).))))))).)))))).))....)))).)))))))))))..)))).))).)).)))))).(((((((.......(((((((....))))))).......))).))))......))))....)))))....)))).)).))..)))..))).))))).....((((.((.....................(((((((((((((((..((((((((((.......)))))...))))).....))))..........)))))))))))..(((((((........)))))))...)).))))..............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....(((((((.,,......}}))))))).{..,((((((,,,..,,.((((((,,{(,(((..{{((....(((((((..((((.((((((.((((.{({(((((,(({..,,,{(,{((,{{(({,{{{.{(((.|||))}}.}}}|||,,(((({{{((((({{,((|(|({|.{.({,,.|}}}}).))))}}|}|,)}))))))))))|,((|((..((((((...((((..,{,.{{(((({((.,{{.{{{|{{|,{|||........{{({{.{,..,|||{||||,.....|||,|||,,|,)),.,))))))))))).}}}}}..,,...))}}..}},..))))..))))))..,,))))}},...||{|||,|,,,..,,}})),.|))|,,{((((((({..{(((((,|..|{......),,.))))))...((((....))))....))))))))))),)))))},})))).))....)))).)))))))))))..}}}|,}}}.}}.}}))))||,,,,,{{{{{{,.(((((((....))))))).....,))))}}}},..,}}})}))..,,))))}.||{||{(((..{{...((((..,.((((.............................}}}}.,,,||||,,,||,,,}}||||||||(({,,....|||||.{{|,|,,.....})))}.,}}}}...,))))),,,}|,,(((((((........)))))))...)))),)},.............
Back