Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001407383.1
Sequence Length
973 nt
GC Content
0.5005
AGGAGAUUGCUGCCUAUGCAAAGCAGGUCCUGACCAGCUCUAAAGAUGGGUCAGCUGCUGUAUUUCCAAGAACCCCAUGACUUCCAGGGCCCCUUGUUCCCAGGAAGGCCCCGCACCCCAGUCGUCCCGUGCAUAACCUCACGGGCCAGCACCUGGUAGCUGCUGGAAGGCUUCUGGGGGAUGCCUGGGCCCCUCCAGCCCUACCUCUAGUCCUGCCACUUUACAACUGAGCACCUCCCGCUGCUGCCUGCUGAACCCUUCAGAGUCCUUGCCACAGGCCCUAUUUACUUUUUCCUGAGAAGAUUUGUGGUCUGCAUUAUGUCUGGAGCCAGAAGUAAGCUUGCUCUUUUCCUCUGCGGCUGUUACGUGGUUGCCCUGGGAGCCCACACCGGGGAGGAGAGCGUGGCUGACCAUCACGAGGCUGAAUAUUAUGUGGCUGCCGUGUAUGAGCAUCCAUCCAUCCUGAGUCUGAACCCUCUGGCUCUCAUCAGCCGCCAAGAGGCCUUGGAGCUCAUGAACCAGAACCUUGACAUCUAUGAACAGCAAGUGAUGACUGCAGCCCAAAAGGAUGUACAGAUUAUAGUGUUUCCAGAAGAUGGCAUUCAUGGAUUCAACUUUACAAGAACAUCCAUUUAUCCAUUUUUGGACUUCAUGCCGUCUCCCCAGGUGGUCAGGUGGAACCCAUGCCUGGAGCCUCACCGCUUCAAUGACACAGAGGUGAUUCCUGCCUUUUUCCUCAGUAGGCUGAGGGUACACAGAGGUGAUCUAAGUCAGGGACCAGAAGCUGUGACAUGUUAACUAAGAUUGAUAGGAGACCUUAACAUCCCCAAAAUCCAACCCAAACUCCCAAAGAUCCAUGUGCCACAUGUUCAUUCCAUUAAAGAAUGUCUGACGUUACAAGGCAGUUAUUCAUCUAUGGAUCUUUCCAUUUAUUAAUUACACAAUAAAUACAGGAAUGUAUACUUAAACCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-291.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -309.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 344.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.((((.......)))).((((((((((((((.((....((((((((((..((((((...((..(((....(((((.((((((((((.((((.....(((..(((((.(((((((((..((((((((........))))).((((((.((...)).))))))..)))..))))))..)))..)))))))).(((((.........(((..(((((..........((((........))))((.((((.....(((((((.....(((...(((((.((..(.((((((...)))))))..)).)))))))).....))))))).....)))).))..((((((((((((((.((((.(((.(.((...)))))).))))))....))))))))))))))))).)))........)))))........(((((((..(((.(((......))).)))...(((((.((....)).)))))....))))))))))).)))))))))).)))))...(((....)))...)))..))))))))..))))...((((.((.....)).)))).........(((..((((((.(((((.((..((((((....(((...)))...))))))..)))))))))))))...))).))))))....)).))))))))....)))..))).((((((......))))))(((.(((((...((.((((((.(((..(((((((....)))))))..(((....)))....))).)))))).))....))))).))).........((((....(((..........)))....)))).........)))).(((((((((((((((..((((((((((.......)))))...))))).....))))..........)))))))))))......................(((((....)))))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(({({,,(((((({.,{|,.,|||({{((((((({,(({,..,{(({{{{{{|{(({|{{.,,,,,.,,...{{(.((,.,,,|||||{{.{|{({(((((((..((((,((,,...(((((((((((((........)))))).(((((...((((((.((.(({.(({..(((((((.,|.,{((|,...,}}})||,,.)))))))....|||,{,,.......}|}|...))).)).)))))))))))....(((((((.....(((...(((((,,(,,(.((({{,...)))}))),.,).)))))))).....)))))))..{{,||||.,,.,|}}||,..,.,,,)))))))...}).))}}..))))))))),,,{,,,|||||||}|}|||||||||}}||||,,.,}||||.......{({(((({,,({{{(((,{|.{{||,.,..,.,((({{.{,...,||,||||,.....}||}}||||}.))}}))))))))))))..}||}.....,,||||,,.||..}}})..|}}})},,,|)|}}|,....||||||,|........{{|..((((((({{{{{.{|,,{||||{.|..||......).,,))))})..,||||,,,,))))...,)))))}))),,,}})}))}||||||||..,)}}}}}.||||||..,,.,|||||,..,.,,,{|,||||.,,,{{{|{{{,.{((((((....)))))))...,.,}})))}......)})))))),),....}}|||((((((..{{...((((....((((.............................))))....)))),,,))...)))))}}|{{((.......}}}}}.,}},},,....))))))}.,.)).}}}|{(({....)))}},,{{,........,,}},(((((....)))))............
Back