Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001413060.1
Sequence Length
6406 nt
GC Content
0.3734
GUCACGUGACCGCGCUCAGCCAAGGCGGCAGCGGCGGCGGCGCGAGCUUCGGCGGCGGUGGCGGCUGUGGCAGCGGGAGCAGCUGCGCCGCCAGCGUGGAGCGGGAGGCGUGUGGGUGUGGAGAAAAGGGAGCGCCAGACCGGAACGGAUGUGUAUAUCUCAUGAUUGAUAUGGAGAAACUAGUCAUGGGCCAAAGGUCAAGAUACUUCUCUGGGAAAUGUUGCUGCUGAUGCUGCUUUACAAAGUCAUACAAUGAGUGUUUGGUUUAAGAAAGAUUUUCAUACUUAAAAGAUUUUCAUCUUGGAAAUACAUCAAGUGAAAAUUAAAUUCUUUUGGGAAACAUUUUCCUUCUGAUAUAUUAUACUUGUAAUGGGCGACAUGGCAAACAACUCAGUUGCUUACAGUGGUGUGAAAAACUCUUUGAAGGAAGCUAAUCAUGAUGGAGACUUUGGAAUUACGCUCGCAGAGCUGCGGGCUCUCAUGGAGCUCAGGUCCACAGAUGCAUUACGAAAAAUACAGGAAAGCUAUGGAGAUGUCUAUGGAAUUUGCACCAAAUUGAAAACAUCUCCCAAUGAAGGUUUAAGUGGAAACCCUGCAGAUUUAGAAAGAAGAGAAGCAGUGUUUGGAAAGAAUUUUAUACCUCCUAAAAAGCCAAAAACCUUUCUUCAAUUAGUAUGGGAAGCAUUACAAGAUGUCACUUUAAUUAUAUUAGAAAUUGCAGCCAUAGUAUCAUUGGGCCUUUCUUUUUAUCAGCCUCCAGAAGGGGAUAAUGCACCAAAAGCCCAGGAUGGUGCAGCCAUGGAAAUGCAGCCAUUGAAGAGUGAAGAAGGUGGAGAUGGUGAUGAAAAAGAUAAAAAGAAAGCAAAUUUGCCAAAAAAGGAAAAAUCUGUUUUACAAGGGAAACUUACAAAACUGGCUGUUCAGAUUGGCAAAGCAGGUCUGUUGAUGUCUGCCAUCACAGUUAUCAUUCUAGUAUUAUAUUUUGUCAUUGACACCUUCUGGGUUCAGAAAAGACCAUGGCUUGCUGAGUGCACACCAAUUUAUAUACAAUACUUUGUGAAGUUCUUCAUUAUUGGAGUUACAGUUUUAGUGGUCGCAGUGCCAGAAGGUCUUCCACUUGCAGUCACGAUCUCACUGGCUUAUUCAGUCAAAAAAAUGAUGAAAGAUAAUAACUUAGUAAGGCAUCUGGAUGCUUGUGAAACCAUGGGAAAUGCUACAGCUAUUUGUUCAGAUAAAACAGGAACUUUGACAAUGAACAGAAUGACAGUCGUUCAAGCUUACAUAAAUGAAAAACAUUAUAAAAAGGUUCCUGAACCAGAAGCUAUUCCACCAAAUAUUUUGUCCUAUCUUGUAACAGGAAUUUCUGUGAAUUGUGCUUAUACAUCAAAAAUAUUGCCACCAGAGAAAGAGGGUGGAUUACCUCGUCACGUUGGUAAUAAAACUGAAUGUGCCUUGUUGGGACUUCUUUUGGAUUUAAAACGGGAUUAUCAGGAUGUUAGAAAUGAAAUACCAGAAGAAGCACUGUACAAAGUCUACACCUUCAAUUCUGUUAGGAAGUCCAUGAGUACUGUCCUGAAAAAUUCAGAUGGAAGUUAUCGAAUAUUCAGCAAGGGUGCAUCUGAGAUAAUUCUGAAAAAGUGUUUCAAAAUCUUGAGUGCUAAUGGUGAGGCAAAAGUAUUCAGACCAAGGGACCGUGAUGAUAUUGUAAAAACUGUGAUUGAACCGAUGGCAUCAGAAGGCUUGAGAACCAUAUGUCUUGCAUUCAGAGAUUUUCCAGCAGGAGAACCAGAACCAGAGUGGGAUAAUGAAAAUGAUAUUGUCACCGGCCUUACAUGCAUUGCUGUUGUGGGGAUUGAAGAUCCUGUGAGACCUGAGGUGCCAGAUGCAAUUAAAAAGUGUCAGAGGGCUGGAAUUACUGUGCGGAUGGUCACUGGUGAUAAUAUUAAUACUGCUCGGGCCAUUGCUACCAAAUGUGGUAUUUUACAUCCUGGGGAAGAUUUUCUGUGCCUAGAAGGUAAAGAUUUUAACAGAAGAAUACGAAAUGAAAAAGGAGAGAUUGAGCAAGAGAGGAUAGACAAGAUUUGGCCAAAACUUCGAGUACUUGCAAGAUCAUCUCCUACUGAUAAGCAUACACUGGUUAAAGGUAUAAUUGACAGCACUGUCUCAGACCAACGCCAGGUUGUAGCUGUAACUGGUGAUGGUACAAAUGAUGGCCCAGCACUAAAGAAAGCAGAUGUUGGAUUUGCAAUGGGUAUUGCUGGAACUGAUGUAGCUAAAGAAGCAUCCGAUAUUAUUCUCACAGAUGACAACUUUACAAGCAUUGUUAAAGCAGUUAUGUGGGGACGAAAUGUCUAUGACAGCAUCUCAAAAUUCCUUCAGUUCCAACUUACUGUUAAUGUAGUAGCAGUGAUUGUUGCUUUUACGGGCGCCUGCAUUACUCAAGACUCACCGCUUAAGGCUGUGCAGAUGCUGUGGGUAAACCUCAUAAUGGAUACACUCGCUUCCCUGGCUCUGGCAACGGAACCACCCACUGAGUCUCUCUUGCUUCGGAAACCUUAUGGUAGAAAUAAGCCUCUCAUCUCACGUACAAUGAUGAAGAAUAUUUUGGGUCAUGCAUUCUAUCAACUUGUAGUAGUCUUUACACUCUUAUUUGCUGGAGAAAAGUUUUUUGACAUUGAUAGUGGAAGAAAUGCUCCUUUGCAUGCUCCUCCUUCAGAACAUUAUACUAUUGUUUUUAAUACCUUUGUGCUGAUGCAACUUUUCAACGAAAUAAAUGCCCGGAAAAUUCAUGGUGAAAGAAAUGUAUUCGAAGGAAUCUUUAACAAUGCCAUCUUCUGCACAAUUGUUUUAGGCACUUUUGUGGUACAGAUAAUAAUUGUGCAGUUUGGUGGAAAACCUUUCAGUUGUUCAGAACUUUCAAUAGAACAGUGGCUAUGGUCAAUAUUCCUAGGAAUGGGAACAUUACUCUGGGGCCAGCUUAUUUCAACAAUUCCAACUAGCCGUUUAAAAUUCCUCAAAGAAGCUGGUCAUGGAACACAAAAGGAAGAAAUACCUGAGGAGGAAUUAGCAGAGGAUGUUGAAGAGAUUGAUCACGCUGAAAGGGAGUUGCGGCGUGGCCAAAUCUUGUGGUUUAGAGGUCUGAACAGAAUCCAAACACAGAUUCGAGUGGUGAAUGCAUUUCGUAGUUCUUUAUAUGAAGGGUUAGAAAAACCGGAAUCAAGAAGUUCGAUUCACAACUUUAUGACACAUCCUGAGUUUAGGAUAGAAGAUUCAGAGCCUCAUAUCCCCCUUAUUGAUGACACUGAUGCCGAAGAUGAUGCUCCUACAAAACGUAACUCCAGUCCUCCACCCUCUCCCAACAAAAAUAACAAUGCUGUUGACAGUGGAAUUCACCUUACAAUAGAAAUGAACAAGUCUGCUACCUCUUCAUCCCCAGGAAGCCCACUACAUAGUUUGGAAACAUCACUCUGAUUGUAAGCUGAAUGUUAACACACUAGCUGCAUUGUAAAGAAACAAAUUGAAACUGGGUCUUUUCACAUAUUGUGAUGGACAAGCUAGUAUUCUUGUCUUUGGACUUCAACAGAAGACACACUUGUACGAAUGUAGAUUUAUUUUUUUAAAAAAAAAAAAGCAAAGCUUUCUGCCAGACUGAGGGUGCUUUUUGGGGGGUGGGAGAAAUGAACUGACAGAUAAACAGUAACUCAGCGUAAGUGACCUGUGGAUCAUCAGUAGUACCCAAGCAUGGUCCUGAACAGUGUAUUAGCAGAGCUUUAGUUUAUCUCAGUCCUGGAUGGGAGAGAGAGGGAGGAGUAAAACUGGGCAAGACAAAGAGCCCUGGAUCGUUGAAUUGAUAGUUUAAUUUCUGCUGUUGGCUGUUAAUAAUUUGGAUUAUUUAUGUUUAUAAAUGAUACAGAUCUGUUUACAAGGUUUGUAGAUACUUUUUUUGUUCCUGUUCAUAGAUGGGAAGCUUCCUUAUAACUGAUGCAGAGAAAAAUUAGUCCUUCAAAUACUGCUGUAUUUUCAGGAAAAAAAAAAAAAGGGGUGUUUCUAUUGAAACUGUACUAAAUUUUUGCCUACAAUUUACCUUGUUAAAUAUUGUAGAUAAAUUGCUAAUACUAAUAGCCAAAUAGAUAACACUAAUGCUUUGUUUAAAAAAACGAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACAUGAGCAGUGGUGUUCUAAUGAAGUUAUGACAUCUGUCCUAAUUAGUUUCUUAAAUACAUUUACUACUUAAUGGUUUUGAAGCAACUGUUUAAUUUUUAAAAUUUUUGAAAACUUGCUAAUAACCUUUUGUUCAGAAUUUAGUAGAUUGUUUAAUGCAGGACAUCAACUACAUAAUGAAAGAUGCUUGAAAUGCUUUUGUUAUUUCAGGCAAAUCAAAUUAAAUCAGACUAUCAAACUACAAGAGAACCUUAGUCUUUUUUGUUUUUGUCUAAACAUGUUAGUUUAGUGAUGUCUUGGUGAACUGUGAGUGAACUGUAUUGAUUUUUCUAAUCUUUAGAGACCUUCACACAGCAUGAGGGCUGUUGGCAUUUUGAAAAAGGUUAAUAAGUAGAAGCAUACAUGUUUUCCUUUUGUUUUUGAAACUUGUUUGUAAACAUAAAUAAAUAUGCCCUUUUAUUAAAUAAAUUCAUGGCAAUGUUUUUUUAAAAGACAUUUCAGCUUCUUUACUCAGUUCUGCAUAUACAGUGCAUCAGUCUGUUCUCUUUGACCACAAUUGGAAUACAUUUCAAGAUGGUAACAGCCCCAUGAAGUACCGCUUUAAUUCCUUGCUGGUAAUCUAAUAGAAUCAGAUUAAGAAAAUUAACACAAUUUUACCAUUUGACAUACUCUUCAUUGAAUUUAGUUUGUCUAAAAUAGUCUCACAGGUAAAAAACAUAACAACAAUGACCACCAUUGUCUUUGAUACAUUUAUUUUAAUUCUUAAGUGGCCAAAUAACAGAUUAGGUAAAAUGAGAUUACAUGAAAAGGUUCUAAA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1650.07 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1781.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 1424.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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