Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001413243.1
Sequence Length
1330 nt
GC Content
0.4707
ACUCUGGCAGCAGGCCUUGGCCAAGGGGCCUUUAGCCCUGACGACCCGGGGAAGAGUCUCCCAAAGCAGAACGCCCGGUCCGGCGCCCAGACCAAACGCGGGGGAACCGGAAGGGCGAGGCCUCCACCGCCAGGUCCCGCCAGUCCCAGCUGCGCGCGCCCCCCAGUCCCGCACCCGUUCGGCCCAGGCUAAGUUAGCCCUCACCAUGCCGGUCAAAGGAGGCACCAAGUGCAUCAAAUACCUGCUGUUCGGAUUUAACUUCAUCUUCUGGCUUGCCGGGAUUGCUGUCCUUGCCAUUGGACUAUGGCUCCGAUUCGACUCUCAGACCAAGAGCAUCUUCGAGCAAGAAACUAAUAAUAAUAAUUCCAGCUUCUACACAGGAGUCUAUAUUCUGAUCGGAGCCGGCGCCCUCAUGAUGCUGGUGGGCUUCCUGGGCUGCUGCGGGGCUGUGCAGGAGUCCCAGUGCAUGCUGGGACUGUUCUUCGGCUUCCUCUUGGUGAUAUUCGCCAUUGAAAUAGCUGCGGCCAUCUGGGGAUAUUCCCACAAGGAUGAGGUGAUUAAGGAAGUCCAGGAGUUUUACAAGGACACCUACAACAAGCUGAAAACCAAGGAUGAGCCCCAGCGGGAAACGCUGAAAGCCAUCCACUAUGCGUUGAACUGCUGUGGUUUGGCUGGGGGCGUGGAACAGUUUAUCUCAGACAUCUGCCCCAAGAAGGACGUACUCGAAACCUUCACCGUGAAGUCCUGUCCUGAUGCCAUCAAAGAGGUCUUCGACAAUAAAUUCCACAUCAUCGGCGCAGUGGGCAUCGGCAUUGCCGUGGUCAUGAUAUUUGGCAUGAUCUUCAGUAUGAUCUUGUGCUGUGCUAUCCGCAGGAACCGCGAGAUGGUCUAGAGUCAGCUUACAUCCCUGAGCAGGAAAGUUUACCCAUGAAGAUUGGUGGGAUUUUUUGUUUGUUUGUUUUGUUUUGUUUGUUGUUUGUUGUUUGUUUUUUUGCCACUAAUUUUAGUAUUCAUUCUGCAUUGCUAGAUAAAAGCUGAAGUUACUUUAUGUUUGUCUUUUAAUGCUUCAUUCAAUAUUGACAUUUGUAGUUGAGCGGGGGGUUUGGUUUGCUUUGGUUUAUAUUUUUUCAGUUGUUUGUUUUUGCUUGUUAUAUUAAGCAGAAAUCCUGCAAUGAAAGGUACUAUAUUUGCUAGACUCUAGACAAGAUAUUGUACAUAAAAGAAUUUUUUUGUCUUUAAAUAGAUACAAAUGUCUAUCAACUUUAAUCAAGUUGUAACUUAUAUUGAAGACAAUUUGAUACAUAAUAAAAAAUUAUGACAAUGUCCUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-430.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -456.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 332.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((..(((((.((.((((....))))...)).)))).)...)))))).(((((((.((((((((((.(((((..(((((..(((...((......)))))..))))).)))))(((((.((.(((((((.(.....(((((((((((((((((.((..(((((((((((......(((((((((.......(((((..((((.((..((((..((.(((.((....(((.......((.((...(((((.............)))))...)).))...))).((((........))))...((((((((((.((((((.......))))....(((......)))...................((((((....))))))......)).)))))))))))).)))))..))))))))))))))).))))))))).)))))))))).)..)).))....))))).))))))))))(((((.((((((((..((((((...))))))........((....))((((((((((...)))).)..))))).........)))))))).))))).....((((((.((..(((((((((...((((..(((((((((..(((((.....)))))..(((((.((((...(((......))).))))..))))).(((((..(((...((((.....)))).))))))))..(((((.((....))...))))).....((((.(((.(..((((...)))).).))).))))(((((.(((((((((...(((......(((((...((((...)))).(((((((........)))))))(((((.((.(((((((((((((.....)))))....)))))))).)))).)))((.(((((......)))))..)).......)))))...)))..))))))))).))))).))))))))).....))))...)))))))))..)).))))))..((.(((.((((((((......((((((..((((((..(((((((...))))).))))))))..)))))).......)))))))).))).))).))).)))))))))))..)))))))))).........(((((.((((..(((((((((((......)))))))))))...)))))))))((((.......)))))))))))...((.((((((((.(((((......((((((((......(((((((....)))))))........((((((((((..(((......))))))))))))).....))))))))))))))))))))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,((((({,{,((((((,,{{{..,})))),...}{||||.....,))))).{|{{{{{.((((((((({.(((((..(((((..(((...((......)))))..))))).))))){((((.{{.{(((((({{,{{{{((((((((((((((({,,((,.(((((((((((...,..(((((((((.......(((((..((((.((..((((..((,(((.((....(((,{..,..({,({.|,{{(((.............}||||...}),))}},}},.((((........))))...((((((((((.((((((.......})))..,,{{{......}}}..............,,...{{{{{{....})))))......}}.)))))))))))).))))),.))))))))))))))).))))))))),)))))))))).)..)).))....))))).)))))))))),((((.((((((((,.((((((...))))))..,.....{{,.|,}|({{{(((((,...)))).,..})}}).},}..,..}))))))).})))}....,((({(({({..(((((((((..,((((.,(((((((((..(((((.....)))))..(((((.((((...(((......})),))))..))))).((((({.(({...({{{.....}}}).))))))))..(((((.((....))...))))).....((((.(((.{..((((...)))).}.))).)))){((((.{((((((((,.,{((,,|,,,(((((,,.((((...)))),{((((((........))))))|{({((.((.(((((((({({((,....})))}....)))))))).)))).))}||.(((({......}))}).,|,.......))}}),..))}..))))))))).))))).))))))))}}}}},))))}}})),))))}),})).,,,,}|{.((,{{{.((((((({.,....((((((..((((({{,{{{((({...,)))}.})))))))..)))))).......}))))))).}},.}),}}}).)))))))))))..))))))))))....,,.{((((({,((((..(((((((((((......)))))))))))...))))))))))},,..,....})}}))),|||{{.{,.((((((((.{({{(,,,..,,,,,{||||||{,.(((((({....})))))),,,,,...{{{{{|||{{..{{,....,,)))))))}})))).{{{{{{.....})))))))))))))}))}.
Back