Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001413248.1

Sequence Length

1171 nt

GC Content

0.4458

AGCCGCCUGCAUCUGUAUCCAGCGCCAGGUCCCGCCAGUCCCAGCUGCGCGCGCCCCCCAGUCCCGCACCCGUUCGGCCCAGGCUAAGUUAGCCCUCACCAUGCCGGUCAAAGGAGGCACCAAGUGCAUCAAAUACCUGCUGUUCGGAUUUAACUUCAUCUUCUGGACCAAGAGCAUCUUCGAGCAAGAAACUAAUAAUAAUAAUUCCAGCUUCUACACAGGAGUCUAUAUUCUGAUCGGAGCCGGCGCCCUCAUGAUGCUGGUGGGCUUCCUGGGCUGCUGCGGGGCUGUGCAGGAGUCCCAGUGCAUGCUGGGACUGUUCUUCGGCUUCCUCUUGGUGAUAUUCGCCAUUGAAAUAGCUGCGGCCAUCUGGGGAUAUUCCCACAAGGAUGAGGUGAUUAAGGAAGUCCAGGAGUUUUACAAGGACACCUACAACAAGCUGAAAACCAAGGAUGAGCCCCAGCGGGAAACGCUGAAAGCCAUCCACUAUGCGUUGAACUGCUGUGGUUUGGCUGGGGGCGUGGAACAGUUUAUCUCAGACAUCUGCCCCAAGAAGGACGUACUCGAAACCUUCACCGUGAAGUCCUGUCCUGAUGCCAUCAAAGAGGUCUUCGACAAUAAAUUCCACAUCAUCGGCGCAGUGGGCAUCGGCAUUGCCGUGGUCAUGAUAUUUGGCAUGAUCUUCAGUAUGAUCUUGUGCUGUGCUAUCCGCAGGAACCGCGAGAUGGUCUAGAGUCAGCUUACAUCCCUGAGCAGGAAAGUUUACCCAUGAAGAUUGGUGGGAUUUUUUGUUUGUUUGUUUUGUUUUGUUUGUUGUUUGUUGUUUGUUUUUUUGCCACUAAUUUUAGUAUUCAUUCUGCAUUGCUAGAUAAAAGCUGAAGUUACUUUAUGUUUGUCUUUUAAUGCUUCAUUCAAUAUUGACAUUUGUAGUUGAGCGGGGGGUUUGGUUUGCUUUGGUUUAUAUUUUUUCAGUUGUUUGUUUUUGCUUGUUAUAUUAAGCAGAAAUCCUGCAAUGAAAGGUACUAUAUUUGCUAGACUCUAGACAAGAUAUUGUACAUAAAAGAAUUUUUUUGUCUUUAAAUAGAUACAAAUGUCUAUCAACUUUAAUCAAGUUGUAACUUAUAUUGAAGACAAUUUGAUACAUAAUAAAAAAUUAUGACAAUGUCCUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-357.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -379.04

Frequency: 0.0000

Diversity: 284.08

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((((.(((((((((((....((((((.(((((((((((((((((((((.((..(((((((((((......((((((.(((((...)))))...(((.....)))...(((((((.(((...((((((......(((((((((((.............)))))))....))))..(((......)))................((.(((((....(((((.......)))))...))))).))........))))))...)))))))))))))))).)))))))))).)..)).))....))))).))))))))))......((((...((.((((((...))))))..))...))))))))..))))))))))))........))))))))))..........(((((((......((((((.((..(((((((((...((((..(((((((((..(((((.....)))))..(((((.((((...(((......))).))))..))))).(((((..(((...((((.....)))).))))))))..(((((.((....))...))))).....((((.(((.(..((((...)))).).))).))))(((((.(((((((((...(((......(((((...((((...)))).(((((((........)))))))(((((.((.(((((((((((((.....)))))....)))))))).)))).)))((.(((((......)))))..)).......)))))...)))..))))))))).))))).))))))))).....))))...)))))))))..)).))))))..((((....)))).........((((((..((((((..(((((((...))))).))))))))..)))))).............((((((((((..(((((.((((..........)))).)))))....((((((.((((..(((((((((((......)))))))))))...))))))))))((((.(((((((((((...)))).).)))))).))))(((((((....)))))))...........))))))))))...........((((((((((..(((......))))))))))))).((((((.....))))))......)))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

...(((((.(((((((((((....((((((.((((((((((((((((((({,,((,.(((((((((((...,..((((((,(((({...}))))...(((.....))}...{((((((.(((...((((({......((((((((,(({{.........{{||||},,..,{|||..,||{,,,,..||,..............,,,..||||{,...})))))......,,,,)})),)))},))})......))))))...)))))))))))))))),)))))))))).)..)).))....))))).))))))))))......((((...((.((((((...))))))..))...))))))))..))))))))))))........))))))))))..........{((((((.....,(((((({({..(((((((((..,((((.,(((((((((..(((((.....)))))..(((((.((((...(((......})),))))..))))).((((({.(({...({{{.....}}}).))))))))..(((((.((....))...))))).....((((.(((.{..((((...)))).}.))).)))){((((.{((((((((,.,{((,,|,,,(((((,,.((((...)))),{((((((........))))))|{({((.((.(((((((({({((,....})))}....)))))))).)))).))}||.(((({......}))}).,|,.......))}}),..))}..))))))))).))))).))))))))}}}}},))))}}})),))))}),})).,,,|||{,((((,,.{(((((({......((((((..((((({{,{{{((({...,)))}.})))))))..)))))).......}))))))).||,.|}|}}||,}}}|((((((((((......{(({....,,{((((({,((((..(((((((((((......)))))))))))...))))))))))}|)))}.,...))))))))))||{{{{({,|{{,|.,.....|.,,,..)))))))}....{((((({....)))))))........((((((((((..(({......))))))))))))).((((((.....))))))..,,..))))))}