Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001413266.1

Sequence Length

1196 nt

GC Content

0.5686

GUUGCUGAGGAAAGAGUGGAGGAGGCUGUUGACCCGUGUGUGUCCCCAUGACUCAAAGAGGGAAAAGUCUAGCUGUUUCCAAUAUCCCGAAAUCAGUCUUGCUGGGAGAACUGGGAAAAUAAAAAAGAGAUGACCCCCGUAGGAAGCUACCUUUAAUCCCAAGUGCCCAAGGCUAGGAGAGAAGAUGCUCCAGGCGAUCCAGGACACCAGUGACUGACACAGCCAGAGGAACAUUCCUCGUGAAGGACUGUGACCAGCAUAGAAAGGCUGCUCAGUGUGAUCCUUGCAUACCGGGGGUCUCCUUCUCUCCUGACCACCACACCCGGCCCCACUGUGAGAGCUGUCGGCACUGUAACUCUGGUCUUCUCGUUCGCAACUGCACCAUCACUGCCAAUGCUGAGUGUGCCUGUCGCAAUGGCUGGCAGUGCAGGGACAAGGAGUGCACCGAGUGUGAUCCUCUUCCAAACCCUUCGCUGACCGCUCGGUCGUCUCAGGCCCUGAGCCCACACCCUCAGCCCACCCACUUACCUUAUGUCAGUGAGAUGCUGGAGGCCAGGACAGCUGGGCACAUGCAGACUCUGGCUGACUUCAGGCAGCUGCCUGCCCGGACUCUCUCUACCCACUGGCCACCCCAAAGAUCCCUGUGCAGCUCCGAUUUUAUUCGCAUCCUUGUGAUCUUCUCUGGAAUGUUCCUUGUUUUCACCCUGGCCGGGGCCCUGUUCCUCCAUCAACGAAGGAAAUAUAGAUCAAACAAAGGAGAAAGUCCUGUGGAGCCUGCAGAGCCUUGUCAUUACAGCUGCCCCAGGGAGGAGGAGGGCAGCACCAUCCCCAUCCAGGAGGAUUACCGAAAACCGGAGCCUGCCUGCUCCCCCUGAGCCAGCACCUGCGGGAGCUGCACUACAGCCCUGGCCUCCACCCCCACCCCGCCGACCAUCCAAGGGAGAGUGAGACCUGGCAGCCACAACUGCAGUCCCAUCCUCUUGUCAGGGCCCUUUCCUGUGUACACGUGACAGAGUGCCUUUUCGAGACUGGCAGGGACGAGGACAAAUAUGGAUGAGGUGGAGAGUGGGAAGCAGGAGCCCAGCCAGCUGCGCCUGCGCUGCAGGAGGGCGGGGGCUCUGGUUGUAAAACACACUUCCUGCUGCGAAAGACCCACAUGCUACAAGACGGGCAAAAUAAAGUGACAGAUGACCACC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-423.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -442.26

Frequency: 0.0000

Diversity: 200.67

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((...((((((..(.(((((..(.((((.((.(.((((((.((((......((((.....................))))......)))).))..)))).)))))))...........(((((((((...((((....))))..............(((...)))(((((((((((..(((((.((..(((.(((((((.....(((((..(((((.(((((....)))))........(((((.....)))))...))))).)))))))).)))).).)).)).)))).)..))))))))))).....((((...........)))).((((.((((((.(((((.((((((((.....(((.((.((.((((..(((..((....)))))..))))..)).))))))))))).)))))))(((..((((..((((...))))..))))..))).........)))))).))))))))))))).(((.....))).....)..))))))..)))))).))))((((..((....((((((((((((((...((((((((...((((...(((.(((....))).))))))).)))))(((((.(((((..((.(((((((.....(((((......(((..((((.......(((((....))))).......)))).))).....))))).....)))))))))..((((((((.(......).))))...))))..........))))).)))))(((((..(((((((.....(((....)))((((.(.(((((.((((..(((((((...((((((.....)).))))..(((.....))).).)))))).))))))))).).))))..)))))))..)))))....))))))))))))))..(((((((((((...(((((((((..........))).((((......)))).(((((..(((((((..(((((.((...((((.........)))))).)))))..)))))..))..)))))...........)))))).))))).).))))).((((((((..(((((((..((.(((((.((.....)).))))).)).)))))))..........)))))))))))....))..))))(((........))).......))))))...........

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((...((((((.,{.(((((..(.,,,({(({.,(((({,.|||,......||||..{{{...}}}.|||{|,...{{{{{.....|||,.},.}))))....))))},.........(((((((((...((((....))))...........,{,({{...||,(((((((((((,.(((((.((..,,,,(((((((.....(((((..(((((.(((((....)))))........(((((.....)))))...))))).)))))))).)))).).,}.)).))))).,.))))))))))).}}..{,{{...|,.....,})}).((((.((((((.{(({,,{,,,(({,..,,,|||.{{,.(,((((..{((,,(({,..||||}.,|||}..,}}))),})))))),)))))))(((..((((..((((...))))..))))..))).........)))))).))))))))))))).(((.....)))}}}}}}..)))))}.,)))))).))))|,{({.,{..,,}{.(((((((((((...((((((((...((((...(((.(((....))).))))))).))))}(((((.(((((..((.(((((((.....(((((....{.(((..((((.......(((((....))))).......}))).))).,...))))).....)))))))))..((((((((,(......).)))),..})))..........))))).))))){((((..(((((((.,...{({....})}((((.(.(((((.((((.{(((((((...((((((.....)).))))..(((.....))).),}))))).))))))))).).))))..)))))))..)))))...,))))))))))))))..(((((((((((...(((((((((..........))).((((......)))).(((((..(((((((..(((((.((.,,{(((....,,,.,)})))).)))))..)))))..))..)))))...........)))))).))))).).))))).((((((((..(((((((..((.(((((.((.....)).))))).)).)))))))..........))))))))........,,,...{{{{.......,))),......))))))...........