Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001413268.1
Sequence Length
1321 nt
GC Content
0.5435
CAGAGUGUGACAGAAGAGAGGCAGCUCUACACCCCUUGCUUGCAAUUCUGAGCAUUCUGUAGCAAACUCGUUUGGCCAUCAAACCAGACCUCAAUUGAGACAAGGCUAUUUAAGCUUCCUCCCAGUUGGUGUAAAUAUUCAAUAGUUUUGCUGCAGAAAUGUUGCGUUUGAUUAUGAGACUACCCCAACUCCCCAAGGGUGUUUUGUGGUGCUGGUUUCUGUAUAAACCUGAAAAAUUCUGAAUUCCAAAACUUAUCUGACCCCCAAAGUUUCAGAUAAGAGCUUGUGGACCUGUGCUCAAUUCUGGUUCUCCUUCCUUCUUUCAACUGUUGUCUGUGAAAGGAGGGAUGCAGGAACAUUCCUCGUGAAGGACUGUGACCAGCAUAGAAAGGCUGCUCAGUGUGAUCCUUGCAUACCGGGGGUCUCCUUCUCUCCUGACCACCACACCCGGCCCCACUGUGAGAGCUGUCGGCACUGUAACUCUGGUCUUCUCGUUCGCAACUGCACCAUCACUGCCAAUGCUGAGUGUGCCUGUCGCAAUGGCUGGCAGUGCAGGGACAAGGAGUGCACCGAGUGUGAUCCUCUUCCAAACCCUUCGCUGACCGCUCGGUCGUCUCAGGCCCUGAGCCCACACCCUCAGCCCACCCACUUACCUUAUGUCAGUGAGAUGCUGGAGGCCAGGACAGCUGGGCACAUGCAGACUCUGGCUGACUUCAGGCAGCUGCCUGCCCGGACUCUCUCUACCCACUGGCCACCCCAAAGAUCCCUGUGCAGCUCCGAUUUUAUUCGCAUCCUUGUGAUCUUCUCUGGAAUGUUCCUUGUUUUCACCCUGGCCGGGGCCCUGUUCCUCCAUCAACGAAGGAAAUAUAGAUCAAACAAAGGAGAAAGUCCUGUGGAGCCUGCAGAGCCUUGUCAUUACAGCUGCCCCAGGGAGGAGGAGGGCAGCACCAUCCCCAUCCAGGAGGAUUACCGAAAACCGGAGCCUGCCUGCUCCCCCUGAGCCAGCACCUGCGGGAGCUGCACUACAGCCCUGGCCUCCACCCCCACCCCGCCGACCAUCCAAGGGAGAGUGAGACCUGGCAGCCACAACUGCAGUCCCAUCCUCUUGUCAGGGCCCUUUCCUGUGUACACGUGACAGAGUGCCUUUUCGAGACUGGCAGGGACGAGGACAAAUAUGGAUGAGGUGGAGAGUGGGAAGCAGGAGCCCAGCCAGCUGCGCCUGCGCUGCAGGAGGGCGGGGGCUCUGGUUGUAAAACACACUUCCUGCUGCGAAAGACCCACAUGCUACAAGACGGGCAAAAUAAAGUGACAGAUGACCACC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-455.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -479.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 272.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((...((((......(((((((((.(((....(((..(..((.(((((((((((((((((((((.((((((........)))))).(((((((.((..(((((.....)))))..)).)))))))..............)).)))))))))))).....((.(((...((((((((.((((...........))))))))))))((((((((((((((((.((((.(((...........((((...(((((((((...........)))))))))......))))...........))).)))).....(((((((((((.(........))))))))))))))))))))(((.((((.....)))).))).))))))))..))).))))))))).))....)..)))..(((((((((............))))......))))).......))))))))))))....)))).)))))((((.(((.((.(((..((((((..(((..((((.(((.((.........))))).)))))))..))))))(((..((((..((((...))))..))))..)))......(((((((((.....((((......))))(((((........)))))..................)))))))))....(((((((((((...((((((((...((((...(((.(((....))).))))))).)))))(((((.(((((..((.(((((((.....(((((......(((..((((.......(((((....))))).......)))).))).....))))).....)))))))))..((((((((.(......).))))...))))..........))))).)))))(((((..(((((((.....(((....)))((((.(.(((((.((((..(((((((...((((((.....)).))))..(((.....))).).)))))).))))))))).).))))..)))))))..)))))....))))))))))))))..(((((((((((...(((((((((..........))).((((......)))).(((((..(((((((..(((((.((...((((.........)))))).)))))..)))))..))..)))))...........)))))).))))).).))))).((((((((..(((((((..((.(((((.((.....)).))))).)).)))))))..........))))))))..............((((........)))).......)))))))).))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((...((((......(((((((((.(((....{({{({,,,..,||||||((((((((((((((.((((((........)))))).{((((((.((..(((((.....)))))..)).))))))}.,............))}))))))))))))..{{,.{{(,,....|||{|||.{{{{...........)))})}},}|||({(({((((({{{{{,.|||{.{{{...........{{{{...(((((((((..,.....}..)))))))))...,,.}}}}.,.,.,.....,}}.)))},.,,{(((((((((({{(........)))))))))))))}|}}|||{{{.{{{|...,,}))},}}|||,||||,,......))))})))|,||{,,,,|||)}..|||||||||....,,......))}).,,,,.,})))}.,,,,.))))))))))))....)))).)))))((((.(((.(,{(((..((((({..,{({{((((.,({{{{,{{,{,,.,||}}}.})))}))}}))))))(((..((((..((((...))))..))))..))).....,{(((({((({....|||}|.....|||.{((((........))))),},...{|{{.|{.....)},))))}}.,|.(((((((((((...((((((((...((((...(((.(((....))).))))))).))))}(((((.(((((..((.(((((((.....(((((....{.(((..((((.......(((((....))))).......}))).))).,...))))).....)))))))))..((((((((,(......).)))),..}}))..........))))).))))){((((..(((((((.,...{({....})}((((.(.(((((.((((.{(((((((...((((((.....)).))))..(((.....))).),}))))).))))))))).).))))..)))))))..)))))...,))))))))))))))..(((((((((((...(((((((((..........))).((((......)))).(((((..(((((((..(((((.((.,,{(((....,,,.,)})))).)))))..)))))..))..)))))...........)))))).))))).).))))).((((((((..(((((((..((.(((((.((.....)).))))).)).)))))))..........)))))))))))}}.}.,,,...{{{{.......,))),.......)))))))).))))...
Back