Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001424211.1
Sequence Length
1324 nt
GC Content
0.5310
GUAGUCCGCAGAGGAUCGACCCGGGGAUUGGACUGGAGGCUUGGGCCCGCCGAAAGUGGGCUUCUGGGCCAUCUCGCAUAUUCUCAACGGCUGGUACCUUAGCAUGUAUGUCAUUAAAAAAAUAAACUCUUCAGGUGGAGAAAUUAAGGGGAAACUGACUCUACUCUGUGAUGCCAAGACAGAUGGGAGUUUCCUUGUACACCACUUUCUCUCCUUCUAUCUCAAAGCUAAUUGUAAAGUCUGCUUUGUGGCACUCAUCCAGUCCUUCAGCCACUACAGUAUCGUGGGACAGAAGCUGGGUGUCAGCCUGACCAUGGCGCGGGAGCGUGGGCAGCUUGUGUUCCUUGAGGGACUCAAGUCUGCAGUGGACGUCGUCUUCCAGGCUCAAAAGGAGCCACACCCCCUGCAGUUUCUCAGGGAGGCUAAUGCUGGGAACUUGAAACCAUUGUUUGAGUUUGUACGGGAGGCCCUGAAGCCAGUAGACAGUGGAGAGGCUCGGUGGACGUACCCGGUGCUGUUGGUGGACGACCUCAGUGUGCUCCUGAGCCUGGGCAUGGGGGCGGUGGCUGUGCUAGACUUCAUUCACUACUGCAGAGCCACCGUGUGCUGGGAACUAAAGGGAAACAUGGUGGUCCUUGUGCACGACAGUGGAGAUGCGGAGGAUGAGGAGAAUGACAUCCUGCUGAAUGGCCUCAGUCAUCAGAGCCAUCUGAUACUGCGGGCUGAGGGCCUGGCCACUGGCUUCUGCAGGGAUGUGCACGGGCAGCUGAGGAUCCUGUGGAGGAGACCAUCGCAGCCCGCAGUCCACCGGGAUCAGAGCUUCACUUACCAGUAUAAGAUACAGGACAAAAGCGUGUCCUUUUUUGCCAAAGGAAUGUCUCCUGCUGUUCUGUGACCUGAUUUCGGAGCAGCUGAAGCUACAUAGGACUGUUUUUGGACGUGGAAGAUAGAGCAACAUAGCAAGAAUGGGUCUUUCUCCUCUGUAGUAAUAUUUCAGGCUGGACCGGCGACUCCACUGUGACCAGAGGGUUGAGUGCUGCAGUGAUGGCAUGCCUUGGCUGCCCUGGGCCCUGUUCAGAAAACACAAGGGACCACAAUCCUGCCUUUGCUGAGAGAGAGGCUGGAUGCUAGACCCAAGUGAAAGGGGUCCUUUGGAGCCUUUGUUUAAAUAUGCCUUAGCCCCAGCUGCCCAUUUUUGGUUGACAAGCCUUUCAGAGCCAGAGUGGGUAUAGAUGUGCCAGCCAGGAGAUGGCACCGGAUGGCAGGUGUGCAAGGUGACAACUAGGAUAAUCAUGGCUGGAAUAAAGUAAGUUUCCACACUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-498.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -522.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 276.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.(.(.((.....)))).))))))..(((((((((((.....(((((((((((((..(((((.......(((((((..(((.((((((((((...((((((..((((((.................(((.(((((((....(((((((((...((((.(((((.........)))))))))))))))))).........))))))))))........(((((..(((....)))..)))))(((((((((((((((((((((((...............((((((.(((((((((....)))...((...((((....)))).)))))))).))))))))))))))))...(((.((((((((.((((((.(((((((((.....)))))...(((((((.((...))))))).))((.(((((((..........((((((((((.((((...((((....))))))))...)))))))))).((((((((((((((.....(((.(((((.(((((....(((((((.(((((.((..(((..(((.((((.(((((((((.(((......((((((...(((((...(((((((((((.((((.(((...(....)....))))))).)))))))...))))...)))))((((((..........))))))..))))))((((((((.((((((....)))))))))).))))....))).))))))))).))))))).))).....)).)))))))))))).((((....))))..)))))))))))))..))))))).......))))))).....))))))).))....((((((......)))))).....(((..((((.....))))(((((((((...........)))))))))((((((((((.(((((((((((((...(((.............)))..))))))))).......)))).)))))).....)))))))))))..)))))))))))))))))....))).)))))))))))))))).))))))...)).))))((((((...))))))......(((((((((...((((.((((((........)))))).)))).......((........))))))))))).)))).)))....)))))))......)))))..)))))))))))))...)))))).)))))..((((.(((((.((..((...(((((((..((.((.((((.....(((....)))..)))).)).))..........)))))))......))..)).))))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((.(.{.((.....))}).))))))..(((((((((((.....(((((((((((((..(((((,......(((((((..(((.((((((((((...((((((.,((((((.................(((.(((((((....(((((((((..{((({.(((((.........)))))})))))))))))).........))))))))))........{((((..(((....)))..))))}(((((((((({(({(((((((((.............,,((((((.(((((((((....)))...{(,{.(({{....))))}).)))))).))))))}))))))))|{..(((.((((((((.((((((.(((((((((.....)))))...(((((((.{{...}}))))).))({.,(({(({{{{{{({({,(,,,,|||||}||||.},|{{{.,,||||||||,...,,,||||}||,(({{((((((((((.....(((.(((({,(((((....(((((((.{(((((((.((,,..||.}||||}||,((,((((((....{{((({((.{{.(((((...(((((((((((.((({{(((...{....).,..))))))).)))))))...))))...)))))|)}}})}}}......{||||||{{.|{..(((((((((,((((((....))))))}}}}.}))))}}}}})|.|||},},)})))),))}))),}})}))})),))))))))).((((....))))..)))))))))))))..)))))))))).,,.,{||||||....}}}}}}}.}}....((((((......)))))).....{{,..((((.....))))(((((((((.{{.....,}.)))))))))|}}||||,{,.(((((((((((({...,{{,,,,,,,,.,{..},,.,)}}|}}},},})}}}}))),})))}}}....})))))))))))..)))))))))))))))))..},))).)))))))))))))))),))))))...)).)))){{((((,,,}}||}}......({{((({(,...((((.((((((........)))))).))))......|||...,,...)))))))}}}).)))).)))....)))))))....).)))))..))))))))))))).,.))))))))})))..((((.(((((.{(..{(,,.(((((((.{(,.({,((((.....{{{,,,,)})..}}}}.,,.)).......)).))))))).,,...})..}}.))))).)))).
Back