Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001424216.1

Sequence Length

1281 nt

GC Content

0.5488

GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGUUUUGCUCUCCAGCCUCCGUCGUCUCUGCAGCACUCCGGGUUCUCCUCCAGAGCGCUAGUCCCAGGAGCUCGGAAUGUUCGUGGAACUUAAUAACCUGCUUAACACCACCCCCGACAGGGCGGAGCAGGGGAAACUGACUCUACUCUGUGAUGCCAAGACAGAUGGGAGUUUCCUUGUACACCACUUUCUCUCCUUCUAUCUCAAAGGGUGUCAGCCUGACCAUGGCGCGGGAGCGUGGGCAGCUUGUGUUCCUUGAGGGACUCAAGUCUGCAGUGGACGUCGUCUUCCAGGCUCAAAAGGAGCCACACCCCCUGCAGUUUCUCAGGGAGGCUAAUGCUGGGAACUUGAAACCAUUGUUUGAGUUUGUACGGGAGGCCCUGAAGCCAGUAGACAGUGGAGAGGCUCGGUGGACGUACCCGGUGCUGUUGGUGGACGACCUCAGUGUGCUCCUGAGCCUGGGCAUGGGGGCGGUGGCUGUGCUAGACUUCAUUCACUACUGCAGAGCCACCGUGUGCUGGGAACUAAAGGGAAACAUGGUGGUCCUUGUGCACGACAGUGGAGAUGCGGAGGAUGAGGAGAAUGACAUCCUGCUGAAUGGCCUCAGUCAUCAGAGCCAUCUGAUACUGCGGGCUGAGGGCCUGGCCACUGGCUUCUGCAGGGAUGUGCACGGGCAGCUGAGGAUCCUGUGGAGGAGACCAUCGCAGCCCGCAGUCCACCGGGAUCAGAGCUUCACUUACCAGUAUAAGAUACAGGACAAAAGCGUGUCCUUUUUUGCCAAAGGAAUGUCUCCUGCUGUUCUGUGACCUGAUUUCGGAGCAGCUGAAGCUACAUAGGACUGUUUUUGGACGUGGAAGAUAGAGCAACAUAGCAAGAAUGGGUCUUUCUCCUCUGUAGUAAUAUUUCAGGCUGGACCGGCGACUCCACUGUGACCAGAGGGUUGAGUGCUGCAGUGAUGGCAUGCCUUGGCUGCCCUGGGCCCUGUUCAGAAAACACAAGGGACCACAAUCCUGCCUUUGCUGAGAGAGAGGCUGGAUGCUAGACCCAAGUGAAAGGGGUCCUUUGGAGCCUUUGUUUAAAUAUGCCUUAGCCCCAGCUGCCCAUUUUUGGUUGACAAGCCUUUCAGAGCCAGAGUGGGUAUAGAUGUGCCAGCCAGGAGAUGGCACCGGAUGGCAGGUGUGCAAGGUGACAACUAGGAUAAUCAUGGCUGGAAUAAAGUAAGUUUCCACACUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-497.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -519.53

Frequency: 0.0000

Diversity: 388.69

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(((((((............))))))))))......((.((((((.((((((.(((((((((((((((((..(((.(((...(.(((((.....))))).).(((.(((.((((.......)))).))).)))......((((((.....((.(((......))).))))))))(((.......))).....))).)))..)))).)))))).(((.(((((((((((..((((((((((((((((((......((((.((((..(((((((((....))))..((((((((.(((((....))))).)))).))))...((((...))))((((((((((...(((((.((((.(((.(((((((((...))))))...))).))).........((((((((((.((((...((((....))))))))...)))))))))).(((((((.((.(((((((...)))).))).)).)).).)))).))))))))))))))))))))))))))))(((((((.(((..................))).)))))))((((((.((((.(((...(....)....))))))).))))))))))...)))))).)))))).))))))............((((.((((....)))))))).((((((((...(((.((((((((((((........)))((((((((((.....((.((((((((((((.((((....))))..((((((((((.(((.((((.((((((((((.(..((((....(((((..(((((.((((((......))))))(((((....))))).)))))..)))))....)))))))))))))))(((..(((((((((((.(((((((((((((...(((.............)))..))))))))).......)))).)))))).....))))))))))))..)))((((.(((.(......).))).)))))))))...)))))....))))))))))))))..)))))..)))))..(((..(((......((((.((((((........)))))).))))......)))..))).(((((.(((...))).)))))...........)))))))))))).((((((((((.((((((........)))..))))))))))))).....((((((.........)))))))))))))).))))))))))).)))...............)))))))....))))))....)))))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.((({((,,{{{{,......}))))),)))},}}}.{(.((((((.{(((((.((((((({(((((((((..((((({(((,(((..,,,,|,,.|}},,},,||.{{{,||||,,,,,..)))},))).}}}......((((((.....{{.(((.,....))).)))))))),.,..,,,.,}}}.,,|,)},.,))..)))).)))))).(((.(((((((((((..,{((((((((((((((((....,.((((.((({..(((((((((,...}))},.((((((((.(((((....))))).)))).))))...((({,,,|||}{((((((((....{|||||{{,(,((({(,((,,,||}}})),))|,..,}}{|}|{{{{{,{{,(,,,,|||||}||||.|,((((,.{{||||||||{..|,,}}}}}}}.,,|||||||,||{|.|.}}|||}||,|||{|{,|.,,,)|||,}}}})))))))})))}})})})))))))(((((((.(((.,,..........,,.,,))).)))))))((((((.((({{(((...(....).,..))))))).)))))))))).,.)))))).)))))).))))}}.....,.,,,,.((({,((((..,,))))}}}}.((((((((...(((.((((((((((((.{....,.))){(((((((({...{.((.((((((((((((.((((....)))),.(((((((|((.{((.((({,((((((((((.(..((((....(((((..(((({.((((((......)))))),{{{{....,}}}|.}))))..))))).|..)))}}))))))))))|||,,(((((((((((.((((((((((((,....|,}}}}}}}}.{{..,...})|||||,,,.,},},,)))).)))))).....)))))))))))).,))){{{{,{({,{......}.))),))}})}})).,,))))),...)))))))))))))).}))))),.})))}..(((..(((.,....((((.((((((........)))))).))))....,.)))..))).(((((.(((...))).)))))...........)))))))))))).{((((({{{{{((((||........),,.}))))))))))))}.....((((((.,,......)))))))))))))).))))))))))).)))...............)))))))....))))))....)))))).)}