Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001424217.1
Sequence Length
1459 nt
GC Content
0.5428
GCCAUCUCGCAUAUUCUCAACGGCUGUGCGUGUCCUUAAAAGUCCCUGGGAAGCGGCCGGGCGCGGUGGCUCACCCCUGUAAUCCCAGCAGUUUGGGAGGCCGAGGCGGGUGCAUCAUCUAAGGUCAAGAGUUCGAGACAAGUCUGGCCAAGAUGGUGAAACCCCCGUCUCUACGAAAAAUACAAAAAUUAGCCGGGCGUGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCUCAGCUACUCGGGAGGCUGAGACAGGAGAAUUGCUUGAACCCGGGAGGCGGAGGUUGCAGUGACCCGAGAUCUCGCCACCGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGCGGGACUCCACCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGAAACUGACUCUACUCUGUGAUGCCAAGACAGAUGGGAGUUUCCUUGUACACCACUUUCUCUCCUUCUAUCUCAAAGGGUGUCAGCCUGACCAUGGCGCGGGAGCGUGGGCAGCUUGUGUUCCUUGAGGGACUCAAGUCUGCAGUGGACGUCGUCUUCCAGGCUCAAAAGGAGCCACACCCCCUGCAGUUUCUCAGGGAGGCUAAUGCUGGGAACUUGAAACCAUUGUUUGAGUUUGUACGGGAGGCCCUGAAGCCAGUAGACAGUGGAGAGGCUCGGUGGACGUACCCGGUGCUGUUGGUGGACGACCUCAGUGUGCUCCUGAGCCUGGGCAUGGGGGCGGUGGCUGUGCUAGACUUCAUUCACUACUGCAGAGCCACCGUGUGCUGGGAACUAAAGGGAAACAUGGUGGUCCUUGUGCACGACAGUGGAGAUGCGGAGGAUGAGGAGAAUGACAUCCUGCUGAAUGGCCUCAGUCAUCAGAGCCAUCUGAUACUGCGGGCUGAGGGCCUGGCCACUGGCUUCUGCAGGGAUGUGCACGGGCAGCUGAGGAUCCUGUGGAGGAGACCAUCGCAGCCCGCAGUCCACCGGGAUCAGAGCUUCACUUACCAGUAUAAGAUACAGGACAAAAGCGUGUCCUUUUUUGCCAAAGGAAUGUCUCCUGCUGUUCUGUGACCUGAUUUCGGAGCAGCUGAAGCUACAUAGGACUGUUUUUGGACGUGGAAGAUAGAGCAACAUAGCAAGAAUGGGUCUUUCUCCUCUGUAGUAAUAUUUCAGGCUGGACCGGCGACUCCACUGUGACCAGAGGGUUGAGUGCUGCAGUGAUGGCAUGCCUUGGCUGCCCUGGGCCCUGUUCAGAAAACACAAGGGACCACAAUCCUGCCUUUGCUGAGAGAGAGGCUGGAUGCUAGACCCAAGUGAAAGGGGUCCUUUGGAGCCUUUGUUUAAAUAUGCCUUAGCCCCAGCUGCCCAUUUUUGGUUGACAAGCCUUUCAGAGCCAGAGUGGGUAUAGAUGUGCCAGCCAGGAGAUGGCACCGGAUGGCAGGUGUGCAAGGUGACAACUAGGAUAAUCAUGGCUGGAAUAAAGUAAGUUUCCACACUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-560.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -584.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 471.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(.((((((.((.....)).)))))).).........(((((((((.(((.((((.((.((((((((..((.((((.......))))...))..))))((((((((..((((((((..(((((.((.((......)).))))))).)))))))).....))))))))....................)))).)).)))).)))....((((...((((((((........)))))))))))).............)))))).))).(((((.(.(((..((((.....(((((...((......))...))))).....)))))))).)))))..................(((((((.(((.((.((((....((((.((....(((..(((.(((((((((((..((((((((((((((((((......((((.((((..(((((((((....))))..((((((((.(((((....))))).)))).))))...((((...))))((((((((((...(((((.((((.(((.(((((((((...))))))...))).))).........((((((((((.((((...((((....))))))))...)))))))))).(((((((.((.(((((((...)))).))).)).)).).)))).))))))))))))))))))))))))))))(((((((.(((..................))).)))))))((((((.((((.(((...(....)....))))))).))))))))))...)))))).)))))).))))))............((((.((((....)))))))).((((((((...(((.((((((((((((........)))((((((((((.....((.((((((((((((.((((....))))..((((((((((.(((.((((.((((((((((.(..((((....(((((..(((((.((((((......))))))(((((....))))).)))))..)))))....)))))))))))))))(((..(((((((((((.(((((((((((((...(((.............)))..))))))))).......)))).)))))).....))))))))))))..)))((((.(((.(......).))).)))))))))...)))))....))))))))))))))..)))))..)))))..(((..(((......((((.((((((........)))))).))))......)))..))).(((((.(((...))).)))))...........)))))))))))).((((((((((.((((((........)))..))))))))))))).....((((((.........)))))))))))))).))))))))))).)))..)))......)).)))))))).)).))).)))))))....))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(,,....||.(({((....,{((((|{,,((((({....,((((({(((.(((.((((.,,.||||,||}..||||,({..{((((|....,})))},}},((((((((..((((((((..((((,{((.((......)).))))))).)))))))).....))))))))....................,|||{||{||||,||||,,,|((({{{(((({(((.{,,,,{.|||}}}},,,||.,..,,}}}}...)))))).))).||||}|||||{|.,.{{,....||)|))),)).,.,..))}}})}|,...,,})))}})),|||||,................,((((((((..{((({.(((((.........)))))}}))))))}|||((((((((..{{((((((((((((((((...,,.((((.((({..((({(((((,...|}}},,((((((((.(((((....))))).)))).))))..,((({,,,|||}{((((((((....{|||||{{,(,((({(,((,.,||}}})),))|,..,}}{|||{{{{{,{{,(,,,,|||||}||||.|,((((,.{{||||||||,..},,}}}}}}}.{{|||||||{||{|.|.},|||}||{{||{|{,|.,,,)|||||}}})))))))})))}})})})))))))(((((((.(((.,,..........,,.,,))).)))))))((((((.((({{(((...(....).,..))))))).)))))))})}.},)))))).)))))).))))},.....,.,,,,.((({,{(((..,,})}}||||.{((((((|...(((.((((((((((((.{....,.)))|(((((((({..,|.((.((((((((((((.((((....)))),.(((((((|((,{({.{(({,((((((((((.(..((((....(((((..((({{.((((((......)))))),{{{{.....||||.}))))..))))).|..)))}}))))))))))|||,|(((((((((((.((((((((((((,....|,}}}}}}}}.{{..,...})|||||,,,.,},},,)))).)))))).....)))))))))))).,)))|{||,|{{,|......},))),}}}}}}})}.,,))))),...)))))))))))))).}))))),.}))}}..(((..(((.,....((((.((((((........)))))).))))....,.)))..))).(((((.(((...))).)))))..........,)))))))))))),{((((({{{{{((((||........),,.}))))))))))))}.....((((((.,,....,.)))))))))))))).)))))))}))).)}}...,))))))..)))))))))}}}}..,,..,.,|||{...})),
Back