Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001424220.1

Sequence Length

1268 nt

GC Content

0.5402

GUAGUCCGCAGAGGAUCGACCCGGGGAUUGGACUGGAGGCUUGGGCCCGCCGAAAGUGGGCUUCUGGGCCAUCUCGCAUAUUCUCAACGGCUGGGAAACUGACUCUACUCUGUGAUGCCAAGACAGAUGGGAGUUUCCUUGUACACCACUUUCUCUCCUUCUAUCUCAAAGCUAAUUGUAAAGUCUGCUUUGUGGCACUCAUCCAGUCCUUCAGCCACUACAGUAUCGUGGGACAGAAGCUGGGUGUCAGCCUGACCAUGGCGCGGGAGCGUGGGCAGCUUGUGUUCCUUGAGGGACUCAAGUCUGCAGUGGACGUCGUCUUCCAGGCUCAAAAGGAGCCACACCCCCUGCAGUUUCUCAGGGAGGCUAAUGCUGGGAACUUGAAACCAUUGUUUGAGUUUGUACGGGAGGCCCUGAAGCCAGUAGACAGUGGAGAGGCUCGGUGGACGUACCCGGUGCUGUUGGUGGACGACCUCAGUGUGCUCCUGAGCCUGGGCAUGGGGGCGGUGGCUGUGCUAGACUUCAUUCACUACUGCAGAGCCACCGUGUGCUGGGAACUAAAGGGAAACAUGGUGGUCCUUGUGCACGACAGUGGAGAUGCGGAGGAUGAGGAGAAUGACAUCCUGCUGAAUGGCCUCAGUCAUCAGAGCCAUCUGAUACUGCGGGCUGAGGGCCUGGCCACUGGCUUCUGCAGGGAUGUGCACGGGCAGCUGAGGAUCCUGUGGAGGAGACCAUCGCAGCCCGCAGUCCACCGGGAUCAGAGCUUCACUUACCAGUAUAAGAUACAGGACAAAAGCGUGUCCUUUUUUGCCAAAGGAAUGUCUCCUGCUGUUCUGUGACCUGAUUUCGGAGCAGCUGAAGCUACAUAGGACUGUUUUUGGACGUGGAAGAUAGAGCAACAUAGCAAGAAUGGGUCUUUCUCCUCUGUAGUAAUAUUUCAGGCUGGACCGGCGACUCCACUGUGACCAGAGGGUUGAGUGCUGCAGUGAUGGCAUGCCUUGGCUGCCCUGGGCCCUGUUCAGAAAACACAAGGGACCACAAUCCUGCCUUUGCUGAGAGAGAGGCUGGAUGCUAGACCCAAGUGAAAGGGGUCCUUUGGAGCCUUUGUUUAAAUAUGCCUUAGCCCCAGCUGCCCAUUUUUGGUUGACAAGCCUUUCAGAGCCAGAGUGGGUAUAGAUGUGCCAGCCAGGAGAUGGCACCGGAUGGCAGGUGUGCAAGGUGACAACUAGGAUAAUCAUGGCUGGAAUAAAGUAAGUUUCCACACUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-485.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -507.11

Frequency: 0.0000

Diversity: 494.55

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((((.....))))..))..((((((..(.(.((((((((((((((((.....))))))..))))))).))).))..))))))..(((.(((((((((.(((.((.((((....((((.((....(((..(((.(((((((((((..(((((((((((((((((((((((..(((....)))..)))))..(((...(((((((..((((..((((.........))))....)))))))))))...)))..(((((((((((((.((((..((((((((.(((((....))))).)))).))))..((((.(....).))))(((((.....)))))...(((((((.((...))))))).)).....((((((..(((....((((((((((.((((...((((....))))))))...)))))))))).))).))))))..)))).))).)))))).))))((((.(((...((((..((((.((.((.(((((....(((((((((.(((..................))).)))))))))))))).))..))..))))..))))))).)))).....(((....))))))))).)))))).))))))............((((.((((....)))))))).((((((((...(((.((((((((((((........)))((((((((((.....((.((((((((((((.((((....))))..((((((((((.(((.((((.((((((((((.(..((((....(((((..(((((.((((((......))))))(((((....))))).)))))..)))))....)))))))))))))))(((..(((((((((((.(((((((((((((...(((.............)))..))))))))).......)))).)))))).....))))))))))))..)))((((.(((.(......).))).)))))))))...)))))....))))))))))))))..)))))..)))))..(((..(((......((((.((((((........)))))).))))......)))..))).(((((.(((...))).)))))...........)))))))))))).((((((((((.((((((........)))..))))))))))))).....((((((.........)))))))))))))).))))))))))).)))..)))......)).)))))))).)).))).))))))).)))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{{((((.,.,.||},...}},|{||||,,,.({((((((((({{{({((,,,,,||||||,.|||||}}.,,,.||,,|||}}|,,{(({(((((((((.,((,((.(((({...{{{{.{|,,,,{||,,|||,|||{({{{{((.,{{{(((((,,,,,,,,,((((((..(((....)))..)))))}.((({,,((((((({,((((.,{{{(.........)))),,|,}||||||}}}}...)))...{(,,{{({{,,.,}}|}||{|||||{{||{{{{,||,)))))||}}|{|}||({((((.((((((.(((((((((.....)))))...({(((((.({...}}))))).)){{..{||{(|{{{{{(,{{,(,,,,|||||}||||.|,{(({..,|||||||||...},,||||}||,{{{{((((((((((.,.,.{{{.(((({{(((((.,..(({{{{{.|{{{(|{|.|{||.,}},}))}}}||{(({(({(((....,,,{{,,,.,,.{{|||.,,||||{((((((.((({,(((..,{....).,..))))))).)))))))...))}),,,))}))})))})))),.....,{|||||,(,{{,,((({{{{{||{(((({....|))))},|||.||||||||||||.|,||.}.)))||||||||||.,,},||,||||||||||||.((((....)))),.|||||||}||}}|,.}||}}|||||,||,{,{,||{{,...,|||||}.||{,,.((((((......)))))).,,,,,,...||{{.,,,,)}})||||{{{{|,||.,,,,}),)))}}}}}|||||||{{{{.((((((((((((,...,{,},}}},,,.,{..,,,.,)}|||},,,.}}}}}})))},)))}}}....,))))))))))),.})))}}}}}}}}}}},,...}}))}}))))})}||{{{,|,||....)),),)))))}|||{|||||}}|}}}....{{|,,|{{.|,,,.{{{{.(((({{.....,,,)))))).)))),...|.}}}..,}}.{{|||,||{...))),))})),....,,,,}}),,}}))))))).,|||||||||||||{|,,},,,,,,})),.}||||}|||||}|....,{({((({((,.,,,.||}||||,,,}}||,)))))))}})),)})..))}......)).))))))),.)}.})).}))}))),),))),.