Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001424222.1
Sequence Length
1459 nt
GC Content
0.5449
GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGUUUUGCUCUCCAGCCUCCGUCGUCUCUGCAGCACUCCGGGUUCUCCUCCAGAGCGCUAGUCCCAGGAGCUCGGAAUGUUCGUGGAACUUAAUAACCUGCUUAACACCACCCCCGACAGGGCGGAGCAGGGGAAACUGACUCUACUCUGUGAUGCCAAGACAGAUGGGAGUUUCCUUGUACACCACUUUCUCUCCUUCUAUCUCAAAGCUAAUUGUAAAGUCUGCUUUGUGGCACUCAUCCAGUCCUUCAGCCACUACAGUAUCGUGGGACAGAAGCUGCCGGCCAACGCUUAGGGAAAAUAGAAAAGAACCUACGUGACUAUCGGGGCAGGUUUCCUGAUAUCGGCAGGUGGAUCACUUGAGGCCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGGGUGUCAGCCUGACCAUGGCGCGGGAGCGUGGGCAGCUUGUGUUCCUUGAGGGACUCAAGUCUGCAGUGGACGUCGUCUUCCAGGCUCAAAAGGAGCCACACCCCCUGCAGUUUCUCAGGGAGGCUAAUGCUGGGAACUUGAAACCAUUGUUUGAGUUUGUACGGGAGGCCCUGAAGCCAGUAGACAGUGGAGAGGCUCGGUGGACGUACCCGGUGCUGUUGGUGGACGACCUCAGUGUGCUCCUGAGCCUGGGCAUGGGGGCGGUGGCUGUGCUAGACUUCAUUCACUACUGCAGAGCCACCGUGUGCUGGGAACUAAAGGGAAACAUGGUGGUCCUUGUGCACGACAGUGGAGAUGCGGAGGAUGAGGAGAAUGACAUCCUGCUGAAUGGCCUCAGUCAUCAGAGCCAUCUGAUACUGCGGGCUGAGGGCCUGGCCACUGGCUUCUGCAGGGAUGUGCACGGGCAGCUGAGGAUCCUGUGGAGGAGACCAUCGCAGCCCGCAGUCCACCGGGAUCAGAGCUUCACUUACCAGUAUAAGAUACAGGACAAAAGCGUGUCCUUUUUUGCCAAAGGAAUGUCUCCUGCUGUUCUGUGACCUGAUUUCGGAGCAGCUGAAGCUACAUAGGACUGUUUUUGGACGUGGAAGAUAGAGCAACAUAGCAAGAAUGGGUCUUUCUCCUCUGUAGUAAUAUUUCAGGCUGGACCGGCGACUCCACUGUGACCAGAGGGUUGAGUGCUGCAGUGAUGGCAUGCCUUGGCUGCCCUGGGCCCUGUUCAGAAAACACAAGGGACCACAAUCCUGCCUUUGCUGAGAGAGAGGCUGGAUGCUAGACCCAAGUGAAAGGGGUCCUUUGGAGCCUUUGUUUAAAUAUGCCUUAGCCCCAGCUGCCCAUUUUUGGUUGACAAGCCUUUCAGAGCCAGAGUGGGUAUAGAUGUGCCAGCCAGGAGAUGGCACCGGAUGGCAGGUGUGCAAGGUGACAACUAGGAUAAUCAUGGCUGGAAUAAAGUAAGUUUCCACACUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-559.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -585.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 353.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((....))))..((((((((..(((..((((((.(((((.......(((((..((((((.(((((((((.(((((..(((((.(((.(((((((((((((.(((.((((.......)))).))).)))......((((((.....((.(((......))).))))))))(((((((...((((.(((((.........))))))))))))))))..((((.(((((.(((((((.....((.((((((..(((....)))..)))))).)).........((((((((((...............((((((.((((((((.(((..(((.((((...............))))..((((.(((.((((.((((((..((..((((((((((...)))))...)))..))..)))))))).)))).)))))))(((.......))))))...).)).)))))))).))))))))))))))))...((((((..(((.(.(((((((((.(((((.....)))))...(((((((.((...))))))).)).......((.((((((.((((....)))))))))).)).)))))))...)).))))))))))...)))))))...)))))..))))..)))))).)))).))).))))).)))))(((((((.((....)).)))))))(((((((.(((..................))).)))))))((((((.((((.(((...(....)....))))))).))))))....)))))))))))))))....)))))....((((.(.(((..((((....(((((((((....)))))).(((.((((((((((((........)))((((((((((.....((.((((((((((((.((((....))))..((((((((((.(((.((((.((((((((((.(..((((....(((((..(((((.((((((......))))))(((((....))))).)))))..)))))....)))))))))))))))(((..(((((((((((.(((((((((((((...(((.............)))..))))))))).......)))).)))))).....))))))))))))..)))((((.(((.(......).))).)))))))))...)))))....))))))))))))))..)))))..)))))..(((..(((......((((.((((((........)))))).))))......)))..))).(((((.(((...))).)))))...........)))))))))))).((((((((((.((((((........)))..)))))))))))))..)))..))))..))).)))))))))).)))))).)))))))))))...............((..(..(((((..........)))))..)..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((({((,,{{{{,......}))))),)))},}}}.{(.((((((.{(((((.((((((({(((((((((..((((({(((,(((..,,,,|,,.|}},,},,||.{{|,||||,,,,,..)))},))).}}}......((((((.....{{.(((.,....))).)))))))),.,..,,,,,}}}.,,,,)},.,))..)))).)))))}.(((.(((((((((((.(((((((((.........((((((..(((....)))..)))))).(((((((({(({(((((((((.............,,((((((.((((((((.((,..(((.((((...............)))).,|(((.(((.((((.((((({,,({,.((((((((((...}})}},.,}}}.,}}..},}})))).)))).))))))}{((.......)))||}...)})).)))))))).))))))}))))))))|,..(((.((((((((.((((((.(((((((((.....)))))...(((((((.{{...}}))))).))({.,(({(({{{{{{({({,(,,,,|||||}||||.},|{{{.,,||||||||,...,,,||||}||,(({{((((((((((.....(((.(((({,(((((....(((((((.{(((((((.((,,..||.}||||}||,((,((((((....{{((({((.{{.(((((...(((((((((((.((({{(((...{....).,..))))))).)))))))...))))...)))))|)}}})}}}......{||||||{{.|{..(((((((((,((((((....))))))}}}}.}))))}}}}})|.||}},},)})))),))}))),}})}))})),))))))))).((((....))))..)))))))))))))..)))))))))).,,.,{||||||....}}}}}}}.}}....((((((......)))))).....{{,..((((.....))))(((((((((.{{.....,}.)))))))))|}}||||,{,.(((((((((((({...,{{,,,,,,,,.,{..},,.,)}}|}}},},})}}})))),})))}}}....})))))))))))..)))))))))))))))))..},))).))))))))(((({{(,(({{.,||.|.))))),,((((({{{||},,,......||}))|.}}...,,,}})),.,,}..)))))))))(((((..(((((.......{{{(((((.(((...))).))))}.,}}}.....,..})))).)))))((((((((((((((({{........)},.,)))))))))))))......(((((.((.{{...,,,,.)}}}.)))))))))))))))).)))...............)))))))....))))))....)))))).)}
Back