Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001424228.1

Sequence Length

1134 nt

GC Content

0.5441

GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGUUUUGCUCUCCAGCCUCCGUCGUCUCUGCAGCACUCCGGGUUCUCCUCCAGAGCGCUAGUCCCAGGAGCUCGGAAUGUUCGUGGAACUUAAUAACCUGCUUAACACCACCCCCGACAGGGCGGAGCAGGGGAAACUGACUCUACUCUGUGAUGCCAAGACAGAUGGGAGUUUCCUUGUACACCACUUUCUCUCCUUCUAUCUCAAAGGGUGUCAGCCUGACCAUGGCGCGGGAGCGUGGGCAGCUUGUGUUCCUUGAGGGACUCAAGUCUGCAGUGGACGUCGUCUUCCAGGCUCAAAAGGAGCCACACCCCCUGCAGUUUCUCAGGGAGGCUAAUGCUGGGAACUUGAAACCAUUGUUUGAGUUUGUACGGGAGGCCCUGAAGCCAGUAGACAGUGGAGAGGCUCGGUGGACGUACCCGGUGCUGUUGGUGGACGACCUCAGUGUGCUCCUGAGCCUGGGCAUGGGGGCGGUGGCUGUGCUAGACUUCAUUCACUACUGCAGAGCCACCGUGUGCUGGGAACUAAAGCUGAGGAUCCUGUGGAGGAGACCAUCGCAGCCCGCAGUCCACCGGGAUCAGAGCUUCACUUACCAGUAUAAGAUACAGGACAAAAGCGUGUCCUUUUUUGCCAAAGGAAUGUCUCCUGCUGUUCUGUGACCUGAUUUCGGAGCAGCUGAAGCUACAUAGGACUGUUUUUGGACGUGGAAGAUAGAGCAACAUAGCAAGAAUGGGUCUUUCUCCUCUGUAGUAAUAUUUCAGGCUGGACCGGCGACUCCACUGUGACCAGAGGGUUGAGUGCUGCAGUGAUGGCAUGCCUUGGCUGCCCUGGGCCCUGUUCAGAAAACACAAGGGACCACAAUCCUGCCUUUGCUGAGAGAGAGGCUGGAUGCUAGACCCAAGUGAAAGGGGUCCUUUGGAGCCUUUGUUUAAAUAUGCCUUAGCCCCAGCUGCCCAUUUUUGGUUGACAAGCCUUUCAGAGCCAGAGUGGGUAUAGAUGUGCCAGCCAGGAGAUGGCACCGGAUGGCAGGUGUGCAAGGUGACAACUAGGAUAAUCAUGGCUGGAAUAAAGUAAGUUUCCACACUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-435.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -455.29

Frequency: 0.0000

Diversity: 270.93

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(((((((............))))))))))......((.((((((.((((((.(((((((((((((((((..(((.(((...(.(((((.....))))).).(((.(((.((((.......)))).))).)))......((((((.....((.(((......))).))))))))(((.......))).....))).)))..)))).)))))).(((.(((((((((((....(((.(((((((..((((((((.((((((((........((((....))))((((((((((.(((((....))))).)).(((.((((((((.((((((.(((((((((.....)))))...(((((((.((...))))))).))((.(((((((..........((((((((((.((((...((((....))))))))...)))))))))).((((((((((((((.....(((.(((((.(((((.(..((((.......((((.(((((.(((((....(((((((((.(((..................))).)))))))))))))).)).......))).)))).......)))).).)))))))))))))..))))))).......))))))).....))))))).))....((((((......)))))).....(((..((((.....))))(((((((((...........)))))))))((((((((((.(((((((((((((...(((.............)))..))))))))).......)))).)))))).....)))))))))))..)))))))))))))))))....((((((((.((.(((((.(.((....)).).))))).((((((...))))))....(((..(((......((((.((((((........)))))).))))......)))..))).(((((.(((...))).)))))..........)))))))))).))))))))......))))))))..)))))..)))..)))).)))...)))..(((((.((.((........)))).)))))))))))))))).)))...............)))))))....))))))....)))))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.((({((,,{{{{,......}))))),)))},}}}.{(.((((((.{(((((.((((((({(((((((((..((((({(((,(((..,,,,|,,.|}},,},{||.{{{,||||,,,,,..)))},))).}}}......((((((.....{{.(((.,....))).)))))))),.,..,,,.,|}}.,||,}},.,))..)))).)))))).(((.(((((((((((.,,.{{{,(({((((.,(({{((((.((((((((.,,....{(((({{{.({,.((((((((((.(((((....))))).)))||,.((((((((.((((((.(((((((((.....)))))...(((((((.{{...}}))))).))({.,(({(({{{{{{({({,(,,,,|||||}||||.},|{{{.,,||||||||,...,,,||||}||,(({{((((((((((.....(((.((((,,(((((.(..((((...,.{.((((.(((((.(((((....(((((((((.(((.{{...............))).)))))))))))))).)).......))).)))).},....)))).).)))))))))))))..)))))))))).,,..{||||||....}}}}}}}.}}....((((((......)))))).....{{,..((((.....))))(((((((((.{{.....,}.)))))))))|}}}|||,{,.(((((((((((({...{{{,,,,,,,,.,{..}},.,)}}|}}},},})}}})))),}))),}}....})))))))))))..))))))))))))))}|,.,.{(((((,((.(,.(((((.(.((....)).).))))),||,|||}}},}}},.....(((..(((.,....((((.((((((........)))))).))))....,.)))..))).{((((.(((...))).))))).........})))),,))))).)),)))},..,,.)))))))}..))))).,))}..)))).)))...}},..(((((.((,{{...,,,}.)})).))))}))))))))))).)))...............)))))))....))))))....)))))).)}