Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001424229.1

Sequence Length

1055 nt

GC Content

0.5507

GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGUUUUGCUCUCCAGCCUCCGUCGUCUCUGCAGCACUCCGGGUUCUCCUCCAGAGCGCUAGUCCCAGGAGCUCGGAAUGUUCGUGGAACUUAAUAACCUGCUUAACACCACCCCCGACAGGGCGGAGCAGGGUGUCAGCCUGACCAUGGCGCGGGAGCGUGGGCAGCUUGUGUUCCUUGAGGGACUCAAGUCUGCAGUGGACGUCGUCUUCCAGGCUCAAAAGGAGCCACACCCCCUGCAGUUUCUCAGGGAGGCUAAUGCUGGGAACUUGAAACCAUUGUUUGAGUUUGUACGGGAGGCCCUGAAGCCAGUAGACAGUGGAGAGGCUCGGUGGACGUACCCGGUGCUGUUGGUGGACGACCUCAGUGUGCUCCUGAGCCUGGGCAUGGGGGCGGUGGCUGUGCUAGACUUCAUUCACUACUGCAGAGCCACCGUGUGCUGGGAACUAAAGCUGAGGAUCCUGUGGAGGAGACCAUCGCAGCCCGCAGUCCACCGGGAUCAGAGCUUCACUUACCAGUAUAAGAUACAGGACAAAAGCGUGUCCUUUUUUGCCAAAGGAAUGUCUCCUGCUGUUCUGUGACCUGAUUUCGGAGCAGCUGAAGCUACAUAGGACUGUUUUUGGACGUGGAAGAUAGAGCAACAUAGCAAGAAUGGGUCUUUCUCCUCUGUAGUAAUAUUUCAGGCUGGACCGGCGACUCCACUGUGACCAGAGGGUUGAGUGCUGCAGUGAUGGCAUGCCUUGGCUGCCCUGGGCCCUGUUCAGAAAACACAAGGGACCACAAUCCUGCCUUUGCUGAGAGAGAGGCUGGAUGCUAGACCCAAGUGAAAGGGGUCCUUUGGAGCCUUUGUUUAAAUAUGCCUUAGCCCCAGCUGCCCAUUUUUGGUUGACAAGCCUUUCAGAGCCAGAGUGGGUAUAGAUGUGCCAGCCAGGAGAUGGCACCGGAUGGCAGGUGUGCAAGGUGACAACUAGGAUAAUCAUGGCUGGAAUAAAGUAAGUUUCCACACUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-408.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -428.58

Frequency: 0.0000

Diversity: 240.38

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(((((((............))))))))))......((.((((((.((((((.((((((((((((((((.(((((((((((...((((.(((((...((((((((.(((.((((.......)))).))).)))......((((((.....((.(((......))).))))))))(.((((...)))))..))))).)))).).)))).(((((.(((((....))))).)))))..((((((((.((((((.(((((((((.....)))))...(((((((.((...))))))).))((.(((((((..........((((((((((.((((...((((....))))))))...)))))))))).((((((((((((((.....(((.(((((.(((((.(..((((.......((((.(((((.(((((....(((((((((.(((..................))).)))))))))))))).)).......))).)))).......)))).).)))))))))))))..))))))).......))))))).....))))))).))....((((((......)))))).....(((..((((.....))))(((((((((...........)))))))))((((((((((.(((((((((((((...(((.............)))..))))))))).......)))).)))))).....)))))))))))..))))))))))))))((((....))))))))))))))).)))))).......((((.(...(((((((.((((..........(((......((((.((((((........)))))).))))......)))...)))).)))))))...).)))).(((((.......(((((.((..((.(((((((((((.((((((........)))..)))))))))(((((....))))).((((.....)))).......))))).)).))))))))))))...))).......)))))))....))))))....)))))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.((({((,,{{{{,......}))))),)))},}}}.{(.((((((.((((((.(((((((,,,((((((.(((((((((((,{.(((({({,,,...((((((((.(((.((((.......)))).))).))}......((((((.....{(.(((,,....))).)))))))),.((({...}))),.}))))),))))}}}))||{(((((.(((((....))))).)))),}}||((((((.((((((.(((((((((.....)))))...(((((((.{{...}}))))).))({.,(({(({{{{{{({({.(,,,,|||||}||||.},|{{{.,,||||||||,...,,,||||}||,(({{((((((((((.....(((.((((,,(((((.(..((((...,.{.((((.(((((.(((((....(((((((((.(((.{{...............))).)))))))))))))).)).......))).)))).},....)))).).)))))))))))))..)))))))))).,,..{||||||....}}}}}}}.}}....((((((......)))))).....{{,..((((.....))))(((((((((.{{.....,}.)))))))))|}}}|||,{,.{((((((((((({...,{{,,,,,,,,.,{..}},.,)}}|}}},},})}}}}))),})))}}}....})))))))))))..))))))))))))}}((((....))))))))))))))).))))))..,{,,.((((.{,..(((((((.{{{{......,{..(((.,....((((.((((((........)))))).))))....,.)))..,))},.))))}}|...),)})).,{{{......,{((({,.(({{{.,,((((((((((((((({{........}},.,))))))))))))}.....{(((((.{{......))))}).}}.,))))}))}}))))))),.},,...))).......)))))))....)))))}....)))))).)}