Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001424230.1
Sequence Length
1121 nt
GC Content
0.5343
GUAGUCCGCAGAGGAUCGACCCGGGGAUUGGACUGGAGGCUUGGGCCCGCCGAAAGUGGGCUUCUGGGCCAUCUCGCAUAUUCUCAACGGCUGGGAAACUGACUCUACUCUGUGAUGCCAAGACAGAUGGGAGUUUCCUUGUACACCACUUUCUCUCCUUCUAUCUCAAAGCUAAUUGUAAAGUCUGCUUUGUGGCACUCAUCCAGUCCUUCAGCCACUACAGUAUCGUGGGACAGAAGCUGGGUGUCAGCCUGACCAUGGCGCGGGAGCGUGGGCAGCUUGUGUUCCUUGAGGGACUCAAGUCUGCAGUGGACGUCGUCUUCCAGGCUCAAAAGGAGCCACACCCCCUGCAGUUUCUCAGGGAGGCUAAUGCUGGGAACUUGAAACCAUUGUUUGAGUUUGUACGGGAGGCCCUGAAGCCAGUAGACAGUGGAGAGGCUCGGUGGACGUACCCGGUGCUGUUGGUGGACGACCUCAGUGUGCUCCUGAGCCUGGGCAUGGGGGCGGUGGCUGUGCUAGACUUCAUUCACUACUGCAGAGCCACCGUGUGCUGGGAACUAAAGCUGAGGAUCCUGUGGAGGAGACCAUCGCAGCCCGCAGUCCACCGGGAUCAGAGCUUCACUUACCAGUAUAAGAUACAGGACAAAAGCGUGUCCUUUUUUGCCAAAGGAAUGUCUCCUGCUGUUCUGUGACCUGAUUUCGGAGCAGCUGAAGCUACAUAGGACUGUUUUUGGACGUGGAAGAUAGAGCAACAUAGCAAGAAUGGGUCUUUCUCCUCUGUAGUAAUAUUUCAGGCUGGACCGGCGACUCCACUGUGACCAGAGGGUUGAGUGCUGCAGUGAUGGCAUGCCUUGGCUGCCCUGGGCCCUGUUCAGAAAACACAAGGGACCACAAUCCUGCCUUUGCUGAGAGAGAGGCUGGAUGCUAGACCCAAGUGAAAGGGGUCCUUUGGAGCCUUUGUUUAAAUAUGCCUUAGCCCCAGCUGCCCAUUUUUGGUUGACAAGCCUUUCAGAGCCAGAGUGGGUAUAGAUGUGCCAGCCAGGAGAUGGCACCGGAUGGCAGGUGUGCAAGGUGACAACUAGGAUAAUCAUGGCUGGAAUAAAGUAAGUUUCCACACUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-423.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -443.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 324.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((.....))))..))..((((((..(.(.((((((((((((((((.....))))))..))))))).))).))..))))))..(((.(((((((((.(((.((.((((....((((.((....(((..(((.(((((((((((.(((((((((.........((((((..(((....)))..)))))).(((...(((((((..((((..((((.........))))....)))))))))))...)))...((.......)).((((.((((((.((((((((((((.((.((((((.(((((((((((.((((((.(((((((((.....)))))...(((((((.((...))))))).))((.(((((((..........((((((((((.((((...((((....))))))))...)))))))))).((((((((((((((.....(((.(((((.(((((.(..((((.......((((.(((((.(((((....(((((((((.(((..................))).)))))))))))))).)).......))).)))).......)))).).)))))))))))))..))))))).......))))))).....))))))).))....((((((......)))))).....(((..((((.....))))(((((((((...........)))))))))((((((((((.(((((((((((((...(((.............)))..))))))))).......)))).)))))).....)))))))))))..))))))))))))))......))).)))))).))(((((.(.((....)).).))))).((((((...))))))......))))))).)))))..)))))).)))))))))))))(((((..(((((.......((((((((.(((...))).))))..))))........))))).)))))((((((((((.((((((........)))..)))))))))))))......(((((.((.((........)))).)))))))))))))))).)))..)))......)).)))))))).)).))).))))))).)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((.{.,.({,....}}}|,}}}}}}..({(((((((((,,,{,((({{{{|||||{..{{{{{||.....{{{{{{|.,|{{,(({(((((((((..{({({.(((((.....,,..}}}}}|||}}||}}|||,{,,,,{{.{{{{{{{{{.........((((((..(((....)))..)))))).((({{{(((((((({((((,,,,,{.........))||{{{{,|||||||||}...})}...{{..,{{{{,,,,|}|}||,|||}||,|||||||||}|}}}||{,,{((,((((((((.((((((.(((((((((.....)))))...(((((((.{{...}}))))).))({.,(({(({{{{{{({({,(,,,,|||||}||||.},|{{{.,,||||||||,...,,,||||}||,(({{((((((((((.....(((.((((,,(((((.(..((((...,.{.((((.(((((.(((((....(((((((((.(((.{{...............))).)))))))))))))).)).......))).)))).},....)))).).)))))))))))))..)))))))))).,,..{||||||....}}}}}}}.}}....((((((......)))))).....{{,..((((.....))))(((((((((.{{.....,}.)))))))))|}}}|||,{,.{((((((((((({...{{{,,,,,,,,.,{..}},.,)}}|}}},},})}}})))),})))}}}....})))))))))))..))))))))))))))}}}..,}})}|}))))})}(((((.(.((....)).).))))),{{((((|||,}|}},....,,|}}|||,|,,}.|{{|,||||{|,,,,,}}}))))||,||,}|,,,{.|||...||,|,|||}|||...)))})),))}....}))))))..,,)}}))))..}|||}}}}}}|}|.|.}}}}}},,}))}..||{{.{{|||,|,..,{.{,(((((((.{{,.{{,{{{{....,|||}}}}))),,))}),}..)),......)).)))))))..},..))..)),))))).)))).
Back