Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001504.2
Sequence Length
1615 nt
GC Content
0.6217
ACAAGCACCAAAGCAGAGGGGCAGGCAGCACACCACCCAGCAGCCAGAGCACCAGCCCAGCCAUGGUCCUUGAGGUGAGUGACCACCAAGUGCUAAAUGACGCCGAGGUUGCCGCCCUCCUGGAGAACUUCAGCUCUUCCUAUGACUAUGGAGAAAACGAGAGUGACUCGUGCUGUACCUCCCCGCCCUGCCCACAGGACUUCAGCCUGAACUUCGACCGGGCCUUCCUGCCAGCCCUCUACAGCCUCCUCUUUCUGCUGGGGCUGCUGGGCAACGGCGCGGUGGCAGCCGUGCUGCUGAGCCGGCGGACAGCCCUGAGCAGCACCGACACCUUCCUGCUCCACCUAGCUGUAGCAGACACGCUGCUGGUGCUGACACUGCCGCUCUGGGCAGUGGACGCUGCCGUCCAGUGGGUCUUUGGCUCUGGCCUCUGCAAAGUGGCAGGUGCCCUCUUCAACAUCAACUUCUACGCAGGAGCCCUCCUGCUGGCCUGCAUCAGCUUUGACCGCUACCUGAACAUAGUUCAUGCCACCCAGCUCUACCGCCGGGGGCCCCCGGCCCGCGUGACCCUCACCUGCCUGGCUGUCUGGGGGCUCUGCCUGCUUUUCGCCCUCCCAGACUUCAUCUUCCUGUCGGCCCACCACGACGAGCGCCUCAACGCCACCCACUGCCAAUACAACUUCCCACAGGUGGGCCGCACGGCUCUGCGGGUGCUGCAGCUGGUGGCUGGCUUUCUGCUGCCCCUGCUGGUCAUGGCCUACUGCUAUGCCCACAUCCUGGCCGUGCUGCUGGUUUCCAGGGGCCAGCGGCGCCUGCGGGCCAUGCGGCUGGUGGUGGUGGUCGUGGUGGCCUUUGCCCUCUGCUGGACCCCCUAUCACCUGGUGGUGCUGGUGGACAUCCUCAUGGACCUGGGCGCUUUGGCCCGCAACUGUGGCCGAGAAAGCAGGGUAGACGUGGCCAAGUCGGUCACCUCAGGCCUGGGCUACAUGCACUGCUGCCUCAACCCGCUGCUCUAUGCCUUUGUAGGGGUCAAGUUCCGGGAGCGGAUGUGGAUGCUGCUCUUGCGCCUGGGCUGCCCCAACCAGAGAGGGCUCCAGAGGCAGCCAUCGUCUUCCCGCCGGGAUUCAUCCUGGUCUGAGACCUCAGAGGCCUCCUACUCGGGCUUGUGAGGCCGGAAUCCGGGCUCCCCUUUCGCCCACAGUCUGACUUCCCCGCAUUCCAGGCUCCUCCCUCCCUCUGCCGGCUCUGGCUCUCCCCAAUAUCCUCGCUCCCGGGACUCACUGGCAGCCCCAGCACCACCAGGUCUCCCGGGAAGCCACCCUCCCAGCUCUGAGGACUGCACCAUUGCUGCUCCUUAGCUGCCAAGCCCCAUCCUGCCGCCCGAGGUGGCUGCCUGGAGCCCCACUGCCCUUCUCAUUUGGAAACUAAAACUUCAUCUUCCCCAAGUGCGGGGAGUACAAGGCAUGGCGUAGAGGGUGCUGCCCCAUGAAGCCACAGCCCAGGCCUCCAGCUCAGCAGUGACUGUGGCCAUGGUCCCCAAGACCUCUAUAUUUGCUCUUUUAUUUUUAUGUCUAAAAUCCUGCUUAAAACUUUUCAAUAAACAAGAUCGUCAGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-674.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -701.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 316.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((.(((((((((((((((((....((.(((((((((((((((((((((..(((..((((((((.....))).)))))....((((.....).)))...((((((((((.....((((.....(((((((((.((....)).)))))..(((((.....)))))))))...)))).((((.(((((((((((.....(((((.........)))))..))))).((((((....((((...........)))))))))).))))))..)))).))))))))))((((((((.((..(((.....))))).))))))))..........(((((.((......)).)))))....))))))))))))...((((((......))))))(((((....))))).(((((((...((((..(((.(((((......))))).)))........(((.((((......(((((((..((..(((((......)))))...))..))).)))).....)))).)))...(((.((......)).)))))))...)))))))((((...))))....))))))).)))))))..))))))))..............(((...........)))((((.((((((((..(((......)))((((.(((((((......((.((....)).))((((((.(((.((((((((((((((((.((.(((.(((.....)))))))).)))((.((((((.....)))))).))...........(.(((.((((...)))).)))).)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))....)))))))))(.(((.((........)).))).))))))....(((....)))(((((.((.(((((((.((....))))))))).(((((((((((((((((((.....))))))....((((..(((((((..((((((((.....((((.((((.(((((((((.((((((((..(((.(((((.((((..((((...))))..)))).)))))))))))))...(((.(.((((((((..((((((((..(((((...(((((((....)))))))..)))))((((.((((((.......)))))).))))((((((((.((((.........(.......).........)))).))))).))).........((((.(.((((...((((...............((((((((((..(.((((..((....))....)))))..))))))).)))........(((((..((((((.(((....))).).))))))))))...)))).......)))).).))))))))))))))))))))).)))((((...(((((((....................))))))).))))..)))))))))))).)))).))))((((......((.(((........))).)))))).))))))))..)))))))..))))...((((.(.........).))))..........))))...)))))))))......................))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....{,,,,.,(({(((((((((((((....((.(((((((((((((((((((((.,(((..((((((((,.,,{|}}.}}))}....({{{.....,.}}}...((((((((((.....((((.....(((({{{{({.,.....,.))))}..(((((.....)))))))))...)))).((((.(((((((((((.....(((((.........)))))..))))).((((((....((((...........)))))))))).))))))..)))).))))))))))((((((((.((..(((.....))))).))))))))..........(((((.((......)).)))))....))})))))))))...((((((......))))))(((((....))))).(((((((...((({(((((..{{((...|,||||||,|}}.....................((((((....}))))){({...{{,,,|||..,},..))}.,,||{{{..,)))})})}|,|{{.||......))}))))))}...)))))))((({...})))....))))))).)))))))..)))))))),,,,,.,.......(((...........|}}(({((((((((((..(((......}))(({(((((((({......,,.,(,...}},))((((((.(((.((((((((((((((((.((.(((.(((.....)))))))).)))((.((((((.....)))))).)}......{||{{,.{{{.((((...)))).)))),)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))...,|||||||||({{{(.((........)).))),))))))},..(((....))),{{|||||.((((((((((....))))))))}.((((((((((((((((((((...(((((((...(((((((((((.,,.{(,,{(,.((....((((.((((.(((((((({{((((((({..(({{(((((.(((({.((((...))))}}}})).)))))))))))))...(((.(.((((((({.,((((((((..(((((...(((((((....)))))))..)))))((((.((((((.......)))))).))))((((((((.((((.........,.......}...,.....)))).))))).))).........((((.(.((((...((({...............((((((((((..(.((((..((....))....)))))..)))))))}}))........(((({.,((((((.(((....))).).))))))))))...)))).......)))).}.))))))))))))))))))))).))),{{{...{{{{{{{................,,,,||}}}}}.))))},)))))))))))).)))).))))|,.))..}}.}..}}...)))))))))))..,|,...),.))))))))))))}}((((.....)))).........................)))),..})))))))).................,,},.,)))))).
Back