Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001554.5

Sequence Length

2278 nt

GC Content

0.5048

AGACCGCGAGCGAGAGCGCCCCCGAGCAGCGCCCGCGCCCUCCGCGCCUUCUCCGCCGGGACCUCGAGCGAAAGACGCCCGCCCGCCGCCCAGCCCUCGCCUCCCUGCCCACCGGGCCCACCGCGCCGCCACCCCGACCCCGCUGCGCACGGCCUGUCCGCUGCACACCAGCUUGUUGGCGUCUUCGUCGCCGCGCUCGCCCCGGGCUACUCCUGCGCGCCACAAUGAGCUCCCGCAUCGCCAGGGCGCUCGCCUUAGUCGUCACCCUUCUCCACUUGACCAGGCUGGCGCUCUCCACCUGCCCCGCUGCCUGCCACUGCCCCCUGGAGGCGCCCAAGUGCGCGCCGGGAGUCGGGCUGGUCCGGGACGGCUGCGGCUGCUGUAAGGUCUGCGCCAAGCAGCUCAACGAGGACUGCAGCAAAACGCAGCCCUGCGACCACACCAAGGGGCUGGAAUGCAACUUCGGCGCCAGCUCCACCGCUCUGAAGGGGAUCUGCAGAGCUCAGUCAGAGGGCAGACCCUGUGAAUAUAACUCCAGAAUCUACCAAAACGGGGAAAGUUUCCAGCCCAACUGUAAACAUCAGUGCACAUGUAUUGAUGGCGCCGUGGGCUGCAUUCCUCUGUGUCCCCAAGAACUAUCUCUCCCCAACUUGGGCUGUCCCAACCCUCGGCUGGUCAAAGUUACCGGGCAGUGCUGCGAGGAGUGGGUCUGUGACGAGGAUAGUAUCAAGGACCCCAUGGAGGACCAGGACGGCCUCCUUGGCAAGGAGCUGGGAUUCGAUGCCUCCGAGGUGGAGUUGACGAGAAACAAUGAAUUGAUUGCAGUUGGAAAAGGCAGCUCACUGAAGCGGCUCCCUGUUUUUGGAAUGGAGCCUCGCAUCCUAUACAACCCUUUACAAGGCCAGAAAUGUAUUGUUCAAACAACUUCAUGGUCCCAGUGCUCAAAGACCUGUGGAACUGGUAUCUCCACACGAGUUACCAAUGACAACCCUGAGUGCCGCCUUGUGAAAGAAACCCGGAUUUGUGAGGUGCGGCCUUGUGGACAGCCAGUGUACAGCAGCCUGAAAAAGGGCAAGAAAUGCAGCAAGACCAAGAAAUCCCCCGAACCAGUCAGGUUUACUUACGCUGGAUGUUUGAGUGUGAAGAAAUACCGGCCCAAGUACUGCGGUUCCUGCGUGGACGGCCGAUGCUGCACGCCCCAGCUGACCAGGACUGUGAAGAUGCGGUUCCGCUGCGAAGAUGGGGAGACAUUUUCCAAGAACGUCAUGAUGAUCCAGUCCUGCAAAUGCAACUACAACUGCCCGCAUGCCAAUGAAGCAGCGUUUCCCUUCUACAGGCUGUUCAAUGACAUUCACAAAUUUAGGGACUAAAUGCUACCUGGGUUUCCAGGGCACACCUAGACAAACAAGGGAGAAGAGUGUCAGAAUCAGAAUCAUGGAGAAAAUGGGCGGGGGUGGUGUGGGUGAUGGGACUCAUUGUAGAAAGGAAGCCUUGCUCAUUCUUGAGGAGCAUUAAGGUAUUUCGAAACUGCCAAGGGUGCUGGUGCGGAUGGACACUAAUGCAGCCACGAUUGGAGAAUACUUUGCUUCAUAGUAUUGGAGCACAUGUUACUGCUUCAUUUUGGAGCUUGUGGAGUUGAUGACUUUCUGUUUUCUGUUUGUAAAUUAUUUGCUAAGCAUAUUUUCUCUAGGCUUUUUUCCUUUUGGGGUUCUACAGUCGUAAAAGAGAUAAUAAGAUUAGUUGGACAGUUUAAAGCUUUUAUUCGUCCUUUGACAAAAGUAAAUGGGAGGGCAUUCCAUCCCUUCCUGAAGGGGGACACUCCAUGAGUGUCUGUGAGAGGCAGCUAUCUGCACUCUAAACUGCAAACAGAAAUCAGGUGUUUUAAGACUGAAUGUUUUAUUUAUCAAAAUGUAGCUUUUGGGGAGGGAGGGGAAAUGUAAUACUGGAAUAAUUUGUAAAUGAUUUUAAUUUUAUAUUCAGUGAAAAGAUUUUAUUUAUGGAAUUAACCAUUUAAUAAAGAAAUAUUUACCUAAUAUCUGAGUGUAUGCCAUUCGGUAUUUUUAGAGGUGCUCCAAAGUCAUUAGGAACAACCUAGCUCACGUACUCAAUUAUUCAAACAGGACUUAUUGGGAUACAGCAGUGAAUUAAGCUAUUAAAAUAAGAUAAUGAUUGCUUUUAUACCUUCAGUAGAGAAAAGUCUUUGCAUAUAAAGUAAUGUUUAAAAAACAUGUAUUGAACACGACAUUGUAUGAAGCACAAUAAAGAUUCUGAAGCUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-749.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -790.35

Frequency: 0.0000

Diversity: 482.14

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(.((((..(((((((((((.((.(.(...((((.....))))...).).))))))....((.(((.....))).))........(((((((((.(((((((((((...))))(((((((((((.((((((.(((((((((.(((((((.(((((((((((..(((((((.((((.((..((((.(((((((.((.(((((((((((((((.(((((((...((((.(((.........))).))))((((..((((...............)))).)))).(((((.(((((...((...((.....))....))....))))))))))...))).)))))))))))......)))))))).)))).))))).(((((..(((....)))..)))))......(((.((((........)))).)))))))..)).)))).)))))))..)))).((((((((.((((((((((((((((.((.....)).))))))....(((.((((....)))).))).......(((((..(((......((((((((.(....(((((((.(.((...(((((((((....)))))))))..)).))))))))).)))).))))((((....((((((((.(((((((...))))..(.((((..(((((((((.((.........)).))))....)))))..)))).)......))))))))).))..)))).(((.(((((.((.....))))))).)))...))).)))))..(((.......))))))))))))).)).....((((......)))).(((((.......)))))..)))))).((((((..((((...))))))))))(((((.(((.(((((.((((((((((((..((.(((..((((....))))...)))..))...(((((((..(...(((.(...(((((.(((.....))).))))).).))).)..))))))).))))))))))........))..)))))))))))))....)))))))))).)))).)))).((((......))))......(((((((.................(((((.....)))))..(((((((.((...)).)))))))........(((((....(((.((((...)))))))...))))).)))))))(((((........((((((((.((..(((..((((...((.(((((((......))))))))).))))..))).....)))))))))).....(((........))).(((.(((.......)))))).....((((......((((((..((((((((....((((((...))))))((..(((((....)))))))...(((.(.....).))).....))))))))))).)))......)))).....)))))))))).).((((((......)))))).((((...(((((((((((((.........)))))...)))).))))....))))...))))).)))))))).)))............((((((....((((((...(((((((......)))))))..)))).))((((((...))))))))))))((((...(((..((((.((((((((((((........(((((.(.((((.(((((.((((...((((....))))......)))).....))))).)))).).))))).((((.(..((((...))))..)))))..............((((((.....))))))(((((....)))))((((((((...))))))))((.((((((((....)))).))))..)))))))))))))).)))).)))....))))(((.(((.(((((....))))).))).)))))))))))))))...........)))).....((((((((((...(((((((((((...(((((((...)))))))))))))))))).))))).)))))...........((((...(((((((.....))))))).....)))).))))))).........((((.....)))))))).)(((((((((...((......))...)))))).)))((((((..((((...(((....)))...)))).)))))).......((((((........(((((((((((((((.((..(((((((..........)))))))..)).)))))))........)))))))))))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

....,(.(((((,(((((({,,,(.({.{,{...{|||.,,,.))))..,},},||||||....((.(((.....))).))}})).,},{{{{({{((.((((((({(((...||||((({((({(((,((((({..{((,((((.((((((,{(((((((((((..(((((((.((((.((..((((.(((((((.((.((((((((((((((({(((((((...((((.(((.........))).))))((((..((((...............)))).)))).(((((.(((((...((...((.....))....))....))))))))))...)))})))))))))))......)))))))).)))},))))).(((((..(((....)))..)))))......(((.((((........)))).)))))))..)).)))).)))))))..))))..(((,,((.((((((((((((((((.{({...,)).))))))....(((.((((....)))).))).......{((((..{{{......((((((((.{....(((((({,(.((...(((((((((....)))))))))..)).))))))))}.)))),)}))((((....{{((((((.(((((({...}))),.(.((((.,(((((((((.((.........)).))))....))))).,)))).).,....))))))))).}}..)))).(((.(((((.((.....))))))).)))...))},))))}..{{{.......))})))))))))).)).}},.{{{{..,,,,,,}},||||,...{{{{|.(({....,,)))((((((.,,,,....},,.)))))).((((.(((.(((((,((((((((((((,,,...,{..,{({....}}}}.,,||,|{{{,,,({{(({,..|..,||{}|,..(((((.(((.....))).))))).,.}}}.,..))}))}}.)))))))))).,......))..)))))))))))))}}}})))))))))).)))).)))).((((,....,|||}......(((((((.................(((((.....)))))..(((((((.({...}).)))))))........(((((...,({(,((({...})))))).,,))))).))))))){(({{..||....((((((((.((..(((..((((...((.(((((((......))))))))).))))..))).....)))))))))).....||,,,,,,..,|||,(((.(((.......)))))},,,,,|||,..,|,}||({({..((((((((....{(((((...)))))}{(..(((((....)))))}}...(((.|.....}.})),....))))))))}}}.}}}.....,)},}.....))))))}})))))}.)}))).,))).}}}.,.((((...{((((((((((((.........)))))...)))).})))....))))...)))}},}))})))).})).,,|,...||,.||{,{{.,||{{,,,{,..(((((((......)))))))...}},.,.((({(|...}))))),,)))}((((...(({..((((.((((((((((((........(((((.{.((((.(((((.((((....{(({...})))......)))).....))))).)))).}.))))).((((.(..{({,...}}})..}))))..,.,,...,},..,,((((,,,..}}}}}}|||||,,..,}}}}((((((((...)))))))),{.((((((((....)))).))))..,,)))))))))))).)))).))}.,,,|||},,,.|||,||{{{...,}}})}.})).},})))})))))))}},.......,,||||{{{,,,,,,(((({,..,|||{,,||||{}},||||{{....|||||||,||||,,,,,,}))),,)})))}......,,,..,,{{,{,(((((((.....)))))))}}}..})))|)))}}|||........{({{.....)))})))).}{({((((((...((.....,))...)))))).))}{(((((.,,{,{..,{{{.....,....}}}).))))))....,..((((((,,,,,,..,{||||||(((((((.((..(((((((..........)))))))..)).)))))))........}}}})})})))))).,...