Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001623.5
Sequence Length
655 nt
GC Content
0.4779
AGGCUUCUGAGAAGACUGGUGGGAGAGAAGGAGAGCCUGCAGACAGAGGCCUCCAGCUUGGUCUGUCUCCCCACCUCUACCAGCAUCUGCUGAGCUAUGAGCCAAACCAGGGAUUUACAGGGAGGAAAAGCUUUCGGACUGCUGAAGGCCCAGCAGGAAGAGAGGCUGGAUGAGAUCAACAAGCAAUUCCUAGACGAUCCCAAAUAUAGCAGUGAUGAGGAUCUGCCCUCCAAACUGGAAGGCUUCAAAGAGAAAUACAUGGAGUUUGACCUUAAUGGAAAUGGCGAUAUUGAUAUCAUGUCCCUGAAACGAAUGCUGGAGAAACUUGGAGUCCCCAAGACUCACCUAGAGCUAAAGAAAUUAAUUGGAGAGGUGUCCAGUGGCUCCGGGGAGACGUUCAGCUACCCUGACUUUCUCAGGAUGAUGCUGGGCAAGAGAUCUGCCAUCCUAAAAAUGAUCCUGAUGUAUGAGGAAAAAGCGAGAGAAAAGGAAAAGCCAACAGGCCCCCCAGCCAAGAAAGCUAUCUCUGAGUUGCCCUGAUUUGAAGGGAAAAGGGAUGAUGGGAUUGAAGGGGCUUCUAAUGACCCAGAUAUGGAAACAGAAGACAAAAUUGUAAGCCAGAGUCAACAAAUUAAAUAAAUUACCCCCUCCUCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-186.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -199.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 154.70
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((.....(.((((.(((......((((.((((........))))))))((((.((..(((((((((...(((.(((((((..(((.(....).))).....(((((((........(((((...(((((...((((((......))))))...)))))(((.(.((....)).).)))..)))))....(((((((.((......))..)).))))).(((.((((....((.((((((((............))))))))..))....))))...)))((((....))))..)))))))......))))))))))......(((((.....))))).....(((((..........((((((......))))))))))).))))))))).))))))..(((...((((((((((((..((.((........)).))))))))........((((........))))......))))))..)))....(((....)))))))))))..)).)))))((((((......((((.......))))...))))))....(((..((.(((((((((......(((....)))....)))))......((((..((....))..)))).............)))).)).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((..,..{.((((.(((.,....((((.((((........)))))))),{{||((.,(((((((((...(((.((((((({.({(,,,,..,.))),....(((((((.....{{{({,,...,(((((...((((((......))))))...))))){||,,.((...,||.,.}}}..}}})}....((((({{..{.,....}},.)}.))))).(((.((((....((.((((((((............))))))))..))....))))...)))|{{,,,..)})),,)))))))....}.}))))))))).....{((({(.,,.,)}}}}.....(((((,.........{(((((......))))))))))).))))))))}.|||||}..(((,,.{{{{|||||{{{..||,|{||....,.}),)))}||||........((((........))))......}})}),..}))....(((....)))))))))))..))}}}))|((((((......((((.......))))...)))))),.,,(({..({.(((((((((......(((....)))....)))))......{(({..{{....))..))}}.,,..........}))),)).))).
Back