Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001647.4

Sequence Length

862 nt

GC Content

0.4872

AAGACAGGCAUCUCAAAUCGGCUGAUUCUGCAUCUGGAAACUGCCUUCAUCUUGAAAGAAAAGCUCCAGGUCCCUUCUCCAGCCACCCAGCCCCAAGAUGGUGAUGCUGCUGCUGCUGCUUUCCGCACUGGCUGGCCUCUUCGGUGCGGCAGAGGGACAAGCAUUUCAUCUUGGGAAGUGCCCCAAUCCUCCGGUGCAGGAGAAUUUUGACGUGAAUAAGUAUCUCGGAAGAUGGUACGAAAUUGAGAAGAUCCCAACAACCUUUGAGAAUGGACGCUGCAUCCAGGCCAACUACUCACUAAUGGAAAACGGAAAGAUCAAAGUGUUAAACCAGGAGUUGAGAGCUGAUGGAACUGUGAAUCAAAUCGAAGGUGAAGCCACCCCAGUUAACCUCACAGAGCCUGCCAAGCUGGAAGUUAAGUUUUCCUGGUUUAUGCCAUCGGCACCGUACUGGAUCCUGGCCACCGACUAUGAGAACUAUGCCCUCGUGUAUUCCUGUACCUGCAUCAUCCAACUUUUUCACGUGGAUUUUGCUUGGAUCUUGGCAAGAAACCCUAAUCUCCCUCCAGAAACAGUGGACUCUCUAAAAAAUAUCCUGACUUCUAAUAACAUUGAUGUCAAGAAAAUGACGGUCACAGACCAGGUGAACUGCCCCAAGCUCUCGUAACCAGGUUCUACAGGGAGGCUGCACCCACUCCAUGUUACUUCUGCUUCGCUUUCCCCUACCCCCCCCCCAUAAAGACAAACCAAUCAACCACGACAAAGGAAGUUGACCUGAACAUGUAACCAUGCCCUACCCUGUUACCUUGCUAGCUGCAAAAUAAACUUGUUGCUGACCUGCUGUGCUCGCAGUAGAUUCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-220.84 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -237.30

Frequency: 0.0000

Diversity: 182.58

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((..(((((........(((((.......(((((((.....(.((((...)))).)......)))))))........))))).......((((((((((.((((((..(.((.((((....((((((((.........)))))))))))).)).)..))))))))))))))))..)))))......((((......))))((..((.(((((((.((((.....(((.(((((((((...((..((((...........))))..))..(((...(((((...(((......((((....(((....(((...((((..((((.(((((((((((.....((((...((..((((((.......(...((((....))))...)......))))))..)).....))))............)))))))))))((((...))))...)))).)))))))....)))....))))......)))...))))).)))))))))...))).))).)))).))))))).))..))((((((.....((((....(((..........((((.......))))..............((.((((.((..........)).)))).)).......((((...)))).)))....))))))))))....(((...((((...(((((((((..(((.......((((((...((.(((((.((((..........................................))))))))).))....))))))......)))))).)))))).)))))))((((.((((.......)))).))))..(((((((....)))))))..))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

..{,..(((((,,......(((((.....{.(((((((..,,.,,(((,...})}},)...,}.)))))))........))))).......((((((((((.((((((..(.((.((((...{((((((((..,....,.}))))))))))).)).,,.))))))))))))))))..})))}......((((......)))){|..((.(((((((.((((.....(((.(((((((({...,{{.{,...,,.|,,....,,}}|.{{,(({{{{.,({{{{||{{{{{.,,.((((((..(((..{(((............}))}...)))..)),,)))||{||..((..((((((....,,,,...((((....))))...),,....))))))..))..,,,,}}}||,,,...{{{{|||,{{{{{...((({..||,.((,...,))..))))))....}}}}|,}}}}}}}.,}}.,,))),}}})).})))))..,))).))).)))).))))))).))..}}((((((.....((({.,..{((..........((({.......))))..............{(.((((.((..........)).)))).)}.......((((...)))).)))....))))))))))....{{{...((((...(((((((((..(((.......((((((...((.(((((.((((.......................................,..))))))))).))....))))))......)))))).)))))).))))}}}{(((.((((.......)))).))))..(((((((....)))))))..,},..